rekombınant dna teknolojisi , suç cinayet bilimleri ve bioteknoloji

advertisement
1
T.C
ERCİYES ÜNİVERSİTESİ
ECZACILIK FAKÜLTESİ
REKOMBİNANT DNA TEKNOLOJİSİ İLE İLAÇ
ÜRETİMİ
HAZIRLAYAN
ZÜBEYDE KATARTAŞ
DANIŞMAN
YRD. DOÇ. DR. DİLŞAD ONBAŞILI
Farmasötik Biyoteknoloji
Bitirme Ödevi
Mayıs 2011
KAYSERİ
i
“……………………………………………………………………………………………………
……………………………………..” adlı Bitirme Ödevi Erciyes Üniversitesi Lisansüstü Tez
Önerisi
ve
Tez
Yazma
Yönergesi’ne
uygun
olarak
hazırlanmış
ve
………………………………………… Anabilim Dalında Bitirme Ödevi olarak kabul
edilmiştir.
Tezi Hazırlayan
Danışman
Ad Soyad
Ad Soyad
İmza
İmza
……………………………ABD Başkanı
Ad Soyad
İmza
ONAY :
Bu tezin kabulü Eczacılık Fakültesi Dekanlığı’nın ………....… tarih ve
…………..……
sayılı kararı ile onaylanmıştır.
………. /……../ …..
Prof.Dr. Müberra
KOŞAR
Dekan
ii
İÇİNDEKİLER
Kabul onay.....................................................................................................................................i
Teşekkür ......................................................................................................................................iv
Özet ............................................................................................................................................... v
Abstract........................................................................................................................................vi
Şekil listesi.................................................................................................................................. vii
Kısaltmalar ............................................................................................................................... viii
1.GİRİŞ VE AMAÇ ..................................................................................................................... 1
2.GENEL TANIMLAR ............................................................................................................... 3
2.1.Rekombinant DNA Teknolojisinin Tarihçesi ve Tanımı .................................................... 3
2.1.1.Tarihçe ................................................................................................................................. 3
2.2. Rekombinant DNA’nın üretimi ........................................................................................... 7
2.2.3.Rekombinant DNA ve rekombinant DNA teknolojisi ..................................................... 8
2.2.1. DNA izolasyonu .................................................................................................................. 8
2.2.2.DNA’nın kesilmesi ve restriksiyon enzimleri ................................................................. 10
2.2.3. DNA’nın birleştirilmesi ve DNA ligazlar ....................................................................... 14
2.3.Klonlama vektörleri ............................................................................................................. 14
2.3.1. Plazmitler .......................................................................................................................... 15
2.3.2. Viral vektörler .................................................................................................................. 16
2.3.3. Kozmid Vektörleri ........................................................................................................... 17
2.3.4. BAC Vektöleri .................................................................................................................. 17
2.3.5. YAC Vektörleri ................................................................................................................ 18
2.4.Genin hücreye sokulması .................................................................................................... 19
2.5.Geni içeren hücrenin seçimi ................................................................................................ 19
2.6.Terapötik protein rekombinant üretimi ........................................................................... 19
2.7. rDNA’nın tıp ve eczacılık sektöründeki kullanımı .......................................................... 20
2.7.1. İnsülin üretimi .................................................................................................................. 21
2.7.2. Hayvanlarda farmasötik ürünler üretimi ...................................................................... 23
2.7.3. Rekombinant aşılar .......................................................................................................... 24
2.7.4. Adli tıpta kullanımı .......................................................................................................... 24
iii
2.7.5. Gen tedavisi ...................................................................................................................... 25
2.7.6. İnsan büyüme hormonu .................................................................................................. 26
2.7.7. Hemofili A hastalığı ......................................................................................................... 27
2.7.8. Interferon eldesi ............................................................................................................... 29
2.7.9. Eritropoetin ..................................................................................................................... 31
2.9.13. (G-CSF) nötrofil üretimini uyaran Granulocyte kolonlama uyarı faktörü .............. 31
2.9.14.İnterlökin ......................................................................................................................... 31
3.TARTIŞMA VE SONUÇ ....................................................................................................... 34
KAYNAKLAR ........................................................................................................................... 37
Özgeçmiş ..................................................................................................................................... 40
iv
TEŞEKKÜR
Bitirme ödevi çalışmalarımın her aşamasında benden bilgi ve deneyimlerini
esirgemeyen, değerli danışmanım Yrd. Dr. Dilşad Onbaşılı’ya, Berrak Dumlupınar
Altınsoy’a ve hayatımın her anında maddi manevi destekleri ile yanımda olan aileme
sonsuz teşekkürlerimi sunarım.
v
REKOMBINANT DNA TEKNOLOJİSİ İLE İLAÇ ÜRETİMİ
ÖZET
Modern biyoloji kavramıyla günümüzde ilk akla gelen tanımlardan olan Rekombinant
DNA ya da Rekombinant DNA teknolojisi, çoğunlukla farklı biyolojik türlerden elde
edilen DNA moleküllerinin, genetik mühendislikle kesilmesi ve elde edilen farklı
biyolojik kaynaklı DNA parçalarının birleştirilmesi işlemine ve bu işlem sonucu
üretilmiş olan yeni DNA molekülüne verilen isimdir.
Ökaryot genlerin yapı ve fonksiyonlarını anlamaya yönelik ayrıntılı moleküler
çalışmaları mümkün kılan bu teknoloji, araştırmaya farklı orjinlerden büyük DNA
moleküllerini izole etme, kesme, yapıştırma, çoğaltma, tanıma, yapısını değiştirme ve
canlı organizmalara tekrar geri kazandırma imkanı sağlamaktadır. DNA moleküllerine
yapılabilecek sayısız müdaheleler sayesinde fenotipten genotipe ulaşılarak yeni bir
genetik analiz yaklaşımıda elde edilmiştir. Yine bu teknoloji ile yeni varyantlar
oluşturulup, genlerin etki düzeyleri değiştirilmekte, yeni genler eklenip, gen analizi
yapılabilmektedir.
Bu araştırmada, rekombinant DNA teknolojisini ana hatları ile tanıtıp bazı uygulama
alanları anlatılacaktır.
Anahtar sözcükler: Rekombinant DNA teknolojisi, rekombinant DNA, rDNA,
restriksiyon enzimleri
vi
ABSTRACT
Definitions come to our mind that the concept of modern biology today is the first
recombinant DNA or recombinant DNA technology, DNA molecules are mostly
derived from different biological species, genetic engineering, cutting and joining of
DNA fragments obtained from different biological process and the new DNA molecule
is produced as a result of this transaction is the name given .1970 'with the enzyme in
the two different restriction enzymes, ligases, such as the discovery of concepts, this
technology has emerged
Structure and function of eukaryotic genes, this technology makes it possible to
understand the detailed molecular studies, the study of DNA molecules isolated from
different origins to a large, cut, paste, duplicate, recognition, change the structure of
living organisms and provides the possibility of bringing back the skin. DNA molecules
can be done thanks to the numerous interventions genotype phenotype was obtained by
reaching a new approach to genetic analysis. With this technology created new variants
of genes influence levels replaced, the new genes added to the gene analysis can be
done.
In this study, recombinant DNA technology to introduce some of the main lines
applications will be explained
Keywords: Recombinant DNA technology, recombinant DNA, rDNA, restriction
enzymes
vii
ŞEKİL LİSTESİ
ŞEKİL 1:Rekombinant DNA teknolojisiyle ilaç üretimi .............................................................. 8
ŞEKİL 2: Rekombinant DNA teknolojisinin işlem basamakları .................................................. 9
ŞEKİL 3: Restriksiyon enzimleri kesim noktalarının yerine bağlı olarak yapışkan veya kütuçlu
fragment verebilirler. ................................................................................................................... 13
ŞEKİL 4: Restriksiyon enzimi fragmentleri jel elektroforezi yardımı ile birbirlerinden
büyüklüklerine göre ayrılır. ......................................................................................................... 14
ŞEKİL 5: Plazmid vektör ............................................................................................................ 17
ŞEKİL 6: YAC vektör ile kaynak DNA ..................................................................................... 20
ŞEKİL 7: Rekombinant plazmit oluşumu ................................................................................... 29
ŞEKİL 8: İmmünoafinite kromatografisi yöntemiyle saflaştırma .............................................. 31
viii
KISALTMALAR
DNA
:Deoksiriboznükleik asit
rDNA
:Rekombinant DNA
E.coli
:Escherichia coli
SDS
:Sodyum dedosil sulfat
cDNA
:Komplementer-tamamlayıcı DNA
PZR
:Polimeraz zincir reaksiyonu
EPO
:Eritropoetin
RNA
:Ribonükleik asit
GDO
:Genetiği değiştirilmiş organizma
mRNA
:Messenger RNA
A.B.D
:Amerika Birleşik Devletleri
TPA
:Plazminojen dokusu aktive ettirici
SCID
:Ağır kombine immun yetmezlik,
HBsAg
:Hepatit B virüsüne karşı hormon
RF
:Replikatif form
S.cerevisiae
: Saccharomyces cerevisiae
TPA
: Aktive ettirici plazminojen dokusu
Kb
: Kilobayt
GH
: İnsan büyüme hormonu
FDA
: Food and Drug Administration
IFN
:İnterferon
PG
:
AML
:
Piyoderma Gangrezum
Akut
myeloid
lösemi
:
1
1.GİRİŞ VE AMAÇ
Rekombinant DNA (rDNA)
molekülleri ilk olarak 1972 yılında Stanford
üniversitesinde bulundu (32). Bu kavram klasik biyoloji haricinde modern biyolojinin
de ortaya çıkmasına sebep oldu. Klasik biyoloji ökoryotlarda ki bilinmeyenlerde çözüm
üretememekteydi. Ökoryot gen ve yapıları anlamaya yönelik çalışmalarda rDNA ’nın
bulunması çok önemli katkı sağladı ve halen de sağlamaktadır (22).
Biyolojik değişimler ve genetik olayların gelişimine paralel olarak rekombinant DNA
teknolojisinde birçok ilerleme yaşandı. Yeni teknolojilerin gelişimi, biyokimyasal
tanımlı proteinlerin çoklu üretimi ile sonuçlanmakta olup, gerek tıp sektöründe gerekse
de
eczacılık
sektöründe
büyük
potansiyel
yaratmıştır.
Rekombinant
DNA
teknolojisindeki süratli gelişme gen aktiviteleri ile ilgili çalışmalar yapmak için yeni
fırsatlar ortaya çıkarmıştır. Bununla birlikte moleküler biyoloji ve genetik mühendisliği
alanında yapılan çalışmalarla, gen aktarım teknolojilerinin önemi gün geçtikçe
artmaktadır (8).
