G Ü Z (FALL ) - MOLEKÜLER BİYOLOJİ ve GENETİK BÖLÜMÜ

“Moleküler Biyoloji” Yüksek Lisans Programında Açılacak Dersler ve İçerikleri
Courses and their contents in Molecular Biology Master of Science Programme
Kod
Dönem
(Code)
(Term)
Zorunlu
(Compulsory)
Seçmeli
(Elective)
MBG717
S
MBG719
S
MBG721
S
MBG723
S
MBG725
S
Adı
Kredisi
AKTS
Sorumlusu
(Name)
(Credits)
(ECTS)
(Instructor)
(3 0 3)
6
Doç. Dr. Ender
BÜYÜKGÜZEL
(3 0 3)
6
Doç. Dr. Ender
BÜYÜKGÜZEL
(3 0 3)
6
Doç. Dr. Ender
BÜYÜKGÜZEL
(3 0 3)
6
Doç. Dr. Ender
BÜYÜKGÜZEL
(3 0 3)
6
Doç. Dr. Ender
BÜYÜKGÜZEL
(2 1 3)
6
Yrd. Doç. Dr.
Tolga ACUN
(3 0 3)
6
Yrd. Doç. Dr.
Tolga ACUN
(3 0 3)
6
Yrd. Doç. Dr.
Tolga ACUN
6
Yrd. Doç. Dr.
Sevim
KARAKAŞ
ÇELİK
6
Yrd. Doç. Dr.
Sevim
KARAKAŞ
ÇELİK
(3 0 3)
6
Yrd. Doç. Dr.
Sevim
KARAKAŞ
ÇELİK
(2 2 3)
6
Prof.Dr. Kemal
BÜYÜKGÜZEL
Böcek Moleküler Fizyolojisi I
(Insect Molecular Physiology I)
Moleküler Hücre Biyolojisi I
(Molecular Cell Biology I)
Sindirim Fizyolojisi I
(Digestive Physiology I)
Biyokimyasal Fizyoloji I
(Biochemical Physiology I)
Sistem Fizyolojisi
(System Physiology)
MBG727
MBG729
MBG731
MBG733
MBG735
MBG737
BIY709
GÜZ (FALL)
Biyolojik Bilimlerde Biyoinformatik
S
(Bioinformatics in
Biological Sciences)
İleri Gen Moleküler Biyolojisi
S
S
S
S
S
S
(Advanced Molecular Biology of the
Gene)
Moleküler Biyolojide Yöntemler
(Methods in Molecular Biology)
Tıbbi Genetik
(Medical Genetics)
Hücre Kültürü Teknikleri ve
Uygulama Alanları
(Cell Culture Techiques
and It’s Applications)
Sitogenetik
(Cytogenetics)
İleri Böcek Biyokimyası-I
(Advanced Insect Biochemistry I)
(3 0 3)
(3 0 3)
Bülent Ecevit University, Faculty of Sciences and Arts, Department of Molecular Biology and Genetics, 67100,ZONGULDAK,TURKEY
Tel: +90.(372).2574010 - Fax: +90.(372).2574181 - e-mail: [email protected] - http://web.beun.edu.tr/mbg
S
BIY719
S
BIY741
BIY743
GÜZ (FALL)
BIY717
(Biochemistry of Health)
Moleküler Metabolizma
(Molecular Metabolism)
(3 0 3)
6
Prof.Dr. Kemal
BÜYÜKGÜZEL
(3 0 3)
6
Prof.Dr. Kemal
BÜYÜKGÜZEL
(3 0 3)
6
Doç. Dr. Hatice
ÇÖLGEÇEN
Bitki Doku Kültürü Teknikleri
S
S
S
BIY745
Sağlık Biyokimyası
(Plant Tissue Culture Techniques)
Biyolojide Elektron Mikroskobu
Teknikleri
(Electron Microscope Tecniques in
Biology)
Bitki Büyüme Düzenleyicileri
(Plant Growth Regulators)
Doç. Dr. Hatice
ÇÖLGEÇEN
(3 0 3)
6
(3 0 3)
6
Doç. Dr. Hatice
ÇÖLGEÇEN
(3 0 3)
6
Doç. Dr. Ender
BÜYÜKGÜZEL
(3 0 3)
6
Doç. Dr. Ender
BÜYÜKGÜZEL
(3 0 3)
6
Doç. Dr. Ender
BÜYÜKGÜZEL
(3 0 3)
6
Doç. Dr. Ender
BÜYÜKGÜZEL
(3 0 3)
6
Doç. Dr. Ender
BÜYÜKGÜZEL
(3 0 3)
6
Yrd. Doç. Dr.
Tolga ACUN
(3 0 3)
6
Yrd. Doç. Dr.
Tolga ACUN
(3 0 3)
6
Yrd. Doç. Dr.
Tolga ACUN
6
Yrd. Doç. Dr.
Sevim
KARAKAŞ
ÇELİK
6
Yrd. Doç. Dr.
