Avrasya Üniversitesi Bologna Süreci

AVRASYA ÜNİVERSİTESİ
Ders Tanıtım Formu
Dersin Adı
BİYOKİMYA I
Öğretim Dili
Türkçe
Dersin Verildiği Düzey
Ön Lisans ( )
Eğitim Öğretim Sistemi
Örgün Öğretim ( X)
Dersin Türü
Zorunlu (X)
Seçmeli ( )
Kuramsal Saat
4
Uygulama Saat
Lisans ( X)
Yüksek Lisans( )
Doktora( )
Uzaktan Öğretim( )
Diğer ( )
Dersin Alan Kodu
BKM
Ders Kodu
303
Toplam Saat
4
Yarıyılı
GÜZ
Ulusal Kredi
4
AKTS Kredi
6
Dersin Amacı
Biyolojik bilimlerde büyük reformlar gerçekleşmektedir ve biyokimya bu
gelişimlerin başında yer almaktadır. Biyokimya I dersi ile canlı materyalin
yapı, organizasyon ve fonksiyonu hakkında moleküler düzeyde bilgi
sağlamak temel hedeftir. Bu giriş dersinde; biyolojik bileşenlerin kimyası
ve biyolojik fonksiyon ile ilişkilendirilmesi ve biyolojik enformasyon
hakkında temel bilgilerin verilmesi amaçlanmıştır.
Dersin Özet İçeriği
Biyokimyaya giriş, biyolojik sistemlerde yapılanmalar, Biyomoleküllerin
yapı ve fonksiyonları; Aminoasitler, peptidler, proteinler, enzim,
koenzimler, nükleik asitler, biyokimyasal evrim, protein sentezi(DNA
replikasyonu, trankripsiyon ve translasyon) protein katlanması ve post‐
translasyonel modifikasyonlar detaylı olarak anlatılmaktadır.
Ön Koşul Dersler
Yok
Önerilen Seçmeli Dersler
Yok
Dersin Öğrenme Çıktıları
1. Canlı sistemlerdeki Biyomoleküllerin temel bilgilerini kullanabilme
becerisi
2. Biyomoleküllerin yapı, fonksiyon ve organizmal fonksiyonlarını
anlayabilme
3. Farklı biyomolekülleri tanıyabilme ve yaşam için vazgeçilmez
özelliklerini anlayabilme becerisi
4. Genetik bilgi depolanması, gen ekpresyonunu ve regülasyonunu
kavrayabilme
5. Biyolojik proseslerdeki reaksiyon mekanizmalarını anlayabilme
Dersin Koordinatörü
Dersin Öğretim Elemanı
Dersin Yardımcı Öğretim Elemanı
Öğretim Yöntemleri
(X) Sözel Anlatım
(X) Tartışma
(X) Problem Çözme
() Deney
( ) Örnek Olay
( ) Drama
( ) Buluş Yoluyla
( ) Proje
( ) Bilgisayar Destekli
() Laboratuvar
( ) ………………….
( ) ………………….