Bu teknoloji ile genlerin analizi, değişimi yapılmaktadır. Artık fenotipten genotipe
değil, genotipten fenotipe ulaşılabilmektedir. Doğada olmayan varyantların oluşumu,
genlerin etki düzeylerinin değişimi, organizmalara yeni gen aktarımı vs. gibi birçok
önemli olay gerçekleştirilmektedir. Bu ilerlemeler tabi ki eczacılıkta ve tıpta da önemli
yer kazanmaktadır (21). Tıpta, birçok genetik bozuklukların ve hastalıkların teşhis ve
tedavisinde önemli rol oynamaktadır. Eczacılıkta ise, farmasötik ürünlerin üretiminde
önemli rol oynamaktadır (2).
2
Rekombinant DNA teknolojisinin tıp bilimine olan etkileri, son yirmi yıl içinde kalıtsal
hastalıklara neden olan nükleotid değişimlerinin tanımlanması üzerinde yoğunlaşmış ve
büyük başarılar elde edilmiştir. Günümüzde ise kanser, psikiyatrik, kardiyovasküler ve
hormonel hastalıklar gibi sık rastlanan hastalıkların gelişiminde önemli bir yer tutan bu
teknoloji,
bireyler
arasındaki
metabolik
farklılıklardan
kaynaklanan
nükleotit
değişimleri de tanımlayabilmektedir (8).
Biyofarmasötik sektör genel olarak moleküler biyoloji tekniklerine bağlı olup,
manipülasyon için genetik mühendisliğini ve terapötik makromoleküllerden üretimini
taban alır. Onaylı biyofarmasötik ürünlerinin çoğunluğu rekombinant yöntemlerle
üretilmiş hücre hatlarında üretilen proteinlerdir. Örnekleri bir mühendislik hayvan
hücresinde doğrultusunda eritropoetin (EPO) üretimi gibi rekombinant E. coli ve
rekombinant S.cerevisiae üretimi içerir (8).
Rekombinant DNA teknolojisinin diğer bir avantajı ise, zaman ve maliyet tasarrufuna
izin vermekle beraber üretim sayısını da arttırmış olmasıdır. Bu durum ticari olarak da
teknolojinin kullanılmasını teşvik etmektedir.
Bu
çalışmamızdaki
amacımız,
rekombinant
DNA
teknolojisinin
kullanımı,
uygulamaları, işlem aşamalarını ve bu teknolojinin önemli elemanlarını inceleyip tıp ve
eczacılık alanındaki faydalarını araştırmaktır.
3
2.GENEL TANIMLAR
2.1. Rekombinant DNA Teknolojisinin Tarihçesi ve Tanımı
2.1.1.Tarihçe
Dünyada hayatın başladığı kabul edilen 4.6 milyar yıl önce, DNA yaşamın hücresel
metabolik aktivasyonlarını ortaya koyan genetik yapı olarak hizmet etmiştir.”GEN”
terimi 1900 lü yıllara kadar kullanılmamasına rağmen genin fonksiyonu ile olan
araştırma 1800 lü yıllarda başlamıştır. Gregor Mendel, Avusturyalı din adamı,
manastırın bahçesinde yıllarca çalışmış, farklı bezelye varyetelerini melezlemiştir (1,
17, 31).
1972 yılında Stanford Üniversitesi’nde bu enzimler kullanılarak ilk “rekombinant”
DNA molekülleri elde edilmiştir (32).
Rekombinant DNA teknolojisi özellikle 1960'lı yılların sonlarına doğru DNA ile ilgili
bazı enzimlerin etki mekanizmalarının anlaşılması sayesinde gerçekleştirilen bir dizi
yöntemleri kapsamıştır. Bununla birlikte bu süreç 1940'lardan 70'lere kadar moleküler
biyolojinin gelişmesini sağlayan bilgi birikimini de rekombinant DNA teknolojisinin
temelini oluşturmuştur (1).
Genetik çeşitlenme olaylarının yapay olarak gerçekleştirilmesi esasına dayanan
rekombinant DNA teknolojisine (rDNA) ilişkin ilk çalışmalar, 1973 yılında başta Cohen
olmak üzere bir araştırma grubunun önderliğinde in vitro koşullarda gerçekleşmiştir.
Buna göre doğada eldesi imkânsız olan yeni gen düzenlemelerinin yapımı bu
teknolojiyle sağlanabilmekte, bir canlının genotipi önceden belirlenebilmekte ve
4
yönlendirilebilmektedir. In vitro koşullarda oluşturulan yeni DNA moleküllerine
önceleri "kimera" (aslan başlı, keçi gövdeli ve yılan kuyruklu mitolojik bir yaratık) adı
verilmiştir. Bu kimeralar, birbirleriyle ilişkili olmayan ve farklı kökenler ait genleri
içeren rekombinant DNA molekülleridir (1).
Rekombinant DNA teknolojisi 1980' li yıllarda dev adımlarla ilerlemiş ve günümüzde
adından en çok bahsedilen ve moleküler genetikte devrim yaratan bir bilim dalı
olmuştur (22).
Özellikle 1985' de ortaya atılan bir veya iki hücreden elde edilen DNA' nın birkaç saat
içersinde çoğaltılarak 24 saatte genetik tanının konmasına olanak sağlayan Polimeraz
zincir tepkimesi (PCR) rDNA teknolojisi için belki en büyük gelişmelerden biri olarak
kabul edilebilir (3 , 4).
Rekombinant DNA teknolojisinin tarihçesi, ana hatlariyla kronolojik olarak şu sekilde
verilebilir.
1869 - Friedrich Miescher hücre çekirdeginden izole ettigi asit karakterli maddeye
"Nükleik Asit" adini vermistir. 1861'de Gregor Mendel ilk kez genlerin varligini
bezelyelerde yaptigi çalismalarla ileri sürmüstür. 1869'da da Ren nehrinde bir sazanin
sperminde DNA'nin bulunmasi; DNA Rekombinant Teknolojisinin baslangicini
olusturmuştur. 1868'de Haeckel spermin nükleer (çekirdeksel) materyelden olustugunu
belirterek; hücre çekirdeginin kalıtımdan sorumlu oldugunu ileri sürmüstür.
1909-Cinsiyet kromozomlarinin keşfi.
1910 - Thomas Morgan tüm kalıtsal özelliklerin kromozomlardan kaynaklandığını
göstermiştir.
1941 - Bir genin, bir tek proteini kodladığı gösterildi (Beadle ve Tatum).
1944 - DNA'nin genetik bir molekül oldugu ve bakterinin kalıtımını değiştirme
yeteneğinin
oldugu
belirlenmistir.
(Avery,
MacLeod,
McCarthy;
A.B.D.)
1946 - Bakteride genetik rekombinasyonun oluşturulması.
1949 - Orak hücreli aneminin, genetik olarak belirlenmesi.
1950 - Chargraff, DNA’nın adenin, guanin, sitozin, timin ve deoksiriboz'dan oluştuğunu
göstermişti.
1953 - DNA’nın komplementer helikal yapısının hipotezi ortaya atılmıştır. "Nature"
5
isimli dergide, Nisan 1953'de J.D.Watson ve F.H. Crick yaklaşık 1000 kelimelik bir
tetmişlerdir. McClintock transposable elemanları tarif etti.
1956 - DNA’nın genetik bilgiyi, baz dizileri ile aktardığının genetik deneylerle
saptanması gerçekleştirilmiştir. Tjio ve Leuan, insanda 46 kromozom olduğunu
belirlemişti.
1957 - John Kendrew, myoglobin proteininin 3 boyutlu yapısını saptamıştı.
1958 - DNA replikasyonunun, double heliksin komplementer dizilerinin ayrılması ile
olduğu belirlenmiştir. DNA polimeraz I'in izolasyonu (tüpte DNA yapımını olası kılan
enzim) gerçekleştirilmiştir.
1960 - RNA polimeraz (Tek zincir DNA üzerinde RNA zincirinin yapımını sağlayan
enzim.) keşfedilmiştir. Messenger RNA’nın, amino asitten protein sentezi için gerekli
olan bilgiyi taşıması bulunmuştur.
1961 - Sentetik mRNA molekülü (poly-U) genetik kodun ilk harflerinin çözümünde
kullanılmıştır.
1962 - Watson ve Crick'in, 1953'de yaptıkları DNA’nın yapısı ile ilgili çalışmaları
Nobel ödülünü kazanmıştır.
1965 - Küçük kromozomların (plazmid) antibiyotik direnç genlerini taşıdıkları
belirlenmiştir.
1966 - Genetik kodun çözümlenmesi tamamlanmıştır.
1967 - DNA Ligase enzimi keşfedilmiştir.
1968 - M. W. Nirenberg, genetik kodun belirlenmesindeki çalışmaları nedeni ile Nobel
ödülünü almıştır.
1970 - İlk Restriction Endonükleaz enzimi ve reverse transkriptaz enziminin keşfi
gerçekleştirilmiştir (W. Arber, H. Smith, D. Nathans).
1971 - Retinoblastomada iki vurus teorisi öne sürülmüştür. (A. G. Knudson).
1972 - İlk rekombinant DNA molekülü DNA Ligase ve Restriction Endonükleazlar
kullanılarak yaratılmıştır.
1973 - İlk klonlama plazmid vektörler kullanılarak gerçekleştirilmiştir (S. Cohen, H.
Bayer).
Rekombinant
DNA
tekniklerinin
potansiyel
olarak
tehlikeli
yeni
6
mikroorganizmaları
yaratabileceği
toplumda
tartışılmaya
başlanmıştır.
1974 - İlk kez rekombinant teknolojinin sınırlarının çizilme çalışmaları başlatılmıştır.
1975 - Spesifik DNA dizilerinin belirlenmesinde kullanılan Southern Blot teknigi
bulunmuştur. G. Köhler ve C. Mistein monoklonal antikorları üretmek üzere hibridoma
tekniğini tanımladılar.
1976 - Taq DNA polimeraz bulunmuştur.
1977 - DNA teknolojisi kullanılarak, ilk insan proteininin biosentezi gerçekleştirilmiştir.
İlk Genetik Mühendislik (Genentech; A.B.D.) firması kurulmuştur. Memeli DNA’sını
kapsayan rekombinant DNA molekülleri ilk kez yaratılmıştır. DNA moleküllerinin uzun
bölgelerinin incelenebilmesi için hızlı dizi analiz yöntemleri geliştirilmiştir (MaxamGibert Teknigi). Split genler keşfedilmiştir. İlk insan viral antijeni (hepatit B)
klonlanmıştır.
1978 - Restriction Endonükleazlar için Nobel Ödülü verilmiştir. Rekombinant teknoloji
ile bir hormon olan "Somatostatin'in üretimi gerçekleştirilmiştir. RFLP ile hastalığa
indirek yaklaşım modeli ileri sürülmüştür.
1979 - Onkologenlerin keşfi. Ayrıca DNA teknolojisi ile ilk teşhis gerçekleştirilmiştir.
(Y. W. Kan).
1980 - İnsülin sentezi için ilk fabrikanın yapımına başlanmıştır. DNA dizi analizi ve ilk
rekombinant DNA moleküllerinin yaratılması için Nobel Kimya ödülü verilmiştir.
1981 - Mitokondrial genomon dizisinin çözümlenmesi.
1982 - DNA teknolojisi ile üretilmiş ilk insan insülini, "Humulin" ismiyle piyasaya
verilmiştir.
1983 - Bakteriofaj lambda DNA’sının tüm dizisinin belirlenmesi tamamlanmıştır.
1985
-
"Polimeraz
Zincir
Reaksiyonu"
tekniği
gerçekleştirilmiştir
(Mullis).
Rekombinant teknolojisi ile üretilmiş ilk aşı olan "Hepatit B" asisi piyasaya verildi.
1986 - İnterferon-a'nin hairy-cell lösemide kullanımına izin verildi.
1988 - Transgenik Fare'nin (oncomouse) ABD'de patent aldı. İnsan Genom Projesinin
başlaması..
1989 - İlk kez genetik olarak yeniden yapılandırılmış lenfositler hastalarda
kullanılmıştır.
1990 - İlk Gen Tedavisi, ADA enzim eksikliği gösteren bir çocukta gerçekleştirilmiştir.
7
1992 - Üçlü nükleotid genişlemesinin yeni bir patojenik mutasyon şekli olduğu
gösterildi.
1993 - K. Mullis (A.B.D.) PCR tekniğinden dolayı Nobel Kimya Ödülünü; genetik
şifreyi yeniden programlayarak proteinin yapımını araştıran M.Smith (Kanada) ile
paylaşmıştır. Nobel Tip Ödülünü ise gen yapısının kesintisiz bir bütün değil, bölünmüş
olduğunu ve genlerin nasil çalistigini gösteren R. Roberts (Ingiltere) ve P. Sharp
(A.B.D.) almışlardır.
1995 - Nobel tip ödülünü erken dönem embriyo gelismesini kontrol eden önemli
genetik mekanizmaları bulan C. Nüsslein-Volhard, E.F.Wies Chaus ve E. B. Lewis
almışlar.
1997 - Helicobacter pylori genomunun tümüyle çözümlenmesi ve ilk kopyalama işlemi
koyunda gerçekleştirilmiştir (2, 17, 19).
2.2. Rekombinant DNA’nın üretimi:
Rekombinant DNA teknolojisinin esası çalışılan organizmadan izole edilen DNA’nın
ilgili parçasının restriksiyon enzimleri ile kesildikten sonra bakteri plazmidleri gibi,
kendisi çoğalabilen bir taşıyıcı DNA (vektör) içine entegre edilmesidir. Vektör DNA’sı
ve içine eklenen DNA parçasının oluşturduğu yeni DNA molekülüne rekombinant DNA
adı verilmektedir. Daha sonra bu molekül bakteri hücrelerine aktarılarak çok fazla
miktarda üretimi sağlanmıştır. Bu işlemde yaygın olarak her bir bakteri hücresine bir
rekombinant DNA molekülünü taşıyan tek bakteri kolonisi oluşturulur. Kolonideki her
bir bakteri aynı rekombinant DNA’yı taşıdığından bu bakteri populasyonuna DNA klonu
adı verilmiştir. Bu koloniye ait bakterilerin çoğaltılması ile istenen DNA parçasının
sınırsız miktarda üretimi sağlamıştır (4, 21).
Rekombinant DNA teknololjisi, bir canlıdan herhangi bir yolla yalıtılan bir genin uygun
bir konağın içerisine sokularak orada çoğaltılmasını ve bazen de ifade edilmesini
amaçlayan çalışmalara ait tekniklerin toplamına da denmektedir (1).
2.2.1.DNA izolasyonu
Rekombinant DNA üretiminin ilk aşaması, çalışılan organizma DNA’sı ve vektör
DNA’sının izolasyonudur. Genomik klonlama için yüksek moleküler ağırlıkta çekirdek
DNA’sının bitkisel veya hayvansal dokulardan izole edilmesi gerekir. Her ne kadar
izole edilen DNA daha sonra spesifik enzimlerle çalışılabilecek büyüklükte kesilse de,
8
izolasyon sırasında mekanik kırılmanın minumum düzeyde gerçekleştiğinden emin
olunmalıdır. Ayrıca, bu DNA organel DNA’sı, RNA ve daha sonraki çalışmaları
aksatacak, özellikle restriksiyon enzimlerinin çalışmasını durduracak, protein ve
polisakkarit gibi kirleticileri de içermemelidir (22).
İlaç Üretiminde
Rekombinant DNA Teknolojisi
İnsan
Hücresi
Hormon
DNAsı
Rekombinant
Plazmid DNAsı
Rekombinant
Bakteri Hücresi
Hormon
Bakteri
Hücresi
Plazmid
DNAsı
Rekombinant
Hayvan Hücresi
Rekombinant
Hormon
ŞEKİL 1: Rekombinant DNA teknolojisiyle ilaç üretimi (14)