Sevim
KARAKAŞ
ÇELİK
Böcek Moleküler Fizyolojisi II
S
MBG720
S
MBG722
S
MBG724
S
MBG726
MBG728
MBG730
MBG732
BAHAR (SPRING)
MBG718
S
S
S
S
(Insect Molecular
Physiology II)
Moleküler Hücre Biyolojisi II
(Molecular Cell Biology II)
Sindirim Fizyolojisi II
(Digestive Physiology II)
Biyokimyasal Fizyoloji II
(Biochemical Physiology II)
Metabolizma
(Metabolism)
Moleküler Biyolojide Model
organizmalar
(Model Organisms in Molecular
Biology)
Kanserin Moleküler Temelleri
(Molecular Basis of Cancer)
İleri Moleküler Genetik
(Advanced Molecular Genetics)
Prenatal Tanı ve Genetik Danışma
MBG734
MBG736
S
S
(Prenatal Diagnosis and Genetic
Counseling)
Rekombinant DNA teknolojisinin
Tedavide Kullanımı
(Using of recombinant DNA
technologies in treatment)
(3 0 3)
(3 0 3)
Bülent Ecevit University, Faculty of Sciences and Arts, Department of Molecular Biology and Genetics, 67100,ZONGULDAK,TURKEY
Tel: +90.(372).2574010 - Fax: +90.(372).2574181 - e-mail: [email protected] - http://web.beun.edu.tr/mbg
MBG738
S
Kök Hücre ve Güncel Uygulamaları
(Stem cell and Recent Applications)
(3 0 3)
6
Yrd. Doç. Dr.
Sevim
KARAKAŞ
ÇELİK
(2 2 3)
6
Prof. Dr. Kemal
BÜYÜKGÜZEL
(3 0 3)
6
Prof. Dr. Kemal
BÜYÜKGÜZEL
(3 0 3)
6
Prof. Dr. Kemal
BÜYÜKGÜZEL
(3 0 3)
6
Doç. Dr. Hatice
ÇÖLGEÇEN
(3 0 3)
6
Doç. Dr. Hatice
ÇÖLGEÇEN
(0 2 0)
3
Öğretim Üyeleri
(2 0 0)
15
Öğretim Üyeleri
(0 1 0)
15
Öğretim Üyeleri
İleri Böcek Biyokimyası-II
BIY710
S
(Advanced Insect
Biochemistry
BIY716
BIY718
BIY756
BAHAR (SPRING)
II)
S
S
S
BIY758
S
MBG797
Z
MBG798
Güz ve
Bahar
(Fall &
Spring)
MBG799
Güz ve
Bahar
(Fall &
Spring)
Z
Z
Biyoteknoloji
(Biotechnology)
Doku ve Sistem Fizyolojisi
(Tissue and System Physiology)
Tohumların Tıbbi ve Farmakolojik
Özellikleri
(Medical and Pharmacological
Properties of the Seeds)
Bitkilerde Hücre Farklılaşması ve
Ölümü
(Differentiation and Cell Death in
Plants)
Yüksek Lisans Seminer
(M.Sc. Seminar)
Yüksek Lisans Uzmanlık Alanı
(M.Sc. Field of Specialization)
Yüksek Lisans Tez Çalışması
(M.Sc. Thesis Research)
Bülent Ecevit University, Faculty of Sciences and Arts, Department of Molecular Biology and Genetics, 67100,ZONGULDAK,TURKEY
Tel: +90.(372).2574010 - Fax: +90.(372).2574181 - e-mail: [email protected] - http://web.beun.edu.tr/mbg
Moleküler Biyoloji Yüksek Lisans Ders İçerikleri
(Molecular Biology M.Sc. Course Contents)
MBG717 Böcek Moleküler Fizyolojisi I (Insect Molecular Physiology I) (3 0 3)6
Böcek Fizyolojisinin tarihçesi, kutikulanın yapısı, kitin, sklerotin, kutikula pigmentasyonu, trake ve
trakeoller, oksijenin difüzyonu, karbonik anhidraz, kan basıncı, kalp atışının kontrolu, plazmatosit,
hemoglobin, yağ doku, beslenme mekanizması, ön barsak, orta barsak, tükrük bezi, selülozun
sindirmi, sindirime simyontların katkısı.
The history of insect physiology, cuticle structure, chitin, sclerotin, pigmentation of cuticle, tracheae,
tracheoles, diffusion of oxygen, carbonic anhydrase, blood pressure, control heartbeat, plasmatocytes,
haemoglobin, fat body, feeding mechanism, fore-gut, salivary glands, digestion of cellulose, symbionts
in digestion.
MBG719 Moleküler Hücre Biyolojisi I (Molecular Cell Biology I) (3 0 3)6
Bu derste hücre teorisi, hücrenin fiziksel ve kimyasal yapısı, biyomoleküllerin yapıları ve özellikleri,
enerji dönüşümleri, genetik bilginin akışı ve hücresel bileşenler tanıtılacaktır.
This course will cover advanced principle of cellular biology including cell theory, physical and
chemical structures of cell, specifity and structures of biomolecules, energy transformations, the flow
of the genetic information and cellular compositions.
