dna yapısı ve analizi - Balıkesir Üniversitesi FEF Biyoloji Bölümü

BAÜ FEF BİYOLOJİ BÖLÜMÜ İ.Ö
MOLEKÜLER BİYOLOJİ 1 ARASINAVI (27.11.2008) Toplam puan 100, Süre: 60dk.
1. Bir molekülün genetik materyal olarak davranabilmesi için dört özelliği
bulunmalıdır. Bunlar 1. ..Kendini eşleme (replikasyon... . 2. Bilgi
depolama... 3. Bu bilgiyi ifade etme. 4. Mutasyonlar çeşitlenme....
olarak sıralanabilir. 8p
2. 1940’da DNA’nın değil de proteinlerin genetik materyal olduğu fikrinin
ağırlık kazanmasının en büyük nedeni neydi? 4p
a) DNA’nın henüz
keşfedilmemiş olması
b) Proteinlerin kendi kopyalarını çıkarabilmeleri
c) Tetranükleotit hipotezi d) Proteinlerin amino asit çeşidinin az olması
e) Proteinler çok çeşitli 3 boyutlu yapı kazanırken DNA’nın tek tip 3
boyutlu yapıya sahip olması.
3. Harriet Taylor’ın, transformasyonun anlaşılması için Griffith ve Avery
grubundan farklı olarak yaptığı neydi? 4p
a) ER (extremely rough)
suşunu bulması b) R suşunun alıcı olarak davrandığını göstermesi
c) Karbohidratların kalıtım materyali olmadığını ispatlamış olması
d) proteinlerin kalıtım materyali olmadığını ispatlamış olması
e) RNA’nın kalıtım materyali olmadığını ispatlamış olması
4. Adenin (A), 6-amino pürin olarak ta adlandırılır. Bu alternatif sistemle
aşağıdaki bazların adlarını karşılarına yazınız. 8p Guanin: ...2-amino-6oksipürin Sitozin: ...2-oksi-4-aminopirimidin... Timin: ...2,4-dioksi5-metilpirimidin Urasil: ...2,4-dioksipirimidin
10. Aşağıdaki grafiğe göre E. coli ile karşılaştırıldığında diğer iki DNA
eğrisi hakkında ne söylenebilir? (C / Co : Tek zincirli kalan fraksiyn) 8p
1.0
2
1
C/Co
0.5
0.0
Cot
1. grafik aslında E.
coli’den daha çok
genoma sahip olmasına
rağmen tekrarlayan
DNA’ya sahip olduğu
için A bölgesi E.coli’den
önce birleşmiş (B Bölgesi
ise tekrarsız DNA). 2.
grafik ise yine E.coli’den
fazla DNA’ya sahip
ancak tekrarlayan
DNA’sı yok. 1 en çok
DNA’ya sahip.
11. DNA polimeraz III’ü oluşturan 10 alt birimi sıralayıp işlevlerini
tamımlayınız. Holoenzim ile kor enzim arasındaki farkı belirtiniz. 10p
5. Adenin ve Guaninden oluşan bir dinükleotitin kimyasal yapısını atomlar
arası bağları göstererek çiziniz (Adenin ve Guanini A ve G olarak
gösterebilirsiniz). 12p
6. Watson-Crick Modelinin özelliklerini yazınız. (14p)
12. Tek bir replikasyon çatalındaki DNA sentezini ve hangi enzimlerin ne iş
yaptığını belirterek şekil üzerinde veya metin olarak açıklayınız. 10p
1. Sağ el ikili sarmalı şeklindedir.
2. İki zincir birbirine antiparaleldir (biri soldan sağa doğru 5’-3’ yönündeyken
diğeri sağdan sola doğru 5’-3’ yönündedir)
3.Bazlar düzlemseldir ve düzlemler eksene diktir, bazlar arasında 3.4 Ǻ
(0.34nm) mesafe vardır.
4. Azotlu bazlar A=T ve G≡C şeklinde H bağlarıyla eşleşirler.
5. Sarmalın her bir tam dönüşü 34Ǻ’dir (3.4nm) ve böylece 10 baz içerir.
6. Sıra ile büyük (majör) oluklar ve küçük (minör) oluklar içerir.
7. Sarmalın çapı 20Ǻ (2nm)’dir.
7. Hiperkromik etki nedir? nasıl ölçülür? Tm ne anlama gelir? 9p
Hiperkromik etki ısıtılan DNA moleküllerinin tek zincir haline gelmelerinden
dolayı 260nm’deki absorbsiyonlarının artmasıdır. Hiperkromik etkiyi ölçmek
için DNA örneği ısıtmadan önce ve sonra 260nm’de ölçülür ve ölçümler
karşılaştırılır. A260 değerindeki artış miktarı hiperkromik etkinin miktarını
gösterir.
Tm bir DNA molekülünün yarısının tek zincirli hale geldiği andaki sıcaklık
değeridir.
8.
Aşağıdakilerden hangisinin Tm derecesi en yüksektir? (4p)
a)TAACTACGAA b)TCATGCGATCGC c)AAATTTGGGA
d)CTTAAATTTG e) ATTGAGTGTAAAA
9.
Aynı miktardaki X ve Y etiketli 2 DNA örneğinin Cot ½ değerleri
sırasıyla 10 ve 5’tir. Buna göre aşağıdakilerden hangisi doğrudur?
(nt:nükleotit) 4p a)Birinci ikinciden daha çok nt içerir. (2p) b)İkinci
birinciden daha çok nt içerir c)eşit miktarda nt içerirler d)birincinin
tekrar miktarı daha fazladır e)hiçbiri
13. Aşağıdaki durumlarda E.coli’nin hangi enzim ya da işlevlerinin
etkilendiğini tahmin ediniz. (5p)
a) Yeni sentezlenin DNA bir çok yanlış eşleşmiş baz çifti içeriyor: DNA
polimeraz I (ya da III’ün ε altbirimi) bozuk veya eksik
b) Okazaki fragmanları birikiyor ve DNA sentezi tamamlanmıyor: DNA ligaz
eksik veya bozuk
c) Sentez başlamıyor: RNA primeri sentezleyen primaz eksik yada bozuk
d)Sentez çok az: DNA polimeraz 3 bozuk veya iyi çalışmıyor
e) Replikasyon sonrası tamamlanmamış üstün kıvrımlı zincirler bulunuyor:
DNA giraz bozuk ya da eksik.