Temelde DNA izolasyonu hücre duvarı ve / veya hücre zarının SDS (sodyum dedosil
sulfat) gibi deterjanlarla zayıflatılıp parçalanarak DNA’nın açığa çıkarılması, protein ve
polisakkarit gibi kirleticilerin fenol-kloroform gibi organik çözücülerle, RNA’nın da
RNaz enzimi ile ortamda uzaklaştırılması ve sonrasında DNA’nın tuz ortamında alkol
ile çöktürülmesi basamaklarından oluşmaktadır, fakat çalışılan organizmaya göre bazı
küçük değişiklikler söz konusu olabilir. Örneğin, bakteri duvarını parçalayan lizozim
enzimi bitki hücre duvarını parçalayamaz, bu nedenle izolasyon öncesinde bitkisel
dokuların sıvı azotta dondurulup pudra haline gelene dek öğütülmesi DNA miktar ve
kalitesini arttırma açısından önemlidir (22).
9
ŞEKİL 2: Rekombinant DNA teknolojisinin işlem basamakları (34)
Vektör DNA’larının izolasyon metotları, Sambrook ve ark. (1989) tarafından verilmiş
olup kullanılan vektör tiplerine göre bazı değişiklikler göstermektedir. En yaygın vektör
olan plazmitlerden DNA izolasyonu için kullanılan strateji genomik DNA
izolasyonunki ile aynıdır. Plazmitleri içeren bakteriler besi ortamında büyütülür,
santrifüjle toplanır, bakteri duvarları parçalanır, açığa çıkan DNA’dan proteinler ve
RNA uzaklaştırıldıktan sonra DNA etanolle çöktürülür. Fakat burada dikkat edilmesi
gereken konu plazmit DNA’sının bakteri kromozom DNA’sından ayrılması
gerekliliğidir. Çünkü plazmit DNA’sına çok küçük miktarda bakteriyel DNA karışması
dahi gen klonlama çalışmalarında istenmeyen sonuçlara yol açabilir. Bu nedenle,
plazmit izolasyonu sırasında bakteri DNA’sını ortamdan uzaklaştıran çeşitli metodlar
kullanılmaktadır. Bu metotlar plazmit DNA’sı ve bakteriyel DNA arasındaki yapı ve
büyüklük farklılığına dayanmaktadır. En sık kullanılanları alkali denatürasyonu ve
etidyum bromid-sezyum klorür yoğunluk gradienti santrifüjlemesidir (22).
10
Diğer bir vektör tipi olan fajların DNA’sı bakteri özütü yerine enfekte olmuş bakteri
kültürünün büyütüldüğü besi yerinden rahatlıkla izole edilebilir. Fakat böyle bir
kültürde milimetre başına düşen hücre dışı faj sayısının yeterince yüksek olması
gerekmektedir. Dolayısıyla yeterli miktarda DNA eldesi içinde 1 ila 2 litrelik kültürler
kullanılmalıdır. Santrifüjlenen kültürde bakteriler pellet halinde çökerken faj partikülleri
sıvı ortamda kalır. Bu aşamadan sonra faj partikülleri polietilen glikol varlığında
çöktürülür ve kapsidleri uzaklaştırılarak DNA açığa çıkarılır (22).
İzole edilen çekirdek ve vektör DNA’larının nanogram veya mikrogram cinsinden
miktarları spektrofotometrik yöntemle belirlenir. DNA kalitesi ve büyüklüğü ise agaroz
jel elektroforezi ile gözlemlenir (22).
2.2.2. DNA’nın kesilmesi ve restriksiyon enzimleri
Rekombinant DNA teknolojisi, DNA moleküllerini bir test tüpü içersinde manipüle
etme yeteneğidir. Bu yeteneğin kaynağı ise ticari olarak üretilen enzimlerdir. Hücre
içinde bu enzimler DNA replikasyonu, transkripsiyon, yabancı DNA’nın ortamdan
uzaklaştırılması, mutasyona uğramış DNA’nın tamiri gibi birçok önemli işlere katılırlar,
hücreden izole edildikten sonra da benzer ortam şartları sağlandığında aynı
reaksiyonları katalizlemeye devam ederler. Restriksiyon enzimleri olarak adlandırılan
ve bakterilerden izole edilen enzimler rekombinant DNA teknolojisinin vazgeçilmez
öğeleridir (14, 22).
Restriksiyon enzimi veya restriksiyon endonükleazı (kesme enzimi veya sınırlama
enzimi de denir) çift zincirli DNA moleküllerindeki belli nükleotid dizilerini tanıyan ve
her iki zinciri birlikte kesen bir enzim türüdür. Bu özel enzimler, bakteri ve arkelerde
bulunurlar. Bu enzimler virüslere karşı bir savunma mekanizması olan restriksiyon
modifikasyon sistemine aittirler. Bakteri içindeki görevleri hücre içine giren viral
kaynaklı DNA’ları parçalamaktır. Bu işlem sırasında bakterinin kendi DNA’sı zarar
görmez, çünkü başka bir enzim, metilasyon enzimi, tarafından metillenmiştir.
Metilasyon DNA’yı restriksiyon enzimlerin kesiminden korur ve hücrenin kendi
DNA’sını parçalamasını önler (32).
Restriksiyon enzimleri, moleküler biyolojide "makas" diye de tabir edilebilirler. Bu
enzimler kanat bölge arasında kalan bölgeyi çıkarır, işlem sonrası iki türlü parçalar
oluşur. Kesim noktaları simetri merkezinde veya dışında olabilir ve buna bağlı olarak da
küt veya yapışkan uçlu DNA fragmentleri verirler. Bazı restriksiyon enzimleri, Smal,
11
Haell gibi, çift kollu DNA’yı tanıma bölgelerinin orta kısımlarından keserek küt uçlar
oluştururken, EcoRI, HindIII gibi bazı enzimler de çift kollu DNA’yı tanıma
bölgelerinde 2 ya da 4 nükleotidlik tek zincirli uçlar oluşturacak şekilde kesmektedir.
Enzim kesim noktasına bağlı olarak tek kollu uçlar 5’ ucunda oluşabileceği gibi
3’ucunda da oluşabilir. İşte bu uçlara genel olarak yapışkan uçlar denir, çünkü aynı
enzimle kesilerek yapılmış yapışkan uçlar birbirinin tamamlayıcısı olduğundan bu
bölgelerden tekrar birleşebilirler. Bazı enzimlerin tanıma bölgeleri farklı olduğu halde
oluşturdukları yapışkan uçlar aynı nükleotit dizisine sahip olabilir. Sau3Al (tanıma
dizisi GATC) ve BamHI (tanıma dizisi GGATCC) enzimleri 5’- GATC-3’ yapışkan
uçlarını oluştururlar. Bunun anlamı Sau3Al ile kesilen bir DNA parçasının BamHI ile
kesilen diğer bir DNA parçası ile birleşebileceğidir. Bu özellik rekombinant DNA
teknolojisi için çok önemlidir. Bir DNA molekülünün aynı restriksiyon enzimi ile
kesilmesi halinde her zaman aynı fragmentleri elde edilir ve bu fragmentler değişik
amaçlarla kullanılabilir (şekil–3) (6).
Sayıları 1200 civarında bulunan restriksiyon enzimleri 3 farklı grupta toplanmıştır: Tip
I - II ve III. Bu enzimlerin tümü spesifik bir DNA dizisini tanırlar, fakat sadece Tip II
restriksiyon enzimleri DNA’yı tanıma bölgesinin içinden keserler. Bu grup enzimler
rekombinant DNA oluşturmada kullanılan en önemli enzim tipidir. Tip I ve III
enzimleri ise DNA’yı tanıma bölgelerinin dışından keserler ve genetik mühendisliğinde
kullanım alanları çok kısıtlıdır (22).
Tip II restriksiyon enzimlerinin tanıma bölgeleri 4–8 baz dizisi uzunluğunda olabilir.
Genelde bu tanıma bölgeleri palindromiktir, yani DNA’nın bir kolunda 5’→3’
yönündeki tanıma bölgesi dizisi, tamamlayıcı koldaki 5’→3’ tanıma bölgesi dizisiyle
aynıdır (32).
Bu enzimler, rekombinant DNA teknolojinin ana elemanlarından biridir ve bakteriyel
endonükleazlardan olan enzimlerdir. Bu enzimler çift zincirli DNA’yı özgül nükleotid
dizilerinden tanır ve keserler. Tanım bölgeleri 4 – 6 nükleotid genişliğinde olan
enzimler bu teknolojide özellikle tercih edilirler. Bugün tanıma bölgeleri ve optimum
çalışma koşulları bilinen 200’den fazla restriksiyon enzimi bulunmakta ve ticari olarak
sağlanabilmektedir. Bir restriksiyon enziminin tanıma bölgesi ne kadar geniş olursa,
DNA molekülü üzerinde tekrarlanma şansı o kadar azalır ve DNA bu enzimle kesildiği
12
zaman da daha az sayıda fragment elde edilir. Tanıma bölgesi incelendiği zaman
nükleotid sekansları yönünden bilateral simetriye sahip olduğu görülür (6, 22).
Enzimler
palindrom özellik
gösteren
yerlerde
4–6
çift
baz
içeren
diziler
oluşturmaktadır. Palindrom derken 5^→3^ okunma ve 3^→5^ okunma yönünde de aynı
diziyi ifade edebilmesidir. Örnek verilecek olursa ATAT dizisi palindrom özellik
göstermektedir. Makasların diğer özelliği ise Z çizerek kesmesidir (6).
Şekil 3: Restriksiyon enzimleri kesim noktalarının yerine bağlı olarak yapışkan
veya küt uçlu fragment verebilirler (6).
Hücresel DNA, restriksiyon enzimlerinden bir veya birkaçı kullanılarak parçalandığı
zaman, ortaya çıkacak fragmentlerden bir tanesi ilgilendiğimiz interferon genlerini
taşıyor demektir. Bu fragmentlerin birbirinden ayrılması jel elektroferezi ile sağlanır.
Tercihen agaroz jelde, elektrik akımının yardımı ile fragmentler büyüklüklerine göre
birbirinden ayrılırlar (şekil- 4) (6).
Kesilen gen parçaları plasmid DNA kullanılarak çoğaltılabilir. Bunun içinde plasmid
DNA'nın yanında konakçı bir bakteri hücresi olması da şarttır. Ancak bakterinin kendi
global DNA'sının üremesini durdurmak gerekir (6).
13
Şekil 4: Restriksiyon enzimi fragmentleri jel elektroforezi yardımı ile
birbirlerinden büyüklüklerine göre ayrılır (6).
Konak bakteri hücresinde restriksiyon enzimleri seçici olarak yabancı DNA’ları
keserler; bu sırada konak DNA’sı kesme enziminin etkinliğinden korunmak için bir
değiştirme (modifikasyon) enzimi (metilaz) tarafından metillenir. Bu iki süreç toplu
olarak kesme-değiştirme sistemi olarak bilinmektedir. Bir kesme enzimi DNA'yı
kesmek için; ilki DNA çift sarmalının her şeker-fosfat omurgasından (örn. her
zincirden) olmak üzere iki yarma (ensizyon) yapar (22).
Restriksiyon enzimleri tek başlarına gen klonlama için yeterli değildir. Aynı enzimle
oluşturulan yapışkan uçlar her ne kadar hidrojen bağları ile birbirlerine tutunsalar da
hidrojen bağları iki DNA parçasının kalıcı şekilde birleştirilmesi, rekombinant DNA
teknolojisi için önemli diğer bir enzim olan DNA ligaz tarafından gerçekleştirilir (22).
2.2.3. DNA’nın birleştirilmesi ve DNA ligazlar
Restriksiyon enzim kesimi ile oluşturulmuş aynı yapışkan uç dizisini taşıyan DNA
parçaları birbirleri ya da aynı restriksiyon kesim yapılmış başka DNA parçaları ile in
vitro şartlarda birleştirilebilir. Bu işlem DNA ligaz enzimleri ile gerçekleştirilir ve
ligasyon olarak bilinir. Ligaz enzimleri her hücrede bulunur, fakat labovatuarda
14
kullanılan ligazlar genelde ya normal E.coli hücrelerinden ya da T4 bakteriofajı ile
enfekte edilmiş E.coli hücrelerinden izole edilirler. Hücrede DNA ligazlar, DNA
replikasyonu sırasında oluşan fragmentlerini 3’- 5’ fosfodiester bağları ile birbirine
bağlamada ve hasarlı DNA’ların tamirinde görev alırlar. Rekombinant DNA
teknolojisinde ise ligaz enzimi ilgi duyulan DNA parçalarını vektör DNA moleküllerine
in vitro şartlarda kovalent bağlarla bağlayarak rekombinant DNA elde edilmesinde
kullanılır. DNA ligaz enzimi ATP varlığında birbirine geçici olarak hidrojen bağları ile
tutunmuş yapışkan uç taşıyan DNA parçalarından birinin 3’ hidroksil ucuyla, vektörün
5’ fosfat ucu arasında 3’-5’ fosfodiester bağı oluşumunu katalizler (22).
T4 DNA ligaz ile küt uç taşıyan DNA parçalarının da birleştirilmesi mümkündür. Fakat
birleşecek uçların karşı karşıya gelme ihtimali az olduğundan başarı düşüktür,
dolayısıyla çok yüksek DNA konsantrasyonları ile çalışılmasını gerektirir. Klonlama
çalışmalarında eğer klonlanacak DNA küt uçlu ise kısa çift iplikli adaptör ya da
bağlayıcı (linker) moleküller eklenir. Bu moleküller yapışkan uç meydana getiren,
vektör DNA ile uyumlu bir restriksiyon enzimi kesim bölgesi içerirler (22).
Buraya kadar DNA’ nın hedef organizmadan ve vektörden nasıl izole edildiğinden,
rekombinant DNA molekülünün nasıl oluşturulduğundan bahsedildi. Bundan sonra ise
rekombinant DNA eldesinin, molekül bir konakçı hücreye aktarılıp çoğaltılmadıkça bir
anlamı yoktur. Bu aşamada en önemli kriter çalışılacak gen parçasının taşınacağı uygun
bir klonlama vektörünün seçimidir.
2.3. Klonlama vektörleri
Normalde restriksiyon kesimleri ile oluşturulmuş DNA parçaları doğrudan bakteri
hücresine giremez. Dolayısıyla,
vektör adı verilen bakteri içinde bağımsız
çoğalabilecek başka bir DNA molekülüne eklenmesi gerekir. Klonlamada kullanılacak
vektörler bazı özelliklere sahip olmalıdır. İlk olarak, vektör molekülü küçük olmalı ve
bakteriden izolasyonu kolay olmalıdır. Vektör molekülü konakçıya uygun bir
replikasyon merkezi taşımalıdır. Aksi halde vektör bakteri içinde çoğalamaz. Vektör
DNA’sı üzerinde, ayrıca, vektörü taşıyan ve taşımayan konakçı hücreleri birbirinden
ayırt etmeye yarayacak kolayca belirlenebilen bir seçici belirteç gen (genel antibiotiğe
direnç geni, ya da konakçı da bulunmayan bir enzim geni) olmalıdır. Rekombinant
DNA moleküllerinin oluşturulmasında klonlanacak DNA’nın büyüklüğüne ve
15
çalışmanın amacına bağlı olarak çok farklı tiplerde klonlama vektörleri kullanılmaktadır
(22).
