POLİFONKSİYONEL SİKLOOKTAN β-AMİNO ASİT SENTEZİ Emine

advertisement
POLİFONKSİYONEL SİKLOOKTAN
-AMİNO ASİT SENTEZİ
Emine YURTOĞLU
Yüksek Lisans Tezi
Kimya Anabilim Dalı
Organik Kimya Bilim Dalı
Prof. Dr. Ramazan ALTUNDAŞ
2014
Her hakkı saklıdır
ATATÜRK ÜNİVERSİTESİ
FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ
YÜKSEK LİSANS TEZİ
POLİFONKSİYONEL SİKLOOKTAN -AMİNO ASİT SENTEZİ
Emine YURTOĞLU
KİMYA ANABİLİM DALI
Organik Kimya Bilim Dalı
ERZURUM
2014
Her hakkı saklıdır
T.C.
ATATÜRK ÜNİVERSİTESİ
FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ
TEZ ONAY FORMU
POLİFONKSİYONEL SİKLOOKTAN -AMİNO ASİT SENTEZİ
Prof. Dr. Ramazan ALTUNDAŞ danışmanlığında, Emine YURTOĞLU tarafından
hazırlanan bu çalışma 19/12/2014 tarihinde aşağıdaki jüri tarafından Kimya Anabilim
Dalı – Organik Kimya Bilim Dalı’nda Yüksek Lisans tezi olarak oybirliği/oy çokluğu
(…/…) ile kabul edilmiştir.
Başkan : Prof. Dr. Yunus KARA
İmza
:
Üye
: Prof. Dr. Ramazan ALTUNDAŞ
İmza
:
Üye
: Doç. Dr. Melda ŞİŞECİOĞLU
İmza
:
Yukarıdaki sonuç;
Enstitü Yönetim Kurulu ........./......../…….. tarih ve . . . . . ./ . . . . . . . . . . . . . . nolu
kararı ile onaylanmıştır.
Prof. Dr. İhsan EFEOĞLU
Enstitü Müdürü
Bu çalışma Tübitak projeleri kapsamında desteklenmiştir.
Proje No: 112T870
Not: Bu tezde kullanılan özgün ve başka kaynaklardan yapılan bildirişlerin, çizelge, şekil ve fotoğrafların kaynak
olarak kullanımı, 5846 sayılı Fikir ve Sanat Eserleri Kanunundaki hükümlere tabidir.
ÖZET
Yüksek Lisans Tezi
POLİFONKSİYONEL SİKLOOKTAN -AMİNO ASİT SENTEZİ
Emine YURTOĞLU
Atatürk Üniversitesi
Fen Bilimleri Enstitüsü
Kimya Anabilim Dalı
Organik Kimya Bilim Dalı
Yönetici: Prof. Dr. Ramazan ALTUNDAŞ
Bir ya da daha fazla hidroksil grubu taşıyan -hidroksi--amino asit örnekleri
gösterdikleri farmakalojik etkiden dolayı araştırmacıların ilgisini çekmektedir. Sekiz
üyeli halka sistemlerinde -amino asit örneklerinin sayısı oldukça azdır. Bu nedenle
siklooktanon’dan çıkılarak, prokiral ve kiral merkeze sahip klorosiyanosiklookten
bileşiği sentezlendi. Klor’un (S)--metilbenzilamin ile yerdeğiştirmesi ile siklooktan
ana iskelet yapısı içeren -amino asit öncüsü diastreomerler elde edildi. Bu
diastereomerlerin
hidrojenasjonunda
istenilen
seçimlilik
sağlanamadı.
Klorosiyanosiklookten bileşiğinden klorun eliminasyonu ile siyanosiklooktadien, bu
bileşiğin
oksidasyonu
ile
epoksisiyanosiklookten
sentezlendi.
Epoksisiyanosiklookten’in (S)--metilbenzilamin ile allilik pozisyondan açılma
reaksiyonu başarısızlıkla sonuçlandı. Epoksit’in lewis asidi, kuvvetli ve zayıf bazik
şartlarda açılmasıyla prokiral ve kiral merkezlere sahip hidroksisiyanosiklooktadien
sentezlendi. Hidroksisiyanosiklooktadien’in Cl3CCN ve DBU eşliğinde gerçekleştirilen
reaksiyondan -hidroksi -amino asit öncüleri elde edildi. Epoksit’in, metanolik HCl ile
açılmasıyla, hidroksiklorosiyanosiklookten bileşiği sentezlendi. Elde edilen bileşiğin
(S)--metilbenzilamin ile reaksiyonundan -hidroksi -amino asit öncüsü
diastereomerler elde edildi. Enantiyosaf olarak sentezlenen diastereomerlerin mutlak
stereokimyası X-Ray analizi ile belirlendi.
2014, 110 sayfa
Anahtar Kelimeler: Siklik -amino asitler, cispentacin, oryzoxymycin, hidroksi-amino asit
i
ABSTRACT
Master Thesis
SYNTHESIS OF POLYFUNCTIONAL CYCLOCTANE -AMINO ACID
Emine YURTOĞLU
Atatürk University
Graduate School of Natural and Applied Sciences
Department of Chemistry
Organic Chemistry Division
Supervisor: Prof. Dr. Ramazan ALTUNDAŞ
-hydroxy--amino acid derivatives carrying one or more hydroxyl groups are of great
interests to scientists due to their pharmacological activities. Since there are very few
examples of eight membered cyclic systems containing -amino acids, we synthesized a
chlorocyanocyclooctene compound containing both a prochiral and chiral center. The
diastereomers of the -amino acid precursors containing the general cyclooctane
structure were obtained via the substitution of (S)--methyllbenzylamine with chlorine.
The expected selectivity was not obtained through the hydrogenation of these
diastereomers. The elimination of chlorine from chlorocyanocyclooctene yielded
cyanocyclooctadiene and this was further oxidized to epoxycyanocyclooctene. The
epoxide ring opening from the allylic position of epoxycyanocyclooctene with (S)-methyllbenzylamine was unsuccessful. Hydroxycyanocyclooctadiene containing a
prochiral and chiral center was synthesized via the opening of the epoxide’s lewis acid
in both strong and weak base conditions. The -hydroxy -amino acid precursors were
obtained from the reaction of hydroxycyanocyclooctadiene in the presence of Cl3CCN
and DBU. The hydroxychlorocyanocyclooctene compound was synthesized via the ring
opening of the epoxide with methanolic HCl. Diastereomers of the -hydroxy -amino
acid precursors were obtained from the reaction of (S)--methyllbenzylamine with the
previously synthesized compound. The absolute stereochemistry of the synthesized
enantiopure diastereomers were confirmed with X-Ray analysis.
2014, 110 pages
Keywords: Cyclic -amino acids, cispentacin, oryzoxymycin, hydroxy--amino acids
ii
TEŞEKKÜR
Yüksek Lisans Tez çalışması olarak yürütülen bu çalışma, Sayın Prof. Dr. Ramazan
ALTUNDAŞ yönetiminde, Atatürk Üniversitesi Fen Fakültesi Organik Kimya
Anabilim Dalı’nda gerçekleştirilmiştir.
Çalışmalarımın her aşamasında desteğini esirgemeyen danışmanım Sayın Prof. Dr.
Ramazan ALTUNDAŞ’a içtenlikle teşekkürlerimi sunarım.
Çalışmalarım esnasında bilgi birikimlerinden faydalandığım Sayın Prof. Dr. Hasan
SEÇEN’e, Sayın Yrd. Doç. Dr. Serdar BURMAOĞLU’na, Sayın Yrd. Doç. Dr. M.
Fatih POLAT’a, Sayın Yakup GÜNEŞ’e, Sayın Öğr. Gör. Derya AKTAŞ’a teşekkür
ederim. Çalışmalarım esnasında yardım ve desteklerini gördüğüm çalışma arkadaşlarım;
Nejat ARÇELİK’e, Büşra ÖZTÜRK AYDIN’a, Ali Osman YILMAZ’a, Sakine
BAYSAL’a teşekkür ederim. Fen Fakültesi Kimya Bölümünde çalışan Emine Soydaş,
Mehmet Şinoforoğlu ve Yeliz Demir’e teşekkür ederim. Ayrıca aralarında çalışmaktan
mutluluk duyduğum Atatürk Üniversitesi Fen Fakültesi Kimya Bölümü elemanlarına ve
NMR spekrumlarının alınmasında ve yorumlanmasında göstermiş oldukları özverili
çalışmalardan dolayı Sayın Prof. Dr. Cavit KAZAZ’a ve X-Ray analizi için Sayın Prof.
Dr. Ertan ŞAHİN’e teşekkürlerimi sunarım.
Çalışmalarıma maddi destek veren TÜBİTAK’a (112T870 nolu proje) teşekkür ederim.
Ayrıca hayatımın her anında beni destekleyen, huzurlu bir ortamda büyüten, sevgi,
saygı ve anlayışla beni yetiştiren anne ve babama; her daim yanımda olan, sevgili
kardeşlerime çok teşekkür ederim.
Emine YURTOĞLU
Aralık, 2014
iii
İÇİNDEKİLER
ÖZET.................................................................................................................................. i
ABSTRACT ...................................................................................................................... ii
TEŞEKKÜR .....................................................................................................................iii
SİMGELER ve KISALTMALAR DİZİNİ ...................................................................... vi
ŞEKİLLER DİZİNİ......................................................................................................... vii
ÇİZELGELER DİZİNİ .................................................................................................... xi
1. GİRİŞ ....................................................................................................................... 1
2. KURAMSAL TEMELLER ................................................................................... 7
2.1. Halka Kapanma Yöntemiyle -Amino Asit Sentezi ........................................... 10
2.2. Seçici İndirgeme İle -Amino Asit Sentezi ........................................................ 12
2.3. 1,2-Dikarboksilik Asit Türevlerinden -amino Asit Sentezi .............................. 13
2.4. -laktamlardan -amino Asit Sentezi.................................................................. 15
2.5. Micheal Tipi Katılma ile -amino Asit Sentezi .................................................. 17
2.6. Diels-Alder Reaksiyonuyla -Amino Asit Sentezi ............................................. 18
2.7. Doğal Kaynaklardan -amino Asit Sentezi ......................................................... 20
2.8. Oksazolin Halkasının Hidrolizi ile -Amino Asitlerin Sentezi.......................... 22
2.9. trans-Sikloheptan ve Siklooktan -amino Asit Sentezi ..................................... 22
2.10. Fonksiyonellendirilmiş Siklooktan -Amino Asit Sentezi .............................. 23
2.11. Çalışmanın Amacı ............................................................................................. 24
3. MATERYAL ve YÖNTEM ................................................................................. 27
4. ARAŞTIRMA BULGULARI .............................................................................. 63
4.1. 101’in Sentezi ...................................................................................................... 63
4.2. 102’nin Sentezi .................................................................................................... 65
4.3. 103’ün Sentezi ..................................................................................................... 66
4.4. 104’ün Sentezi ..................................................................................................... 67
4.5. 107a ve 107b’nin Sentezi .................................................................................... 68
4.6. 109’un sentezi...................................................................................................... 72
4.7. 110’un Sentezi ..................................................................................................... 74
iv
4.8. 113’ün sentezi...................................................................................................... 76
4.9. 114’in sentezi ...................................................................................................... 78
4.10. 118’in Sentezi .................................................................................................... 80
4.11. 123’ün sentezi.................................................................................................... 82
4.12. 132’nin Sentezi .................................................................................................. 85
4.13. 133a ve 133b’nin Sentezi .................................................................................. 87
4.14. 134’ün Sentezi ................................................................................................... 91
4.15. 135’in sentezi .................................................................................................... 93
4.16. 137a ve 137b’nin Sentezi .................................................................................. 97
4.17. 138a ve 138b’nin Sentezi .................................................................................. 98
5. SONUÇ ve TARTIŞMA ..................................................................................... 101
KAYNAKLAR ............................................................................................................. 108
ÖZGEÇMİŞ .................................................................................................................. 111
v
SİMGELER ve KISALTMALAR DİZİNİ
CDCl3
Kloroform-d1
d
Dublet
DCM
Diklorometan
dd
Dubletin dublet
ddd
Dutletin dubletinin dubleti
ddq
Dubletin dubletinin kuvarteti
ddt
Dubletin dubletinin tripleti
DMF
Dimetilformamid
dq
Dubletin kuvarteti
EA
Etil asetat
Ee
Enantiyomerik aşırılık
Ekv
Ekivalent
G1
Grup
HRMS
Yüksek çözünürlüklü kütle spektrometre
Hz
Hertz
IR
Kızılötesi
m
meta
m
Multiplet
MS
Kütle spektrumu
Ph
Fenil
s
Singlet
t
Triplet
td
Tripletin dubleti
tert-bütil
Tersiyerbütil
THF
Tetrahidrofuran
TLC
İnce tabaka kromatografisi
tt
Tripletin tripleti
α
Alfa
β
Beta
vi
ŞEKİLLER DİZİNİ
Şekil 1.1. Amino asitlerin amin (-NH2) grubunun pozisyonuna göre isimlendirilmesi
ve sınıflandırılması ........................................................................................... 1
Şekil 1.2. -Amino asitlerin genel sınıflandırılması ......................................................... 2
Şekil 1.3. Serbest halde bulunan β-amino asitler .............................................................. 3
Şekil 1.4. Pantotenik asit (Vitamin B3), β-Alanin’in yapısı............................................. 4
Şekil 1.5. Cryptophycin, L-Dopa ..................................................................................... 4
Şekil 1.6. Jasplakinolide ve Taxol .................................................................................... 5
Şekil 1.7. Biyolojik aktiviteye sahip -amino asitler ....................................................... 6
Şekil 2.1.-amino asitlerden elde edilebilecek türler....................................................... 7
Şekil 2.2.Cispentacin ....................................................................................................... 8
Şekil 2.3. İcofungipen, BAY Y9379 ve tilidin bileşikleri ................................................ 8
Şekil 2.4. Amypurimycin ve pitucamycin bileşikleri ....................................................... 9
Şekil 2.5.Oryzoxymycin .................................................................................................. 9
Şekil 2.6. Asiklik bir yapıdan halka kapanmasıyla siklopenten -amino ester
sentezi ............................................................................................................. 10
Şekil 2.7. (S)-Metiyonin ve (R)-Allilglisin’den halka kapanmasıyla -amino ester
sentezi ............................................................................................................. 11
Şekil 2.8. Asiklik bir yapıdan halka kapanmasıyla siklohepten -amino ester sentezi .. 11
Şekil 2.9. Halka kapanma yöntemiyle 7 üyeli -aminoester sentezi .............................. 12
Şekil 2.10. Enaminlerin katalitik indirgenmesiyle cis-siklopentan -amino ester
sentezi ............................................................................................................. 12
Şekil 2.11. Enaminlerin NaBH3OAc indirgenmesiyle cis ve trans -amino ester
