Lab Raporu Sonuç Raporu İstem Yapan: Tedarikçi Kurum: Tedarikçi Telefonu: İstem Tarihi: Alınma Tarihi: Varış Tarihi: İstem No: Sequenom Laboratuvarları 3595 John Hopkins Court San Diego, CA 92121 CLIA #: 05D2015356 CAP #: 7527138 877.821.7266 Dr. SANLI ERKAN BioGen - İstanbul - Türkiye + 90 212 438 6590 01.10.2014 01.10.2014 03.10.2014 ORD12345-01234 21, 18 ve 13. Kromozomlar için Test Sonucu NORMAL Çalışılan örnekte 21, 18 ve 13. kromozomlar için normal değerler saptanmıştır. Klinik takip önerilmektedir. Hasta: Doğum Tarihi: Hasta No: Örnek No: İsteyen Doktor: Lab Direktörü: Sonuç Tarihi: Performans MaterniT21 PLUS laboratuvarda geliştirilmiş test (LDT) için performans özellikleri artmış fetal kromozomal anöploidi riski bulunan gebe kadınlarda yapılan klinik validasyon çalışmaları ile belirlenmiştir. 1, 2, 3 Kullanım Amacı Trizomi 21 Diğer ilişkili olduğu bilinen kromozom bölgeleri de ayrıca incelenmiştir; Trizomi 22, Trizomi 16, Turner, Klinefelter, Trizomi X, XYY sendromları ve belirli mikrodelesyonlar (22qDiGeorge, 15q- Angelman / Prader Willi, 11q- Jacobsen, 8qLanger-Giedion, 5p- Cri-du-chat, 4p- Wolf-Hirschhorn ve 1p36- sendromu) sadece anormallik saptanması halinde Ek Bulgu olarak raporlanmaktadır. Analiz Metodu Anti koagulan içeren maternal tam kandan plazma içeriği ayrıldıktan sonra serbest fetal DNA saflaştırıldı. Genomik DNA bilgisi oluşturularak 21, 18, 13 ve Y kromozomu değerlendirildi.1 Ek olarak 22, 16. kromozomlar, cinsiyet kromozom (X ve Y) miktarları ve belirli bölgeler de (22q, 15q, 11q, 8q, 5p, 4p, 1p) ayrıca değerlendirildi, sadece anormallik saptanması halinde Ek Bulgu olarak raporlanmaktadır. AD, SOYAD 01.01.1978 12345 123456789 Dr. SANLI ERKAN Juan-Sebastian Saldivar, MD 09.10.2014 12:00 Trizomi 18 Trizomi 13 Y Kromozomu Performans Güven Aralığı (%95) Sens: %99.1 Spes: %99.9 Sens: >%99.9 Spes: %99.6 Sens: %91.7 Spes: %99.7 Hass: %99.4 %96.3 - 99.8 %99.6 - 99.9 %92.4 - 100 %99.2 - 99.8 %59.7 - 99.6 %99.3 - 99.9 %99.0 - 99.6 Testin Sınırları DNA test sonuçları tüm bireylerde net sonuç vermeyebilir. Serbest fetal DNA analizi, CVS veya amniyosentez ile elde edilen hassasiyet ve doğrulukta prenatal tanının yerini alamaz. Anormal test sonucu olan veya ek bulgu saptanan bir hasta genetik danışmanlık için yönlendirilmeli ve test sonucunun doğrulanması için invazif prenatal tanı işlemi önerilmelidir.4 Normal sonuç olması veya ek bulgu bulunmaması da gebeliğin etkilenmediği anlamına gelmez. Test sonuçları çok yüksek doğruluğa sahip olsa da, plasental, maternal veya fetal mozaisizm veya başka nedenlerle tüm kromozomal anomaliler tespit edilemeyebilir. Bilinen çoğul gebeliklerde cinsiyet kromozom anomalileri raporlanamaz. Uzman doktor bu bilginin kullanımı ve hastasının takibinden sorumludur. Test Hakkında MaterniT21 PLUS testi, maternal kan örneğinden ayrıştırılan serbest fetal DNA örneğini analiz eder. Testin kromozomal anomaliler açısından artmış riski bulunan gebe kadınlarda kullanımı önerilmektedir. İkiz gebeliklerdeki validasyon bilgisi sınırlıdır ve üçüz gebeliklerdeki anöploidi tespiti henüz valide edilmemiştir. Not Bu test Sequenom Laboratuvarları tarafından geliştirilmiş ve performans özellikleri belirlenmiştir. ABD FDA kapsamına alınmamış veya onaylanmamıştır. Bu test klinik amaçla kullanılmaktadır. Araştırma veya geliştirme amaçlı olarak değerlendirilmemelidir. Bu laboratuvarın, Klinik Laboratuvar Geliştirme Yönergeleri (CLIA) doğrultusunda sertifikasyonu mevcut olup, Amerikan Patoloji Derneği (CAP) tarafından da yüksek derecede karmaşık klinik laboratuvar testini yapabileceğine dair akreditasyonu tamamlanmıştır. Referanslar 1. Palomaki GE, et al. Genet Med. 2012; 14(3): 296-305. 2. Palomaki GE, et al. Genet Med. 2011; 13(11): 913-920. 3. Mazloom AR, et al. Prenat Diag. 2013; 33(6): 591-597. 4. ACOG/SMFM Komite Görüş Raporu No. 545, Aralık 2012. Sequenom, MaterniT21 ve MaterniT21 PLUS, Sequenoma ait tescilli markalardır. 