2.3.1. Plazmitler
Plazmitler, bakteri içersinde kromozom DNA’sından bağımsız olarak kendi kendine
çoğalabilen, çift zincirli, halkasal ekstra DNA molekülleridir. Plazmitler, doğal olarak
tüm bakterilerde bulunur ve taşıdığı genlerle bakteriye bazı ekstra özellikler kazandırır.
Örneğin, bazı bakteri plazmitleri, antibiotikleri inaktifleştiren enzimler kodlar.
Plazmitler klonlama çalışmalarında kullanılmak üzere değiştirilerek yukarıda bahsedilen
özellikler kazandırılır. Doğal plazmitlerden türetilerek kullanılan en yaygın plazmitler
pBR322 ve pUC vektörleridir (22).
Şekil 5: Plazmid vektör (14)
pBR322 genel amaçlı kullanılan en eski plazmit vektörüdür ve 4361 baz çifti
büyüklüğündedir. Yapısında seçici belirteç geni olarak amfisilin ve tetrasiklin
antibiotiklerine direnç genleri bulunur. Her iki gen içinde klonlamada kullanışlı
restriksiyon enzim kesim bölgeleri yer alır. Saflaştırılmış, kapalı pBR322 molekülleri
herhangi bir antibiotik direnç geni içinde bulunan enzim kesim bölgesinden kesildiğinde
yapışkan uçlu doğrusal DNA molekülleri meydana gelir. Bu doğrusal vektör
molekülleri çalışılan organizmadan izole edilmiş ve aynı enzimle kesilerek yapışkan uç
oluşturulmuş hedef DNA ile birleşebilir özelliktedir. Eğer kesim, tetrasiklin geni
içinden yapılıp hedef DNA molekülü eklenmişse tetrasiklin geni inaktif duruma geldiği
için bu vektörü taşıyan hücreler tetrasikline duyarlı olacaklarından ortamda seçilebilir
(22).
pUC vektör sistemleri daha da geliştirilmiş yapıdadır. Bu vektörler seçici belirteç geni
olarak antibiotiğe direnç geninin yanında E.coli B-galaktosidaz geninin bir parçasını
16
taşır. E.coli B-galaktosidaz geni içinde farklı restriksiyon enzim kesim dizileri taşıyan
birçok klonlama bölgesi bulunur. Bu bölgeye DNA klonlandığında genin yapısı bozulur
ve bu plazmitleri içeren hücreler B-galaktosidaz substratı X-gal içeren ortamlarda
çoğaltıldığında kolaylıkla seçilebilir. Plazmid vektörler 5-10 kb büyüklüğündeki DNA
parçalarının klonlanmasında etkin şekilde kullanılabilirler (22).
2.3.2. Viral vektörler
Plazmit vektörlerine 10 kb’dan daha büyük parçalarının etkin şekilde klonlanamaması
nedeniyle viral vektörler geliştirilmiştir. Bunlardan en yaygın kullanılanı bakteriofaj
lambda vektörüdür. Bir E.coli virusu olan lambda fajının genomu yaklaşık 45 kb
büyüklüğündedir ve bunun yaklaşık 15 kb’lık kısmı faj DNA’sının E.coli kromozomuna
entegrasyonunu sağlayan genleri içerir. Genomun ortasında bulunan bu bu restriksiyon
enzimleri ile çıkarılıp yabancı DNA, DNA ligaz enzimi yardımıyla eklenebilir. Faj
DNA’sı bu şekliyle de bakteriyi enfekte etme ve kendini bakteri içinde çoğaltma
yeteneğine sahiptir. Lambda genomu doğrusaldır, fakat cos bölgesi denilen, genomun
iki ucundaki 12 nükleotitlik tek kollu uçlar tamamlayıcı diziler taşıdığından bir biriyle
birleşir ve halkasal yapı oluşturur. Dolayısıyla deney tüpünde plazmitle aynı yolla
manipule edilerek transfeksiyon denilen bir yöntemle E.coli hücrelerine aktarılırlar (22).
Klonlama vektörü olarak geliştirilen diğer bir viral vektör de M13 bakteriofajıdır. Bu
virüsün bakteri hücresini enfekte eden tek zincirli DNA’sı bakteri içinde çift zincir
oluşturur. Replikatif form (RF) olarak bilinen bu çift zincirli molekül bakteriden izole
edilerek gen klonlamada kullanılabilir. Bu moleküller bakteri hücresine aktarıldığında
normal RF, DNA gibi davranır ve kendisinin dolayısıyla da taşıyacağı yabancı
DNA’nın tek zincirli kopyalarını oluşturur. M13 klonlama vektörleri tek zincirli DNA
molekülü gerektiren Sanger dna dizi analizi için yaygın olarak kullanılmaktadır. Viral
vektörlere 10–15 kb büyüklüğünde DNA parçaları parçaları rahatlıkla klonlanana
bilmektedir. Küçük bir E.coli plazmit vektörüne gama fajının cos dizisi eklenerek
oluşturulurlar. Cos dizisi vektörün protein kılıf içine paketlenmesi için gerekli sinyal
dizisidir. Bunun yanında bir kozmid vektörü bir replikasyon merkezi, bir antibiotiğe
direnç geni ve çoklu klonlama yeri içerirler. Restriksiyon enzimi ile kesilen bir kozmid
vektöre 35–45 kb büyüklüğünde DNA parçaları eklenebilir. Rekombinant kozmidler in
vitro paketleme ile faj partikülleri gibi bakteriyi enfekte etme özelliğine sahiptirler.
Fakat bakteri içine girdikten sonra yeni faj partikülleri oluşturmaz, bir plazmit gibi
17
replike olur. Dolayısıyla rekombinant DNA molekülleri faj plaklarından değil bakteri
kolonilerinden elde edilir (22).
2.3.3. Kozmid Vektörleri
Kozmid vektörler gama fajı ve plazmit DNA parçalarından oluşan hibrit vektör
sistemleridir. Küçük bir E.coli plazmid vektörüne gama fajının cos dizisi eklenerek
oluşturulurlar. Cos dizisi vektörün protein kılıf içine paketlenmesi için gerekli sinyal
dizisidir. Bunun yanında bir kozmid vektörü bir replikasyon merkezi, bir antibiotiğe
direnç geni ve çoklu klonlama bölgesi içerirler. Restriksion enzimi ile kesilen bir
kozmid vektöre 35–45 kb büyüklüğünde DNA parçaları eklenebilir. Rekombinant
kozmidler in vitro paketleme ile faj partikülleri içine paketlenir. kozmid DNA içeren
partiküller gerçek faj partikülleri içine paketlenir. Kozmid DNA içeren partiküller
gerçek faj partiküllerigibi bakteriyi enfekte etme özelliğine sahiptir. Fakat bakteri içine
girdikten sonra yeni faj partikülleri oluşturmaz, bir plazmit gibi replike olur. Dolayısıyla
Rekombinant DNA molekülleri faj plaklarından değil bakteri kolonilerinden elde edilir
(22).
2.3.4. BAC Vektörleri
Ökoryotik genomların analizini kolaylaştırmak amacıyla çok daha büyük DNA
parçalarının klonlanabileceği vektörler geliştirilmiştir. Bunlardan bir tanesi de E.coli Ffaktör plazmiti temel alınarak oluşturulan Bakteri Yapay Kromozomlarıdır. Bu vektörler
yaklaşık 100–300 kb büyüklüğündeki DNA parçalarını taşıyabilirler. Rekombinant
BAC vektörleri standart rekombinant plazmit vektörleri ile aynı yolla oluşturulurlar,
fakat normal transformasyon yoluyla bakteri hücrelerine aktarılamayacak kadar
büyüktürler. Bu nedenle BAC vektörlerin bakteri hücrelerine aktarımı Elektroporasyon
adı verilen bir teknikle gerçekleştirilir. Vektör DNA ve bakteri karışımı yüksek elektrik
akımına maruz bırakılarak vektörlerin bakteri plazma zarından geçmesi sağlanır. BAC
vektörleri düşük kopya aysısına sahip olduğundan taşıdıkları büyük DNA parçaları
kaybedilmeden nesiller boyu kalır. Bununla birlikte yine düşük kopya sayısı
özelliklerinden dolayı bakteri hücrelerinden izole edilen plazmit miktarı çok düşüktür
(22).
18
2.3.5. YAC Vektörleri
Çok büyük DNA parçalarının klonlanmasında kullanılan en popüler vektör sistemi
Maya Yapay Kromozomlarıdır. Bu vektörler kromozomlar temel alınarak hazırlanırlar.
Her ökoryotik kromozom hücre döngüsünün S fazında üzerinde bulunan sentromer, iki
telomer ve replikasyon bölgelerinin fonksiyonuyla etkin şekilde replike olur.
Dolayısıyla, bir YAC vektörü oluşturmak için de maya hücresi içinde fonksiyon
görebilecek iki telomer, bir sentromer ve bir replikasyon merkezine ihtiyaç vardır.
Bunlara ek olarak bir ya da iki seçici belirteç geni ile yabancı DNA’nın ekleneceği en az
bir enzim kesim noktası bulunmalıdır. YAC vektörleri maya hücrelerine direk olarak
aktarılamazlar,
öncelikle
maya
hücrelerinin
dış
duvarlarının
uzaklaştırılması
gerekmektedir. Yine de maya hücrelerine transformasyon başarısı ve klonlanmış DNA
eldesi düşüktür. Ayrıca bazı YAC vektör tiplerinde aktarılan DNA, replikasyon
sırasında yeniden düzenlenerek yeni dizi kombinasyonlarına dönüşebilmektedir. Tüm
bu dezavantajlara rağmen YAC vektörlerien büyük DNA parçası taşıma kapasitesine
sahiptir ve birçok genom projesinde fiziksel haritalama işlemlerinde yoğun şekilde
kullanılmaktadır (22).
ŞEKİL 6: YAC vektör ile kaynak DNA (11)
19
2.4. Genin hücreye sokulması
Genin hücreye sokulması, plazmid ya da virüslerle, füzyon uygulaması, kimyasal
yöntemlerle ve ya fiziksel yöntemlerle olmaktadır. Kimyasal yöntemde, Ca2(PO4)2
kullanılarak DNA tuzakladıktan sonra seçici bir ortamda yapılmaktadır. Fiziksel
yöntemde ise, hücre çekirdeğine sokulacak cam mikropipetlerle DNA injeksiyonu
yapılmaktadır. Bu yöntemle gen herhangi bir hücreye direkt olarak sokulabilmektedir
(34).
Fiziksel yöntemlerde, ya da eritrosit hayaletler (liderindeki hemoglobin ve diğer
proteinler boşaltılmış, bütünlüğü korunmuş eritrosit membranları) kullanılarak
içerdikleri DNA’nın hücre erimesi yöntemiyle diğer bir hücre ile birleştirilmesi yöntemi
olarak uygulanmaktadır (34).
2.5. Geni içeren hücrenin seçimi
Antibiyotiklere dirençlilik, seçici ortamlar hücre seçiminde etkilidir. Yabancı geni
içeren hücre seçildikten sonra uygun koşullarda saklanabilir ya da arzu edildiğinde adı
geçen geni üreten bir fabrika gibi kullanılabilir. Günümüzde değerli proteinlerin genleri
ekspresyon vektörlerine klone edilmiş olarak mevcuttur. Hatta çeşitli firmalardan ücreti
ödenerek temin edilebilmektedir (34).
2.6. Terapötik protein rekombinant üretimi
Bugün rekombinant protein üretim teknolojisiyle özellikle ilaç endüstrisi için çok sayıda
protein üretilmekte ve ilgili yöntemler optimize edilmektedir. Zira protein sentezinin
yüksek maliyeti nedeniyle, en verimli şekilde gen ifadesinin düzenlenmesi
gerekmektedir (35).
Bir rekombinant protein üretimi, yani bir canlı hücrede arzu edilen yabancı bir gen
ürününün büyük miktarda hedeflenen sentezi için çok sayıda ekspresyon sistemleri
vardır. Bunlar, iyi bilinen organizmalar veya hücre hatlarının bir serisi (bakteriler,
böcek hücreleri, mayalar, memeli hücreleri ) ile farklı promotorlar, seçimli markerler
ve gerekirse füzyon partnerli değişik vektörleri içine alırlar. Moleküler biyolojik olarak
bir rekombinant proteinin hazırlanması için, bir plazmid veya farklı bir vektör içine
kodlanan genin girişi gerekmektedir. Bu vektör daha sonra seçilen hedef hücreye
aktarılır (transformasyon veya transfeksiyon) ve konakçı hücre çoğaltılır. Promotora
20
göre genin ekspresyonu ya tüm çoğalma zamanı sırasında yada dışarıdan indüklenirse
belirli bir zaman peryodundan sonra meydana gelir. Uygun ekspresyon sisteminin
seçimi, yani en iyi gözüken ekspresyon vektörü/ konakçı hücre kombinasyonu işin ana
kısmını oluşturur. Seçim, proteinin daha sonraki kullanım amacına göre yönlendirilir
(33).
Gerek protein gerekse farklı farmasötik ürün üretiminde en sık E.coli kullanılmaktadır.
Çünkü genomu iyi bilinmekte, uygun suşu bulunabilmekte, kolay ve kısa sürede
klonlama yapılabilmekte, basit ve ucuz kültür ortamı sağlanabilmekte, patojen
olmamakta ve çok sayıda vektör bulabilmektedir (33).
Uygun ekspresyon koşulları altında rekombinant protein fazla miktarda üretilebilir,
ancak sürekli konakçı hücrenin kontamine edici proteinleri, üretime eşlik eder; bu
yüzden hemen hemen bütün kullanma amaçları için ekspresyon ürününün saflaştırılması
da dikkate alınmalıdır. Bu amaçla ekspresyon vektörünün uygun seçimi ve tasarımında
afinite kromatografik yöntemler geliştirilmiştir (33).
Bundan başka ilgili proteinin direkt veya füzyon proteini olarak ekspresyona uğrayıp
uğramıyacağı ve nerede ekspresyon ürününün lokalize olması gerektiğine karar
verilmelidir. Ekspresyon ürününün sekresyonu için gerekli olan N-terminal signal
peptid için araya sokulan DNA’nın kodlanıp kodlanmamasına bağlı olarak,
rekombinant protein salgılanmakta veya intraselüler olarak kalmaktadır (35).
2.7. rDNA’nın tıp ve eczacılık sektöründeki kullanımı:
DNA’nın labovatuar ortamlarında manipule edildikten sonra çeşitli vektörler
aracılığıyla aktif olcak şekilde organizmalara geri kazandırılması biyoloji biliminin
birçok alanında ufku genişletmiştir. Bilim adamları şimdi daha önce hayal dahi
edemedikleri araştırma ve ugulamaları gerçekleştirmektedir. Bu durum rekombinant
DNA teknolojisinin kullanıldığı moleküler biyoteknolojiyi geleceğin en önemli bilim
dalı yapmaka kalmamış, aynı zamanda çok büyük bir sanayi haline de getirmiştir.
Rekombinant DNA teknolojisinin bazı örnek uygulamaları ve açıklamaları aşağıda
belirtildiği gibidir (22).