sentezi ............................................................................................................. 13
Şekil 2.12. Enaminlerden cis-selektif katalitik indirgenmesiyle cis-sikloheptan
-amino ester sentezi ...................................................................................... 13
Şekil 2.13. Düzenlenme reaksiyonuyla siklohekzan -amino asit sentezi ..................... 14
Şekil 2.14. Düzenlenme reaksiyonuyla icofungipen sentezi .......................................... 15
Şekil 2.15. Siklopentenden -laktam oluşmasıyla cispentacin sentezi ........................... 16
vii
Şekil 2.16. Rasemik -laktamdan cispentacin eldesi ...................................................... 16
Şekil 2.17. Siklookten ve 1,5 siklooktedienden -amino asit sentezi............................. 17
Şekil 2.18. Micheal tipi katılmayla cispentacin sentezi .................................................. 17
Şekil 2.19. ,-doymamış esterlerden -amino asit sentezi .......................................... 18
Şekil 2.20. Asiklik bir yapıdan Diels-Alder’le siklohekzen -amino asit sentezi .......... 19
Şekil 2.21. Asiklik bir yapıdan Diels-Alder’le siklohekzen -amino asit sentezi .......... 20
Şekil 2.22. -Pinenden-laktam üzerinden-amino asit sentezi ................................. 21
Şekil 2.23. (+)-Myrtenal Micheal tipi katılmayla -amino asit sentezi .......................... 21
Şekil 2.24. Oksazolin Halkasının Hidrolizi ile -Amino asitlerin Sentezi ..................... 22
Şekil 2.25. Cis-2-hidroksisikloalkanlardan 7 ve 8 üyeli -amino asit sentezi ................ 23
Şekil 2.26. -laktamlardan fonksiyonellendirilmiş siklooktan -amino asit sentezi ..... 24
Şekil 3.1. 103 ve 104 bileşiklerinin sentezi .................................................................... 27
Şekil 3.2. 107a ve 107b’nin sentezi ................................................................................ 30
Şekil 3.3. 108a ve 108b’nin sentezi ................................................................................ 31
Şekil 3.4. 108c ve 108d’nin sentezi ................................................................................ 32
Şekil 3.5. 104’ün sentezi ................................................................................................. 32
Şekil 3.6. 110’un sentezi ................................................................................................. 33
Şekil 3.7. 112a ve 112b’in sentez planı .......................................................................... 34
Şekil 3.8. 114’ün sentezi ................................................................................................. 35
Şekil 3.9. 114’ün oluşumu için önerilen mekanizma ...................................................... 36
Şekil 3.10. 116’nın sentez planı ...................................................................................... 37
Şekil 3.11. 118’in sentez planı ........................................................................................ 38
Şekil 3.12. 118’in Metal tuzları ile sentezi ..................................................................... 39
Şekil 3.13. 118’in K2CO3 kullanılarak sentezi ................................................................ 40
Şekil 3.14. 118’in NaN3 ile sentezi ................................................................................. 41
Şekil 3.15. 123 ve 124’ün sentezi ................................................................................... 43
Şekil 3.16. 125’in sentez planı ........................................................................................ 44
Şekil 3.17. 127’nin sentez planı ...................................................................................... 45
Şekil 3.18. 128’in sentez planı ........................................................................................ 45
Şekil 3.19. 130a ve 130b’nin sentez planı ...................................................................... 47
Şekil 3.20. 129’un sentez planı ....................................................................................... 46
viii
Şekil 3.21. 132’nin sentezi .............................................................................................. 47
Şekil 3.22. 130a ve 130b’nin sentezi .............................................................................. 47
Şekil 3.23. 133a ve 133b’nin sentezi .............................................................................. 49
Şekil 3.24. 134’den 133a ve 133b’nin sentezi................................................................ 50
Şekil 3.25. 135’in sentezi ................................................................................................ 52
Şekil 3.26. 137a ve 137b’nin sentez planı ...................................................................... 54
Şekil 3.27. 137a, 137b ve 138a, 138b’nin sentezi ......................................................... 55
Şekil 3.28. 140a, 140b ve 141a, 141b’nin sentezi ......................................................... 57
Şekil 3.29. 143a, 143b ve 144a, 144b’nin sentezi ......................................................... 57
Şekil 3.30. 145a ve 145b’nin sentez planı ...................................................................... 58
Şekil 3.31. 147a ve 147b’nin sentez planı ...................................................................... 60
Şekil 3.32. 149’un sentez planı ....................................................................................... 60
Şekil 3.33. 148’in sentez planı ........................................................................................ 61
Şekil 3.34. 153’ün sentezi ............................................................................................... 61
Şekil 4.1. 101’in 1H-NMR spektrumu ............................................................................ 64
Şekil 4.2. 101’in 13C-NMR spektrumu ........................................................................... 64
Şekil 4.3. 102’nin 1H-NMR spektrumu .......................................................................... 65
Şekil 4.4. 103’ün 1H-NMR spektrumu ........................................................................... 66
Şekil 4.5. 103’ün 13C-NMR spektrumu .......................................................................... 67
Şekil 4.6. 107a’nın 1H-NMR spektrumu ........................................................................ 69
Şekil 4.7. 107a’nın 13C-NMR spektrumu ....................................................................... 70
Şekil 4.8. 107b’nin 1H-NMR spektrumu ........................................................................ 70
Şekil 4.9. 107b’nin 13C-NMR spektrumu ...................................................................... 71
Şekil 4.10. 107b kristalinin ORTEPIII çizimi ................................................................ 71
Şekil 4.11. 109’un 1H-NMR spektrumu ......................................................................... 73
Şekil 4.12. 109’un 13C-NMR spektrumu ........................................................................ 73
Şekil 4.13. 109’un APT-NMR spektrumu ...................................................................... 74
Şekil 4.14. 110’un 1H-NMR spektrumu ......................................................................... 75
Şekil 4.15.110’un 13C-NMR spektrumu ......................................................................... 76
Şekil 4.16. 113’ün 1H-NMR spektrumu ......................................................................... 77
Şekil 4.17. 113’ün APT-NMR spektrumu ...................................................................... 78
Şekil 4.18. 114’ün 1H-NMR spektrumu ......................................................................... 79
ix
Şekil 4.19. 114’ün 13C-NMR spektrumu ........................................................................ 80
Şekil 4.20. 118’in 1H-NMR spektrumu .......................................................................... 81
Şekil 4.21. 118’in 13C-NMR spektrumu ......................................................................... 82
Şekil 4.22. 123’ün 1H-NMR spektrumu ......................................................................... 83
Şekil 4.23. 123’ün bileşiğinin13C-NMR spektrumu ....................................................... 84
Şekil 4.24. 123’ün NOE-NMR spektrumu ..................................................................... 84
Şekil 4.25. 132’nin 1H-NMR spektrumu ........................................................................ 86
Şekil 4.26. 132’nin bileşiğinin13C-NMR spektrumu ..................................................... 86
Şekil 4.27. 133a’nın 1H-NMR spektrumu ...................................................................... 88
Şekil 4.28. 133a’nın bileşiğinin13C-NMR spektrumu .................................................... 89
Şekil 4.29. 133a’nın bileşiğinin APT-NMR spektrumu ................................................. 89
Şekil 4.30. 133b’nin 1H-NMR spektrumu ...................................................................... 90
Şekil 4.31. 133b’nin 13C-NMR spektrumu ..................................................................... 91
Şekil 4.32. 134’ün 1H-NMR spektrumu ......................................................................... 92
Şekil 4.33. 134’ün APT-NMR spektrumu ...................................................................... 93
Şekil 4.34. 135’in 1H-NMR spektrumu .......................................................................... 94
Şekil 4.35.135’in 13C-NMR spektrumu .......................................................................... 95
Şekil 4.36. 135’in -NMR spektrumu............................................................................... 95
Şekil 4.37. 135’in NOE-NMR spektrumu ...................................................................... 96
Şekil 4.38. 135’in kristalinin ORTEPIII çizimi .............................................................. 96
Şekil 4.39. 137a, 137b’nin 1H-NMR spektrumu ............................................................ 97
Şekil 4.40. 138b’nin 1H-NMR spektrumu ...................................................................... 99
Şekil 4.41. 138’in bileşiğinin13C-NMR spektrumu ........................................................ 99
Şekil 4.42. 138b kristalinin ORTEPIII çizimi .............................................................. 100
x
ÇİZELGELER DİZİNİ
Çizelge 3.1. Konsantrasyona bağlı olarak belirlenen verim ........................................... 29
Çizelge 3.2. 107a’nın hidrojenasyon reaksiyon şartları ve sonucu ................................ 31
Çizelge 3.3. 107b’nin hidrojenasyon reaksiyon şartları ve sonucu ................................ 32
Çizelge 3.4. 103’un eliminasyon reaksiyon şartları ve sonucu ....................................... 33
Çizelge 3.5. 114’ün sentezinde kullanılan reaksiyon şartları ......................................... 37
Çizelge 3.6. 118’in sentezinde kullanılan reaksiyon şartları .......................................... 39
Çizelge 3.7. 118’in Metal tuzları ile sentezinde kullanılan reaksiyon şartları ................ 40
Çizelge 3.8. 118’in K2CO3 ile sentezinde kullanılan reaksiyon şartları ......................... 41
Çizelge 3.9. 123’ün sentezinde kullanılan reaksiyon şartları ......................................... 43
Çizelge 3.10. 123’den 128’in sentezinde kullanılan reaksiyon şartları .......................... 46
Çizelge 3.11. 132’nin sentezinde kullanılan reaksiyon şartları ...................................... 47
Çizelge 3.12. 133a ve 133b’nin sentezinde kullanılan reaksiyon şartları ...................... 51
Çizelge 3.13. 135 ve 136’nın sentezinde kullanılan reaksiyon şartları........................... 53
Çizelge 3.14. 137a, 137b ve 138a, 138b’nin sentezinde kullanılan reaksiyon şartları .. 55
Çizelge 3.15. 145a ve 145b’nin sentezinde kullanılan reaksiyon şartları ...................... 58
Çizelge 3.16. 148’in sentezinde kullanılan reaksiyon şartları ........................................ 61
Çizelge 3.17. 153’ün sentezinde kullanılan reaksiyon şartları ....................................... 62
xi
1
1. GİRİŞ
Amino asitler, karboksilik asit ve amino grubu ihtiva eden bileşiklerdir. Ayrıca amino
asitler bir yan gruba (R) sahiptir. R grubu, alkil, aril, heteroaraomatik hidrokarbonların
yanı sıra amin, hidroksil ve sülfür gibi fonksiyonel gruplar da olabilir. IUPAC
adlandırılmasında en uzun karboksilik asit zinciri seçilir ve karboksilik grubundan
başlanarak numaralandırılır. Amin fonksiyonel grubunun pozisyonu belirtildikten sonra
ilgili hidrokarbonun sonuna oik eki getirilir. Geleneksel isimlendirmede ise karbonil
karbonuna en yakın karbondan başlanarak alkil zinciri --- olarak belirlenir ve
fonksiyonel grubun bağlı olduğu pozisyon belirtildikten sonra asit ismi yazılır.
Şekil 1.1. Amino asitlerin amin (-NH2) grubunun pozisyonuna göre isimlendirilmesi ve
sınıflandırılması
Fonksiyonel grubun bağlı olduğu merkez sekonder veya tersiyer ise isimlendirme bu
merkezlerin uzayda dizilişlerini de göz önüne alarak yapılır. -amino asitlerin
stereokimyasal isimlendirilmelerinde D ve L terimleri sıklıkla kullanılmakla beraber son
yıllarda stereomerkezlerin isimlendirilmelerinde R ve S terimleri kullanılmaktadır.
2
-Amino asitlerin peptit bağları ile birleşmesi sonucu proteinler oluşmaktadır. Tabiatta
yaklaşık 300 tane -amino asit bilinmesine rağmen bunlardan sadece L formunda olan
20 amino asit protein yapısında bulunur. Çok sayıda amino asitten oluşan proteinler
büyük molekül ağırlıklarına sahiptirler. Proteinler, canlı hücrede birçok hayati
fonksiyondan (enzimler, hormon sistemi, bağışıklık sistemi, beyin gelişimi) sorumlu
olan en önemli birimdir. Amino asit yapısında hem karboksil hem de amin grubu ihtiva
ettiği için asidik ve bazik özellik gösterebilirler. Amino grubunun protonlanmasıyla
pozitif yüke sahip olur ve asidik özellik gösterirken; karboksil grubundan proton
ayrılmasıyla, negatif yüke sahip olur ve bazik özellik gösterir. Bundan dolayı
aminoasitler amfoter özelliğe sahiptir. Yani asite karşı baz, baza karşı asit gibi
davranırlar.
