Sitazol ve aktin filaman yapısı Doç. Dr. Çiğdem KEKİK ÇINAR Sitoplazma Organel Hücre iskeleti Sıvı Sitazol (Şekilsiz temel plazma) Yarı akışkan, kolloidal sıvıdır. Çoğunluğu (%90) sudan oluşur. Geri kalan %10’luk kısmın %90’ı organik, %10’u inorganik maddedir. Mitokondri Golgi kompleksi Peroksizom nukleus Plazma membranı Ribozom Endoplazmik retikulum Kolloidal yapı Suda çözünmüş inorganik ve organik moleküller içerir. İnorganik moleküller; asit, baz, tuz Hücredeki çeşitli moleküllerin yapısına (C,H,O,N,K,Ca,Mg vb) elementler bulunur. Organik moleküller; Proteinler, amino asitler Tüm partiküller hidrofilik özelliktedir. giren Sitozol içerisinde hücrenin şekilli elemanları bulunmaktadır. 1. Hücre iskeleti 2. Organeller Hücre iskeleti Hayvan hücrelerinin genel yapısı Lenfosit Nöronlar, astrosit Beyaz Kan Hücreleri Kırmızı Kan Hücreleri Nöronlar Kalp Kası Hücreleri Hücre iskeleti, Hücre şeklini ve sitoplazmanın organizasyonunu belirleyen bir yapı iskelesi görevi yapar. Hücre hareketlerinin gerçekleşmesinden sorumludur. Dinamik bir yapıdır. Hücre iskeleti, aktin filamanları, ara filamanlar, mikrotübül gibi üç temel proteinden oluşur. Bunlar bir arada bulunur ve çok sayıda aksesuar proteinler aracılığı ile hücre içi organeller ve plazma zarı ile bağlantılıdır. ***Bakterilerde gözlenmez. HÜCRE İSKELETİ; Karmaşık, protein filamanları şebekesi Hücre/çekirdek şeklinin ve yerleşiminin belirlenmesi ve korunması (elastikiyet, sağlamlılık) Hücre hareketi (göç, diapedez vb), hücrenin bir bölümünün hareketi (siliyum, kuyruk vb) Fagositoz, endositoz, ekzositoz Sitokinez Hücre içi taşıma Kasılma Hücre-hücre ve hücre-matriks ilişkilerini destekleme Hücre İskeleti İlk olarak artefakt zannedilmiş 100 farklı protein Plazma membranına bağlı 3 filaman sistemi Mikrotübüller (25 nm) Intermediate (ara) filamanlar (10 nm) Mikrofilamanlar –Aktin filamanlar (5-7 nm) Hücre İskeletinin Temel Elemanları MİKROFİLAMANLAR (7 nm) • Aktin (F ve G) MİKROTUBULLER (25 nm) • Tubulin (alfa, beta, gamma) ARAFİLAMANLAR (IF) (10nm) •Keratinler •Nörofilaminler •Vimentin •Desmin •GFAP •Laminler •Nestin •Periferin Mikrofilamanlar Mikrotubuller Hücre içi hareketten sorumludurlar Intermediate (ara) Filamanlar Yapısal destek sağlarlar Aktin filamanlar (Mikrofilamanlar) Mikrotubuller İntermediate filamanlar Hücre iskeletini oluşturan üç protein filaman ARA ÇAPLI FİLAMANLAR MİKROTUBULLER AKTİN FİLAMANLAR Aktin filamanlar kırmızı, mikrotubuller yeşil ve nukleus mavi Hücre Hareketi Ameboid hareket Sol-jel geçişi Lamellipod Filopod Özelleşmiş Yapılar Silya Flagella Kas Aktin-miyozin etkileşimi Hücre iskeleti elemanları Hücre iskeletini oluşturan filamanların her biri identik protein moleküllerinin polimerleşmesi sonucunda oluşur. Filamanların üç tipi de kendi kendilerine hücreye şekil yada güç veremezler. Fonksiyonları kendilerine bağlı motor proteinler aracılığı ile gerçekleşir. Bütün bu sitoiskelet elemanları aksesuar proteinlerle etkileşim halindedirler. Bu proteinler; filamentlere yada alt ünitelerine bağlanır. Filamentleri birbirine, organellere yada plazma membranına bağlar. Aktin filamanlar (Mikrofilamanlar) Mikrofilamentler; (7-9 nm) AKTİN Globüler yapısal bir proteindir. Ökaryotlarda en çok bulunan hücre içi proteindir. 