Prof.Dr.HamdiÖĞÜŞ [email protected] YakınDoğuÜniversitesiTıpFakültesi BiyokimyaAnabilimDalı,LeJoşa,KKTC Dersplanı 1. SinyalilePmi(signaltransducPon)nedir? 2. SinyalilePminingenelözellikleri Özgüllük,Duyarlılık,Çoğaltma,Duyarsızlaş6rmauyum,Bütünleşme 3. SinyalilePmimekanizmaları–sınıflandırma 4. Kapılıiyonkanalları 5. G-protein-kenetlireseptörler 6. Reseptörenzimler 7. EnzimakPvitesiolmayanreseptörler 8. Nükleerreseptörler SinyalilePmi(signaltransduc?on) • Birhaberinkimyasalbirdeğişikliğeçevrilmesidir. – Yaşamiçintemeldir. – Yaşayanbütünhücrelerdeevrenselözelliklere sahip?r. • Sinyal,özgülreseptörlertaraLndanalgılananbir bilgidirvedaimakimyasalbirişlemikullanan hücreselbiryanıtadönüştürülür. Haberleşmenin aşamaları 1. Alma Birincilhabercinin reseptörebağlanması 2. TransducPon(Evirme?) -İkincilhabercininoluşumu -Ak?vasyonzinciri 3. Yanıt - İyontransportu - Proteinmodifikasyonu - Geneekspresyonu Hücrelerinyanıtverdiğibazısinyaller • An?jenler • Işık • Gelişimsinyalleri • Mekaniktemas • Büyümefaktörleri • NörotransmiWerler • Hormonlar • Besinmaddeleri • Ekstrasellülermatriks • Kokulumaddeler bileşenleri • Tatverenmaddeler • Feromonlar • Hücreyüzeyiglikoproteinleri/oligosakkaridler SinyalilePmsistemlerininözellikleri • Özgüllük Sinyalmolekülleriilereseptörlerarasındakesinbir tamamlayıcılıkvardır(non-kovalanetkileşme) • Duyarlılık Sinyalmolekülünekarşıreseptörleryüksekafinite gösterirler. • Yükseltme(Amplifica?on) Reseptöryanı6nşidde?ardışıkişlemlerlear6rılır. • Duyarsızlaşma–Uyarlama • Bütünleşme(Integra?on) SinyalilePmsistemlerininözellikleri Özgüllük(specificity) Sinyalmolekülütamamlayıcı reseptörünbağlanmabölgesine tamuyumgösterir,diğer molekülleruymaz. Çokhücreliorganizmalardaekbir özgüllükdahavardır,çünküsinyale yanıtverenreseptöryadabirsinyal yolağınınhücreiçihedefleriyalnız belirlihücrelerdebulunur. Reseptör Etki SinyalilePmsistemlerininözellikleri Güçlendirme (amplifica?on) Enzimlerenzimleri ak?vee`ğinde etkilenenmolekül sayısıgeometrik olarakartar. SinyalilePmsistemlerininözellikleri Duyarsızlaşma-Uyarlama (desensi?za?on-adapta?on) Reseptörak?vasyonu,reseptörü devredışıbırakanyadahücre yüzeyindenkaldıranbirgeri beslemedevresinite?kler. Birsinyalsürekliolarakvarsa, reseptörkapanır(desensiPzasyon). Dahasonra,uyarıbelirlibireşiğin al6naindiğindesöstemyeniden duyarlıhalegeçer(adaptasyon). Sinyal Reseptör Yanıt SinyalilePmsistemlerininözellikleri Bütünleşme(integra?on) Sinyal 1 Sinyal 2 Birmetaboliközellik, örneğinbirikincihaberci Reseptör Reseptör (X)yadazarpotansiyeli 1 2 (Vm)üzerindezıtetkiliiki sinyalvarsa,düzenleyici çıkışherikireseptöre gelengirişsinyalinin integrasyonuile Yanıt sonuçlanır. Entegrasyon, sistemin çoklu sinyalleri alabilmesi ve