Doğada bulunan β-amino asitler -amino asitlere göre oldukça azdır. β-amino asitler αamino asitler gibi proteinlerin yapısında yer almazlar. Bu bileşikler serbest formda
bulunabildikleri gibi peptid, siklopeptid, depsipeptid, glikopeptid, alkaloid ve terpenoid
gibi doğal ürünlerin temel yapılarını da oluşturmaktadırlar (Von Nussbaum and
Spiteller 2004).
-amino asitler genel olarak α, β, veya hem α hem de β konumunda bulundurdukları
fonksiyonel gruplara göre alifatik, siklik ve hetereosiklik olarak sınıflandırılabilir (Şekil
1.5).
Şekil 1.2. -Amino asitlerin genel sınıflandırılması
3
Günümüzde serbest formda bulunan sadece 8 tane β-amino asit bilinmektedir. Bunlar;
β-Alanin, β-Lösin, β-Lisin, β-Arginin, β-Glutamat, β-Glutamin, β-Fenilalanin ve βTirozin’dir.
Şekil 1.3. Serbest halde bulunan β-amino asitler
α-amino asitlerin oluşturduğu peptitlerin peptidaz enzimi ile parçalanması oldukça
kolaydır.
Fakat
bu
enzimler
β-amino
asitlerin
oluşturduğu
peptid
bağını
tanıyamadıklarından dolayı parçalayamamaktadır (Steer et al. 2002). Bakteriler,
mantarlar, siyanobakteriler ve bitkiler ikincil metabolitlerinde β-amino asit içerirler. Bu
bileşiklerin birçoğu antibiyotik, antifungal, analjezik özellik göstererek sekonder
metabolitlerin yapısında koruma ve savunmada görev almaktadırlar (Buchwaldt et al.
1992). Memelilerde -peptidaz enzimi olmadığından protein yapısına yerleştirilen amino asitler proteinlerin farmakalojik ve biyolojik etkilerini artırırlar. Yeni ilaçların
keşfedilmesinde ve sentezinde β-amino asitler oldukça önemlidir (Pegova et al. 2000).
1909 yılında Carnose’nin hidrolizi ile elde edilmiş olan β-Aminopropiyonik asit (βAlanin) bilinen en basit β-amino asittir. Protein yapısına katılmamasına rağmen vitamin
4
B3 (13) gibi biyolojik aktiviteye sahip birçok bileşiğin temel yapısını oluşturur
(Windholdz 1976).
Şekil 1.4. Pantotenik asit (Vitamin B3), β-Alanin’in yapısı
Antitümör etkiye sahip olduğu bilinen cryptophycin bileşiği de bünyesinde β-amino asit
bulundurmaktadır (Shih et al. 1999).
Şekil 1.5. Cryptophycin, L-Dopa
Birçok bitkisel molekülde bulunan ve biyolojik aktiviteye sahip L-Dopa β-amino asit
yapısı ihtiva etmektedir. L-Dopa çikolatada bulunan ve mutluluk hormonunun
salgılanmasında görevli olan feniletilamin yapısına sahiptir (Spiteller et al. 2000). LDopa doğal olarak insan vücudunda bulunmaz fakat bir tür fasulyeden L izomerinin
izolasyonu ile elde edilebilir. L-Dopa tavşanlarda glikoz metabolizmasını ve kan
basıncını artırır (Hornykiewicz 2002).
Böcek öldürücü, anti mantar ve anti kanser özellik gösteren Jasplakinolide bir β-amino
asit yapısı ihtiva etmektedir (Crews et al. 1986; Zabriskie et al. 1986).
5
Şekil 1.6. Jasplakinolide ve Taxol
-amino asitlere verilebilecek en iyi örneklerden birisi de Taxol ticari ismi ile satılan
paclitaxel
bileşiğidir.
Taxus
brevifolia
bitkisinden
(porsuk
ağacı
dallarının
kabuklarından) izole edilmiş olup, antikanser etkiye sahiptir (Stierle et al. 1993;
Nicolaou et al. 1994).
Mantarlardan izole edilen ve antibiyotiklerin önemli sınıfını oluşturan -laktam
yapısındaki Penicilin ve Cephalosporin bileşikleri de β-amino asit iskeleti ihtiva
etmektedirler (Schofield et al. 1999).
6
Şekil 1.7. Biyolojik aktiviteye sahip -amino asitler
Doğum kontrol ilacı olarak kullanılan Microginin (Okino et al. 1993), Bestatin ticari
ismiyle satılan, 1976’da Streptomyces olivoreticuli’den izole edilen, antikanser ilacı
olarak kullanılan Ubenimex bileşiği (Umezawa et al. 1976) ve
amino peptidaz
inhibitörü olarak bilinen Amastatin bileşikleri (Roers and Verdine 2001) β-amino asitler
için verilebilecek örneklerdendir.
7
2. KURAMSAL TEMELLER
-amino
asitler
biyolojik
aktiviteden
sorumlu
ilaç
öncü
bileşikler
olarak
bilinmektedirler. Özellikle bir ya da daha fazla hidroksil grubu taşıyan -hidroksi-aminoasit
örnekleri
araştırmacıların
ilgisini
çekmektedir.
Çünkü
grupların
fonksiyonellendirilmeye açık olmaları ve biyolojik etkiden sorumlu sistemlerle kolayca
etkileşmelerinden dolayı biyolojik aktivitede önemli değişiklikler gözlenmektedir. Bu
bileşikler doğal ürün ve antibiyotiklerin yapısında bulunurlar (Kiss and Fülöp 2012;
Kiss et al. 2014). Ayrıca hidroksi aminoasitlerin, peptit ve heterosiklik halkaların
sentezlerinde çıkış bileşikleri olarak kullanıldığı bilinmektedir (Szakonyi et al. 2005).
-pozisyonunda sübstitüent içeren -amino asitlerin yanı sıra, -pozisyonunda
sübstitüent içermeyen -amino--hidroksi asitler de gösterdikleri farmakolojik etki ve
biyolojik aktivitelerinden dolayı araştırmacıların ilgisini çekmektedir (Griffith 1986;
Shinozaki 1996).
Şekil 2.1.-amino asitlerden elde edilebilecek türler
Doğada bulunan ilk siklik -amino asit cispentacindir (Kiss et al. 2008) ve antibiyotik
etkiye sahiptir (Fülöp 2000). Cispentacin Bacillus cereus L450-B2 ve Streptomyces
setoni 7562 de serbest formda bulunmaktadır. Cispentacin in vivo ve in vitro antifungal
8
aktivite göstermektedir (Konishi et al. 1989; Oki et al. 1989; Kawabata et al. 1990;
Iwamoto et al. 1990).
Şekil 2.2.Cispentacin
5 ve 6 üyeli halka sistemlerine icofungipen ve BAY Y9379 önemli derecede antifungal
ve antibiyotik özellik gösteren -amino asitler örnek verilebilir (Ziegelbauer 1998; Kiss
and Fülöp 2012). Tilidin ise şiddetli ağrılara karşı orta seviyede terapi için kullanılan
opioid (vücutta morfin gibi etki gösteren kimyasal maddeler) analjeziktir (Coursindel et
al. 2011).
Şekil 2.3. İcofungipen, BAY Y9379 ve tilidin bileşikleri
Streptomyces novoguineensis’den izole edilen amypurimycin’in in vivo ve in vitro
olarak pirinçte hastalık yapan bir organizma olan Pyricularia oryzae’e karşı aktivite
gösterir. Bunun yanısıra Alternaria kikuchiana ve Helminthosporium sigmoideum’a
karşı in vitro aktivite gösterir (Fülop 2001). Pitucamycin’in ise antibiyotik özelliği
bilinmektedir (Gomes et al. 2010).
9
Şekil 2.4. Amypurimycin ve pitucamycin bileşikleri
Oryzoxymycin bilinen ilk hidroksil grubu içeren siklik -amino asittir. -amino asit
yapılarına hidroksil gruplarının yerleştirilmesi biyolojik aktivite üzerinde önemli bir
etkiye sahip olduğu gözlenmiştir (Bunnage et al. 2003). Streptomyces türlerinden izole
edilen ve Xanthonas orzyae’ya karşı in vitro aktivite gösterdiği bilinen ilk doğal siklik
hidroksi--amino asit örneğidir (Hashimot et al. 1972).
Şekil 2.5.Oryzoxymycin
Literatürde 5 ve 6 üyeli siklik -amino asitlerlerin enantiyosaf olarak sentezi ile ilgili
birçok çalışma mevcuttur. Ancak orta büyüklükteki 7 ve 8 üyeli halka sistemlerinde amino asit örneklerine daha az rastlanmaktadır. Bilinen en yaygın -amino asit sentez
yöntemi -amino asitlerin öncüleri olarak bilinen -laktamların hidrolizidir. Ayrıca amino asit sentez yöntemleri arasında asiklik sistemlerin siklizasyonu, uygun bileşikler
eşliğinde enantiyoselektif sentez, enzimatik rezülüsyon ve rasematların rezülüsyonuyla
diastereomer ayrımı yer almaktadır. 5, 6 ve 7 üyeli siklik -amino asitler benzer şekilde
10
bu yöntemlerin geneliyle sentezlenebilmektedir. Ancak daha büyük halka sistemi olarak
adlandırılan siklooktan -amino asit sentezi asiklik sistemlerin siklizasyonu ile
yapılamamaktadır (Fülop 2001; Kiss and Fülöp 2012).
2.1. Halka Kapanma Yöntemiyle -Amino Asit Sentezi
Siklik -amino asitler, asiklik -amino asit türevlerinden halka kapatma yöntemiyle
hazırlanabilmektedir.
Bu
yöntemin
en
önemli
avantajı
çift
bağa
sahip
fonksiyonellendirilmiş türevleri olan siklik -amino asitlerin sentezlenebilmesidir.
Doymamış asiklik esterlere kiral lityum amidlerin katılması sonucunda iki stereomerkez
oluşturulmaktadır.
Kiral lityum amidin -doymamış sisteme katılmalarının ardından oluşan yapının
Rutenyum alkilidin katalizörüyle halka kapanması sonucu 3 ve 6 elde edilmiştir
(Chippindale et al. 2003) (Şekil 2.6).
Şekil 2.6. Asiklik bir yapıdan halka kapanmasıyla siklopenten -amino ester sentezi
11
Arndt-Eistert
reaksiyonuyla
(S)-Metiyonin
ve
(R)-allilglisin
amino
esterleri
oluşturulmaktadır. Daha sonra 5 ve 6 üyeli -amino esterler halka kapatma yöntemiyle
sentezlenmektedir (Gardiner et al. 2004) (Sentez 2.7).
Şekil 2.7. (S)-Metiyonin ve (R)-Allilglisin’den halka kapanmasıyla -amino ester
sentezi
Yedi üyeli siklik -amino asit türevlerinin sentezi diolefinik ara ürün üzerinden başarı
ile sentezlenmiştir. Sonuç olarak aminden 2 karbon uzaklıkta olefinik bir bağ ve
enantiyomerik trans--aminosiklohepten ester oluşturulmuştur (Chippindale et al. 2003)
(Şekil 2.8).
Şekil 2.8. Asiklik bir yapıdan halka kapanmasıyla siklohepten -amino ester sentezi
12
Optikçe saf serinden çıkarak halka kapanma yöntemiyle trans--aminosiklohepten elde
edilebilmektedir (Gardiner et al. 2004) (Şekil 2.9).
Şekil 2.9. Halka kapanma yöntemiyle 7 üyeli -aminoester sentezi
2.2. Seçici İndirgeme İle -Amino Asit Sentezi
Son yıllarda kiral katalizör kullanılarak enantiyoselektif -amino asit sentez yöntemleri
geliştirilmektedir. Siklik enaminlerin katalitik asimetrik hidrojenasyonuyla cisaminokarboksilatlar elde edilebilir. Rutenyum katalizörü ve kiral ligandlar bu amaçla
kullanılmaktadır. 2-Asetilaminosikoalka-1-enkarboksilik asit etil ester’in, Rutenyum
katalizörlüğünde yüksek basınç altında hidrojenasyonu ile-amino ester sentezi
yapılmıştır.
Geliştirilen
bu
yeni
yöntemde
hem
kimyasal
verim
hem
de
enantiyoseçimlilik oldukça yüksektir (Tang et al. 2003). Reaksiyon oda sıcaklığında ve
yüksek basınç altında (50 atm.) gerçekleştirilmiştir. Sıcaklık artışına paralel olarak
seçimlilikte azalma görülmektedir (Şekil 2.10).
Şekil 2.10. Enaminlerin katalitik indirgenmesiyle cis-siklopentan -amino ester sentezi
13
Enantiyosaf –(4-florobenzil) aminosiklopentankarboksilat (22) polimeraz inhibitörü
olarak bilinen HCV NS5B’in öncüsüdür. keto esterin dönüşümüyle enaminlerin eldesi
için rasemik olarak 22’nin sentezine başvurulmaktadır (Dragovich et al. 2008). Rasemik
olarak sentezi gerçekleştirilen 22’nin (S)-(+)- mandelik asitle rezülüsyonu sonucunda
istenilen ürün HCV NS5B’in öncüsü enantiyosaf olarak elde edilmektedir (Şekil 2.11).