İnsülin (Diyabet hastaları için)

Hayvanlarda farmasötik ürünler üretimi
21

Herbisitlere dayanıklı kültür bakterileri

Rekombinant aşılar

Adli tıpta kullanımı

Transplantasyon

Genetik Hastalıkların gen tabanlı çözüm yolu

Faktör 8 Hemofili A

Faktör 9 Hemofili B

İnsan büyüme hormonu (GH)

EPO (Anemi yani kansızlık tedavisi için)(eritropoeitin)

3 çeşit interferon

Çok sayıda interlökin

(G-CSF) nötrofil üretimini uyaran Granulocyte kolonlama uyarı faktörü

Plazminojen dokusu aktive ettirici (TPA)

(ADA) (SCID)

Angiostatin, Endostatin Kansere karşı yapılan denemeler

Paratroid hormonu

Leptin

Hücre (doku kültürü)

HBsAg (Hepatit B virüsüne karşı hormon) (9, 22)
2.7.1. İnsülin üretimi
Bu yöntem ile en önemli ve en çok yararlanılan ilaç üretimi, insan insülinidir; İlk 1921
de diyabet hastaları için kullanılan bu yöntem hayvanların pankreasından üretilen
insülinle olmuştur (8).
1980’lerin başında ilk olarak uygulanmaya başlayan insülin, genetik mühendisliğinin
ürünü olup sadece terapötik olarak denenmeye başlanmıştır. Düzinelerce biyoteknoloji
şirketi kurularak rekombinant DNA teknolojisi ile tıpta tedavi amacıyla kullanılan
22
proteinlerin yapımına başlanmış, genetik değişikliğe uğratılmış Escherichia coli (E.coli)
isimli bağırsak bakterisi tarafından üretilen insan insülini FDA tarafından onaylanarak
pazara sunulan ilk ürün olmuştur (31). Hayvanların pankreasından elde edilen insülinin
yanısıra son 10 yılda yarı sentetik yolla insan insülini elde edilmiş ve daha sonra genetik
mühendisliği ile bakterilere ve mayalara, insan insülin geni aşılanarak insan insülini
üretimi sağlanmıştır (31).
Şeker hastalarında bu insülinle tedavi sonrası antikorların oluşması, insülinin
biyosentezinin rekombinant DNA teknolojisiyle eldesinin önemini daha da artırmıştır.
Ayrıca E.coli de rekombinant DNA teknoloji kullanımı hem verimliliği artırmış (yani
üretimi daha kolay ve çoklu hale getirdi) hem de maliyetini yani insanlar için kullanım
fiyatını oldukça aşağı çekmiştir. Bu sayede biyosentetik insan insülinleri rekombinant
DNA teknolojisi ile üretilmekte ve şeker hastalarınca yaygın olarak kullanılmaktadır
(32) .
İnsülinler en basit biçimde kısa, orta ve uzun etki süreli olmak üzere etki sürelerine göre
sınıflandırılabilirse de enjekte edilen insülinin emilimi aynı kişide %25 oranında, kişiler
arasında ise %50 ye varan oranda değişkenlik gösterebilmektedir (31).
Bakteri DNA’larının ’’plazmit’’ adlı özel bir türü, özellikle molekül klonlamada
kullanılmaktadır. Plazmitlerin, üzerlerinde bol gen bulunan (antibiyotiklere direnç geni
gibi) küçük çembersel DNA molekülleri olup, bakterinin içinde, hiçbir sınıra bağımlı
olmaksızın, kendilerini eşleyebilir, kendi kopyalarını izole edilebilirler. Bu özelliklerden
dolayı, plazmitler molekül klonlamaya özellikle elverişli malzemelerdir. İkinci
yöntemde ise, plazmit molekülü çemberi bir restriksiyon enzimi ile kesilerek açılır. Bu
plazmit DNA’sı aynı biçimde ve aynı restriksiyon enzimi ile kesilerek, hayvan DNA’sı
ile bir araya getirilip karıştırılır. Bu karışıma ligaz eklenir ve böylece hayvan DNA’sı,
aynı biçimde aynı restriksiyon enzimi kesilerek, hayvan DNA’sı ile bir araya getirilip
karıştırılır. Bu karışıma ligaz eklenir ve böylece hayvan DNA’sı bir bakteri plazmidi
DNA’sına bağlanmış olur. Bu molekül, transformasyon denen bir süreçle bir bakteriye
ilave edilebilir. Tek bir rekombinant molekülü taşıyan tek bir bakteri hücresi, hızla
üreyerek kendisinin çok büyük sayılarda kopyasını hazırlayabilir. Bu şekilde hazırlanan
bakteri hücrelerinin ‘insülin’ gibi hayvansal proteini üretmesi sağlanabilir. Üretilen
genlerin bakteriden izole edilmesi kolayca gerçekleşebilir (23-32). Aktif insülinin
yapısına bakıldığında iki polipeptit zincirinden oluşan (a=20 a.a,B=30 a.a) bir
23
hormondur. İki zincir S-S bağları ile bir arada tutulur. İnsülinin gen mühendisliği ile
eldesi için değişik yaklaşımlar vardır. Bunlardan birincisinde somatostatin örneğinde
olduğu gibi A ve B zincirlerine karşılık gelen sentetik DNA dizileri yapılmıştır. Her dizi
bir ucunda BamHI ve diğer uçta EcoRI ile oluşturulan yapışkan uçlar taşımaktadır.
Ayrıca her birine laktoz promotoru takılarak Pbr322’nin EcoRI, BamHI kesim noktaları
arasına E.coli’ye verilmiş sentezlenen A ve B zincirleri kimyasal tepkime sonucu S-S
bağları ile bir araya gelerek aktif insülini oluştururlar. Bu sıra doğrudan genomik DNA
olabilir fakat protein kodlaması için mRNAdan da hareket edilebilmektedir. İkinci
yaklaşımda; izole edilen insülin mRNA’sında ters transtriptaz enzimi ile cDNA yapılır.
Uç kısımlara cD eklenerek kuyruklanmıştır. pBR 322 plazmidi de PstI noktasından
kesime uğratılarak dG ile kuyruklandıktan sonra hazırlanan cDNA bu vektöre
eklenmiştir. Elde edilen rekombinant vektör E.coli’ye verildiğinde proinsülin (ekstra
sinyal peptidi taşıyan A+B zinciri) ampisilinaza bağlı olduğundan E.coli tarafından
hücre dışına salgılanır (32).
Ampisilinazın çıkarılmasından sonra elde edilen proinsülinin sinyal peptidi enzimatik
yoldan ayrılarak aktif insülin elde edilir. Hedef terapötik protein ökaryotik ise, sonra
sadece cDNA ekzon yanması olacak ise genomik DNA hem kodlanmış hem de
kodlanmamış diziler içerebilir (32).
İnsan insülini insanlardan elde edilmez, insan vücudunun yaptığı insülin moleküler
yapısı ile aynı olacak şekilde üretilir. En modern insülin tipidir ve labovatuvar
koşullarında tamamıyla aynısı olduğu için kullanıldığında vücudun bu insüline karşı
tepki gösterme olasılığı hayvan insülinlerine göre çok daha azdır (32).
2.7.2. Hayvanlarda farmasötik ürünler üretimi
Bakteri sistemleri prokaryot olduğundan ökoryot tabiattaki yüksek canlılara ait
proteinlerin üretiminde ciddi problemler ortaya çıkmaktadır. Prokoryot sistemleri,
ökoryot sistemleri modifiye edemezler ve tam fonksiyon için gerekli olan şekerleri ve
fosfat gruplarını ekleyemezler. Daha da önemlisi proteinini fonksiyonu için mutlak
gerekli olan protein kıvrılması ve bunun sonucunda ortaya çıkan üç boyutlu yapı,
prokaryot hücrelerde iyi bir şekilde oluşmaz. Bu nedenle alfa -1 -antitripsin enzimi gibi
bazı insan proteinleri hayvan sütünde üretilecek şekilde mühendisliğe tabi tutulurlar. Bu
enzimin yetersizliği Avrupa soyundan insanlarda bir solunum rahatsızlığı olan
emfisema hastalığını meydana getirmektedir. Bu enzimi kodlayan insan geni, bir süt
24
proteini genine eklenmiştir. Süt proteini genine ait promotor yeni genin sütte sınırlı
olarak üretilmesini sağlamaktadır. Yeni kimerik gen in vitro döllenmiş koyun
yumurtasına mikroenjeksiyonla aktarılır. Daha sonra bu döllenmiş yumurta taşıyıcı
koyuna aktarılır. Ortaya çıkan transgenik koyunun sütünde yüksek konsantrasyonda
fonksiyonel alfa–1-antitripsin üretilmektedir. Bu transgenik koyunlardan oluşan küçük
bir sürü protein böylece bir kimyasal fabrika olarak çalışmaktadır (22).
2.7.3. Rekombinant aşılar
Aşılar bağışıklık sisteminin bir zararlıya karşı antikorlar üretmesini tetiklemektedir.
Klasik aşılar öldürülmüş ve ya üreyemez hale getirilmiş canlı organizmalardan elde
edilmektedir. Rekombinant DNA teknolojisi ile üretilen aşılar ise virüs ve ya bakterinin
yüzey proteinlerinden bir veya birkaçını taşımaktadır. Bu protein veya proteinler,
bağışıklık sistemini harekete geçiren antijenler olarak iş görmektedir. Bu şekilde tescil
edilen ilk aşı Hepatit B virüsünün bir yüzey proteinini taşıyan aşıdır. Bu proteini
kodlayan gen bir maya ekspresyon vektörüne klonlanmıştır. Maya sistemi kullanılarak
ticari boyutta aşı üretimi yapılmaktadır. Bu ve diğer birçok proteinin bitkilerde
üretilmesi
şeklinde
çalışmalarda
gerçekleştirilmiş
ve
böylece
bitkisel
aşılar
geliştirilmiştir (22).
HBV genomunun 1979 yılında klonlanmasına ve nükleotid dizisinin okunmasına
takiben özellikle yüzey antijeni ‘HBsAg’ içeren aşı elde etme çalışmaları başlatılmıştı.
E.Coli ekspresyon sistemlerinde elde edilen rekombinant proteinlerin özellikle ‘a’
epitopunun doğru üçüncül yapısının sağlanamaması yüzünden koruyucu antikor eldesi
sağlanamamıştır. 1982 yılında ‘S’ bölgesini içeren HBsAg’ ni bir mantar hücresi olan
‘S. cerevisiae’ de eksprese edilmiştir. Bu rekombinant proteinin maymunlarda ve daha
sonra insanlarda gerçekleştirilen deneysel HBV infeksiyonuna karşı koruyucu
immunglobulin üretecek etkiye sahip olduğu gösterilmiştir. Bu yalnızca ilk hepatit aşısı
değil, ayrıca insanlık tarihinde uygulamaya sokulan ilk rekombinant aşı olma özelliğini
taşımaktadır (35).
Saccharomyces cerevisiae mantar hücresindeki bu başarıyı diğer mantar hücreleri
ekspresyon sistemleri ile olan aşı denemeleri takip etmiştir. Bunların içinde özellikle iki
tanesi ‘Pichia pastoris ve Hansenula polymorpha ‘ mantar hücreleri yüksek verimli
sonuçlar vererek gelişmekte olan ülkelerdeki aşılama çalışmalarında maliyeti azaltma
yönünden umut vericidir (35).
25
2.7.4. Adli tıpta kullanımı
Polimeraz Zincir Reaksiyon (PZR) teknolojisindeki gelişmeler DNA’nın adli tıpta çok
etkin bir araç olarak kullanımını gündeme getirmiştir. Bir damla kurumuş kandan, bir