Ders Kitabı / Önerilen Kaynaklar
Lehninger Principles of Biochemistry”, 5 th Edn. Palgrave Macmillan,
(2008) Voet D., Fundamentals of Biochemistry: Life at the molecular
Level.(2008) Horton R., Principles of Biochemistry, Prentis Hall (2005)
Boyer R. Interactive Concepts in Biochemistry 2/e, Wiley (2008)
Yardımcı Ders Kitabı
1/4
AVRASYA ÜNİVERSİTESİ
Başarı Notunu Değerlendirme Sistemi
( ) Doğrudan Dönüşüm Sistemi
Ölçme ve Değerlendirme
Yarıyıl içi çalışmaları
Devam (a)
Laboratuar
Uygulama
Alan Çalışması
Derse Özgü Staj (Varsa)
Ödevler
Sunum
Projeler
Seminer
Kısa Sınavlar
Ara sınav
Toplam
Yarıyıl İçi Çalışmalarının Başarı
Notuna Katkısı
Yarıyıl Sonu Sınavının Başarı
Notuna Katkısı
TOPLAM
2/4
( X) Bağıl Değerlendirme
Sayısı
Katkı Payı %**
1
40
1
60
100
AVRASYA ÜNİVERSİTESİ
Haftalara Göre Ders Konuları
Hafta
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
Konular
Biyokimyaya giriş, sulu ortamlardaki zayıf etkileşimler, non‐kovalent etkileşimler,
biyolojik proseslerde suyun önemi, makroiyonların solüsyonlardaki etkileşimleri
Amino asitler; yapı/stereokimya, sınıflandırma ve yanzincirlerin özellikleri,
esansiyal amino asitler, amino asitlerin iyonizasyonları ve izoelektrik nokta, amino
asit reaksiyonları ve amino asit kompozisyon analizi, Peptidler: sınıflandırma,
peptid bağı ve yapısı; stabilite ve peptid bağı oluşumu, rotasyonlar,
konformasyonlar, peptidlerin poliampolit özelliği, Peptid N‐, C‐ Terminal analizi:
Sanger ve Edman Degredasyonu, Merrifield peptid sentezi, Biyoaktif Peptidler
Proteinler; fonksiyonel ve yapısal sınıflandırma, Protein yapısının organizasyonu,
Primer Yapı: protein dizilerinin tabiatı, Sekonder yapı: heliksler, tabaka yapılar, β‐
Döngü, düzensiz sarmal yapılar, stabilite, karakteristik özellikler, Ramachandran
eğrileri, süpersekonder yapı, protein motifleri ve domainleri
Tersiyer yapı:Tersiyer yapı oluşumunu etkileyen faktörler, Protein katlanmasının
termodinamiği, Şaperonlar, Denaturasyon, Kuarternar yapı:multimerik yapılar,
fibröz proteinlere örnekler; fibroin, keratin, kollogen, elastin, Protein izolasyon ve
saflaştırmasına genel bakış
Protein fonksiyonu: Oksijen transportu ve depolanması; Hemoglobin/Miyoglobin,
kooperativite ve allosteri, allosterik değişim modelleri, Allosterik davranışa diğer
ligantların etkileri, Bohr etkisi, İmmunoglobulinler: Antijenler ve antikorlar, motor
proteinler
Enzimler: Terminoloji, sınıflandırma ve genel özellikler, Katalizin prensipleri, enzim
kataliz kinetiği ve kinetik parametreler, enzim inhibisyonu, enzim aktivitesinin
düzenlenmesi, Enzim kataliz mekanizmaları, Ribozimler, Katalitik antikorlar,
enzimlerin endüstriyel ve medikal uygulamaları
Koenzimler, vitaminler ve esansiyal metaller; Sınıflandırma, metabolit ve vitamin
türevi koenzimlerin yapıları, enzim fonksiyonundaki rolleri, protein koenzimler,
Esansiyal prekürsör olarak vitaminler, suda ve yağda çözünür vitaminler
Ara Sınav
Nükleik asitler: Nükleik asitlerin tabiatı, primer, sekonder ve tersiyer yapıları; baz
eşleşmesi, ikili heliksler, dairesel DNA ve super sarmallar, Denaturasyon ve