Şekil 2.11. Enaminlerin NaBH3OAc indirgenmesiyle cis ve trans -amino ester sentezi
7 üyeli halka sisteminde de -amino ester eldesi için katalitik indirgenme yöntemi
uygulanmış ve kantitatif verimle cis ürün elde edilmiştir (Tang et al. 2003) (Şekil 2.12).
Şekil 2.12. Enaminlerden cis-selektif katalitik indirgenmesiyle cis-sikloheptan -amino
ester sentezi
2.3. 1,2-Dikarboksilik Asit Türevlerinden -amino Asit Sentezi
Diastereomerik olarak saf olan, 1,2-dikarboksilik asitler hem ticari olarak satın
alınabilmekte hemde Diels-Alder reaksiyonlarıyla bütadien ve maleik anhidritten
kolayca hazırlanmaktadır. Tetrahidroantranilik anhidrit kolayca hekzahidro analoğuna
14
indirgenmektedir. Hekzahidroftalik anhidritin ilk olarak amide dönüştürülmesi,
ardından
Hoffman
düzenlenmesiyle
cis
siklohekzan
amino
asit
sentezi
gerçekleştirilmiştir (Fülop 2001; Kiss and Fülöp 2012). Alternatif olarak da anhidritin
hidrolizi sonucu oluşan asit 28 Curtius düzenlenmesiyle 6 üyeli -amino asit 29’a
dönüştürülmüştür (Şekil 2.13).
Şekil 2.13. Düzenlenme reaksiyonuyla siklohekzan -amino asit sentezi
Mittendorf ve grubu desimetrizasyon yöntemini kullanarak yüksek enantiyoseçimlilik
(ee) ile icofungipen’i (34) elde etmişlerdir. Stokiyometrik miktarda guininin varlığında,
sinnamil alkol ile anhidrit 31’in alkoliziyle 32 elde edilmiştir (Hamersak et al. 2007).
Curtius düzenlenmesinin ardından koruyucu gruplar Pd(OAc)2 katalizörlüğünde
uzaklaştırılarak icofungipen (34) sentezlenmiştir (Şekil 2.14).
15
Şekil 2.14. Düzenlenme reaksiyonuyla icofungipen sentezi
2.4. -laktamlardan -amino Asit Sentezi
-amino asitler, -laktamların öncüsü olarak bilinirler. -aminoasit sentezlerinde laktamların hidrolizi kullanılmaktadır.
Sikloalkenlere klorosülfonil izosiyanatın 1,2-dipolar siklokatılması -laktam sentezi için
en iyi bilinen yoldur. Katılma her zaman stereo ve regioselektif olarak gerçekleşir.
Katılmanın ardından laktamın açılması sonucu -amino asitler elde edilmektedir (Kiss
and Fülöp 2012) (Şekil 2.15).
16
Şekil 2.15. Siklopentenden -laktam oluşmasıyla cispentacin sentezi
Rasemik -laktamların enzimatik olarak açılmasıyla -amino asitler enantiyosaf olarak
elde edilebilmektedir. Enzimatik reaksiyonlarla yapılan çalışmalarda genel olarak
reaksiyon verimleri düşüktür. -laktam açılmalarında da kimyasal verimler düşük,
ürünlerin enantiyosaflığının ise oldukça yüksek olduğu görülmüştür (Forro and Fülöp
2003). Bu yöntemin oldukça sınırlı birkaç türevde kullanılması yöntemin dezavantajını
ortaya koymaktadır (Şekil 2.16).
Şekil 2.16. Rasemik -laktamdan cispentacin eldesi
Beş ve altı üyeli siklik-amino asitlere benzer şekilde siklookten veya 1,5
siklooktadiene CSI`in katılmasıyla -laktam oluşturulmakta ve daha sonra -laktamın
hidroliziyle cis--amino asit sentezlenmektedir (Forro et al. 2001) (Şekil 2.17).
17
Şekil 2.17. Siklookten ve 1,5 siklooktedienden -amino asit sentezi
2.5. Micheal Tipi Katılma ile -amino Asit Sentezi
,-doymamış karboksilik asit türevleri siklik -amino asit sentezi için çok uygun
başlangıç maddeleridir. Kiral lityum amidlerin katılması sonucu stereoselektif olarak amino asitlerin sentezi başarılabilmektedir. 5, 6 ve 8 üyeli siklik -amino asitlerde
konjuge katılma başarılmıştır. 5 üyeli siklik ,-doymamış estere 53, lityum amidin
katılması sonucunda 54 elde edilmistir. Bu bileşikte karboksilik asit ve amin grubunun
aynı yönlu olduğu bulunmuştur. Koruyucu grupların hidrolizinin ardından cispentacin
(55) elde edilmistir (Davies et al. 2006) (Şekil 2.18).
Şekil 2.18. Micheal tipi katılmayla cispentacin sentezi
Bir başka yöntemde ise cis sikloktan  amino asit sentezini Garrido ve grubu siklookten,
1,3- ve 1,5-siklooktadienden başlayarak gerçekleştirmiştir. İlk olarak dien sistemi
epoksitlenmiş ve epoksit halkası TMSCN ile Et2AlCl eşliğinde açılarak 57 bileşiği elde
18
edilmiştir.
Nitril
grubunun
hidrolizinin
ardından
karboksilik
asit,
estere
dönüştürülmüştür. Ester türevlerinin indirgenmesi sonucu 62 elde edilmektedir
(Garrido et al. 2008) (Şekil 2.19).
Şekil 2.19. ,-doymamış esterlerden -amino asit sentezi
2.6. Diels-Alder Reaksiyonuyla -Amino Asit Sentezi
Diels-Alder reaksiyonu, siklik yapılarda yeni stereomerkezlerin oluşturulmasında
sıklıkla kullanılan bir yöntemdir.
Ayrıca siklik -amino asit eldesinde de sıklıkla
kullanılır. Siklokatılma reaksiyonları sadece halka oluşturmak için en güçlü yöntem
olmayıp aynı zamanda moleküllerin fonksiyonellendirilmesinde de kullanılmaktadır. Bu
19
maksatla 63 den başlanarak 2-amino-3-siklohekzen karboksilik asit türevleri (67, 68)
rasemik olarak sentezlenebilmektedir (Choi and Silverman 2002) (Şekil 2.20).
Şekil 2.20. Asiklik bir yapıdan siklohekzen -amino asit sentezi
Steel ve grubu -hidroksi--aminoasit sentezi için furanın Diels-Alder katılma
reaksiyonundan yaralanmışlardır. Nitroalken’ın furana Diels-Alder katılması ile
oksonorbornen (71a, 71b)’yi elde etmişlerdir. Katılmada reaksiyon şartlarına bağlı
olarak endo ve exo (71a, 71b) oranında değişiklikler olmaktadır. Ana ürün 71b’nin
güçlü ve hacimli bir baz olan KHMDS ile muamelesinden elde edilen 73 nolu bileşik,
ilk doğal siklik hidroksi--amino asit Oryzoxymycin’in ana iskelet yapısına sahiptir.
73’de Oryzoxymycin’de olduğu gibi amino ve hidroksil grubu anti konumdadırlar.
Ayrıca çift bağların hidrojenasyonu ile -hidroksi-aminoasit 74 elde edilmiştir. (Şekil
2.21).
20
Şekil 2.21. Furan’dan siklohekzan -amino asit sentezi
2.7. Doğal Kaynaklardan -amino Asit Sentezi
Optikçe saf -amino asit dönüşümünü başarabilmenin en etkili yolu mevcut kiral
monoterpenlerden yola çıkmaktır. Farklı monoterpenlerden yola çıkarak bir seri siklik
-amino asitler sentezlenebilmektedir. -Pinen’e (75) , CSI’ın 1,2-dipolar siklokatılma
reaksiyonu sonucu regio ve stereoselektif olarak -laktam oluşmaktadır. Laktamın
Boc2O ile korunmasının ardından laktam halkası LiOH ile açılarak -amino asit 78 elde
edilmektedir (Szakonyi et al. 2006) (Şekil 2.22).
21
Şekil 2.22. -Pinenden-laktam üzerinden-amino asit sentezi
Tabiatta var olan ve
enantiyosaf
çıkış bileşiklerinin kullanıldığı
-amino asit
sentezlerine bir başka örnek olarak 82’in sentezi verilebilir. (+)-myrtenal’dan (79) elde
edilen estere (80) lityum amidin konjuge katılması ile 81 elde edilmiştir. Burada ester
grubu ile amin grubu bir birine göre trans konfigurasyondadır. Debenzilasyon ve ester
hidrolizinin ardından trans--amino asit elde edilmiştir (Szakonyi et al. 2010) (Şekil
2.23).
Şekil 2.23. (+)-Myrtenal Micheal tipi katılmayla -amino asit sentezi
22
2.8. Oksazolin Halkasının Hidrolizi ile -Amino Asitlerin Sentezi
Metil-3-hidroksisikloalkankarboksilat
ve
trikloroasetonitril’in,
DBU
eşliğinde
reaksiyonundan olusan asetimidat grubunun esterin -karbonuna saldırısı ile oksazolin
türevlerinin sentezi başarılmıştır. Oksijen ve amin grubu molekülün aynı yüzünü
paylaştıklarından nükleofilik azot çift bağa, oksijene göre aynı yönden yaklaşmaktadır.
Oksazolin halkası asidik ortamda hidroliz edilerek 87a, 88a ve 87b, 88b nolu bileşikler
sentezlenmiştir (Matsushima and Kino 2009) (Şekil 2.24).
Şekil 2.24. Oksazolin Halkasının Hidrolizi ile -Amino asitlerin Sentezi
2.9. trans-Sikloheptan ve Siklooktan -amino Asit Sentezi
Yedi ve sekiz üyeli cis-2-hidroksisikloalkanlardan yola çıkılarak trans -amino asitler
(93a, 93b) kolayca elde edilebilir. Bunu gerçekleştirebilmek için öncelikle hidroksil
grubu tosil grubuna çevrilip ardından azitle substitue edilmelidir. Böylelikle hidroksil
grubunun stereokimyası degiştirilmiş olacaktır. Azitin indirgenmesini takiben ester
hidroliziyle yedi ve sekiz üyeli siklik enantiyosaf -amino asitler elde edilmektedir. Bu
yöntem enzimatik rezolusyonla elde edilen enantiyosaf esterlere de başarılı bir şekilde
uygulanarak enantiyosaf amino asitler elde edilmiştir (Kiss et al. 2004) (Şekil 2.25)
23
Şekil 2.25. Cis-2-hidroksisikloalkanlardan 7 ve 8 üyeli -amino asit sentezi
2.10. Fonksiyonellendirilmiş Siklooktan -Amino Asit Sentezi
Hidroksil, azit, amin, flor gibi gruplarla fonksiyonellendirilmiş -amino asitlerin
katıldığı peptidlerin önemli derecede biyolojik aktivite ve farmakolojik etki gösterdiği
bilinmektedir (Fülöp 2000). Rasemik -laktamın asidik ortamda hidroliziyle -amino
asit elde etmişlerdir. Sonrasında gerçekleştirdikleri amin grubunun Boc2O ile
korunmasının ardından çift bağ I2/KI sistemi ile iyodonyum ara ürününe
dönüştürülmüştür. Bikarbonatın asitten proton koparması ile oluşan karboksilatın
iyodonyum ara ürününe saldırısı ile iyodolaktonizasyon gerçekleştirilmiştir. İyotun
tributil kalay hidrür ile dehalojenasyonunun ardından laktonun hidrolizi sonucu -amino
asit elde edilmiştir (Palkó et al. 2010) (Şekil 2.26).
24
Şekil 2.26. -laktamlardan fonksiyonellendirilmiş siklooktan -amino asit sentezi
2.11. Çalışmanın Amacı
Literatürde siklik 5 ve 6 üyeli halka sistemlerinde -amino asitlerin sentezine yönelik
birçok çalışma bilinmektedir. Bununla birlikte orta büyüklükte halka sistemleri olan 7
ve 8 üyeli halkada -amino asitlerin asimetrik sentezleri ile ilgili çalışmalar oldukça
azdır. Asiklik bir bileşikten 7 ve 8’li halka oluşturmak 5 ve 6 üyeli halka sistemlerine
göre çok daha zordur. Asiklik bir zincir üzerinde ard arda gelen ve birden çok
stereomerkez yerleştirilse bile halka oluşumu esnasında istenilen stereokimyayı
korumak oldukça güçtür. Bundan dolayı sikloalkan -amino asit ve siklooktan -amino
asit örnekleri genel olarak enzimatik rezülüsyon ile yapılmaktadır. Bu yöntemin en
önemli dezavantajlarından biri çok küçük miktarlarda (mg) çalışma ve geliştirilmiş olan
yöntemin aynı iskelet sistemine sahip türevlerine uygulanamama zorluğudur.
Bu tez kapsamında, enzimatik rezülüsyonla veya hedef bileşikteki stereokimyayı
koruyarak asiklik bir bileşiğin çok basamaklı siklizasyonuna alternatif yeni bir asimetrik
sikloalkan -amino asit sentez stratejisi geliştirmek amaçlanmaktadır. Siklooktan halka
sisteminin değişik pozisyonlarında hidroksil veya amin grubu içeren siklooktan -amino
25
asit sentezleri yapılacaktır. Siklooktan -amino asit sentezi için çıkış bileşiği olarak
kullanılan siklooktan halkasında var olan prokiral ve kiral merkezler yardımı ile
“Reaktif kontrollü asimetrik sentez” hedeflenmektedir.