2014 © Sequenom Laboratuvarları MaterniT21 PLUS Laboratuvar Raporu 1. sayfa Nilesh Dharajiya Laboratuvar Direktörü, Sequenom Laboratuvarları AD, SOYAD İstem No: 09.10.2014 ORD12345-01234 MaterniT21 PLUS testi ile girişimsel olmayan bir şekilde anne karnındaki bebeğin kromozom bozukluklarının analizi: 100.000 Klinik Örneğin Sonucu Ron M. McCullough, Eyad A. Almasri, Xiaojun Guan, Jennifer A. Geis, Susan C. Hicks, Amin R. Mazloom, Cosmin Deciu, Paul Oeth, Allan T. Bombard, Bill Paxton, Nilesh Dharajiya, Juan-Sebastian Saldivar Sequenom Genetik Tanı Laboratuvarı, San Diego, California, A.B.D. Amaç: Sequenom Genetik Tanı Laboratuvarı, massif paralel DNA dizileme yöntemi kullanarak, girişimsel olmayan bir şekilde anne karnındaki bebeğin kromozomal anomaliler açısından analizini yapan ilk laboratuvar olup, bugüne kadar Amerika Birleşik Devletlerindeki 50 eyalet ve 13 farklı ülkeden 100.000’den fazla klinik örneği toplama tecrubesini elde etmiştir. Bu çalışmanın amacı laboratuvarda geliştirilen MaterniT21 PLUS serbest fetal DNA testinin üstün klinik performansını göstermektir. Çalışma Tasarımı: Bu çalışma, yüksek riskli gebelerden Ağustos 2012 ile Haziran 2013 ayları arasında toplanan plazma örneklerinin, CLIA sertifikalı, CAP tarafından akredite Sequenom laboratuvarlarında yapılan analiz sonuçlarını içermektedir. Alınan örnekler trizomi 21, 18, 13 ve Y kromozomu açısından değerlendirildi. Laboratuvar sonuçları ve klinisyenlerden gelen geri bildirimler toplanarak hasta popülasyonunun özellikleri ve MaterniT21 PLUS testinin performansı, gerçek klinik verilere dayanılarak oluşturuldu. Sonuçlar: Girişimsel olmayan bir şekilde anne karnındaki bebeğin serbest fetal DNA analizini yaptıran gebelerin ortalama 35,1 yaşında olduğu ve testi yaklaşık 15 hafta 3 günlükken yaptırdığı görülmüştür. Test sonuçları örnekler laboratuvara ulaştıktan sonra ortalama 4,5 iş gününde verilmiştir. Örneklerden yaklaşık %1,3’ünde sonuç verilememiştir. Örneklerin % 1,51’inde trizomi 21 (Down sendromu), %0,45’inde trizomi 18 (Edwards sendromu), %0,21’inde trizomi 13 (Patau sendromu) pozitif olarak saptanmıştır. Serbest fetal DNA analizi ile elde edilen pozitif sonuçlar, amniyosentez işlemi uygulanan 35 yaşından büyük gebelerde daha önceden yapılmış olan geniş klinik çalışmalarda elde edilen sonuçlarla benzerdir. Bu çalışma grubunun %3,5’i (3519) çoğul gebelik olup, %2,61 olguda pozitif serbest fetal DNA sonucu elde edilmiştir. Özet: Serbest fetal DNA analizi, 2 yıldan uzun bir süredir ticari bir test olarak sunulmakta olup, anne adayları ve klinisyenler tarafından giderek artan bir oranda kullanılmaktadır. Yüksek riskli gebelerde kromozomal anomali ihtimalini serbest fetal DNA analizi gibi farklı bir yöntemle değerlendirmek, girişimsel işlemlere bağlı komplikasyon oranını belirgin bir şekilde azaltmıştır. Serbest fetal DNA analizinin doğruluk derecesi ve pozitif olguların oranı daha önceden yapılan klinik doğrulama çalışmalarıyla uyumlu olup, gebelik takibini iyileştiren standart bir analiz olmuştur. Toplam 100.000 yüksek riskli gebenin “MaterniT21 PLUS” serbest fetal DNA analiz sonuçları Tüm Gebeler False Pozitif False Negatif Sensitivite Trizomi 21 (Down sendromu) 4 6 % 99.6 Trizomi 18 (Edwards sendromu) 5 4 % 99.0 Trizomi 13 (Patau sendromu) 13 2 % 98.9 Trizomi 21 (Down sendromu) 1 0 % 99.9 Trizomi 18 (Edwards sendromu) 0 1 % 95.2 Trizomi 13 (Patau sendromu) 1 0 % 99.9 Spesifite % 99.9 % 99.9 % 99.9 İkiz Gebelikler % 99.9 % 99.9 % 99.9 McCullough RM, Almasri EA, Guan X, Geis JA, Hicks SC, et al. (2014) Non-Invasive Prenatal Chromosomal Aneuploidy Testing - Clinical Experience: 100,000 Clinical Samples. PLoS ONE 9(10): e109173. Bu yayının orjinal tam sürüm versiyonuna aşağıdaki internet sayfasından ulaşabilirsiniz ; www.plosone.org/article/fetchObject.action?uri=info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0109173&representation=PDF