renaturasyon, DNA’nın erime noktası, Nükleik asit dizi analizinin prensipleri;
Maxam‐Gilbert ve Sanger Metodu
Nükleik asitlerin biyolojik fonksiyonları, Moleküler biyolojiye bakış, genetik bilginin
depolanması, genom, merkezi dogma, terminology; recombinant DNA, PCR,
Southern Blotlama, genetik varyasyonlar ve mutasyonların belirlenmesi
Protein Biyosentezi; Gen ekspresyonuna genel bakış, Replikasyon: semikonservatif
replikasyon, replikasyon mekanizmaları,Telomerler ve telomerazlar, DNA hasarı ve
tamiri, mutasyonlar, Transkripsiyon: genler ve operonlar, trankripsyonun
regülasyonu ve inhibisyonu, intron ve ekzonlar, RNA prosesleme: caping,
yarılmalar, poliadenilasyon
Translasyon:genetik kod, kodon/antikodon etkileşimi, Wobble hipotezi ve baz
çiftleri, aktivasyon, başlama, uzama ve sonlanma, protein sentezinin kontrolü,
translasyon sonrası modifikasyonlar, proteolitik prosesleme, protein turnover ve
protein degredasyon sistemleri
Genel Tekrar
Final
3/4
Ön Hazırlık
AVRASYA ÜNİVERSİTESİ
DERSİN ÖĞRENME ÇIKTILARININ PROGRAM YETERLİLİKLERİ İLE İLİŞKİLENDİRİLMESİ
Dersin Öğrenme
Çıktıları *
01 02 03 04 05
Program Yeterlilikleri
PO 01: Biyokimya ile birlikte diğer fen bilimleri alanlarında temel bilgilere sahip
olabilme
PO 02: Biyokimya ile yaşam bilimleri arasında bağlantıyı kurabilme
PO 03: Biyokimya bilgisini moleküler biyoloji, genetik, tıp, biyoteknoloji, gıda,
kimya ve benzeri endüstriyel alanlarda alanlarında kullanabilme
PO 04: Biyolojik materyallerin toplanması, preparasyonu ve incelenmesi ile ilgili
laboratuar bilgi ve birikimine sahip olabilme
PO 05: Deney ve gözlem sonuçlarını analitik olarak analiz edebilme ve sonuç
çıkarabilme
PO 06: Bilgilerini açık ve anlaşılır bir şekilde aktarabilme yeteneğini kazanabilme
PO 07: Bilimsel yeniliklere açık olabilme ve kendi ilgi alanına uygulayabilme,
PO 08: Güncel bilgilere ulaşabilme ve öğrendiği bilgileri uygulama yeteneğine
sahip olabilme
PO 09: Klasik ve modern biyokimya literatürünü takip edip kullanabilme ve
meslektaşları ile iletişim kurabilecek düzeyde güçlü bir temel kazanabilme
PO 10: Ülkesine ve topluma karşı olan sorumluluklarının bilincine sahip olabilme
ve bilimsel etik kurallara göre davranabilme
PO 11: Biyokimyagerlerin istihdam edildiği alanlarda yapılan çalışmaları
anlayabilme, yorumlayabilme ve yürütebilme.
3
3
3
3
3
4
4
4
4
5
4
4
4
5
4
4
4
3
3
4
4
4
4
4
5
2
4
2
4
2
4
2
4
2
4
5
5
5
5
5
5
5
5
5
5
1
1
1
1
1
5
5
5
5
5
* 1: Çok düşük 2: Düşük 3: Orta 4: Yüksek 5: Çok yüksek
AKTS ( Öğrenci İş Yükü) Hesabı (Ortalama Saat)
Etkinlikler
Sayısı
Kuramsal Ders
12
Uygulamalı Ders
Ödevler
5
Sunum / Seminer hazırlama
2
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi (Ön
12
Çalışma, pekiştirme, vb)
Dönem Ödevi / Proje
1
Uygulama (Lab., Atölye, Arazi, PDÖ)
Diğer bilgi edinme çalışmaları
Kısa Sınav(lar)
Ara Sınav(lar)
1
Yarıyıl Sınavı
1
Ön Hazırlık
1
Etkinlik Süresi
4
Toplam İş Yükü
60
10
2
1
10
22
3
36
10
10
12
18
2
2
Toplam İş Yükü (Saat)
Yuvarla *Toplam İş Yükü (saat) / Haftalık İş Yükü (30)+ = Dersin AKTS Kredisi
4/4
14
20
172
6