İlk olarak siklooktanon halkası üzerinde kiral ve prokiral merkezlerin oluşması
sağlanacak, ardından diğer stereomerkezler moleküldeki sterik ve grupların elektronik
etkilerinden faydalanılarak enantiyo ve diasteroselektif olarak yerleştirilecektir.
Böylelikle siklooktan -amino asit ana yapısının birden çok pozisyonunda peş peşe
gelen stereomerkezler oluşturulacaktır.
Prokiral ve kiral merkezleri oluşturmak için siklooktanon çıkış bileşiği olarak
kullanılacaktır. Kiral merkezin enantiyosaf aminle nükleofilik olarak yer değiştirmesi
planlanmaktadır. Oluşturulan enantiyosaf merkez yardımıyla halka üzerine yerleştirilen
diğer
grupların
mutlak
stereokimyası
belirlenecektir.
Prokiral
merkezlerde
gerçekleştirilen reaksiyonlar sonrasında elde edilen moleküllere farklı fonksiyonel
grupların yerleştirilmesinde mevcut grupların etkisi olacaktır. Bu yöntem sayesinde
siklooktan
halkası
üzerinde,
art
arda
gelen
stereomerkezlerin
diastereoselektif bir şekilde oluşturulması başarılmış olacaktır.
enantiyo
ve
26
Siklooktan ana iskeleti üzerinde peş peşe gelen stereomerkezlerin oluşturulmasının yanı
sıra büyük miktarlarda çalışmaya imkân tanıyan bir sentez yöntemi geliştirilecektir.
Böylelikle elde edilen sonuç ürünler, ilaç keşfi ve biyolojik aktivite çalışmalarında
kullanılmasının yanı sıra doğal ürünlerin sentezine de katkıda bulunacaktır.
27
3. MATERYAL ve YÖNTEM
Siklooktan halkası üzerinde prokiral ve kiral merkezleri oluşturmak için ticari olarak
satın alınan siklooktanon (100) çıkış bileşiği olarak kullanıldı. İlk olarak miligram
skalada reaksiyonlar gerçekleştirildi. Siklooktanon NBS/NH4OAc ile  pozisyonundan
brominasyonu yapılarak NaCN ile yerdeğiştirme reaksiyonu geçildi. Elde edilen nitril
102 PPh3/CCl4 ile muamele edilerek prokiral ve kiral merkezlere sahip - doymamış
nitril 103 elde edildi. mg skaladan 10 g skalaya çıkılarak reaksiyonlar birçok defa
tekrarlandı. Çıkış bileşiğinin miktarı artırılarak 20 g skalanın üzerinde çalışılmaya
başlandığında toplam verimin % 18’lerde olduğu görüldü. Bunu üzerine sistematik bir
yaklaşımla hangi basamak veya basamakların verim kaybına yol açtığı araştırıldı.
Şekil 3.1. 103 ve 104 bileşiklerinin sentezi
Çıkış bileşiği olarak kullanılan siklooktanondan bromosiklooktanın sentezinde gram
skalada gerçekleştirilen reaksiyonlarda oldukça yüksek verimler elde edildi. Fakat bir
sonraki basmak olan yerdeğiştirme reaksiyonunda (Br’un CN ile yerdeğiştirme
reaksiyonu) madde miktarı ve sıcaklık artışına bağlı olarak yan ürün oluşumu
gözlemlendi. Reaksiyon sıcaklığının 75°C’nin üzerine çıkmasıyla birlikte yan ürün
28
oluşumunun arttığı gözlendi. Artan madde miktarına bağlı olarak ise DMSO miktarının
da artması ekstraksiyon işlemini zorlaştırmaktadır. Sıcaklık, maksimum madde ve
DMSO miktarını belirlemek için bir seri denemeler yapıldı. İdeal reaksiyon sıcaklığın
65-67°C, maksimum madde miktarının 62 mmol ve DMSO miktarının da 70 mL olduğu
belirlendi. Böylece bu basamaktaki verim problemi aşılarak, reaksiyon %77 verimle
gerçekleştirildi. Bir başka problem ise PPh3/CCl4 eşliğinde 102’den 103’e geçişte
gözlemlendi. Bu reaksiyonun yüksek sıcaklıkta kapalı tüpte gerçekleştirilmektedir.
Yapılan reaksiyonlarda verimlerin yaklaşık olarak %40’larda kaldığı görüldü. 102
bileşiğinin miktarı artırılarak daha konsantre ortamlarda çalışıldığında eliminasyon
sonucu yan ürün miktarının arttığı görüldü. Bu yan ürünün -amino asit eldesi için
farklı reaksiyonlarda kullanılması mümkündür. Ancak burada 103’ün saf bir şekilde
elde edilip doğrudan-amino siklooktan karboksilik asit sentezinde kullanılması
planlanmaktadır. 104 ile Rf değeri çok yakın olan ve yapısı karakterize edilemeyen 105
kromatografik yöntemlerle ayrılamamaktadır. Bu sonuçlar ürün verimini etkilemektedir.
Bu
nedenle
hedeflenen
ürünün
veriminin
artırılmasına
yönelik
denemeler
gerçekleştirildi (Çizelge 3.1). Ön deneme olarak yapılan çalışmalarda (küçük ölçekler,
mg ) daha yüksek olan verimin, madde miktarının artışı ile birlikte azaldığı
gözlemlendi. Ayrıca yan ürün miktarın da artan sıcaklıkla arttığı belirlendi. Kapalı tüpte
gerçekleştirilen bu reaksiyonun sıcaklığı 125°C’den 110°C’ye düşürüldüğünde
reaksiyon veriminde artış olduğu görüldü. Çıkış bileşiğine bağlı olarak çözücü miktarı
değiştirilerek yapılan reaksiyonlarda düşük konsantrasyonda verimin arttığı gözlendi.
Sıcaklık ve konsantrasyon değiştirilerek elde edilen bu sonuçlara göre reaksiyonun
100°C’de ve çıkış bileşiği/DCM oranın 1.7 g/10 mL olması durumunda reaksiyon
veriminin %72 olduğu belirlendi. Bu optimizasyon çalışmalarının ardından bir çok defa
1 g skaladan başlanılarak 103’ün sentezi yüksek verimlerle problemsiz bir şekilde
tekrarlanarak eldesi gerçekleştirildi.
29
Çizelge 3.1. Konsantrasyona bağlı olarak belirlenen verim
Konsantrasyon
Sıcaklık (°C)
Süre
Verim (%)
390 mg / 6 mL
125
24 saat
50
2,5 g /8 mL
115
24 saat
24
500 mg / 7 mL
reflüks
24 saat
Reaksiyon olmadı
500 mg / 7 mL
110
24 saat
42
2,14 g / 7 mL
115
24 saat
38
2,6 g / 10 mL
110
24 saat
42
750 mg / 15 mL
110
10 gün
61
1,72 g / 10 mL
100
75 saat
72
130’ün sentezinin ardından siklooktan halkasında kiral merkez oluşturmak için
stereokimyası bilinen (S)--metilbenzilamin (111) ile aminasyon denemelerine geçildi.
İlk olarak 200 mg, (1,2 mmol) skalada DCM içerisinde ve oda sıcaklığında (S)-metilbenzilamin ile reaksiyona sokuldu ve 107a, 107b’nin oluştuğu gözlendi.
Reaksiyon ortamına NEt3 ilave edilerek tekrarlandığında verimin neredeyse kantitatif
olduğu görülmektedir. Her iki diastereomerin Rf değerleri (0,33, 0,23, %10 EA/hek)
birbirine oldukça yakın olduğundan yüksek miktarlarda ürünün kromatografik olarak
ayrılması oldukça güçtür. Miligram skalalarda diastereomer karışımının silica gel
miktarı artırılarak kromatografik olarak ayrımı mümkün iken büyük skalalarda (1-5 g)
tekrarlanan reaksiyonlarda ayrım zaman, çözücü, silica gel açısından büyük kayıplara
yol açmaktadır. Bu problem bize, alternatif ayırma yöntemlerine başvurulması
gerekliliğini göstermektedir.
30
Şekil 3.2. 107a ve 107b’nin sentezi
Elde edilen diastreomerlerin katı formunda olup olmadıkları araştırıldı. Reaksiyon
ortamında aşırısı kullanılan aminin uzaklaştırılmasının ardından uygun çözücü
sistemlerinde kristallnedirme denendi. Bu denemelerde diastreomerlerden birinin kristal
olduğu gözlendi. Kristallendirme için en uygun çözücü sisteminin Et2O/hek. veya
DCM/hek. olduğu belirlendi.
1
H-NMR yardımıyla bu bileşiğin yapısı kolaylıkla
karakterize edilebilmektedir. Fakat bu sonuç mutlak stereokimyaya ait bir bilgi
vermemektedir. Bu izomerin mutlak stereokimyasının aydınlatılması için X-Ray
analizine ihtiyaç duyulmaktadır. X-Ray yardımıyla, kristal formda elde edilen izomerin
107b yapısında ve amin grubunun bağlı olduğu merkezin mutlak stereokimyasının da
(S) konfigürasyonda olduğu belirlendi (Araştırma Bulguları Şekil 4.10). Geriye
dönülerek, reaksiyon karışımında izomerlerin hangi oranda oluştuğu ham ürünün 1HNMR spektrumları ile ayrılan diastereomerin
1
H-NMR spektrumları kıyaslanarak
belirlendi. Bu diastereomerik oranın 2:3 olduğu görüldü. Kristallendirme sonucunda
107b %60 verimle elde edilirken 107a ise %39 verimle elde edildi.
Böylece -amino asit için gerekli olan ilk stereomerkez enantiyosaf formda halka
üzerine yerleştirildi. Bu başarının ardından yapılacak hidrojenasyon ve hidroliz
reaksiyonları sonrası siklooktan -amino asit sentezi gerçekleştirilebilecektir.
İlk olarak çift bağın seçimli bir şekilde hidrojenasyonuna geçildi. Literatürde amin
gruplarının Pd/C ile etkileşerek hidrojenasyonun aynı yüzden gerçekleşmesini
sağlayacağı ve böylece hidrojenasyonu yönlendireceği bilinmektedir (Bunnage et al.
2003). Benzer şekilde 107a molekülündeki amin grubununda Pd/C ile etkileşerek
hidrojenasyonun aynı yüzden gerçekleşmesini sağlayacağı, böylelikle trans ürünün elde
edileceği öngörülmektedir.
İlk olarak 107a, MeOH içerisinde oda sıcaklığında ve atmosferik basınçta
hidrojenasyona maruz
bırakıldı (Şekil 3.3). Ham üründen alınan
1
H-NMR
spektrumunda hidrojenasyonun %50 verimle diastereomerik karışım verdiği görüldü.
31
Şekil 3.3. 108a ve 108b’nin sentezi
Hidrojenasyonun, polar çözücüler eşliğinde yapılması reaksiyon verimini artırdığı genel
bir kabuldür. Hidrojenasyonun MeOH, EtOAc, H2O gibi farklı çözücü sistemlerinde
gerçekleştirildiği bilinmektedir. Hatta katalitik miktarda asit ilave edilerek de
hidrojenasyon gerçekleştirilmektedir. Bu bilgiler ışığında; EtOAc, THF, AcOH gibi
farklı polaritedeki çözücülerle 107a hidrojenasyona maruz bırakıldı. Fakat 107a’nın bu
çözücü sistemlerinde indirgenmeden reaksiyon ortamında kaldığı görüldü.
Çizelge 3.2. 107a’nın hidrojenasyon reaksiyon şartları ve sonucu
Çözücü
Sıcaklık (°C)
Verim (%)
Sonuç
EtOAc
25
-
Reaksiyon yok
AcOH
25
-
Reaksiyon yok
THF
25
-
Reaksiyon yok
Bu denemelere paralel olarak MeOH içerisinde 107b ile yapılan hidrojenasyonda da
yine diastereomerik karışım elde edildi. Ham ürünün
1
H-NMR spektrumunda
diastereomerlerin sinyalleriyle birlikte bir yan ürünün oluştuğu görüldü. Kolon
kromatogrofisi ile saflaştırma işlemlerinin ardından diasteromerlerin %45 verimle
oluştuğu fakat birbirinden ayrılmadığı görüldü. Benzer şekilde değişik çözücü
sistemlerinde hidrojenasyon denendi.
32
Şekil 3.4. 108c ve 108d’nin sentezi
Çizelge 3.3. 107b’nin hidrojenasyon reaksiyon şartları ve sonucu
Çözücü
Verim (%)
Sonuç
MeOH
45
Diasteomerik karışım
AcOH
43
Diasteomerik karışım
MeOH:AcOH (9:1)
45
Diasteomerik karışım
THF
-
Reaksiyon yok
EtOAc
-
Reaksiyon yok
Hidrojenasyonda seçimliliğin sağlanamaması üzerine yeni prokiral merkez üzerinden
fonksiyonel grupların halka üzerine yerleştirilmesine karar verildi.
Şekil 3.5. 104’ün sentezi
Daha önce miligram skalada dien 104 sentezlendi (Şekil 3.5). Kloronitril 103 DBU ile
muamele
edilerek
dien
104’e
dönüştürülüp
daha
sonra
çift
bağdan
fonksiyonellendirilmek istendi. İlk olarak 103’ün DCM içerisinde ve oda sıcaklığında
DBU (ek 1.2) ile eliminasyonu denendi. Ham ürünün silica gel kolondan
33
saflaştırılmasının ardından alken 104 %70 verimle elde edildi. Reaksiyon veriminin
artırılması için reaksiyon süresi ve baz miktarında değişiklikler yapıldı. 1.3 ek. DBU
kullanıldığında ve oda sıcaklığında 18 saat karıştırıldığında ise reaksiyon veriminin
%90’a yükseldiği görüldü (Çizelge 3.4 sıra no 4).