MBG721 Sindirim Fizyolojisi I (Digestive Physiology I) (3 0 3)6
Bir hücrelilerden çok hücrelilere, omurgasızlardan insanların da dahil olduğu omurgalılara kadar tüm
canlı organizmalarda sindirim sistemi, sorumlu organel veya organlar karşılaştırmalı olarak ele
alınacaktır.
Bir hücrelilerden çok hücrelilere, omurgasızlardan insanların da dahil olduğu omurgalılara kadar tüm
canlı organizmalarda sindirim sistemi, sorumlu organel veya organlar karşılaştırmalı olarak ele
alınacaktır.
MBG723 Biyokimyasal Fizyoloji I (Biochemical Physiology I) (3 0 3)6
Biyokimyasal fizyoloji, hayvanların değişen metabolizmaya adaptasyonu hakkında bilgi veren bir
alandır. Aşırı su kaybının önlenmesi, besin toplama ve dalgalanma gösteren sıcaklık, tuzluluk, ve
oksijen seviyelerinde hayvanların biyokimyasal fizyolojilerinde oluşan değişimler ile ilgilenir. Ayrıca
bu derste, hücresel seviyede sinyal iletimi ve hormonların etki mekanizması, karbohidrat, lipid, ve
protein metabolizmasının metabolik yollarının düzenlenmesi, aralarındaki ilişkinin belirlenmesi,
makro ve mikro besin bileşenleri, besin maddelerinin sindirimi ve emilimi, karbohidrat ve yağlar
arasındaki dönüşüm, vücudun vitamin ve mineral kullanımı, aşırı beslenmede enerji harcanması ve
gereksimi, açlık, kas faaliyeti, beslenme yetersizliği, yanlış beslenme ve buna bağlı olarak fazla kilo
alınması, vücut sıvıları, kan, elektrolit dengesi, asit baz dengesi, serbest radikal oluşumu ve
antioksidant olaylar incelenecektir.
Biochemical physiology is an area that give an information about adaptation to altered changing
metabolism of animals. It is concerned with prevention of excessive water loss , nutrient acquisition and
fluctuating temperature, salinity, and oxygen levels in the biochemical physiology changes of animals.
And also this course will be examined action mechanism of hormones and level signal transmission at
the cellular, regulation of carbohydrate, lipid , and protein metabolism metabolic pathways and
determination of their correlation , macro and micro nutrient components , digestion and absorption of
nutrient, conversion between carbohydrates and fats, using vitamins and minerals in the body, energy
Bülent Ecevit University, Faculty of Sciences and Arts, Department of Molecular Biology and Genetics, 67100,ZONGULDAK,TURKEY
Tel: +90.(372).2574010 - Fax: +90.(372).2574181 - e-mail: [email protected] - http://web.beun.edu.tr/mbg
expenditure in over nutrition and consequent excess weight, hunger, muscle activity, nutritional
deficiencies, malnutrition body fluids , blood, electrolyte balance, acid-base balance , formation of free
radicals and antioxidants events.
MBG725 Sistem Fizyolojisi ( System Physiology) (3 0 3)6
Hücresel fizyoloji, Sinir ve kas fizyolojisi, Özel Duyu organları, Endokrinoloji, üreme, insan solunum
sistemi, organizmalarda biyomoleküllerin taşınması, metabolik olayların düzenlenmesi.
Cellular physiology, Nervous and muscle physiology, Special sensory systems, Endocrinology,
Reproduction, Respiration of animals and human, Blood, Transport of biomolecules in organisms,
Regulation of metabolic processes.
MBG727 Biyolojik Bilimlerde Biyoinformatik (Bioinformatics in Biological Sciences) (2 1 3)6
Biyoinformatik araçların kullanımı ve uygulamaları (protein yapı analizi, primer dizaynı, mutasyon
analizi, promotor bölgesi tahmini, metilasyon analizi, kesim haritalaması, homoloji araştırma, dizi
eşleme, mikroarray teknolojisi ve analizi vb.), genom tarayıcıları ve veri tabanlarının tanıtılması ve
uygulamaları (NCBI, Pubmed, Sanger, Ensembl, UCSC vb.).
Usage of bioinformatic tools and their applications (protein structure analysis, primer design, mutation
analysis, prediction of promoter region, methylation analysis, restriction analysis, homology search,
pairwise alignment, microarray technology and its analysis etc.), introduction of genome browser and
databases and their applications (NCBI, Pubmed, Sanger, Ensembl, UCSC etc.)
MBG729 İleri Gen Moleküler Biyolojisi (Advanced Molecular Biology of the Gene) (3 0 3)6
İleri gen moleküler biyolojisi konularının (kromozom paketlenmesi, DNA tamir mekanizmaları, gen
ifade kontrol mekanizmaları, sinyal yolakları, hücre döngüsü vb.) işlenmesi ve bu konularda yapılan
güncel ve yüksek etki değerine sahip araştırma ve derleme türü makalelerin, detaylı olarak incelenmesi,
değerlendirilmesi ve tartışılması.