saç telinin dibindeki hücrelerden veya çok küçük doku parçalarından elde edilen
DNA’nın karakterini ortaya çıkarmak mümkün olmaktadır. Bu amaçla orta kısmı, farklı
insanlarda büyük ölçüde değişiklik gösteren ancak ortanın iki tarafında yüksek derecede
benzerlik gösteren DNA bölgeleri kullanılmaktadır. Benzerlik gösteren bölgelerden
geliştirilen DNA başlatıcıları ile yapılan DNA sentezi sonunda elde edilen yapılan suç
mahallinden ve şüpheli şahıslardan elde edilen DNA’larla karşılaştırılmaktadır. Bu
şekilde beş ve ya daha fazla bölgenin kullanılmasıyla 100.000 de bir veya milyonda bir
hata ihtimali ile suçlular belirlenmektedir. Bu bölge sayısının daha da artırılması ile hata
ihtimali daha da düşürülmektedir (22).
2.7.5. Gen tedavisi
Ökoryotik gen klonlaması, ökoryotik gen ifade vektörlerinin oluşturulması ve memeli
hücrelerine gen aktarma teknolojilerinde ki gelişmeler genetik hastalıkların gen tabanlı
tedavisinin gerçekleştirilebileceği fikrini oluşturmuştur. Gen tedavisi, teorik olarak bir
genin DNA dizisindeki mutasyonlardan kaynaklanan hastalık fenotipinin, mutasyonlu
bazların ilgili genin doğal DNA dizisindekilerle yer değiştirmesi ve hasta bireye
aktarılması sağlıklı fenotipin bireye kazandırılmasıdır. Günümüzde bu yöntem, somatik
hücreler üzerinde gerçekleştiriliyor ise, somatik gen tedavisi olarak ifade edilmektedir.
Somatik hücreler üzerinde yapılmasının temel sebebi, gen tedavi yönteminin henüz tam
kontrollü olarak yapılamaması yani geliştirilme evresinde olmasıdır. Ayrıca insan eşey
hücre gen tedavisinin bireyin gelecek nesilleri üzerinde oluşturabileceği sonuçlarının
henüz bilinmemesi, günümüz bilimsel ahlak kurallarınca mümkün değildir. Sonuç
olarak somatik gen tedavisi ile sadece belli dokuların genetik bozukluklarının tedavisi
mümkündür. Yapılan deneyler bu dokunun tamamının transgenik yapılmasının
gerekmediğini, belli bi miktar hücrenin transgenik hale gelmesinin tedavi için yeterli
olabileceğini göstermiştir. Çeşitli genetik hastalıkların gen tabanlı tedavisi için iki temel
yaklaşım geliştirilmiştir. Bu yaklaşımlar ex vivo gen tedavisi ve in vivo gen tedavisidir
(22).
26
2.7.6. İnsan büyüme hormonu
İnsan büyüme hormonu şu an piyasada bulunan ilaçların en önemlilerinden biridir. Ve
gen transferi teknolojisi sayesinde büyük ilerlemeler kaydedilmiştir. Aksi takdirde
rDNA teknolojisi olmadan önce büyüme hormonu, ceset yani kadavradan nakledilmiştir
(8). Bu durumda deli dana hastalığı gibi birçok hastalığa ve çeşitli enfeksiyonlara
sebebiyet vermekteydi. Bu sebeplerden dolayı birçok hasta bu yöntemi kullanmak
istememiştir. Bu hormon 191 farklı amino asit bileşen kalıntı ihtiva etmektedir (8).
İnsan büyüme hormonu da üretim olarak insüline çok benzemektedir (5). Restriksiyon
enzimlerini kullanarak “gene splicing” DNA’nın istenilen bölgesinin kesilip çıkarılması
ve kesilen parçanın ligaz enzimi kullanılarak “vektör’’adı verilen taşıyıcı bakterinin
plazmidine yapıştırılması işlemlerini içermektedir. Daha sonra plazmid bakteri içine
yerleştirilerek rekombinant DNA’nın normal hücresel aktivitesine devam etmesini ve
ayrıca klonlanan genin ürününün o organizmada yüksek seviyede ifade edilmesini
(sentezlenmesini) de sağlamaktadır (8).
Bilim adamları, istedikleri geni ister tek hücreli, ister çok hücreli, isterse hücresiz
(virüs türü)
bir canlıdan yalıtmış olsunlar, bir bakterinin (örneğin E.coli'nin)
plazmidinin kestikleri bölgesine yapıştırarak, onu bakteri hücresine yerleştirmişlerdir.
Böyle bir bakteri hücresi, 15 saatte 1.000.000,000 sayıya ulaşacak biçimde hızla
çoğalırken, rDNA'nın sentezlediği protein türünü de istenildiği kadar elde etme
olanağını
sunmaktadır.
Böylece
bakteriler
organik
kimya
fabrikaları
gibi
çalıştırılmışlardır. Ayrıca, aynı maddenin sentezi, o bakterinin sokulduğu bitkide ya da
hayvanda da sürecek, sokuşturulan gen, bakteriyi kullanarak, o bakterinin daha önce
sentezlemeyi bilmediği proteinleri yetkinlikle sentezlemeye başlayacaktır (31).
Son elli yıldır somatotropinlerin (büyüme hormonunun) süt sığırlarına enjekte edildiği
takdirde süt verimini artırıcı (galaktopoietik) etki yaptığı bilinmektedir. Ancak bu
hormonun galaktopoietik etkisi üzerine derinlemesine araştırmalar, 1980 li yıllardaki
rekombinant DNA tekniğindeki gelişmelerin bir sonucu olarak mümkün olabilmiştir.
Eksojenik sığır büyüme hormonunun galaktopoietik etkisi ilk defa 1937 yılında Rus
bilim adamları Asimov ve Krouze tarafından tesbit edilmiş ve aııterior pituitaıy
bezinden elde edilen extrakdın süt verimini artırdığı belirlenmiştir. Bu bulgular birçok
araştırmacı tarafından yapılan çalışmalarla desteklenerek, süt verimini artırıcı etkinin
27
laktasyonun süt veriminin düşmeğe başladığı (maksimum noktadan sonraki) devrede
daha etkin olduğu belirlenmiştir. Bir süre sonra bu galaktopoietik bileşiğin sığır anterior
pituitary bezinde bulunan büyüme hormonu olduğu belirlenmiştir, İkinci dünya savaşı
boyunca İngiliz bilim adamlan açlık problemini çözmek için somatoropinlerin eksrakte
edilmesi için çalışmalarını yoğunlaştırmalarına rağmen ekstraksiyon işleminin pahalı ve
200 adet sığır pituitary bezinden ancak 1 ineğin bir günlük ihtiyacı olan büyüme
hormonunun üretilebilmesi nedeniyle vazgeçilmiştir. Bu nedenle ancak kısa süreli
araştırmalarda kullanılmak üzere büyüme hormonunun üretimi yapılmış ancak pratiğe
intikal edememiştir (35).
ŞEKİL 7: Rekombinant plazmit oluşumu (18)
2.7.6. Hemofili A hastalığı
Hemofili A hastalığı 10.000 de 1 ortaya çıkan ve geni içerisindeki mutasyonlardan
kaynaklanan bir hastalıktır. Hemofili A hastalığı kan içerisindeki FVIII düzeyine göre 3
değişik tipte sınıflandırılmaktadır ve bu Hastalığı gösterenlerin yarısından çoğu ağır tip
28
İmmünoafinite kromatografisi yöntemiyle saflaştırma
1. Faktör VIII'in, yalnızca Faktör VIII proteinine bağlanan antikorları içeren
silindirden geçirilmesi.
2. Antikorlar Faktör VIII'i silindir içerisinde tutarken, gereksiz olan ve istenmeyen
proteinler de ortamdan uzaklaştırılmış olur.
3. Saf Faktör VIII'in antikorlardan ayrılması sağlanır. Faktör VIII'ler toplanır ve
dodurularak kurutularak ürün son haline getirilir
ŞEKİL 8: İmmünoafinite kromatografisi yöntemiyle saflaştırma (12)
29
Hemofili A sınıfına girmektedir. Geni çok büyük bir gen olup (~180 kb) yapısal
olarakta kompleks bir yapı göstermektedir (26 Ekzon). Bu gen X kromozomunun uzun
kolu üzerinde Xq28 pozisyonunda yer almaktadır. Hemofili A hastaları insan kanından
veya modifiye edilmiş hücre kültürlerinden elde edilen rekombinant FVIII in periyodik
olarak damardan kana verilmesi ile tedavi edilmektedir. Son yıllarda hastalığın in vivo
ve ex vivo gen terapisi yöntemleriyle tedavisi alanında önemli gelişmeler elde edilmiştir
(12-13).
Bu rekombinant DNA teknolojisi eczacılık endüstrisinin son 30 yıldaki büyümesine çok
yarar sağlamıştır. Bu fenni gelişimler ve atılımlar tıp endüstrisine değişim ve dönüşüm
şekliyle değer katmaktadır.
2.7.8. Interferon eldesi
İnterferonlar hedef hücreler üzerinde antiviral, antitümöral ve immünmodülatör etki
gösteren moleküllerdir. Antijenik, biyolojik ve kimyasal özellikleri dikkate alındığı
zaman interferonlar üç grup halinde toplanabilirler. Lökosit veya alfa interferon (IFN-a),
fibroblast veya beta interferon (IFN-b) ve immün veya gama interferon. Bu üç sınıf
interferon molekülü hemen hemen tüm memelilerde mevcuttur. İnterferon a ve b aside
dirençli ve virus tarafından indüklenebilen moleküller olduğundan bunlar hakkında daha
fazla çalışma yapılabilmiş ve bilgi edinilmiştir. Bu iki tip inter cDNA feronun
rekombinant DNA teknolojisiyle sentezlenmiş olması sayesinde yapıları ve aktiveteleri
açıklanabilmiştir. IFN-gama ise diğer interferonlarla kros reaksion vermeyen, aside
dirençsiz farklı bir moleküldür (5-6).
Rekombinant interferon; hücrelerde bulunan interferon genlerinin izole edilip veya in
vitro şartlarda sentezlenip, uygun taşıyıcı sistemler yardımıyla bakteriye aktarılması ve
bu genlerin bakteride çoğaltılarak interferon molekülünün sentezlenmesi sağlanmıştır.
Bu sentezde restriksiyon enzimleri önemli görev almaktadır. Sonraki işlem restriksiyon
enzimleri, büyüklüklerine göre ayrıldıktan sonra prob kullanılarak interferon genini
taşıyan fragmentin saptanmasıdır. Prob olarak radyoaktif işaretli interferon mRNA sı
veya cDNA kullanılabilir. Memeli genomuna ait genlerin bakteriye aktarılıp, bakterinin
genleriymiş gibi çoğaltılması olayı gen klonlaması olarak bilinmektedir. Ancak, memeli
genomundan elde edilen genler, bakteride çoğalsalar bile her zaman bakteride ekspresse
olmamaktadır. Çünkü bakteri ve ökoryotlarda genetik bilginin aktarımı sırasında farklı
mekanizmalar işlemektedir. Genetik bilginin akımı sırasında, mRNA’nın sentezini
30
takiben ‘RNA splicing’ adı verilen bir mekanizma ile proteine çevrilmeyen intron
bölgeler çıkarılmakta ve geri kalan ekzon bölgeler birleştirilerek olgun mRNA
sentezlenmektedir. Oysaki bakteride böyle bir mekanizma bulunmadığından, memeli