43 kD ağırlığında ve yüksek oranda korunmuştur. Hücreye mekanik destek sağlar. Hücre hareketinde rol oynar (lamellipod,filopod). Hücre bağlantılarında rol alır (fokal adezyon). Kas hücrelerinde miyozinle birlikte kontraksiyonu sağlar. İnsan ve hayvan hücrelerinde altı farklı aktin izoformu tespit edilmiştir: Doku /hücre tipi Aktin tipi İskelet kası α-iskeletal Kalp kası α-kardiyak Damar sistemi düz kaslar α-vasküler İç organlardaki düz kaslar γ-enterik Kas dışı hücreler β-sitoplazmik Kas dışı hücreler γ-sitoplazmik. Aktin polimerizasyonu Her monomer 1660 açı ile bağlandığı için 37nm’de bir sağa dönüm yapar. (+) uç Birleşme yönüne polarize olur. (-) uç göre (-) uç nispeten daha yavaş, (+) uç daha hızlı büyür. Kısa, ince ve bükülebilir özelliklidir. (+) (+) (+) (-) (-) (-) POLİMERİZASYONU ETKİLEYEN FAKTÖRLER Mantar toksinleri Latrankulin: G aktine bağlanıp filamente eklenmesi önlenir. Sitokalasin B: + uca bağlanarak polimerizasyonu engeller. Amanita Phaloidin: F-aktine bağlanır. Yeni alt ünitelerin bağlanmasını bloke eder. Depolimerizasyonu engeller. Proteinler Kofilin: F aktin’de - uçtaki ADP-aktinlere bağlanıp ayrışmasını sağlar. Ayrıca filamenti 2’ye bölerek daha fazla + uç oluşumuna neden olur. Profilin: ADP-G aktine bağlanır ve ATP-G aktine dönüştürür. Polimerizasyona katılır. Timosin β4: ATP-G aktine bağlanarak polimerize olmalarını inhibe eder. Cap Z: Dimer yapıdadır. + uca bağlanıp yeni monomer eklenmesini önler. Etkisi PIP2 ve diğer + uç proteinlerince baskılanır. Tropomodülin: - uca bağlanarak ayrışmayı önler. Gelsolin: Yüksek Ca’da + uca bağlanır. Filamenti kırar, depolimerizasyona neden olur. 2 sınıf protein, sinyal iletimi kontrolünde nükleasyonda görev alır. Formin FH1 ve FH2 domainlerinden oluşur. 2 FH2 halka şeklinde birleşir ve filament + ucuna bağlanır. Monomer bağlanmasına olanak sağlar. FH1 domaini, prolince zengindir ve Profilin bağlanma bölgesi oluşturur. Formin N ve C ucu üst üste katlanınca inaktif haldedir. Zara bağlı Rho (GTPaz) ile aktive olur. GTP-Rho, forminin RBD’e bağlanır ve aktifler. Nüve oluşumu Stres lif oluşumu Kasılabilir halka oluşumu ARP2/3 Öncü uç oluşumunu sağlar. 7 alt üniteden oluşur. 