Topics of advanced molecular biology of the gene (chromosome packaging, DNA repair mechanisms,
control mechanisms of gene expression, signaling pathways, cell cycle etc.) will be covered and
comprehensive reading, evaluations and discussions of recent and high impact research and review
articles based on those topics.
MBG731 Moleküler Biyolojide Yöntemler (Methods in Molecular Biology) (3 0 3)6
Modern moleküler biyolojide kullanılan teknik ve protokollerin, örnek bilimsel makaleler yardımıyla
anlatılması.
Techniques and protocols used in modern molecular biology will be covered with the help of
representative scientific articles.
MBG733 Tıbbi Genetik (Medical Genetics) (3 0 3)6
Mendel kuralları, Aile ağacı, mutasyonlar, otozomal dominant, otozomal resesif, X kromozomal
kalıtımın özellikleri, tek gen hastalıklarında fenotipi etkileyen faktörler, mozaisizm, uniparental dizomi
ve genomik imprinting, multifaktöriyel kalıtım, mitokondriyal kalıtım ve üçlü tekrar hastalıkları gibi
temel tıbbi genetik kavramların anlatılması.
Explanation of the basic concepts of medical genetics such as mendelian inheritance, pedigree,
mutations, properties of autosomal dominant, autosomal recessive, X chromosomal inheritance, factors
affecting the phenotype in single gene disorders, mosaicism, uniparental disomy and genomic
imprinting, multifactorial inheritance, mitochondrial inheritance and triplet repeat diseases.
Bülent Ecevit University, Faculty of Sciences and Arts, Department of Molecular Biology and Genetics, 67100,ZONGULDAK,TURKEY
Tel: +90.(372).2574010 - Fax: +90.(372).2574181 - e-mail: [email protected] - http://web.beun.edu.tr/mbg
MBG735 Hücre Kültürü Teknikleri ve Uygulama Alanları (Cell Culture Techiques and It’s
Applications) (3 0 3)6
Çok hücreli canlılardan alınan hücrelerin nasıl kültüre edildiği, kültür özellikleri, kültür yapmada
kullanılan araç ve materyallerin hazırlanması (hücre kültürü laboratuarlarında güvenlik, doku kültürü
laboratuarında çalışma prensipleri, kontaminasyon, sterilizasyon teknikleri, kültür medyumları ve
solüsyonlar) ve hücre kültürü yöntemlerinin moleküler biyoloji ve rekombinant DNA teknolojisindeki
uygulama alanları
How the cells were cultured that was taken from multicellular organisms, cultural characteristics,
preparation of tools and materials that is used to make culture (safety of cell culture laboratory, working
principles in the tissue culture laboratory, contamination, sterilization techniques, culture media and
solutions) and Applications of cell culture methods in molecular biology and recombinant DNA
technology.
MBG737 Sitogenetik (Cytogenetics) (3 0 3)6
Kromozom yapı ve organizasyonu, kromozom bandlama teknikleri, X inaktivasyonu, Lyon hipotezi,
mayotik kromozomlar, kromozom kırıkları, uzun süreli kültürlerden insan kromozomlarının eldesi,
karyotipleme, sitogenetikte araştırma yöntemlerinin incelenmesi.
Structure and organization of the chromosome, chromosome staining and band techniques, X
inactivation, Lyon hypothesis, meiotic chromosomes, chromosome breakage, obtaining human
chromosomes by long-term cultures, karyotyping, to examine the research methods in cytogenetics.
BIY709 İleri Böcek Biyokimyası I (Advanced Insect Biochemistry I) (2 2 3)6
Organogenez, Peritrofik zar, Sindirim enzimleri, Besin maddeleri, Besin alınımı ve kullanımının
ölçülmesi, Deri değiştirme ve yeni kütikül tabakasının oluşumu, Protorasik bezler, Korpora allata ve
Jüvenil hormon, Metabolizmanın ara yolları, Merkezi sinir sistemi, Nöropil, Aksiyon potansiyelinin
iletimi.
Organogenesis, Peritrophic membrane, Digestive enzymes, Specific nutrients, Measures of food intake
and utilization, Molting and formation of new cuticle, The Prothoracic glands, The Corpora allata and
Juvenil hormon, Pathways of Metabolism, The Central Nervous System, The Neuropil, Conduction of
the action potential.
BIY717 Sağlık Biyokimyası (Biochemistry of Health) (3 0 3)6
Biyomoleküllerin genel yapı ve fonksiyonları, metabolizma bozuklukları, ara metabolik olayların
denetlenmesi ve düzenlenmesi, biyokimyasal korunma sistemleri, besinsel biyomoleküllerin canlılar
için önemi.
Genaral structure and function of biomolecules, Metabolism deficiency, Control and regulation of
intermediate metabolic processes, Biochemistry of defence mechanism, Importance of nutritional
biomolecules for living organisms.