gen fragmetleri doğrudan bakteriye aktarılacak olursa, intron bölgelerin çıkarılarak
fonksiyonel proteinin sentezlenmesi söz konusu değildir. Bu nedenle intron bölge içeren
genlerden ürün elde etmek söz konusu olduğu zaman intron bölge içermeyen genler
sentetik olarak oluşturulmaktadırlar (6).
Rekombinant interferonlar her iki metodla da elde edilebilir. Alfa ve beta interferon
genleri intron bölge içermediği için interferon sentezleyen hücrelerden mRNA izole
edilip kısmi purifikasyonu yapıldıktan sonra revers transkriptaz enzimi ve DNA
polimeraz yardımı ile cDNA hazırlanmaktadır. Bu cDNA’lar içermediği için bakteride
proteine çevrilebilmektedirler. Değişik metotlarla hazırlanan interferon genlerinin
bakteriye aktarılması ise özel vektörler aracılığıyla gerçekleştirilmektedir. Vektör olarak
kromozomdan bağımsız çoğalabilen sitoplazmik plazmid veya viral DNA’lar
kullanılmaktadır (6).
Interferon alfa E.coli’de ilk kez üretildiği zaman hücre başına 50 molekül interferon
eldesinin büyük başarı olarak değerlendirilmesine karşın, rekombinant DNA
teknolojisindeki gelişmelere paralel olarak bu miktar artmış ve ilk verimin bin katına
çıkmıştır. Bu bakterileri verimli birer interferon fabrikası haline getirebilmek için
değişik yöntemler uygulanmakta ve genin çalışmasını hızlandıracak özel promotor
diziler de rekombinant vektörlere eklenerek 1 lt E.coli kültüründen mg düzeyinde
interferon elde edilebilmektedir (6).
Doğal kaynaklardan elde edilen IFN-alfa ve beta moleküllerinin bir kısmı glikoliz
moleküllerdir. Bakteride sentezlenen interferonlar ise şeker ünitesi içermemektedirler.
Glikolizasyonun antiviral aktivite için gerekli olmaması rekombinant interferonların
önem kazanmasında rol oynamıştır. Glikolize olmayan alfa ve beta interferonlar
antiviral aktivite gösterebilmektedirler. Söz konusu immün interferon olduğu zaman
şeker ünitesi aktivite için şart olduğundan bakteride sentezlenen moleküllerin in vitro
glikolizasyonu ve aktivasyonu gerekmektedir. Doğal ve rekombinant interferonlar
yapısal olarak karşılaştırıldığında göze çarpan diğer bir özellik ise rekombinant lökosit
interferonun, doğal interferondan 10 amino asit daha eksik olmasıdır. Bu fark aktiviteyi
etkilememektedir (6).
31
2.7.9. Eritropoetin
Eritropoetin (ya da EPO) eritrositler (alyuvar) için sitokin görevi gören bir glikoprotein
hormondur. Hematopoetin ya da hemopoetin olarak da adlandırılmaktadır. Böbreklerde
üretilmekte ve eritrosit üretiminin kontrolünden sorumlu tutulmaktadır (36).
Eritropoetin, memeli hücre kültüründe rekombinant DNA teknolojisi ile üretilerek
tedavi amaçlı olarak da kullanılmaktadır. Böbrek yetersizliğine ya da kanser
kemoterapisine bağlı anemilerin (kansızlık) tedavisinde de yeri vardır. Ayrıca bisiklet
yarışı, triatlon ve maraton koşusu gibi dayanaklılık gerektiren sporlarda doping amacı
ile suiistimal edilmektedir (36).
2.7.10. (G-CSF) Granulocyte kolonlama uyarı faktörü
Granülosit koloni uyarıcı faktör (G-CSF), insanlarda fibroblastlar, endotel hücreleri,
makrofajlar, akut myeloid lösemi (AML) hücreleri gibi çeşitli hücreler tarafından veya
rekombinant DNA teknikleri ile üretilen bir hematopoetik büyüme faktörüdür. Nötrofil
yapımını uyardığı için, kemoterapiye bağlı nötropeniyi veya diğer nötropenik durumları
iyileştirmek için kullanılmaktadır. G-CSF kullanımına bağlı farklı deri reaksiyonları
bildirilmiştir ( 20).
Rekombinant DNA teknolojisi halen, gıda olarak kullanılan bitkilerde hepatit B yüzey
proteinini üretmek için kullanılmaktadır. Burada yatan fikir, bitki yapraklarının ya da
meyvelerin ağız yoluyla alınan bir aşı kaynağı olarak kullanılmasıdır. Kronik
nötropenili hastaların koloni uyarıcı faktörlerle ile tedavisi ile ilgili ilk çalışmayı
Komiyana yapmıştır. Subkutan G-CSF tedavisi ile absolü nötrofil sayısının 3000/mm3
üzerinde korunması sağlanmıştır. Yapılan çalışlmalarda bu tedavinin ağır konjenital
nötropenili hasta çocukların nötrofil sayıları üzerindeki etkisi teyit edilmiş, aynı
zamanda enfeksiyonların iyileşlmesinde ve enfeksiyon oluşumunun azalmasındaki
etkileri gösterilmiştir (20).
2.7.11. İnterlökin
DNA aşıları, humoral ve hücresel immün yanıtların oluşturulmasında antijenlerin
(antijen-spesifik immün tedavi) veya uyarıcı faktörlerin in vivo ekspresyonları için
geliştirilmiş yeni bir yöntemdir. Bu yöntem aynı zamanda birçok hastalığın pre-klinik
modellerinde koruyucu immünite geliştirilmesini de gündeme getirmiştir. DNA
aşılarında proteinin kendisini, canlı bir ajanı veya bir patojenin zayıflatılmış formunu
32
kullanmak
yerine
patojen
veya
tümörlerin
proteinlerini
kodlayan
genler
kullanılmaktadır. Bu aşamada rekombinant DNA teknolojisi devreye girmektedir.
DNA aşılarında (ve aynı zamanda gen tedavisinde) plazmit veya viral (retrovirüs,
adenovirüs veya adeno ilişkili virüs kökenli) vektörler kullanılmaktadır. Plazmit
vektörler güçlü bir viral promotor, ilgili gen, poliadenilasyon/transkripsiyonel
terminasyon dizileri ve bakteriyel sistemde seçici bir marker gen taşımaktadır. Plazmit
vektörler bakteride (E. coli) çoğaltılır, saflaştırılır, bir tuz solüsyonunda çözülür ve
sonra da konakçıya enjekte edilir. Plazmit DNA, (mekanizması tam olarak
açıklanamayan bir yolla) enjeksiyon bölgesindeki hücreler tarafından alınmaktadır.
Plazmitler ökaryotik hücrelerde fonksiyonel olan replikasyon orijinleri taşımayacak
şekilde hazırlanır; bu tür plazmitler ökaryotik hücrelerde ne çoğalırlar ne de kromozoma
entegre olmaktadır (insersiyonel mutageneze neden olmazlar). Plazmit DNA’lar zararsız
olup çok zayıf bir immünojeniteye sahiptirler (bu nedenle de sık aralıklarla
uygulanabilirler). Enfeksiyoz olma potansiyeli yoktur, intravenöz yolla enjekte
edildiklerinde toksisiteleri de yoktur. Viral vektörlere göre daha kolay hazırlanabilirler,
yüksek saflıkta izole edilebilirler, proteinlere ve diğer biyolojik polimerlere göre de son
derece dayanıklıdırlar. Viral kaynaklı vektör moleküllerinin transdüksiyon verimleri
yüksek olmasına karşın üretim ve saflaştırılmalarındaki zorluk ve bir takım potansiyel
problemler
kullanımlarını
kısıtlamaktadır.
Diğer
taraftan,
plazmit
DNA’lar
güvenilirlikleri açısından viral vektörlere iyi bir alternatiftir. Toksisiteleri çok düşük
olduğu gibi büyük ölçekli üretimleri de oldukça kolaydır. Plazmit DNA’lar kas içine,
peritona ve deri altına enjekte edilebilirler. Deri altına enjeksiyon durumunda buradaki
keratinositler, fibroblastlar ve dentritik hücreler plazmitleri daha verimli bir şekilde
almaktadırlar. Plazmitler için dezavantaj ise transdüksiyon verimlerinin düşük
olmasındadır. Transdüksiyon verimini yükselten uygulamalar (bir takım ligandlarla
birlikte kullanım, elektroporasyon ve lipozom aracılı kullanım gibi) ile de bu sorun
çözümlenebilmektedir. Lipozom aracılı gen aktarımında; plazmit DNA’lar polikatyonik
lipidlerle karıştırılarak lipozom/ DNA kompleksleri oluşturulmaktadır. Bu yapıların
hedef hücre zarı ile birleşerek gen aktarımını sağladığı düşünülmektedir. Bu amaçla
kullanılan değişik lipit preparasyonları (DOPE, DOTMA, DOSPA, DDAB, DOGS,
DOTAP, DMRIE gibi) ticari olarak mevcut olup lipozom/plazmit komplekslerinin
hazırlanması da oldukça kolay olmaktadır. Bu yapılar non-immünojenik olup minimal
sistemik toksisiteye sahiptir, çok sayıda hücre tipine gen aktarımı yapabilmektedir ve
33
aynı bireye tekrar tekrar uygulanabilmektedir. Kanser hücrelerinin immün sistem
tarafından yok edilmesi (immünotedavi) amacı ile sitokin genlerinin kullanılması,
kansere karşı pasif immünite (CD4+ ve CD8+ T hücrelerini aktive ederek) sağlamak
veya aktif immüniteyi (antijenik determinantlarla immünizasyonla)
uyarmak veya
güçlendirmek içindir (26–27).
Tablo1: 2000–2001 Rekombinant ilaç satışları (15)
2000-2001
Rekombinant ilaç satışları
Kaynak: TEB Raporu, 2003
Yukarıdaki tabloda 2000–2001 yıllarının rekombinant ilaç satışları gösterilmektedir. Bu
tabloda ortaya koymaktadır ki rekombinant ilaç gitgide artan oranlarda günümüz ilaç
endüstrisine girmiş ve yer edinmiştir.
34
3.TARTIŞMA VE SONUÇ
1900 yıllarda Mendelin çalışmalarının yeniden keşfinden sonra genin doğası hakkında
büyük bir bilgi patlaması olmuştur (18). Amerikalı James Watson, İngiliz Francis Crick
ve birkaç biyolog araştırmacı 1953 yılında DNA’nın çift heliks yapısını incelediler.
DNA kavramının, yaşamın geleneksel dili olduğunu bakterilerde, mantarlarda, bitki ve
hayvanlarda yaptıkları çalışmalarla ortaya koymuşlardır. 1970’li yıllarda araştırmacılar,
DNA'nın bir canlıdan kesilerek diğer canlıya yerleştirebileceklerini bulmuşlardır. Ve
böylece rekombinant DNA teknolojisi ortaya çıkmıştır. Gelişmeler doğrultusunda
araştırmacılar, insülin, hormon, interferon ve TPA (doku plasminogen aktifleştirici) gibi
ilaçları tıp dünyasına sunmuşlardır (10).
DNA’nın yapısının ve taşıdığı genetik kodun çözülmesinin ardından birçok biyolojik
sırrın DNA’nın baz diziliminde saklı olduğu anlaşılmış ve moleküler düzeyde
çalışmalar başlamıştır. Biyoteknoloji, organizmaların veya onların bileşiklerinin pratik