2’si aktin bağlama bölgesidir. Filamente Arp2/3 kompleksi bağlanarak + uca benzer yapı oluşturur ve ATP-G aktin bağlar. Eski ile yeni filament arasında 700 vardır. WASP (Wiskott-Aldrich Send proteini) ve Cdc42 (GTP bağlı protein) ile aktive olur. Arp2/3 için bağlanma bölgesi oluşturur. Aktin bağlayıcı proteinler Aktine çapraz bağlanarak organizasyonunu sağlarlar. kortikal filamanların 1.Demetleyici proteinler; fimbrin ve α-aktinin Filamanların aynı yönde düzenlenmelerini ve paralel sıralar oluşturmalarını sağlarlar. 10-20 nm Fimbrin α-aktinin 30-60 nm 2. Jel oluşturan proteinler; Filamin, Spektrin Aktin filamanların gevşek, jel benzeri organizasyon oluşturmasını sağlarlar. Filamin Stres lifi Kontraktil demetler (α-aktinin) Hücre korteksi Jel benzeri ağ (filamin) Filapod Paralel demetler (fimbrin) Tüm ökaryotik filamanları taşırlar. hücreler aktin Hücrede hem stabil, Mikrovilli Kas hücresi kontraktil apereyi Hem de labil yapılar bunurlar; İnvaginasyon Lamellipod Kontraktil halka halinde Kas hücresi kontraktil apereyi Z diski Aktin filaman M çizgisi Miyozin Sarkomer MİKROFİLAMENTLERİN FONKSİYONLARI Hücre membranı ile aktin filamentleri ilişkisi 1) İntegrinler ile adezyon plaklarında matriks - hücre bağlantısı 2) Kaderinler ile bağlantı komplekslerinde Hücre- hücre bağlantısı Sitokinez (myosin II+Aktin ) Vezikül transpotu Aktin filamentleri boyunca Miyosin I ve 5 ile. Hücre hareketi örn: Fibroblast Filopod — parmak şeklinde çıkıntı oluşumu Lamellipod — yaprak şeklinde uzantılar Mekanik destek ve gerginlik -Stres fibrilleri Yarıklanma bölgesi Mikroflamanlardan oluşan kontrktil halka Mitoz bölünmede Sitokinez aşamasında Yavru hücreler Eritrositlerde plazma zarının altında bulunan Periferal mambran proteinleri kortikal hücre iskeletinin bileşenleri olarak davranırlar. Eritrosit membranlarında aktin-spektrin bağlantısı α - aktinin Aktin filament Vinkulin Paksilin Protein kap /Z başlığı Talin Sitozol Hücre membranı İntegrin (fibronektin reseptörü)α/β alt üniti Fibronektin Ekstrasellüler matriks Aktin filamentlerinin hücredeki yerleşimi Labil Yapılar; 1- Hücre Korteksinde 2- Hücre adezyon kemerlerinde 3- Stress fibrilleri 4- Kotraktil halka Stabil yapılar; 1-Mikrovillus yapısında 2- Sarkomerde Mikrofilaman motorlar Miyozin Kas hücreleri Kas olmayan hücreler Hareketli bir başı olan büyük protein Baş Boyun Kuyruk Miyozin I Kalmodulin hafif zincir Miyozin II Esas hafif zincir Düzenleyici hafif zincir Miyozin V Kalmodulin hafif zincirler Sınıfı Adım boyutu Fonksiyonu Zara bağlı, Endositoz 10-14 nm I (-) (+) (+) (-) (-) (+) 5-10 nm II Kontraksiyon (+) (-) (-) (+) Vezikül V 36 nm Organel transportu (-) (+) Miyozin motor proteinleri Miyozinler genellikle aktinin (+) ucuna doğru hareket ederler. Miyozin VI farklı olarak (-) uca doğru hareketi sağlar. Herediter Sferositoz Otozomal dominant bir hemolitik bozukluk Primer defekt, lipid memebranın kaybı Lipid membranı destekleyen iskelet proteinlerindeki genetik defektler membran kaybından sorumludur. Membranlarını kaybeden hücreler giderek küreselleşir ve esnekliğini kaybeder Amasya Teşekkürler...