BIY719 Moleküler Metabolizma (Molecular Metabolism) (3 0 3)6
Canlı organizmaların metabolik ara ürünleri, yapı taşları ve bunların fonksiyonları. Karbohidratlar,
lipidler,hormonlar ve vitaminlerin metabolizması, amino asitlerin bireysel metabolizmaları . RNA nın
sentezi ve işlenmesi,protein hedeflendirilmesi, sinyal sekansları, sinyal taşıyıcı partikül. Reseptör
aracılığı ile endositoz.
Building blocks and metabolic intermediate products of living organisms, and their functions.
Metabolism of carbohydrates, lipids, hormons, vitamins and amino acids, RNA synthesis and
processing, Protein targeting, signal sequences, signal recognition particle, Receptor-mediated
endocytosis.
Bülent Ecevit University, Faculty of Sciences and Arts, Department of Molecular Biology and Genetics, 67100,ZONGULDAK,TURKEY
Tel: +90.(372).2574010 - Fax: +90.(372).2574181 - e-mail: [email protected] - http://web.beun.edu.tr/mbg
BIY741 Bitki Doku Kültürü Teknikleri (Plant Tissue Culture Techniques) (3 0 3)6
Biyoteknoloji çalışmalarında temel çalışma konularından biri olan bitkilerde hücre ve doku kültürünün
tarihçesi, temel prensipleri, kullanılan kimyasal maddeler ve malzemeler, besin ortamları, amaçlarına
göre bitki hücre ve doku kültürü tipleri (sekonder metabolit üretimi, hücre süspansiyon kültürleri,
biyoreaktörler, somatik embriyo elde edilmesi).
Importance of plant tissue culture, Meristem culture, Production of virus free plants, Clonal
propagation, Synthetic seed, Anther and ovul culture-Regeneration of haploid plant and importance of
it, Protoplast culture and applications, PlanBiyolojik bimprovement, Germplasm preservation, Plant
tissue culture in biotechnology.
BIY743 Biyolojide Elektron Mikroskobu Teknikleri (Electron Microscope Tecniques in
Biology) (3 0 3)6
Temel bilim çalışmalarında ultrasütürktürel yapı araştırmalarında önemli bir araç olan elektron
mikroskobu ile yapılan çalışmalar için temel konuları vermek amaçlanmıştır. Elektron mikroskop
tipleri, çalışma prensipleri, ince yapı araştırmalarında kullanılan preparasyon teknikleri, örnek
protokoller ve son yıllarda gelişen teknikler .
The purpose is to give basic topics regarding the studies with electron microscope - an important tool
in ultrastructural researches in basic science studies. Types and operating principles of electron
microscopes, preparation techniques used in ultrastructural researches, sample protocoles and recent
techniques.
BIY745 Bitki Büyüme Düzenleyicileri (Plant Growth Regulators) (3 0 3)6
Temel bilim çalışmalarında ve uygulamalı biyolojik bilimlerde, bitki yetiştiriciliğinde, bitki doku
kültüründeki araştırmalarında önemli uyarıcı maddeler olan bitki büyüme düzenleyicilerinin
kullanıldığı çalışmalar için temel konuları vermek amaçlanmıştır. Bitki büyüme maddelerinin tanımı,
sınıflandırılması, oksinlerin, sitokininlerin, giberellik asitlerin, absisik asitin, etilenin ve yeni
çalışmalarla bitki büyüme maddesi olarak nitelendirilen organik moleküllerin bitkide biyosentezi,
işlevleri, metabolizmadaki yeri ve yıkımları, sentetik bitki büyüme maddelerinin özellikleri.
The purpose is to give the basic topics regarding the studies about plant growth regulators, which are
regarded as important stimulant substances in basic science studies, applied biological sciences, plant
breeding as well as plant tissue culture researches. Definition and classification of plant growth
regulators; biosyntheses, functions and metabolic processes of auxins, cytokinins, giberellic acids,
absisic acid, etylene and organic molecules (one of the plant growth regulators as considered in recent
studies) as well as characteristics of synthetic plant growth regulators.
MBG718 Böcek Moleküler Fizyolojisi II (Insect Molecular Physiology II) (3 0 3)6
Salgı sistemi, salgı organları, ürat hücreleri, malpighi tüpcükleri, kalın bağırsakta geri emilim, osmotik
basıncın düzenlenmesi, suyun emilimi, besin ihtiyacı, vitaminler, enerjikaynakları, anaerobik
metabolizma, ipek üretimi, mum, savunma salgıları, büyüme oranı, başkalaşım, juvenil hormon,
ekdizon doku, yenilenmesi,eşeysel dimorfizm, fotoperyod ve diyapoz, testis ve sperm hücreleri,
yumurtalık ve yumurta hücreleri, döllenme, partenogenez, kanat hareketi, uçma kası, duyu organları,
davranış, endokrin bezler, feromonlar.
Excretion system, excretory organs, urate cells, malpighian tubules, rectal reabsorption, absorption of
water, food requirements, vitamins, energy sources, anaerobic metabolsim, silk production, mum,
defensive secretions, growth ratio, metamorphosis, juvenil hormone, ecdysone, regeneration, sexual
dimorphism, photoperiod and diapause, testis and spermatozoa, ovary and egg cells, flight muscle,
sense organs, behaviour, endocrine glands, pheromones.