Çizelge 3.4. 103’un eliminasyon reaksiyon şartları ve sonucu
Sıra No
DBU (ek.)
Süre
% verim
1
1.2
21 saat
70
2
1.2
23 saat
75
3
1.3
15 saat
85
4
1.3
18 saat
90
104’ün sentezinin ardından çift bağın mCPBA ile oksidasyon denemelerine geçildi
(Şekil 3.6). 800 mg çıkış bileşiği DCM içerisinde çözüldü ve mCPBA (1.3 ek.) ile
muamele edildi. 17 saat oda sıcaklığında karıştırıldıktan sonra reaksiyon durduruldu ve
ham ürün kolon kromatografisi ile saflaştırıldı. 110, %73 verimle elde edildi.
Şekil 3.6. 110’un sentezi
Epoksit halkasının nükleofillerle kolaylıkla açıldığı bilinmektedir. Epoksit allilik
pozisyonda ise açılma allilik pozisyondan olmaktadır. Siklohekzen epoksit de benzer
şekilde bölge seçimli olarak allilik merkezden açılmaktadır (Falkheppner 1989;
Armbruster 2000). Bizim sistemimize benzeyen yedili halkada değişik nükleofillerle
epoksit açılması regioselektif olarak allilik merkezden gerçekleşmektedir (Knapp 1986).
Bu
bilgiler
epoksit
açılmasının
allilik
merkezden
olacağı
hipotezimizi
34
güçlendirmektedir. Eğer biz 110’un, kiral amin 111 ile seçimli olarak allilik
pozisyondan bölge seçici olarak açılmasını başarabilirsek kolaylıkla -hidroksi-aminoasit öncüsüne ulaşabileceğimiz öngörüldü. Ayrıca enantiyosaf amin kullanılacağı
için oluşan diastereomerlerin kromatografik yöntemle ayrılabileceği düşünüldü (Şekil
3.7).
Şekil 3.7. 112a ve 112b’in sentez planı
Epoksit 110 ve amin 111 (1.5 ek.) THF içerisinde çözüldü. Reaksiyon karışımı 60oC’de
karıştırıldı. Belirli aralıklarla reaksiyon TLC ile takip edildi. TLC’de çıkış bileşiğinin
bitmediği fakat yeni bir spotun oluştuğu görüldü. 60 saat sonra oda sıcaklığına
getirilerek çözücüsü uzaklaştırılan ham üründen alınan 1H-NMR spektrumunda benzilik
proton 4.37 ppm’de multiplet olarak görülmektedir. Ayrıca 113 nolu bileşik bir dien
sistemi içermekte olup, iki farklı olefinik protonu mevcuttur. 6.16 ppm’deki triplet -
doymamış sistemin - pozisyonundaki proton olarak, 4.30 ppm’de singlet ise enamin
sistemine ait olefinik proton olarak rezonans olmaktadır.
35
Şekil 3.8. 114’ün sentezi
Bir miktar amin 111 içeren bu ham ürün kolon kromatografisi ile saflaştırılmaya
çalışıldığında ise yeni bir ürünle karşılaşıldı.
Ham ürünün 1H-NMR spektrumundaki
enamin sistemine ait olefinik protonun kaybolduğu görüldü.
ürünün keton 114 yapısında olduğu belirlendi.
Buradan elde edilen
İzole edilen keton 114’ün miktarı
başlangıçta kullanılan çıkış bileşiğine ve ham ürün miktarına göre oldukça düşüktü.
Verimdeki bu düşüşü anlamak için reaksiyon aynı şartlarda tekrarlandı. Ham üründen
alınan 1H-NMR spektrumu ile bir önceki denemeden alınan ham ürünün 1H-NMR
spektrumu aynı ve spektrum oldukça temiz gözükmektedir.
Yine bu ürün kolon
kromatografisi ile ayrıldığında reaksiyon veriminin %30 civarında olduğu gözlendi.
Keton sistemi içeren 114’ün ancak bir enamin 113 bileşiği üzerinden oluşabileceği
düşünüldü. Reaksiyon yine aynı şartlarda tekrarlandıktan sonra ham ürün DCM/hekzan
karışımından kristallendirilerek 113 saflaştırıldı. Epoksit açılması izopropanol içerisinde
yapıldığında keton
114
%74 verimle sentezlendi.
1
H-NMR,
13
C-NMR,
IR
spektrumlarından önerilen yapının 113 ile uyumlu olduğunu göstermektedir. Enamin
oluşumunun ilk bakışta bu reaksiyondan oluşuması mümkün gözükmemektedir. Biz bu
reaksiyonun amin grubunun epoksite allilik pozisyondan yaklaşmadığı ve diğer
elektrofilik merkeze saldırdığı açılmayla ilerlediğini düşünmekteyiz (Şekil 3.9). Epoksit
halkasının açılmasının ardından allilik hidroksil grubu kolaylıkla elimine olmaktadır.
36
Çünkü konjuge çift bağ ve nitril grubu ile konjugasyon bunu tetiklemektedir. Bu
enaminler asidik şartlarda kolaylıkla ilgili ketonlara hidroliz olmaktadırlar. Bu enamin
113 silica gel kolonda keton 114’e dönüşmektedir.
Şekil 3.9. 114’ün oluşumu için önerilen mekanizma
Bu reaksiyonda epoksitin allilik pozisyondan açılmasını kolaylaştırmak için reaksiyon
sıcaklığı, çözücü ve reaksiyon süresi değiştirilerek denemeler yapıldı (Çizelge 3.11).
Fakat
bu
denemelerin
hiç
birinde
istenilen
pozisyondan
epoksit
açılması
gerçekleşmemektedir. Genel olarak bu denemelerde keton 114 oluşmaktadır. En yüksek
verim (%74) izopropanolün solvent olarak kullanıldığı denemede ulaşıldı (Çizelge 3.5)
37
Çizelge 3.5. 114’ün sentezinde kullanılan reaksiyon şartları
Sıra no
Çözücü
Sıcaklık °C
Süre
Verim %
1
H2O
70
60 saat
Reaksiyon olmadı
2
K2CO3/ H2O
70
36 saat
Reaksiyon olmadı
3
THF
60
60 saat
%30 (113)
4
THF
70
4 gün
%28 (113)
5
İzopropanol
80
3 gün
%31 (113)
6
THF
70
46 saat
%31 (113) %34 (114)
7
THF
80
5 gün
%74 (114)
8
t-BuOH
110
5 gün
%64 (114)
9
İzopropanol
80
3 gün
%74 (114)
Bu sonuç bizi direkt olarak epoksit açılmasından elde etmeyi hedeflediğimiz ürüne
götürmemekle beraber, yeni -amino asit sentezlerine imkan tanıyacağı açıkça
görülmektedir. Keton grubunun seçimli indirgemesinin ardından doymamış çift bağda
indirgeme veya fonsiyonellendirmeyle değişik-aminoasit türevleri elde edilebilecektir
(Şekil 3.10).
Şekil 3.10. 116’nın sentez planı
Kullanılan aminin nükleofilik gücünün artırılmasıyla epoksit açılma denemelerine
geçildi. Bu maksatla amin 111, n-BuLi ile -78°C’de muamele edildikten sonra
reaksiyon ortamına epoksit 110 ilave edildi ve reaksiyonun oda sıcaklığına ısınmasına
müsaade edildi. Bir gece boyu oda sıcaklığında karıştırılan bu reaksiyon durduruldu.
Elde edilen karışım silica gel kolondan saflaştırıldı. Bu ayırma sonucunda izole edilen
yeni ürünün 118 yapısında olduğu spektroskopik yöntemlerle (1H-NMR, 13C-NMR, IR,
38
CHN) aydınlatıldı. Burada daha önce karşılaştığımız epoksit açılmalarından daha farklı
bir durumla karşılaşıldı. Biz n-BuLi ile aminin 111 muamelesinden oluşan amitin (117)
güçlü baz olarak davrandığını epoksit halkasında açılma yerine proton kopararak
eliminasyona sebep olduğunu düşünmekteyiz (Şekil 3.11).
Şekil 3.11. 118’in sentez planı
Her ne
kadar burada da hedef ürün öncülerine ulaşılamadıysa da çift bağların
stereoselektif ve regioselektif fonksiyonlendirilmesi değişik -amino asit öncülerinin
sentezine imkan tanıyacağı aşikardır. Fakat alkolün 118 sentetik açıdan önem arz
edecek bir miktarda sentezinin yapılabilmesi gerekmektedir. Bu maksatla reaksiyon
şartlarında bir seri denemler yapıldı (Çizelge 3.6). Ancak bu denemelerin hiç birinde
reaksiyon verimi %55’den daha yukarıya çıkarılamadı.
39
Çizelge 3.6. 118’in sentezinde kullanılan reaksiyon şartları
Sıra no
Amin (ek)
n-BuLi (ek)
Süre
Verim %
1
1.1
1.2
17saat
%35 (118) + %30 (110)
2
1.3
1.2
15 saat
%53 (118)
3
1.6
1.5
16saat
%45 (118)
4
2.5
2.4
24saat
%55 (118)
Metal tuzları katalizörlüğünde de epoksitler nükleofillerle açılabilmekte ve bu açılma
allilik pozisyondan gerçekleşmektedir (Tang et al. 2008; Andreev et al. 2013). Allilik
açılmayı kolaylaştırmak için epoksit 110, LiClO4 katalizörlüğünde amin 111 ile kuru
CH3CN içerisinde reaksiyona sokuldu. Oda sıcaklığında karıştırılan bu reaksiyon belirli
aralıklarla TLC ile kontrol edilerek çıkış bileşiğinin bitip bitmediği takip edildi. Yedi
gün boyunca oda sıcaklığında karıştırılan bu reaksiyon karışımından elde edilen ham
ürün kolon kromatogarfi ile saflaştırıldı. Yine burada alkol 118’in oluştuğu gözlendi. Bu
yöntemin bazik şartlarda açılmaya göre daha kolay ve daha güvenli olduğu
görülmektedir. Fakat reaksiyon veriminin artırılması gerekmektedir. Bu maksatla bir
seri epoksit açılma denemesi yapıldı. Buradan elde edilen sonuçlar ışığında epoksit
açılmasının belki ilk önce epoksit açılması daha sonra aminin katılması şeklinde
yürüyüp yürümediği reaksiyonda sadece metal tuzları kullanılarak denendi. Gerek amin
ve gerekse de metal tuzları ile yapılan denemelerden elde edilen en anlamlı sonuçlar
Çizelge 3.7 verildi (Şekil 3.12).
Şekil 3.12. 118’in Metal tuzları ile sentezi
40
Çizelge 3.7. 118’in Metal tuzları ile sentezinde kullanılan reaksiyon şartları
Sıra
no
Reaktifler
Çözücü
Sıcaklık
(oC)
Süre
Verim
1
111 (1ek) / LiClO4 (1 ek) CH3CN(kuru)
25
7 gün
%52
2
111 (1ek) / LiClO4 (2ek)
CH3CN(kuru)
40
5 gün
%43
3
111 (2ek) / LiClO4 (2ek)
CH3CN(kuru)
25
5 gün
%43
4
LiClO4 (2ek)
CH3CN(kuru)
25
23 gün
Reaksiyon
olmadı
5
111 (3ek) / ZnCl2 (2 ek)
H2O
95
27 saat
%25
Epoksit açılması denemelerinden elde edilen bütün bu sonuçlar ışığında tekrar bazik
ortamda epoksit açılmasına geri dönülmesi ve uygun biz bazın bulunması gerektiği
düşünüldü.
İlk olarak 110 (50 mg) ile DMF (kuru) içerisinde K2CO3 eşliğinde yapılan reaksiyonda
%82 verimle alkol 118 elde edildi (Şekil 3.13).
Şekil 3.13. 118’in K2CO3 kullanılarak sentezi
118’in daha önceki yöntemlere göre çok iyi bir verim ile elde edilmesinin ardından çıkış
bileşiğinin miktarı miligramdan grama artırıldı. K2CO3 miktarı ve çözücünün kontrollü
bir şekilde değiştirilerek maksimum verim elde edilmeye çalışıldı (Çizelge 3.8). Bu
reaksiyonun kurutulmadan kullanılan DMF ile de yürüdüğü görüldükten sonra
kullanımı daha kolay olan normal DMF ile denemeler yapıldı. Alkol 118 %80 verimle
istenilen allil alkol elde edildi (Çizelge 3.8 sıra no 5).
41
Çizelge 3.8. 118’in K2CO3 ile sentezinde kullanılan reaksiyon şartları
Sıra no
K2CO3 (ek)
DMF
Çıkış
Ürün
Verim %
1
1.0
2 mL (susuz)
50 mg
42 mg
82
2
1,0
12 mL (susuz)
590 mg
470 mg
80
3
1.0
15 mL
830 mg
640 mg
77
4
1.3
10 mL
540 mg
467 mg
80
5
1.3
30 mL
1.9 g
1.52 g
80
Bu başlık altında yapılan çalışmalarda allilik pozisyona -amino asit için gerekli olan
amin grubu yerleştirilemedi. Amin veya amin öncüsünün allilik pozisyona
yerleştirilmesi için alternatif yöntemlerin denenmesine karar verildi. Epoksit
açılmalarında sıklıkla kullanılan ve iyi bir nükleofil olan NaN3 ile epoksit açılması
düşünüldü. Azit grubu amin öncüsü olarak sentetik organik kimyada sıklıkla
kullanılmaktadır. Çok kolay bir şekilde de amine dönüştürülebilmektedir. Her ne kadar
epoksit açılmasından rasemik ürün karışımı elde edilecek olsa da azit grubu amine
indirgendikten sonra klasik rezülüsyon yöntemi ile izomerlerin ayrılabileceği öngörüldü
(Şekil 3.14).
