MOLEKÜLER GENETĠK ANALĠZ RAPORU

GENETİK HASTALIKLAR TANI MERKEZİ
MOLEKÜLER GENETĠK ANALĠZ RAPORU
Tanımlama
Warfarin (Kumadin) arteriel ve venöz tromboembolinin tedavisinde çok sık kullanılan
antikoagülan ajanlardan bir tanesidir. Tedaviye bağlı kanama ise en sık karşılaşılan
ciddi ve ölümcül yan etkilerden birisidir. Warfarinin metabolizmasında karaciğerde
bulunan mikrozomal enzimlerden CYP2C9 (cytochrome P450 2C9) etkin rol alır.
CYP2C9 iki önemli varyanta sahip olup bu varyanların heterozigot veya homozigot
bulunması ilacın eliminasyonu yavaşlatır.
CYPC9 geni 10. kromozomun uzun kolu (10q23) üzerinde yer alır ve 9 ekzondan
oluşur. Warfarin metabolizmasında etkili 2 polimorfizm saptanmıştır. Bunlar; 3.
ekzonda bulunan CYP2C9*2 (C430T) ve 7. ekzonda yer alan CYP2C9*3 (A1075C)
polimorfizmleridir.
Kullanılan Teknik
İncelenen örnekten elde
edilen
DNA
materyaline kromozom 10 üzerinde yer alan
CYP2C9 gen bölgesi 3 ve 7. ekzonlarına
spesifik primerler ve C430T ve A1075C
bölgelerine spesifik wild type (Wt) ve mutant
Type (Mt) problar kullanılarak Roche
LightCycler 2.0 sistemi yardımı ile Real Time
PCR analizi yapılmıştır. Daha sonra elde
edilen PCR ürününe yine LightCycler 2.0
sistemi ile Melting Curve analizi uygulanmıştır.
Buradan sağlanan veriler pozitif ve negatif
kontrollerle karşılaştırılmıştır.
Ġncelenen polimorfizmler:
Ad Soyad
: <Hasta AdıMMMM
Protokol No
: <Protokol No>
GeliĢ Tarihi
: 15.12.2010
Endikasyon
: Kumadin Sensitivitesi?
Ġncelenen Örnek
: Periferik kan
Rapor Tarihi
: 22.12.2010
CYP2C9*1
CYP2C9*2
CYP2C9*3
Wild tip
430C>T (R144C)
1075A>C (I359L)
Gönderen Doktor : <Hasta AdıMMMMMMM
CYP2C9 10q23.33
Hastanıza ait DNA örneğinde CYP2C9*2 (C430T) ve CYP2C9*3 (A1075C) için uygulanan
Single Nucleotid Polymorphism (SNP) analizinde, elde edilen bulgular aşağıdadır:
CYP2C9*2 (C430T) : Homozigot Normal (WT/WT)
CYP2C9*3 (A1075C): Homozigot Normal (WT/WT)
Taranmayan bölgelere ait mutasyonlar ve hastalık olasılığı ile ilgili bilginin genetik danışma ile verilmesi önerilir.
Saygılarımızla,
Dr. Y.Hakan ÖZÖN
Tıbbi Genetik
Dr. Jülide CAFERLER
Tıbbi Genetik
*Bu analiz, DNA düzeyinde primerler ile belirlenen alanlar dışındaki mutasyonlar, büyük delesyonlar ve polimorfizmler ile UPD'i dışlamamaktadır.
*Genetiks Genetik Hastalıklar Tanı Merkezi, DNA dizi analizi (sequencing) ve mutasyon taraması için "Avrupa Moleküler Genetik Kalite Ağı
(European Molecular Genetics Quality Network - EMQN)" programına dahildir.
GENETĠKS SAĞLIK HĠZMETLERĠ TĠC. LTD. ġTĠ
Gayrettepe Mah. Bahar Sokak Baras Han No:4A 34349, Beşiktaş - İstanbul / TÜRKİYE
• T: +90 (212) 275 70 20 pbx • F: +90 (212) 275 70 08 • www.genetiks.com.tr • [email protected]
GENETİK HASTALIKLAR TANI MERKEZİ
CYP2C9/VKORC1 GENOTĠPĠ ve WARFARĠN DOZ AYARLAMASI
Genotip
Enzim Düzeyine
Etkisi
Normal
*1/*1
-
0
Heterozigot *2
*1/*2
inaktif
14-30
Homozigot *2
*2/*2
inaktif
28-47
Heterozigot *3
*1/*3
inaktif
28-70
Homozigot *3
*3/*3
inaktif
72-87
Compaund heterozigot (*2 ve * 3)
*2/*3
inaktif
58-81
Genotip
Enzim Düzeyine
Etkisi
Doz Azaltımı (%)
Normal
*1/*1
-
0
Heterozigot *2
*1/*2
azalmış transkripsiyon
20-28
Homozigot *2
*2/*2
azalmış transkripsiyon
40-50
CYP2C9 varyantları
VKORC1 varyantları
* Ġncelenen polimorfizmler (varyasyon):
* Kısaltmalar:
Doz Azaltımı (%)
Aralık
Ortalama
17
37
-
CYP2C9*2 (430C>T)
CYP2C9*3 (1075A>C)
VKORC1*2 (1639G>A)
WT/WT: normal
WT/MT: heterozigot taşıyıcı
MT/MT: homozigot hasta
CYP2C9 GENOTĠPĠ ve DĠĞER ĠLAÇ DOZ AYARLAMALARI
Genotip
Enzim Düzeyine
Etkisi
Doz Azaltımı (%)
Normal
*1/*1
-
-
Heterozigot *2
*1/*2
inaktif
20-60
Homozigot *2
*2/*2
inaktif
çok düşük doz
Heterozigot *3
*1/*3
inaktif
20-60
Homozigot *3
*3/*3
inaktif
çok düşük doz
Compaund heterozigot (*2 ve * 3)
*2/*3
inaktif
çok düşük doz
CYP2C9 varyantları
CYP2C9 ile METABOLĠZE EDĠLEN DĠĞER ĠLAÇLAR
Ġlaç
Sildenafil (Viagra)
Naproxen
Ibuprofen
Tolbutamide
Piroxicam
Tenoxicam
Tamoxife
Glipizide
Glucotrol
Sülfonilüre grubu ilaçlar
Tolbutamide
Piroxicam
Chlorpropamide
İndomethacin
Torsemide
Sertraline
Valproic acid
Flurbiprofen
Meloxicam
Diclofenac
Phenytoin
Glimepiride
Losartan
Isoniazid
Fluoxetine
Lescol
lornoxicam
Starlix
Phenobarbital (Luminal)
Fluvastatin
GENETĠKS SAĞLIK HĠZMETLERĠ TĠC. LTD. ġTĠ
Gayrettepe Mah. Bahar Sokak Baras Han No:4A 34349, Beşiktaş - İstanbul / TÜRKİYE
• T: +90 (212) 275 70 20 pbx • F: +90 (212) 275 70 08 • www.genetiks.com.tr • [email protected]