Bülent Ecevit University, Faculty of Sciences and Arts, Department of Molecular Biology and Genetics, 67100,ZONGULDAK,TURKEY
Tel: +90.(372).2574010 - Fax: +90.(372).2574181 - e-mail: [email protected] - http://web.beun.edu.tr/mbg
MBG720 Moleküler Hücre Biyolojisi II (Molecular Cell Biology II) (3 0 3)6
Hücre seviyesinde incelendikleri zaman canlıların temel bir organizasyon planı gösterdikleri
anlaşılmaktadır. Bu derste öğrencilere hücredeki organellerin yapı ve görevleri, ile hücre zarında
taşınma, zar potansiyeli, protein çeşitlenmesi, hücre farklılaşması, embriyo oluşumu ve hücresel
bağışıklık gibi işlevlerin temelini oluşturan moleküler mekanizmalar hakkında bilgi verilecektir.
Organisms have a common structure at cellular and subcellular levels. The students will gain insight
into the molecular mechanisms that are the basis for the cellular processes such as membrane transport,
membrane potential, protein sorting, cell differentiation, embryo formation and cellular immunology
in this course.
MBG722 Sindirim Fizyolojisi II (Digestive Physiology- II) (3 0 3)6
Bir hücrelilerden çok hücrelilere, omurgasızlardan insanların da dahil olduğu omurgalılara kadar tüm
canlı organizmalarda sindirim sistemi, sorumlu organel veya organlar karşılaştırmalı olarak ele
alınacaktır.
This course comparatively examines the digestive system, organells and organs involved in this system
from one-celled to multicellular living things, and from invertabrates to vertebrates including man.
MBG724 Biyokimyasal Fizyoloji II (Biochemical Physiology II) (3 0 3)6
Bu ders metabolizma, enzimlerin yapısı ve fonksiyonları, sinyal iletimi ve hormonların etki
mekanizması, karbohidrat, lipid, ve protein metabolizmasının metabolik yollarının düzenlenmesi,
aralarındaki ilişkinin belirlenmesi, makro ve mikro besin bileşenleri, besin maddelerinin sindirimi ve
emilimi, karbohidrat ve yağlar arasındaki dönüşüm, vücudun vitamin ve mineral kullanımı hakkında
bilgi vermektedir.
This course will be given an information about metabolism, enzyme structure and function, signal
transduction and action mechanisms of hormones, carbohydrate, lipid, and regulation of metabolic
pathway of protein metabolism, the relationship between this pathways, macro and micro nutrient
components, digestion and absorption of nutrient, conversion between carbohydrates and lipids, the
use of vitamins and minerals in the body.
MBG726 Metabolizma (Metabolism) (3 0 3)6
Canlı organizmaların oluşması ve metabolik ara ürünleri, lipid, karbohidrat, protein metabolizması,
RNA sentezi ve aşamaları, sinyal mekanizmaları, protein hedefleme, sinyal sekansları, sinyal tanıma
proteinleri.
Building blocks and metabolic intermediate products of living organisms, and their functions.
Metabolism of carbohydrates, lipids, hormons, vitamins and amino acids, RNA synthesis and
processing, Protein targeting, signal sequences, signal recognition particle, Receptor-mediated
endocytosis.
MBG728 Moleküler Biyolojide Model organizmalar (Model Organisms in Molecular Biology)
(3 0 3)6
Moleküler biyoloji ve genetik alanındaki araştırmalarda kullanılan çeşitli ökaryotik ve prokaryotik
model organizmanın (E. coli, S. cerevisiae, S. pombe, D. melanogaster, C. elegans, D. reiro, M.
musculus, R. norvegicus, A. thaliana) tanıtılması, kullanım alanlarının, nasıl ve niçin kullanıldıklarının,
avantajlı ve dezavantajlı yanlarının, örnek araştırma makaleleri eşliğinde işlenmesi.
Various eukaryotic and prokaryotic model organisms used in molecular biology and genetics field (E.
coli, S. cerevisiae, S. pombe, D. melanogaster, C. elegans, D. reiro, M. musculus, R. norvegicus, A.
thaliana) will be introduced, area of their use, how and for what purpose they are used, their
Bülent Ecevit University, Faculty of Sciences and Arts, Department of Molecular Biology and Genetics, 67100,ZONGULDAK,TURKEY
Tel: +90.(372).2574010 - Fax: +90.(372).2574181 - e-mail: [email protected] - http://web.beun.edu.tr/mbg
advantageous and disadvantageous properties will be covered with the help of representative scientific
articles.
MBG730 Kanserin Moleküler Temelleri (Molecular Basis of Cancer) (3 0 3)6
Onkogenler ve tümor baskılayıcı genler, sinyal yolakları, hücre döngüsü, kanser gelişimi, angiojeneziz,
metastaz, tümör immünolojisi, kanser tedavisi konuları ve bu konularla ilgili güncel ve yüksek etki
değerine sahip araştırma veya derleme türü makalelerin incelenmesi, değerlendirilmesi ve tartışılması.