hücreningereksinmelerineuygunbirleş?rilmişbiryanıt verebilmeyeteneğidir. Molekülermekanizmalar Kapılı iyon kanalı Yılansı reseptör Sinyal ligandına (S) ya da zar Reseptöre (R ) bağlanan potansiyeline yanıt olarak açılır ligand, ikincil haberci olan ya da kapanır. bir X molekülünü oluşturacak enzimi regüle eden hücreiçi bir GTP-bağlayıcı proteini aktive eder. Enzim aktivitesi olmayan reseptör Bir gen düzenleyici proteini (doğrudan ya da bir protein kinaz zinciri yoluyla) aktive ederek gen ekspresyonunu değiştiren sitozolik bir protein kinazla etkileşir. İyon Plazma zarı Reseptör enzim Ligandın ekstrasellüler bölgesine bağlanmasıyla hücre içindeki kısımda yer alan enzim aktivitesi uyarılır. Çekirdek zarı Steroid reseptörü Steroid bir nükleer reseptör proteinine bağlanır ve reseptörün özgül genlerin ekspresyonuna izin verir. Yapışma Kinaz reseptörü zinciri Ekstrasellüler matrikste molekülleri bağlar, konformasyon değişikliğine uğrar, hücre iskeletiyle olan etkileşmeler değişir. Lipidadacıklarınınönemi • Plazmazarındaküçük Nature Reviews Neuroscience 8, 128– 140 (February 2007) yapılarhalindebulunan lipidadacık-larındasinyal ile?mproteinleri toplanmış6r. • Böyleceetkileşmelerive sinyalile?midahaetkinbir biçimdegerçekleşir. • Lipidadacıklarınınyapısı kolesterolün uzaklaş6rılmasıile bozulursa,birçok haberleşmeyolağıişlevsiz halegelir. Molekülermekanizmalar • Kapılı (gated) iyon kanalları • G protein-kenetli reseptörler • Reseptör enzimler • Enzim aktivitesi olmayan reseptörler • Nükleer reseptörler KapılıİyonKanalları Kapılıiyonkanallarısinyaliikişekildeile?lir: • Dahasonrabirikincilhaberciolarakgörevalacak biriyonun(Ca2+gibi)sitoplazmadakiderişimi değişPrilir. • Zaraşırı(transmembrane)elektrikpotansiyelini değişPrilirvezarpotansiyelineduyarlıproteinler etkilenir Asetilkolin(Ach)reseptörü • Achreseptörü,Achiçinikiyüksekafinitelibağlamayeri olanbirallosterikproteindir. • Ligand-reseptörbağlanmasında,pozi?fkoopera?fbir etkileşmesözkonusudur.Na+yadaCa2+iyonlarının içeriakmasızarıdepolarizeeder. Asetilkolin(Ach)reseptörü AsePlkolin(Ach) UyarılmışbirnörontaraLndansalınanAchbirkaç mikrometre genişliğinde olan sinap?k yarığı diffüzyonlageçerek,yarığınöbürtaraLndakipostsinap?k nörona ya da nöromüsküler plaktaki miyosite ulaşır. Postsinap?k hücredeki Ach reseptörü ile etkileşir ve elektriksel uyarıyı (depolarizasyon)te?kler. Asetilkolin(Ach)reseptörü Asetilkolin(Ach)reseptörü • Achsinap?karalıkta asePlkolinesteraz(AChE) enzimitaraLndanhızla ortadankaldırılır. • Ach’ninyüksekderişimde kaldığıbirkaçmilisaniyelik süredereseptör duyarsızlaşır. • Ach’ninyavaşbirşekilde reseptördenayrılmasıile reseptöryenidendinlenme durumunageçer. GProtein-kenetlireseptörler • Plazmazarıreseptörlerizarıyedikez geçenhelikalbölgeleresahip?r (GPCR,7TM,SerpenPn). • GPCRailesininyaklaşık1000üyesi vardır.