uygulamaları ile ilgilenmektedir. Günümüzdeki uygulamalar; yeni ilaçların üretimi,
transgenik bitki ve hayvanların elde edilmesi, biyolojik yakıt elde edilmesi, gen
terapileri ve çevre kirliliğini önlemeyi içeren çok farklı araştırma alanlarını
kapsamaktadır (28). Ekinci ve ark. (2010), 1973 ve sonrası ‘modern biyoteknoloji
dönemi’ nin geliştiğini ve modern tekniklerin biyolojik sistemlere uygulanmasına ilişkin
çalışmaları kapsadığını ve böylece, mutasyonlar ya da rekombinant DNA teknolojisi
yardımıyla oluşturulan mutantların veya transgenik organizmaların, endüstride ve diğer
alanlarda yoğun biçimde kullanılmaya başlandığını, bu bağlamda 20. Yüzyılın son
yıllarında biyoteknoloji biliminin, uygulamalı ve disiplinler arası bir alan olarak
tanımlandığını söylemektedirler (25, 29).
Rekombinant DNA teknolojisi, DNA moleküllerini bir test tüpü içersinde manipüle
etme yeteneğidir. Bu yeteneğin kaynağı ise ticari olarak üretilen enzimlerdir. Hücre
içinde bu enzimler DNA replikasyonu, transkripsiyon, yabancı DNA’nın ortamdan
35
uzaklaştırılması, mutasyona uğramış DNA’nın tamiri gibi birçok önemli işlere katılırlar
ve hücreden izole edildikten sonra da benzer ortam şartları sağlandığında aynı
reaksiyonları katalizlemeye devam ederler. Restriksiyon enzimleri olarak adlandırılan
ve bakterilerden izole edilen enzimler, rekombinant DNA teknolojisinin vazgeçilmez
öğesidir (22).
Rekombinant DNA teknolojisi ile üretilen insan insülini bu teknolojiyle elde edilen ilk
ticari sağlık ürünüdür. Büyük ölçekli rekombinant DNA çalışmaları veya rekombinant
DNA ürünlerinin ticari gelişimi için federal kurallar dahilinde bu ürün üzerinde
çalışmalar başlatılmıştır. Büyük ölçekli çalışmalarda, kimlik ve böyle bir ürünün
güvenliğinin kanıtı için atılan adımlar açıklanmıştır. Rekombinant DNA teknolojisi,
temel çalışmalar, yaşam bilimleri ve araştırmalarla, ticari uygulamalar, iyi ekonomik
şartlar ve yatırım sermayesinin durumu ile kontrol edilmiştir (32).
Hayvan insülinleriyle diabet tedavisinden yarım asır sonra 1980’li yılların başlarında
rekombinant DNA teknolojisi ve gelişmiş protein kimyası ile insan insülini
hazırlanmıştır. Bir sonraki adım olarak, son on yıl içinde, insülin analogları, tedavi
edici özelliklerinin iyileştirilmesi amacı ile yerli protein yapısını değiştirerek inşa
edilmiştir. Orta, hızlı ve uzun etkili preparatlar ile imkansız olan kan şekerini düzenleme
işi artık mümkün olmaktadır. İlk klinik kullanımda insülin analogu lispro, gilisemik
kontrolün hipoglisemik etki ile olabileceğini göstermiş ve teorik bilgiyi doğrulamıştır.
İki yeni insülin analogu aspart ve insülin glargin, yakın zamanda A.B.D.’de klinik
kullanım için onaylanmış ve diğer analogları da yoğun test altından geçirilmiştir (32).
Vajo ve ark. (2001)’ na göre yeni kısa etkili analogların tanıtımı ve gerçek anlamda ilk
uzun etkili analogların gelişimi ile süreklilik ve daha az değişkenlik ile üretim hatta
belki de seçici eylem analoglarının gelişimi mümkün olacak, özel hasta özellikleri ve
hedeflenen daha bireysel tedavi stratejileri geliştirmelerine yardımcı olacak, glisemik
kontrolle daha fazla gelişmeler elde edilecektir (23).
Gen teknolojisiyle biyoteknolojideki ilerlemeler zararlılara ve soğuğa dayanıklı bitki
türleri, daha çok üreyebilen ve gelişkin çiftlik hayvanları üretimine başarılı olmuştur.
Genetik olarak farklı domates türleri, rafta kalma süresi uzun olan varyetelerin
gelişmesini sağlamıştır. 1990 yıllarında Amerikada daha da ileri gidilerek İnsan Genom
Projesi gündeme getirilmiş ve insan genlerinin tüm haritasının yapılması planlanmıştır.
Bu projenin yaklaşık değeri yılda 200 milyon dolar olup 2005 yılında bitirilmesi
36
planlanmaktadır. Cystic fibrosis, orak şekilli hücre anemisi ve Huntingon's chorea gibi
birçok hastalık için DNA kodları kromozomlarda yer alan özel bölgelerde kodlanmış
olduğu bu sayede bulunmuştur (25).
Ergün (2010)’e göre, gen tedavisi, tedavi amaclı olarak hücreye bir genin aktarılması
olarak tanımlanırken, tedavinin amacı ise, mutant (farklanmıs: değisime uğramıs)
fenotipi duzelterek hastanın iyileştirilmesidir. Germ hücrelerine gen kopyasının
aktarılması (germinal genoterapi) yeni mutasyon yaratma riski tasıdığı ve olusan
mutasyonun da yeni kuşaklara aktarılma riski olduğu için, etik olarak uygun
bulunmadığını söylemektedir (30).
Sonuç olarak rekombinant DNA teknolojisi, hızlı, ekonomik ve adet bazında daha çok
ürün eldesini mümkün kılmaktadır. Bu doğrultuda kullanım olarak rekombinant ilaç
tüketimi yıldan yıla artmaktadır. Gen transferindeki birkaç risk haricinde bu yöntem
günümüze ve geleceğe faydalı ve umut olacak bir teknolojidir.
37
KAYNAKLAR
1)
http://tr.wikipedia.org/wiki/Rekombinant_DNA_teknolojisi
Moleküler Genetik 2 Prof. Dr. Güler Temizkan
2)
http://www.medicine.ankara.edu.tr/internal_medical/pediatrics/molgen/index.php?PgId=41
3)
http://www.medicine.ankara.edu.tr/internal_medical/pediatrics/molgen/index.php?PgId=70
4)
http://www.cyber-warrior.org/forum/rekombinant-dnateknolojisi_341171,0.cwx
5)
Petska S: The human interferons- From protein purification and sequence to
cloning and expression in bacteria: Before, between and beyond, Arch Biochem
Biophys 1983 ; 221:1
6)
Ayter Ş:İnterferonların rekombinant DNA teknolojisi ile eldesi, Ankem Derg 2
(No 3) 1988; ss 213-220
7)
Arslan K., Akyüz B: Gen Transfer Teknolojileri, Erciyes Üniv Vet Fak Derg 6
(1) 2009; 77-82
8)
Shivanand P., Noopur S., Recombinant DNA technology: Applications in the
field of biotechnology and crime sciences, March-April 2010
9)
http://www.nkfu.com/genetigin-dunyada-ve-turkiyede-ki-tarihsel-gelisimi/
10)
http://bloomberg.blogcu.com/genetigin-dunyada-ve-turkiyedeki-tarihi/7524930
11)
http://bteml.biotek.ankara.edu.tr/wiki/images/d/dd/Molekuler_Genetik_Hafta8.p
df
12)
http://www.hemofili-dunyasi.com/az_hemofili.aspx?id=39&fmb=1
13)
Yanisch-Perron, C., Vieira, J. and Messing, J. 1985; Gene 33,pp 103-119
14)
http://fens.sabanciuniv.edu/biyotek05/docs/10Sep/2-Mehmet%20Ozturk.ppt
15)
Ekici A., Timur M. ve Bağış H., Transgenik canlılar ve aquakültürdeki önemi.
E.Ü Su Ürünleri Dergisi, 2006 ; 23: ss 211-214
38
16)
Ekinci, M.S., Akyol, İ., Karaman, M., Ozkose, E.,. Hayvansal biyoteknoloji
uygulamalarında güncel gelişmeler. KSÜ Fen ve Mühendislik Dergisi, 2005;
8:89-95
17)
http://yunus.hacettepe.edu.tr/~coner/GEN/02/genetik.htm
18)
http://www.genbilim.com/content/view/2358/32/
19)
SANDRA L. BLETHEN, PHD, MD; VIRGINIA V. WELDON, MD Am J Dis
Child., 1982; 136(8): pp 669-671.
20)
Akman ve ark.,Akut Miyeloid Lösemili Bir Olguda G-CSF’e Ba¤l› Atipik
Piyoderma Gangrenozum Turkderm 2006; 40: 139-41
21)
Rhein R.,Lu M,.Wang Y., Restriction mapping in nanofluidic devices,May 12
2005
22)
Moleküler Biyoloji, geliştirilmiş 2. Baskı, Yıldırım A., Bardakçı F. ve ark.,: ‚
‘Rekombinant DNA teknolojisi bölüm 13, Nobel yayın 2010 ;ss 471-502
23)
Vajo Z.,Fawcett J. ve Duckworth W., Recombinant DNA Technology in the
Treatment of Diabetes: Insulin Analogs,2001; pp 706-717
24)
http://www.textara.com/genetik-genetiksel-genetig-genetim-nedir?page=0%2C6
25)
Kuiper M, Sanches R, Bignon YJ and Farzaneh F. B7.1 and Cytokines. Habib
NA.
26)
Güzel A. Fare lizozim ve interlökin-2 genlerinin klonlaması ve malign
melanomada anti-tümoral DNA aşısı olarak kullanılması, Doktora Tezi,
Çukurova Üniversitesi Sağlık Bilimleri Endtitüsü Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı ,
2006
27)
Peron JM, Shurin MR and Lotze MT. Cytokine Gene Therapy of Cancer.
Lattime EC and Gerson SL. Gene Therapy of Cancer. Academic Press, USA.
1999
28)
Smith, 1996; Kappes, 1999; Gijs ve Harry, 2002; Lyson, 2002; Braun, 2002
29)
Ekinci M., Akyol İ. ve ark.,Hayvansal Biyoteknoloji Uygulamalarında Güncel
Gelişmeler, 2005, ss 89-95
39
30)
http://www.teb.org.tr/images/upld2/ecza_akademi/makale/20110113034105gen
_tedavi.pdf
31)
http://makinecim.com/bilgi_1586_Insulin-Uretimi
32)
http://www.haticemergen.com/FileUpload/ks106265/File/restriksiyon_enzimler.
ppt#257,2,ENZİMLER
33)
http://www.proteinengineering.ege.edu.tr/SUNUMLAAR/Protein%20salinimiKufrevioglu-Agustos-%202007.pdf
34)
http://www.yunus.sumae.gov.tr/2010/03/05.pdf
35)
Yanar M, Rekombinant büyüme hormonu ve süt sığırlarında süt verimi, yem
alımı üzerine etkileri, Atatürk Ü. Zir. Fak. Der.1996; 27,ss 461-465
36)
http://tr.wikipedia.org/wiki/Eritropoetin
40
ÖZGEÇMİŞ
Zübeyde KATARTAŞ,1988 yılında Kayseri’de doğdu.İlköğretimine 1993 yılında Özel
Özhamurkar İlköğretim Okulu’nda başladı, Özel Yılmaz Akansu İlköğretim Okulu’nda
devam etti ve bu okulda bitirmiştir..Orta öğretimini Özel Atlas Koleji’nde,
lise
eğitimini 2006 yılında Sami Yangın Anadolu Lisesi’nde tamamladı.
Lisans eğitimi olarak ilk 3 dönem Ankara Üniversitesi Eczacılık daha sonra da Erciyes
Üniversitesi Eczacılık Fakültesi’ne geçmiş olup şuan son dönem eğitimindedir.
Adres:
Yıldırım Bayezıd mah .Kızılırmak cad.
Olgunlar sk. Koru 2 sitesi No:16
Melikgazi/ Kayseri
Download