Şekil 3.14. 118’in NaN3 ile sentezi
42
Bu amaçla Aseton:H2O (1:1) çözücü sistemi içerisinde 2.5 ek. NaN3 ve 1 ek. epoksit
110 19 saat reflüks edildi. Aseton uzaklaştırıldıktan sonra EtOAc ile ekstraksiyonun
ardından alınan ham ürünün 1H-NMR spektrumunda allil alkol 118’in oluştuğu görüldü.
Saflaştırma işlemlerinden sonra reaksiyonun %56 verimle gerçekleştiği belirlendi. Yine
burada da çok iyi bir nükleofil olan azit kullanılmasına rağmen doğrudan epoksit
açılması yerine çift bağın -pozisyonundan proton koparılması ile ilerleyen düzenlenme
ürünü alkol 118 elde edilmektedir.
Her ne kadar istediğimiz açılma ürünü 119 elde edilemediyse de polifonksiyonel
siklooktan birimi kolaylıkla elde edilebilmektedir. Çift bağların elektron yoğunlukları
birbirinden farklı olduğu için kolaylıkla seçimli oksidasyon yapmaya müsait
gözükmektedir. Ayrıca bu bileşik rasemik olsa da hidroksil grubunun bağlı olduğu kiral
merkez yardımıyla diastereoselektivite kontrol edilebilir gözükmektedir.
İlk olarak 118’in mCPBA ile oksidasyonu tasarlandı. -doymamış sistem elektronca
fakir olduğu için epoksidasyonun diğer çift bağ üzerinden ilerleyeceği düşünüldü. Her
ne kadar allilik sistemlerde hidroksil gruplarının epoksidasyonu yönlendirdiği
biliniyorsa da bu daha çok oluşan hidroksil grubuna göre stereokimyası ile ilgilidir. Bu
bilgiler göz önünde bulundurulduğunda 118’in mCPBA ile oksidasyonundan elektronca
daha zengin çift bağın epoksitlenmesi öngörülmekteydi. Bu epoksit üzerinden ilgili
aminoasit türevlerine geçmek mümkün olacağı düşünüldü (Şekil 3.15).
43
Şekil 3.15. 123 ve 124’ün sentezi
Bu maksatla allil alkol 118’in DCM içerisindeki çözeltisi mCPBA ile muamele edildi ve
oda sıcaklığında karıştırıldı. Reaksiyon belirli aralıklarla TLC ile kontrol edildi. Çıkış
bileşiği 118 reaksiyon ortamında bitmemekle birlikte yeni iki spotla karşılaşıldı. Kolon
kromotogrofisi ile her iki ürün saflaştırıldı. Bu ürünlerin yapıları 1H-NMR,
13
C-NMR,
IR spektrumları ile aydınlatıldı. Ana ürün olarak beklenen 124’in %10 verimle
oluşurken 123 ise %48 verimle oluşmaktadır. Bir miktar çıkış bileşiği ise reaksiyona
girmeden kalmaktadır. (Çizelge 3.9) 124’deki epoksit ve hidroksil grubunun relatif
stereokimyalarını belirlemek için ilgili analizlerin yapılmasına gerek duyulmadı.
Çizelge 3.9. 123’ün sentezinde kullanılan reaksiyon şartları
Sıra no
Çıkış (ek)
mCPBA (ek)
Süre
Sonuç
1
1
1.3
18 saat
%50 (118) + %30 (123)
2
1
1.5
24 saat
%50 (118) + %35 (123)
3
1
2.0
24 saat
%40 (118) + %40 (123)
4
1
2.5
36 saat
%40 (118) + %40 (123)
5
1
3.0
60 saat
%30 (118) + %48 (123)
44
Her ne kadar CN konjugasyonla bağlı olduğu alkenin elektron yoğunluğunu
düşürüyorsa da mCPBA’in 118’in hidroksil grubu ile hidrojen bağı yaparak elektronca
fakir olan olefin biriminden epoksidasyonun ilerlemesini kontrol ettiği görülmektedir.
123’in NOE analizinden hidroksil grubu ile epoksitin birbirlerine göre syn
konfigürasyonda olduğu bulundu.
110’un açılması ve oluşan 118’in epoksidasyonundan rasemik karışım elde
edilmektedir. Hidroksil grubunun regio ve diasterestereoselektiviteye etkisi görülünce
123’ün enantiyo ve diastereoselektif epoksidasyonu tasarlandı. En yaygın ve en yüksek
seçimlilikle yürüyen Sharpless epoksidasyonunun bizim sistemimize uygulanmasına
karar verildi (Şekil 3.16).
Şekil 3.16. 125’in sentez planı
118’in epoksidasyonu DCM içerisinde hem (-)-DIPT hemde (+)-DET kullanılarak
Ti(OiPr)4 katalizörlüğünde denendi. Bu denemelerin hiçbirinden epoksit 125 elde
edilemedi. Bu yöntem beklenenin aksine bizim molekülümüzde çalışmadığı gözlendi.
Bu istenmeyen durumun bizim reaksiyon şartlarımızdan kaynaklanıp kaynaklanmadığı
model bir çalışma ile test edildi. 118 ve 3-metil-2-büten-1-ol karışımı daha önce
uyguladığımız reaksiyon şartlarında Sharpless epoksidasyonuna maruz bırakıldı. H
NMR da 3-metil-2-büten-1-ol’ün tamamen bittiği 118’e hiç bir şey olmadığı gözlendi.
Buradan elde edilen bulgular 118’in Sharpless epoksidasyonuna karşı reaktivitesinin
düşük olduğunu göstermektedir (Şekil 3.17).
45
Şekil 3.17. 127’nin sentez planı
Ana ürün olarak izole edilen epoksitin 123 amin 111 ile açılmasından 82 bileşiğinin
oluşacağı öngörülmektedir. Çünkü kuarterner (nitrilin bağlı olduğu karbon) merkeze
nükleofilin
yaklaşması
mümkün gözükmemektedir. Böylelikle seçimli
olarak
nükleofilin diğer epoksit karbonuna saldıracağı düşünüldü. Nükleofilik açılmayla
siyanohidrin elde edileceği bununda keton 128’e dönüşeceği öngörüldü (Şekil 3.18). Bu
kurgunun gerçekleşmesi durumunda kontrollü olarak iki yeni stereomerkez ve üç tane
de prokiral mekezin oluşumunun mümkün olacağı planlandı. 123 daha önceki epoksit
açılmalarında olduğu gibi değişik şartlarda reaksiyona sokuldu.
Şekil 3.18. 128’in sentez planı
Bu denemelerin hiç birinde epoksit açılması ya da yeni bir ürünle karşılaşılmadı. Çıkış
bileşiğinin reaksiyona girmediği görüldü (Çizelge 3.10).
46
Çizelge 3.10. 123’den 128’in sentezinde kullanılan reaksiyon şartları
Çözücü
Sıcaklık°C
Süre
Verim %
111 (1.2ek) /n-BuLi (1.1 ek)
THF
-78
15saat
111 (1.5 ek) /n-BuLi (1.4 ek)
THF
-78
4 gün
111 (2.5 ek) n-BuLi (2.4 ek)
THF
-78
7 gün
111 (2 ek)
THF
25-70-110
4 gün
111 (1ek) /LiClO4 (2 ek)
CH3CN
95
27 saat
111 (2 ek) /LiClO4 (2 ek)
CH3CN
80
47 saat
111 (1 ek) /LiClO4(1 ek)
İsopropanol
25
18 saat
111 (2 ek) /LiClO4(2 ek)
İsopropanol
80
24 saat
Reaksiyon
olmadı
Reaksiyon
olmadı
Reaksiyon
olmadı
Reaksiyon
olmadı
Reaksiyon
olmadı
Reaksiyon
olmadı
Reaksiyon
olmadı
Reaksiyon
olmadı
Reaktifler
Şekil 3.19. 130a ve 130b’nin sentez planı
Allil alkol 118’de hidroksil grubunun bulunduğu kiral merkeze enantiyosaf amin 111’in
yerleştirilmesi ile diastereomerik aminler (130a ve 130b) elde edilebileceği düşünüldü.
Bu diastereomerlerin ayrılmasının ardından her bir aminin ilgili -aminoasit öncülerine
dönüştürülerek sonuca gidilebileceği öngörüldü. İlk olarak hidroksil grubu MsCl ile
kolay çıkan bir grup haline dönüştürüldü. Mezilat 129 kısa bir kolondan süzüldüğünde
bu ürünün bozulduğu görüldü.
47
Şekil 3.20 129’un sentez planı
129 nolu bileşğin istenilen şekilde sentezi gerçekleşmeyince OH grubunun başka bir
yöntemle kolay çıkan grup haline getirildikten sonra sübstitüsyonuna karar verildi.
PPh3 ve CBr4 azot atmosferinde DCM içerisinde çözüldü ve 0°C’ye soğutulan bu
karışıma 118’in DCM çözeltisi ilave edildi. Bu reaksiyon karışımı oda sıcaklığına
getirildikten sonra 16 saat daha karıştırıldı. En uygun şartları bulmak için bu reaksiyon
bir kaç kez tekrarlandı ve en yüksek verimin %89 olduğu gözlendi (Şekil 3.21).
Şekil 3.21. 132’nin sentezi
Çizelge 3.11. 132’nin sentezinde kullanılan reaksiyon şartları
Çıkış
Ürün
CBr4
PPh3
Süre
Verim
50 mg
25 mg + çıkış
1.1
1.0
17 saat
35 + çıkış
200 mg
227 mg
1.1 + 1.1
1.0 + 1.0
17+18 saat
80
210 mg
265 mg
2.0
2.0
16 saat
89
132’in sentezinin ardından sübstitüsyon denemelerine geçildi (Şekil 3.22).
48
Şekil 3.22. 130a ve 130b’nin sentezi
132’in, DCM’deki çözeltisine oda sıcaklığında ve azot atmosferinde 111 (1.5 ek.) ilave
edildi. TLC ile kontrol edilen reaksiyon 24 saat karıştırıldı. TLC de çıkış bileşiğinin
bitmediği görüldü. Reaksiyon ortamına NEt3 (0.5 ek) ilave edilerek 18 saat daha
karıştırıldı. TLC’de çıkış bileşiğinin azaldığı ve yeni spotun oluştuğu görüldü.
Reaksiyon süresi uzatılarak çıkış bileşiğinin reaksiyon ortamında bitişi başarılamadı.
NEt3’nin (1.5 ek.) miktarı artırılıp reaksiyon 40°C’ye ısıtıldığında 24 saat sonra çıkış
bileşiğinin reaksiyon ortamında tamamen bittiği fakat yeni spotların oluştuğu görüldü.
Aminin fazlasını içeren bu ham ürün kolon kromatografisi ile saflaştırıldı. Diastromerik
karışım (130a, 130b) diğer yan ürünlerden kolaylıkla ayrılmalarına rağmen
birbirlerinden ayrılamamaktadır. Alternatif ayırma
yöntemi olarak izomerlere
DCM/Hekzan, Et2O/Hekzane solvent sistemlerinde kristallendirilme denendi. Fakat
İzomerlerin kristallenmediği gözlendi.
Metil-3-hidroksisikloalkankarboksilat (siklopentan ve siklohekzan halka sistemi)
trikloroasetonitril, asetonitril içerisinde DBU eşliğinde reaksiyona sokarak asetimidat
grubunun esterin -karbonuna saldırısı ile oksazolin türevlerinin sentezi başarılmıştır.
Oksazolin halaksının hidrolizi ile -hidroksi--aminoasit elde edilmiştir (Matsushima et
al. 2009). Hidroksi--amino asitin sentezi 118’den başlayarak kolaylıkla yapılabilecek
gözükmektedir. Çünkü allil alkollerin aminasyonu Cl3CCN kullanılarak tek ya da iki
kademede
selektif
olarak
başarılabilmektedir.
Hidroksil
grubu
aminasyonu
yönlendirmektedir. Çünkü amin grubu hidroksil grubu ile aynı yönden transfer
edilmektedir. Nitrilin bağlı olduğu prokiral merkez elbette çok kolay kontrol
49
edilemeyebilir. Fakat her iki diastereomerin dipol momentleri farklı olduğundan
ayrılmaları kolay olacağı öngörüldü (Şekil 3.23).
Bu bilgiler ışığında 118 ve Cl3CCN’ün DCM içerisindeki 0°C’deki çözeltisine belirli
aralıklarla DBU ilave edildi. Bu reaksiyon sıcaklığının kendiliğinden oda sıcaklığına
ısınmasına müsaade edildi. TLC ile kontrol edilen reaksiyon karışımı 48 saat sonunda
çıkış bileşiğinin tamamen bittiği görüldü.
Şekil 3.23. 133a ve 133b’nin sentezi
Ektraksiyon işleminden sonra ele geçen ham ürün silica gel kolondan saflaştırıldı. İki
farklı yeni bileşikle karşılaşıldı. Bu bileşiklerin 1H-NMR spektrumları birbirine çok
benzemektedir. Bu bize bu maddelerin diastereomer olabileceğini göstermektedir.
