Balkan Arboretumunda Dere, Gölet ve Çeşmenin Mikrobiyolojik analizi
advertisement
Balkan Arboretumunda Mikrobiyolojik analizi Dere, Gölet ve Çeşmenin Prof. Dr. Ece ŞEN T.Ü. Arboretumu Projesinde Önerdiğimiz Çalışmalar: 1. Arboretum alanındaki yüzeysel suların mikrobiyal kirliliğinin denetlenmesi ve patojen mikroorganizmaların klasik ve moleküler mikrobiyolojik yöntemlerle saptanarak çevreye etkilerinin belirlenmesi: Su ile bulaşan insan patojeni mikroorganizmalar klasik ekim teknikleri ve yeni moleküler tespit yöntemleri (Polimeraz Zincir Reaksiyonu, DNA probları gibi) ile saptanacak, suların kirlilik derecelerinin belirlenmesi klasik ve yeni kullanılmaya başlanan indikatör mikroorganizmalarla yapılacaktır. Bulunan patojenler izole edilerek antibiyotik ve dezenfektanlara direnç durumları incelenerek derenin ıslahı konusunda kullanılması gerekli yöntemler geliştirilecektir. Ayrıca yeni çıkan patojenler de araştırılarak Güllapoğlu deresinin çevredeki insanlara ve canlılara riskleri saptanacaktır. 2. Su kenarlarından ve bitki örtüsünden tarla fareleri, kaplumbağalar taşıyabilecekleri patojen mikroorganizmalar yönünden incelenerek, insanlara ve evcil hayvanlara hastalık bulaştırma risklerinin saptanması: Bu konularda tez projeleri yüksek lisans ve doktora öğrencilerime verilmiş olup Biyoloji Bölümü'de kurduğumuz araştırma laboratuvarında (zemin kat 101 no.lu laboratuvar) yeni alınan moleküler çalışmalara yönelik cihazlarla (Termal döngü cihazı, jel elektroforez cihazı, güç kaynağı, PZR kabini, immünoblot transfer cihazı, bakteriyolojik biyogüvenlik kabini , temiz izolasyon odası gibi) yapılacaktır. Trakya Üniversitesi Arboretumu Projesi ile ilgili ilk 6 Aylık Çalışmalarımız: Yüksek Lisans öğrencim Müjdat Özgür’ün, Edirne İlindeki Çevresel Sularda Kirlilik İndikatörü Mikroorganizmaların ve Yeni Çıkan Bakteriyel Patojenlerin Moleküler Yöntemlerle Saptanması’’ başlıklı tezi ve projesi (TÜBAP 2011/181) tamamlanmıştır. Bu proje kapsamında, Trakya Üniversitesi Balkan Arboretumu içinde bulunan yüzeysel sular ve Güllapoğlu deresi su örnekleri mikrobiyal kirlilik yönünden klasik ve moleküler yöntemlerle incelenmekte, klasik kirlilik indikatörü mikroorganizmaların yanısıra yeni indikatör bakterilerin varlığı da (Clostridium perfringens sporları) kantitatif olarak belirlenerek kirlilik dereceleri saptanmaktadır. Ayrıca Leptospira sp., Legionella sp. gibi yeni çıkan patojenlerin varlığı da RT PZR (real time polimeraz zincir reaksiyonu) araştırılmaktadır. Patojen tespitinde klasik besiyeri ekim yöntemlerinin yanında hızlı sonuç alınan moleküler yöntemler, patojenin varlığını gösterdiği gibi filogenetik analizle tür tayinine de olanak sağlamaktadır. Real-time polimeraz zincir reaksiyonu yöntemiyle de su numunelerinde antropojenik ve zoonotik kaynaklı patojenlerin tespiti çalışmaları devam etmektedir. Örneğin Leptospira sp. ve Legionella sp. gibi patojenlerin güvenilir ve hızlı yöntemlerle saptanması halk sağlığı açısından önemlidir. Çalışmamız bu konuda halk sağlığı ve çevre hijyeni yönünden önemli katkı sağlayacaktır. Klasik indikatör bakteriler (E.coli, total koliform, fekal streptokok, total jerm) ve yeni kullanımına başlanan bir kirlilik indikatörü olan kükürt indirgeyen Clostridium sp. saptanmasına dayanan incelemelerimiz devam etmektedir. İzole edilen bakterilerin antibiyotik ve dezenfektan direnç durumlarının incelenmesine yakında, gerekli malzemelerin alınmasıyla başlanacaktır. Real time polimeraz zincir reaksiyonu ile de klasik filtrasyon ve seçici, ayırt edici besiyerine ekim yöntemlerinde üretilen bakterilerin teyidi yapılmakta olup tür tayinleri yakında tamamlanacaktır.