İlaçlarınyaklaşık%60’ınınhedefi buproteinailesidir. • Reseptörünsitoplazmikparçasıbir guaninnükleoPdibağlayanprotein(G proteini)ileetkileşir. • Gproteini;α,β,veγaltbirimlerinden oluşanbirheterotrimerproteindir. G-PROTEİNLERİNİNORTAKÖZELLİKLERİ a) Hücreiçininperiferalzarproteinleridir. b) Guaninnükleo?dlerini(GTP,GDP)bağlarlar. c) Uyarılmıştransmembranreseptörlerceak?ve edilirler. d) Birefektörproteine/enzimekenetlenirler. e) BakteriyeltoksinlerleADP-ribozillenirler (Kolera,Boğmaca,Dineri). f) HidrolizedilemeyenGTPanaloglarıve AlF4-ileak?veolurlar. GProtein-kenetlireseptörler GProtein-kenetlireseptördöngüsü GProtein-kenetlireseptördöngüsü cAMP • 1958yılındaSutherlandve RalltaraLndanbulundu. • 1960-Katekolaminlerin etkisiilecAMPar6şıve fosforilazak?vasyonu ATP Adenilat siklaz 3’,5’-cAMP PDE 3’,5’-cAMP5’-AMP Gproteinlerinindeğişikα-altbirimleribulunur Heterotrimerik(α-,β-,veγ-altbirimleri)yapıdakiG proteinleri,yerleşimveişlevineuygunolarakfarklıαaltbirimiiçerir.Bualtbirimler,yapılarıveişlevleriaçısından önemlifarklılıklargösterir. Başlıcatürleri; 1) 2) 3) 4) 5) 6) 7) Gsα Adenililsiklazıak?veeder. Giα Adenililsiklazıinhibeeder. Gqα FosfolipazC’yi(PLC)ak?veeder. Ggust Adenililsiklazıak?veeder(Tatreseptörü,tatlı). Golf PLC’yi(1)veAdenililsiklazı(2)ak?veeder(Koku). Gt(Transdusin)PDE’yiinhibeeder(Rodopsin>görme). 12αve13αHücreiskele?(ak?n)yapımısinyali Gproteinlerinindeğişikα-altbirimleribulunur G proteinlerindeki bu heterojenite, alfa- dışında beta- ve gamaaltbirimlerindedebulunur.Aslında,insanlarda21farklıalfa,6farklıbeta ve12farklıgamaaltbirimibulunmuştur.Bunlarınbazılarıyaygınolarak ve bol miktarda sentezlenirken, bazıları ise özel hücrelerde ve kısıtlı olaraksentezlenirler. GPROTEİNİα-ALTBİRİMLERİNİNYAPIve ÖZELLİKLERİ Gs Sinyal dedektörü Efektör pr. Etki Molekül α Ağırlığı β (kDa) γ Toksinlere duyarlılığı Yerleşim Gi β-Adrenerjik α2-Adrenerjik reseptör reseptör Go Transdusin (Gt) ? Rodopsin (reseptör) A. Siklaz A. Siklaz ? cGMP-PDE Stimülasyon İnhibisyon ? Stimülasyon 44, 45, 46 35, 36 8 41 35, 36 8 39 35, 36 8 39 36 8 Kolera Boğmaca Boğmaca Boğmaca Kolera Hücrelerin çoğunda Hücrelerin çoğunda Beyin Retinal rod GörmeolayındasinyalilePmi Rodopsin birGprotein- kenetliışık reseptörüdür. Busistemdeki Gproteini transdusindir. AdenililsiklazaetkiedenGαproteinleri Gsα sPmulatör Giα inhibitör BirGPCRprotoPpi:β-adrenerjikreseptör E İkincilhabercisicAMPolanbazısinyaller ACTHsalgılaqrıcıhormon Melanosituyarıcıhormon (CRH) (MSH) Folliküluyarıcıhormon (FSH) Dopamin[D1,D2] Kokular(birçok) Parathormon Epinefrin(β-adrenerjik) ProtaglandinlerE1veE2 KorPkotropin(ACTH) Serotonin[5-HT-1a,5-HT-2] Glukagon SomatostaPn