Topics of oncogenes and tumor suppressor genes, signaling pathways, cell cycle, cancer progresssion,
angiogenesis, metastasis, tumor immunology, cancer therapy will be covered and comprehensive
reading, evaluations and discussions of recent and high impact research and review articles based on
those topics.
MBG732 İleri Moleküler Genetik (Advanced Molecular Genetics) (3 0 3)6
Mendel ve Non-Mendel kalıtım mekanizmaları, prokaryot ve ökaryotlarda replikasyon ve
rekombinasyon mekanizmaları, gen yazılım ve çevirim mekanizmaları ve bu mekanizmaların
düzenlenmesi, mitokondri genomu ve bu konularda yapılan güncel ve yüksek etki değerine sahip
araştırma ve derleme türü makalelerin, detaylı olarak incelenmesi, değerlendirilmesi ve tartışılması.
Mechanisms of mendelian and non-mendelian inheritance, mechanism of replication and
recombination in prokaryotes and eukaryotes, mechanisms of gene transcription and translation and
regulation of those mechanisms, comprehensive reading, evaluations and discussions of recent and
high impact research and review articles based on those topics.
MBG734 Prenatal Tanı ve Genetik Danışma (Prenatal Diagnosis and Genetic Counseling) (3 0
3)6
Günümüzde kullanılan prenatal tanı yöntemleri, Prenatal taramaların önemi, Prenatal Tanı
endikasyonları, Amniosentez, Koryon Villi biyopsi örneklerinden kromozom analizi, Kordosentez,
Genetik danışmanın önemi ve temel prensipleri, tek gen hastalıklarında, nonmendelian ve
multifaktöriyel hastalıklarda genetik danışma, kromozom anomalilerinde, mental geriliklerde ve
konjenital malformasyonlarda genetik danışma ve genetik danışmanın etik ve kanuni yönleri.
The methods currently used for prenatal diagnosis, significance of prenatal screening in prenatal
diagnosis, indications of prenatal diagnosis, Amniocentesis, the chromosome analysis of chorionic villi
biopsy, cordocentesis, the importance of genetic counseling and basic principles, genetic counseling in
single gene disorders, nonmendelian and multifactorial diseases, genetic counseling in chromosome
abnormalities, mental retardation and congenital malformations. Ethical and legal issues in genetic
counseling.
MBG736 Rekombinant DNA teknolojisinin Tedavide Kullanımı (Using of recombinant DNA
technologies in treatment) (3 0 3)6
Bu dersin temel amacı DNA dizi tasarımı ve güncel araştırmalarda uygulanan klonlama tekniklerinin
öğrenilmesi olup, genetik tedavinin uygulanmasındaki evreler, antisens oligonükleotidlerde tedavi,
genetik immünomodülasyonlar, normal dokunun korunması, hedef dokular ve gen transfer
tekniklerinin seçimi, ilaç hedeflenmesi, gen tedavisi gibi konular işlenecektir.
Main objective of this course is learning to DNA sequence design and cloning techniques applied in
current research and genetic therapy. Stages in the implementation of gene therapy, treatment with
antisense oligonucleotide, genetic immunomodulations and protection of normal tissue, selection of
target tissue and gene transfer techniques, drug targeting, gene therapy will be discussed.
Bülent Ecevit University, Faculty of Sciences and Arts, Department of Molecular Biology and Genetics, 67100,ZONGULDAK,TURKEY
Tel: +90.(372).2574010 - Fax: +90.(372).2574181 - e-mail: [email protected] - http://web.beun.edu.tr/mbg
MBG738 Kök Hücre ve Güncel Uygulamaları (Stem cell and Recent Applications) (3 0 3)6
Kök hücre nedir, kök hücre çeşitleri, elde edilmesi, çoğaltılması ve farklılaşması, bulundukları yerleri,
görevleri ve kök hücre kültür metodları, tanı ve tedavi amaçlı kullanımasının öğrenilmesi.
What are stem cells, stem cell types, acquisition, duplication and differentiation, their location, tasks
and learning to use stem cell culture methods for diagnosis and treatment.
BIY710 İleri Böcek Biyokimyası II (Advanced Insect Biochemistry II)(2 2 3)6
Kaslar, Kasların temel yapısı, Kemoreseptörler, Hemositler, Böceklerde hemoglobin, Trake sisteminin
yapısı, solunum pigmentleri, Su dengesi, Malpighi tüpçükleri, feromonlar, Dişi üreme sistemi,
Koryon.
Muscles, Basic muscle structure, Chemoreceptors, Hemocytes, Hemoglobin in insects, Structure of the
tracheal system, Respitory pigments, Water balance, Malpighian tubules, Pheromones, Female
reproductive system, The Chorion.
BIY716 Biyoteknoloji (Biotechnology) (3-0-3)6
Biyoteknolojiye giriş, Biyoteknolojinin temel prensipleri, Metabolitlerin üretimi, Biyoteknolojinin
insan ve çevre açısından önemi.
