moleküler genetġk analġz raporu

GENETİK HASTALIKLAR TANI MERKEZİ
MOLEKÜLER GENETĠK ANALĠZ RAPORU
Tanımlama
CYP2C19 (cytochrome P450 2C19) klinik olarak kullanımda olan ilaçların %5-10'unun
(antikonvülzan, ülser, antideprasan) metabolizmasında rol oynar. Bu nedenle, CYP2C19
için heterozigot veya homozigot polimorfizm saptanan hastalarda ilgili ilaç gruplarında
doz ayarlaması yapılması önerilmektedir. CYP2C19 bölgesinde ilaç metabolizmasında
etkili olduğu gösterilen birçok polimorfizm saptanmıştır.
Kullanılan Teknik
İncelenen örnekten elde edilen DNA materyaline
kromozom 10 üzerinde yer alan CYP2C9 gen bölgesi
*2, *3, *4 ve *17 polimorfizmlerinin gözlendiği
bölgelere spesifik primerler kullanılarak PCR analizi
yapılmıştır. Daha sonra elde edilen PCR ürününe
otomatik DNA sequencing (Floresan Teknolojisi) ile
CYPC19 geni 10. kromozomun uzun kolu (10q24) üzerinde yer alır ve 9 ekzondan oluşur. DNA dizi (sekans) analizi uygulanmıştır. Elde edilen
İlaç metabolizmasında etkili 2 polimorfizm saptanmıştır. Bunlar 5. ekzonda bulunan sekans örnekleri Gen Bankası Veri Tabanı'ndan elde
CYP2C9*2 (G681A) ve 4. ekzonda yer alan CYP2C9*3 (G636A) polimorfizmleridir
edilen normal bireye ait genom sekansı ve ilgili gene
ait mutasyon tablosu ile karşılaştırılmıştır.
Ġncelenen polimorfizmler:
Ad Soyad
: <Hasta AdıMMMM
Protokol No
: <Protokol No>
GeliĢ Tarihi
: 01.12.2010
Endikasyon
: İlaç sensitivitesi?
Ġncelenen Örnek
: Periferik kan
Rapor Tarihi
: 17.12.2010
Gönderen Doktor
: <Hasta AdıMMMMMMM
CYP2C19*1
CYP2C19*2
CYP2C19*3
CYP2C19*4
CYP2C19*17
wild tip (normal)
4681G>A (Splicing mutasyon)
636G>A (W212X)
1A>G (start kodon mutasyonu)
991A>G
Hastanıza ait periferik kan örneğinden DNA ekstraksiyonunu takiben yukarıda belirtilen
CYP2C19 polimorfizmleri için uygulanan DNA dizi analizinde elde edilen bulgular aşağıdadır:
Enzim
Sonuç
CYP2C19*2
WT/WT
CYP2C19*3
WT/WT
Genotip
Normal
1/*1
CYP2C19*4
WT/WT
CYP2C19*17
WT/WT
NM: normal metabolizör
IM: orta metabolizör
Fenotip
Metabolizör
PM: düşük metabolizör
*Test kapsamında olmayan polimorfizmlerin varlığı kiĢilerdeki fenotipin değiĢmesine neden olabilir.
Saygılarımızla,
Dr. Y.Hakan ÖZÖN
Tıbbi Genetik
Dr. Jülide CAFERLER
Tıbbi Genetik
*Bu analiz, DNA düzeyinde primerler ile belirlenen alanlar dışındaki mutasyonlar, büyük delesyonlar ve polimorfizmler ile UPD'i dışlamamaktadır.
*Genetiks Genetik Hastalıklar Tanı Merkezi, DNA dizi analizi (sequencing) ve mutasyon taraması için "Avrupa Moleküler Genetik Kalite Ağı
(European Molecular Genetics Quality Network - EMQN)" programına dahildir.
GENETĠKS SAĞLIK HĠZMETLERĠ TĠC. LTD. ġTĠ
Gayrettepe Mah. Bahar Sokak Baras Han No:4A 34349, Beşiktaş - İstanbul / TÜRKİYE
• T: +90 (212) 275 70 20 pbx • F: +90 (212) 275 70 08 • www.genetiks.com.tr • [email protected]
GENETİK HASTALIKLAR TANI MERKEZİ
CYP2C19 fenotipi ve doz önerileri
Fenotip
Genotip
Doz önerisi
Normal metabolizör (NM)
*1/*1
standart doz
Orta metabolizör (IM)
*1/diğer genotipler
etkili en küçük doz
Zayıf metabolizör (PM)
aktif allel (*1) içermeyen genotipler
3-5 kat doz azaltımı
*Yukarıda belirtilen doz önerileri pro-drug olan clopidogrel (Plavix) vb. ilaçlar için geçerli değildir.
CYP2C19 ile metabolize edilen ilaçlar*
Amitriptyline
Escitalopram
Moclobemide
Propranolol
Carisoprodol
Esomeprazole (düşük etkili)
Nelfinavir
R-warfarin
Citalopram
Fluoxetine (düşük etkili)
Omeprazole
Sertraline
Clomipramine
Flunitrazapam
Pantoprazole (düşük etkili)
Soma
Clopidogrel
Imipramine
Phenytoin
Trimipramine
Cyclophosphophamide (pro-drug)
Lansoprazole
Plavix
Vfend
Diazepam
Mephenytoin
Proguanil (pro-drug)
Voriconazole
*Substratlar ifadesi, CYP2C19 vasıtasıyla aktifleştirilen veya etkisiz hale getirilen ilaçlar anlamına gelir.
CYP2C19 inhibitörleri*
Chloramphenicol
Fluoxetine
Omeprazole
Ticlopidine
Delavirdine
Fluvoxamine
Oral contraceptives
Topiramate
Efavirenz
Isoniazid
Oxcarbazepine
Voriconazole
Felbamate
Lansoprazole
Prilosec
Fluconazole
Modafinil
Provigil
*İnhibitör ifadesi, CYP2C19 vasıtasıyla ilaçların işleme kabiliyetini azaltan ilaçlar anlamına gelir. Başka ilaçlar ile birlikte verilmesi,
ilaçların belirtilen metabolik yol vasıtasıyla metabolize edilme oranını düşürecektir ve bu da toksisite olasılığını arttıracaktır.
CYP2C19 indükleyicileri*
Ginko biloba
Rifampin
*Bir yolun aktivitesini arttıran ilaçları ifade eder. Başka ilaçlar ile birlikte verilmesi, belirtilen yol vasıtasıyla gerçekleşen metabolize
edilmiş ilaç ekskresyon oranını arttırır ve bu da ilacın etkinliğini azaltır.
GENETĠKS SAĞLIK HĠZMETLERĠ TĠC. LTD. ġTĠ
Gayrettepe Mah. Bahar Sokak Baras Han No:4A 34349, Beşiktaş - İstanbul / TÜRKİYE
• T: +90 (212) 275 70 20 pbx • F: +90 (212) 275 70 08 • www.genetiks.com.tr • [email protected]