Histamin[H2] Tadvericiler(tatlı,acı) LüteinleşPricihormon Tiroiduyarıcıhormon(TSH) AdenililsiklazısPmüle Adenililsiklazıinhibe edenhormonlar(Hs) edenhormonlar(Hi) ACTH hCG AsePlkolin ADH LH α2-Adrenerjikler Glukagon LPH AngiotensinII Kalsitonin MSH SomatostaPn CRH PTH FSH TSH β-Adrenerjikler Yağhücrelerindedepolanannötralyağların(TAG) hormonaletkiylemobilizasyonu Sinyalingüçlendirilmesi • Epinefrinhiperglisemikbir hormondur. • Kanglukozunu,glikojen yıkımınıuyararakyüksel?r. • Glikojen,glikojen fosforilazlayıkılır. • Glikojenfosforilazise fosforilasyonyoluyla ak?fleşir. • Epinefrin,fosforilasyon/ defosforilasyonzincirini te?klervesinyalzincirin herbasamağındadaha dagüçlenir. Dominoetkisi➭Sinyalgüçlendirme İkincilHaberciKriterleri(Sutherland,1971) 1- Fizyolojikderişimdeadenilatsiklazak?vasyonu(intakt hücreveyazarpreperatlarında) 2- Ak?vasyonsadecebiyolojikcevapoluşturabilen hormonlaraözgülolmalı. 3- HormoncAMPderişiminiarwrmalıdır.İnak?veedilen hormonaynıetkiyesahipolmamalı. 4- HormonderişimiilecAMPsentezivebiyolojikcevap arasındailişkiolmalıdır. 5- Biyolojikcevap;fosfodiesterazenzimleritaraLndan önlenmeli,fosfodiesterazinhibitörlerincearwrılmalıdır. 6- cAMPanaloglarıhormonaletkiyitaklitetmelidir. 7- cAMPderişiminebağlıolarakproteinkinazak?vasyonuve sonradaproteinfosforilasyonugerçekleşmelidir. Sinyalinsonaerdirilmesi β-Adrenerjikreseptöründuyarsızlaşwrılması GPCRakPvitesiileilgilihastalıklar Örnek:KoleratoksiniGsα’yıkovalanolarakdeğişPrir GPCRakPvitesiileilgilihastalıklar • Kolera toksiniyle kalıcı olarak ak?fleşen Gs bağırsak epitel • • • • hücrelerindeadenililsiklazısürekliolarakak?veeder. SürekliolarakcAMPüre?lirvePKAak?vasyonudasüreklidir. PKA klorür iyon kanalını (CFTR) fosforile eder ve bağırsak lümeninesürekliklorüriyonusalgılanır. Klorürlebirliktediğeriyonlar vedoğalolaraksukaybısöz konusudur. Sonuçolarakdehidratasyon veelektrolitkaybıkoleradaki başlıcapatolojikbulgular olarakortayaçıkar. FosfolipazCüzerindeetkiliGproteini-Gqa FosfolipazCüzerindeetkiliGproteini-Gqa Gqa FosfolipazCüzerindeetkiliGproteini-Gqa Kalsiyum • NormalolaraksitozolikCa2+çokdüşükderişimlerde (10-7M)tutulur.BunuCa2+pompalarısağlar. • FarklıuyarılarCa2+kanallarıüzerindensitoplazmaya Ca2+girişinenedenolur. Ca2+; – Nöronveendokrinhücrelerdeekzositoz, – Kaskasılması, – Kanpıh6laşması, – Kanpıh6laşması, – Hücreiskele?düzenlenmesi,ve – Kalmodülinibağlama→Ca2+-kalmodlin-bağımlı enzimler – Konularındagörevalır. Ca2+-Kalmodülinkompleksi • CaM(kalmodülin),kendiadını verdiğibirenzimailesinin(Ca2+CaM-bağımlıproteinkinaz, CaMkinaz,CAMK)integralbir birimidir. • HücreiçindeCa2+arwğında, CaMkalsiyumubağlarvebir konformasyondeğişikliğine uğrar. • Ca2+-CaMkompleksiCaM kinaz’abağlanarakenzimi ak?veeder.