Overview of biotechnology, Basic fundamentals of biotechnology, Production of biological metabolits,
Applications of biotechnology in human life and environment.
BIY718 Doku ve Sistem Fizyolojisi (Tissue and System Physiology) (3 0 3)6
Hücresel Fizyoloji. Sinir, kas ve özel duyuların fizyolojisi. Endokrinoloji ve üreme Memeli
hayvanlarda ve insanda solunum. Kan ve canlılarda madde taşınması. Metabolik olayların
düzenlenmesi.
Cellular physiology, Nervous and muscle physiology, Special sensory systems, Endocrinology,
Reproduction, Respiration of animals and human, Blood, Transport of biomolecules in organisms,
Regulation of metabolic processes.
BIY756 Tohumların Tıbbi ve Farmakolojik Özellikleri (Medical and Pharmacological
Properties of the Seeds) (3 0 3)6
Tohumun gelişimi ve yapısı, Tohumların tedavi amaçlı kullanılması(Etnobotanikteki yeri), Tohumda
bulunan maddeler(Yağ asitleri, Antioksidanlar, İnorganik bileşenler vs.),Sağlık açısından tohumların
önemi(Kardiyovasküler,Metabolimiks,Kanser vs.), Tohumlardaki toksinler, Tohumlardaki alerjenler,
Tıbbi ve farmakolojik etkileri için kullanılan tohumlara örnekler.
Seed development and structure, Therapeutic Use of Seed (Ethnobotanic Position), material in the
seed (fatty acids, antioxidants, inorganic components, etc..), The importance of the seeds to health
(cardiovascular, Metabolimiks, cancer etc..), toxins, allergens in the seeds, examples of the seed used
for pharmacological and Medical effects.
BIY758 Bitkilerde Hücre Farklılaşması ve Ölümü (Differentiation and Cell Death in Plants) (3
0 3)6
Bitkilerde Hücre Farklılaşması ve Ölümü’ne giriş(Senesens, yaşlanma,Programlı hücre ölümü),
Bitkilerde hücre farklılaşması, Bitkilerde hücre ölümü, Alevron ve skutellum, Ksilem, Aerankima,
Absisyon zonları, Üreme organlarında hücre ölümü, Bitki hastalıklarında hücre ölümü, Senesensde gen
ekspresyonu, Etilen sinyali, Jasmonatların strese cevapta ve gelişim süreçlerindeki rolü, yaprak
senesensi, tüm bitki senesensi
Bülent Ecevit University, Faculty of Sciences and Arts, Department of Molecular Biology and Genetics, 67100,ZONGULDAK,TURKEY
Tel: +90.(372).2574010 - Fax: +90.(372).2574181 - e-mail: [email protected] - http://web.beun.edu.tr/mbg
Introduction to Plant Cell Differentiation and death input (senescence, aging, programmed cell death),
Plant cell differentiation in plant, cell death in plant, alevrone and skutell, I xylem, Aeranki me,
abscission zones, cell death in reproductive organs, cell death in plant diseases Senesensd gene
expression, Ethylene signal, Jasmonate role in response to the stress and the development process, leaf
senescence, the whole plant senescence.
MBG797 Yüksek Lisans Seminer (M.Sc. Seminar) (0 2 0)3
Belirli bir konuda birden fazla kaynağa dayalı bir inceleme yapılması, yazım kurallarına uygun bir
yazılı metin haline getirilmesi ve bir dinleyici topluluğuna sözlü olarak sunulması. Sözlü sunuşlarda,
karşılıklı bilgi alışverişine yönelik tartışma alışkanlıklarının edinilmesi.
The Course offers the M.Sc. students to prepare a text with a proper format by investigating literatures
and to give an oral presentation to their departmental academic staff. The oral presentations enable the
students to gain ability in interactively transfering knowledge and disscusion.
MBG798 Yüksek Lisans Uzmanlık Alanı (M.Sc. Field of Specialization) (2 0 0)15
Yüksek Lisans öğrencileri için danışmanın atanmasını takiben yarıyıl, ara tatil ve yaz tatillerinde
açılan teorik bir derstir. Yüksek Lisans öğrencilerine bilimsel etik ve çalışma disiplini
kazandırılmasını sağlar.
This is a theorical course offerred in semestre, semestre break and summer terms followed by
appointment of the advisor for M.Sc. students. It provides M.Sc. students to obtain scientific ethic and
discipline.
MBG799 Yüksek Lisans Tez Çalışması (M.Sc. Thesis Research) (0 1 0)15
Yüksek Lisans öğrencileri için danışmanın atanmasını takiben yarıyıl, ara tatil ve yaz tatillerinde açılan
pratik bir derstir.
This is a practical course offerred in year, semestre, semestre break and summer terms followed by
appointment of the advisor for M.Sc. students.
Bülent Ecevit University, Faculty of Sciences and Arts, Department of Molecular Biology and Genetics, 67100,ZONGULDAK,TURKEY
Tel: +90.(372).2574010 - Fax: +90.(372).2574181 - e-mail: [email protected] - http://web.beun.edu.tr/mbg