GENETİK HASTALIKLAR TANI MERKEZİ MOLEKÜLER GENETĠK ANALĠZ RAPORU Tanımlama Herediter Nonpolipozis Kolorektal Kanser (HNPCC); otozomal dominant kanser predispozisyon sendromu olup kolorektal kanserlerin %4-6'sını oluşturur: MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 gibi DNA tamir genlerindeki (MMR-mismatch repair) mutasyonlardan kaynaklanır. MMR genlerindeki mutasyonlar DNA replikasyonu sırasında tamir mekanizmasının bozulması ile karakterizedir. Hastalık; kolorektal adenokarsinom (Lynch Tip I) veya buna ilaveten endometriyal, over, gastrik, ureter, renal pelvis, küçük kemik vb. kanserler (Lynch Tip II) ile kendisini gösterir. Mikrosatellit İnstabilitesi (MSI); MMR genlerindeki inaktivasyonlara bağlı tümor DNA'sında ekstra mikrosatellit alellerinin gözlenmesi durumudur. HNPCC'den şüphelenilen ve ailesel mutasyonun bilinmediği olgularda tümör hücrelerinde MSI'nin araştırılması ilk basamakta yapılması gereken bir tanımlamadır. HNPCC'li hastaların çoğunda MSI saptanırken sporadik kolorektal kanserlerde bu oran %15-20 civarındadır. Bu test HNPCC tanısında kullanılmazken, MSI saptanan olgularda MMR genlerinin incelenmesi gerekliğini ortaya koyar. Kullanılan Teknik Hastadan alınan örnekten elde edilen DNA materyaline "The MSI Analysis System, Version 1.2 (Promega)" kiti kullanılarak, 5 mononükleotid tekrarı ve 2 pentanükleotid tekrarı (miks-up/ kontaminasyonunu elimine etmek için) olmak üzere toplam 7 marker ile fluoresan PCR yapılmıştır. Elde edilen PCR ürünleri ABI 310 DNA sequencer da Fragment Analizine tabi tutulmuş ve GeneMapper Analiz programı ile değerlendirilmiştir Ġncelenen Markerlar: Ad Soyad : <Hasta AdıMMMM Protokol No : <Protokol No> GeliĢ Tarihi : 03.11.2010 Endikasyon : KML? Ġncelenen Örnek : Kemik iliği Rapor Tarihi : 10.11.2010 Mononükleotid tekrar markerları BAT25 BAT26 Mono27 NR21 NR24 Pentanükleotid tekrar markerları kontaminasyon tayini için) (miks-up/ Penta C Penta D Gönderen Doktor : <Hasta AdıMMMMMMM Hastanıza ait DNA örneğinde 5 farklı mononükleotid tekrar markerı ve 2 farklı pentanükleotid tekrar markerı olmak üzere toplam 7 marker ile Mikrosatellit Instabilite (MSI) analizi uygulanmıştır. Analiz sonrasında MSI'ne ait bulgular aşagıdadır. Mikrosatellit İnstabilitesi Sonuç Referans Aralığı MSS / MSI-L MSS / MSI-L: pozitif 0-1 marker MSH-H : pozitif 2-5 marker * MSS: Mikrosatellit Stabilite / MSI-L: Mikrosatellit İnstabilitesi (düşük) / MSI-H: Mikrosatellit İnstabilitesi (yüksek) Saygılarımızla, Dr. Y.Hakan ÖZÖN Tıbbi Genetik Dr. Jülide CAFERLER Tıbbi Genetik *Bu analiz, DNA düzeyinde primerler ile belirlenen alanlar dışındaki mutasyonlar, büyük delesyonlar ve polimorfizmler ile UPD'i dışlamamaktadır. *Genetiks Genetik Hastalıklar Tanı Merkezi, DNA dizi analizi (sequencing) ve mutasyon taraması için "Avrupa Moleküler Genetik Kalite Ağı (European Molecular Genetics Quality Network - EMQN)" programına dahildir. GENETĠKS SAĞLIK HĠZMETLERĠ TĠC. LTD. ġTĠ Gayrettepe Mah. Bahar Sokak Baras Han No:4A 34349, Beşiktaş - İstanbul / TÜRKİYE • T: +90 (212) 275 70 20 pbx • F: +90 (212) 275 70 08 • www.genetiks.com.tr • [email protected]