İzomerlerden IR alındığında bir izomerde nitril grubuna ait sinyal gözlenirken diğer
izomerde nerede ise sinyal gözlenmemektedir.
13
C-NMR spektrumunda da sinyaller
birbirine çok benzemekle birlikte bir tane karbon sinyali eksik gözükmektedir. Her ne
kadar buradan elde edilen ürünlerin (133a, 133b) yapıları tam olarak bilinmiyorsa da
reaksiyon verimi sentetik açıdan düşük gözükmektedir. Reaksiyon şartlarının gözden
geçirilmesi ve iyileştirilmesi gerekmektedir.
Tek kademede yapılan bu reaksiyon veriminin oldukça düşük olduğu görülmekteydi.
Literatürde bilinen örneklerin aksine bizim sistemimizde reaksiyon veriminin (%35)
düşük olması bizi reaksiyon şartlarında değişiklik yapmaya zorladı.
50
Şekil 3.24. 134’den 133a ve 133b’nin sentezi
İlk olarak reaksiyonda verim düşüşünün hangi basamakta olduğunu anlamak için her bir
basamağın tek tek denenmesine karar verildi.
-25°C’de 118’in kuru CH3CN içerisindeki çözeltisine Cl3CCN (10 ek.) ve DBU (1.04
ek.) ilave edildi. 118 çıkış bileşiğinin 3 saat sonra bittiği gözlendi. Ham ürün silica gel
kolondan saflaştırıldı. 134 %82 verimle elde edildi. Reaksiyon Cl3CCN (1.5 ek.) 0°C’de
18 saatte tekrarlandığında ise verimin %78’lere düştüğü görüldü. Cl3CCN pahalıdır. Bu
maddenin ekivalent miktara yakın kullanılması ve reaksiyon süresinin biraz uzun
tutulması gerekmektedir. Görüldüğü gibi bu denemelerimizde Cl3CCN miktarı, sıcaklık,
çözücü parametreleri reaksiyon verimini etkilemektedir.
İkinci basamakta verim artışı sağlayabilmek için değişik çözücü ve bazlarla denemeler
yapıldı. İlk olarak 134 bileşiği farklı çözücülerde çözülerek yüksek sıcaklıklarda baz
kullanılmadan denemeler yapıldı (Çizelge 3.13). Bu reaksiyonların hiçbirinin
gerçekleşmediği görüldü. Baz olarak NaH, DBU ve NEt3 kullanıldığında çıkış
bileşiğinin tamamen reaksiyon ortamında bitmesine rağmen istenilen ürünlere ait
sinyallere rastlanmadı. NaH ile gerçekleştirilen reaksiyonlarda faz transfer katalizörü
kullanılmasına karar verildi. Böylelikle azottan proton koparıldıktan sonra açığa çıkan
anyona bağlı bulunan sodyum atomu crown eter kullanılarak uzaklaştırılarak nükleofilik
gücün artırılması düşünüldü. Ortamda serbest olarak bulunan eksi yükün konjuge çift
bağın  pozisyonundan saldırısıyla halkalaşma ürünü 133a, 133b’nin oluşacağı
öngörüldü. TLC ile takip edilen reaksiyonda çıkış bileşiğinin bittiği görüldü. Fakat ham
ürünün 1H-NMR spektrumunda istenilen ürün sinyalleriyle karşılaşılmadı.
51
Bu sonucun ardından düzenlenmenin daha zayıf bazlarla denenmesine karar verildi.
134’ün metanol içerisindeki çözeltisine K2CO3 ilave edilerek 24 saat oda sıcaklığında
karıştırıldı. Ham ürünün 1H-NMR spektrumunda 134’nin 118’ya hidroliz olduğu
görüldü.
Çizelge 3.12. 133a ve 133b’nin sentezinde kullanılan reaksiyon şartları
Sıra
Çıkış
Çözücü
Sıcaklık°C
Sonuç
no
mg
1
50
DCM
-
24
35
Reaksiyon olmadı
2
20
THF
-
24
60
Reaksiyon olmadı
3
50
THF
-
24
80
Reaksiyon olmadı
4
50
Toluen
-
24
110
Reaksiyon olmadı
5
50
Ksilen
-
24
120
Reaksiyon olmadı
6
30
THF
NaH (1.0 ek.)
5
0
İstenilen ürün yok
7
50
THF
NaH (1.0 ek.)
12
0-80
İstenilen ürün yok
9
124
THF
NaH (1.6 ek.)
24
80
İstenilen ürün yok
10
30
THF
DBU (1.1 ek)
3
25
İstenilen ürün yok
11
50
DCM
DBU (1.1 ek)
18
35
İstenilen ürün yok
12
50
DCM
NEt3 (1.2 ek)
16
35
İstenilen ürün yok
13
65
THF
NaH (1.0 ek.)
3
0
İstenilen ürün yok
8
0
İstenilen ürün yok
24
25
Hidroliz (118)
Reaktif
Süre
saat
15-crown-5
(cat)
14
100
THF
NaH (1.0 ek.)
15-crown-5
(1.0 ek)
15
80
MeOH
K2CO3
Tekrar geriye dönülerek 118’dan tek kademede 133a ve 133b’nin sentezleri için bir
strateji geliştirilmesi öngörüldü. 50 mg 118’nın DCM içerisindeki çözeltisine Cl3CCN
ve DBU (0.5 ek.) ilave edildi. Reaksiyon 30 saat boyunca TLC ile takip edildi ve
134’nin reaksiyon ortamında bitmediği görüldü. Bu denemeyle eş zamanlı başlatılan bir
başka çalışmada 200 mg 118 bileşiğinin üzerine damla damla DBU (0.5 ek.) 0°C’de
52
azot atmosferinde ilave edildi. 134’nin reaksiyon ortamında bitmemesi üzerine oda
sıcaklığındaki karışıma 24 saatlik periyotlarda DBU (0.8 ek.) 8 gün boyunca ilave
edildi. Reaksiyon yine TLC ile takip edildi. 8 günün sonunda reaksiyon ortamında 134
gözlenmesine rağmen 133a, 133b’nin oluştuğu gözlendi. Bu gözlemin ardından
reaksiyonun 134’nin reaksiyon ortamında bitişi gözleninceye kadar devam ettirilmesine
karar verildi. Daha uzun sürede gerçekleştirilen reaksiyonlarda reaksiyon veriminde
herhangi bir artış olmadığı görüldü.
-hidroksi--aminoasit sentezi için direkt bazik ortam veya Lewis asidi katalize epoksit
açılma yerine metanolik HCl ile açılmanın da denenmesi gerektiği düşünüldü. Epoksit
açılmasında hangi epoksit karbonu tercih edilirse edilsin (bizim beklentimiz allilik
karbonun tercih edileceği yönündeydi) moleküle yerleştirilen klor daha sonra aminle
süsbtitüe edilebilir. Böylelikle -amino asit öncü bileşiklerine geçilebileceği düşünüldü.
Şekil 3.25. 135’in sentezi
Bu maksatla 110 metanolik HCl içerisinde 5 saat karıştırıldı (Şekil 3.25). TLC ile
kontrol edilen reaksiyon karışımında çıkışın tamamen bitmemesiyle birlikte ve yeni bir
spotun oluştuğu görüldü. Ham ürün saflaştırılarak 135 %58 verimle elde edildi.
Bu reaksiyon veriminin artırılması üzerine çalışmalar yapıldı. Sonuçlar Çizelge 3.13’de
özetlendi. 110, 0°C’de metanolik HCl ile muamele edildikten sonra reaksiyon
karışımının oda sıcaklığına ısınmasına müsaade edildi. Bu sıcaklıkta 8 saat karıştırıldı
(Çizelge 3.14). 8 saatin sonunda yapılan TLC de yine çıkış bileşiğinin reaksiyon
53
ortamında kaldığı görüldü. Bunun üzerine aynı şartlarda reaksiyon 10 saat karıştırıldı.
Bu reaksiyona TLC yapıldığında yine çıkış bileşiğinin bitmediği görüldü. Reaksiyon
süresi 18 saate uzatıldığında yeni bir ürünle karşılaşıldı. Hidroklorik asitle de bu epoksit
açılması denendiğinde yan ürünün daha yüksek oranda oluştuğu gözlendi.
Çizelge 3.13. 135 ve 136’nın sentezinde kullanılan reaksiyon şartları
Sıra
no
Çıkış
Çözücü
Süre
mg
saat
Sıcaklık
o
( C)
Reaksiyona
girmeyen
çıkış bileşiği
%
%
Verim Verim
135
136
1
50 mg
HCl/MeOH
5
25
20 mg
58
-
2
100
HCl/MeOH
8
25
35 mg
60
-
3
150
HCl/MeOH
10
0
45 mg
65
-
4
220
HCl/MeOH
18
25
-
42
24
5
500
HCl/MeOH
7
0
226 mg
58
-
6
540
HCl/MeOH
10
0
-
60
25
7
725
HCl/MeOH
20
0
-
62
24
8
50
H2O/HCl-THF
18
25
-
40
16
9
180
H2O/HCl-THF
24
0
-
42
23
10
300
H2O/HCl-THF
24
0
-
40
18
Kolon kromatogrofisiyle saflaştırma işleminin ardından izole edilen bileşiğin yapısı 1HNMR ve
13
C-NMR ve IR spektrumları yardımıyla aydınlatıldı. Fakat OH grubu ile Cl
grubunun
bağlı
olduğu
karbonları
kesin
olarak
doğrulamak
çokta
kolay
gözükmemektedir. Her ne kadar en aşağı alanda Cl’un bağlı olduğu karbondaki proton
rezonans olacağı öngörülse de bunu kesin olarak belirlemek gerekmektedir. İster klor
allilik ister se de hidroksil grubu allilik pozisyonda bulunsun bu grupların birbirlerine
göre stereokimyalarının da belirlenmesi gerekmektedir. 135’e NOE yapılarak OH ve
Cl’un birbirlerine göre anti olduğu belirlendi. Ayrıca 135 DCM/hek karışımından
kristallendirildi. Kristal formunda elde edilen 135 nolu bileşiğin yapısı X-Ray analizi ile
aydınlatıldı.
54
Bu başarılı epoksit açılmasının ardından klorun diastereoslektif olarak 111 ile
sübstitüsyonu tasarlandı. Çünkü klor başarılı bir şekilde sübstitüe edilebilmesi
durumunda hedeflenen -hidroksi--amino asit öncülerine 137a, 137b ulaşılmış
olacaktır.
Şekil 3.26. 137a ve 137b’nin sentez planı
Bu maksatla azot atmosferinde 135 DCM ile çözüldü ve üzerine amin 111 ilave edilerek
18 saat karıştırıldı. TLC ile kontrol edilen reaksiyon ortamında çıkış bileşiği tamamen
bittiği görüldü. Ham ürün kolon kromotogrofisi ile ayrıldı. Toplanan fraksiyonlardan
yapılan TLC’de birden fazla spotla karşılaşıldı. Ana ürün izole edildi. Bu ürünün 1HNMR spektrumunda 6.38 ppm’de dublet ve 3.89 ppm’de kuartet görülmektedir. Bu
değerler 137a ve 137b ile uyuşmamaktadır. 6.38 ppm’de dubletin varlığı konjuge
sistemin etkileşebileceği sadece bir protonun olabileceğini göstermektedir. Elde edilen
ürünler 138a ve 138b SN2' mekanizmasına göre ana ürün olarak oluştuğu ve bu
reaksiyon ortamında SN2 ve SN2ı reaksiyonlarının yarışmalı olarak ilerlediği görüldü.
Aminasyon denemelerinde istenilen ürün elde etmek ve en iyi reaksiyon şartlarını
belirlemek için reaksiyon şartları çözücü, sıcaklık, süre, ekivalent miktarlarla oynanarak
bir çok defa tekrarlandı. Sonuçlar Çizelge 3.14’de verildi.
55
Şekil 3.27. 137a, 137b ve 138a, 138b’nin sentezi
Oda sıcaklığında DCM içerisindeki 135’un çözeltisine 1.0 ekivalent (S)-metilbenzilamin (111) ilave edilerek reaksiyon 10 saat karıştırıldı. TLC ile kontrol
edilen reaksiyonda çıkış bileşiğinin bitmediği fakat yeni spotların oluştuğu görüldü.
Evaporatörde
çözücü
uzaklaştırılmasıyla
elde
edilen
ham
ürünün
1
H-NMR
spekturmunda aminin klor ile SN2 reaksiyon mekanizması üzerinden 137a ve 137b
diastereomerlerinin yanı sıra SN2ı üzerinden ise 138a ve 138b izomerlerinin oluştuğu
gözlendi.
Çizelge 3.14. 137a, 137b ve 138a, 138b’nin sentezinde kullanılan reaksiyon şartları
Sıra
no
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
Çıkış
mg
50
87
160
70
100
160
50
240
220
300
50
75
66
50
Çözücü
DCM
DCM
DCM
DCM
DCM
DCM
DCM
DCM
DCM
DCM-NEt3
THF
THF
Toluen
Toluen
Amin
(e.k)
1.0
1.6
1.6
1.6
1.0
1.6
1.0
1.3
2.0
2.4
1.6
1.6
1.2
1.5
15
220
Toluen
1.5
Sıcaklık
(oC)
25
25
25
25
40
40
0
0-25
25
40
80
80
reflüks
110 kapalı
tüp
110 kapalı
tüp
Süre
saat
10
16
36
48
18
18
10
24
24
48
24
48
24
17
17
% Verim % Verim
137(a, b) 138(a, b)
23
36
30
43
32
42
38
42
25
36
28
38
21
38
23
36
35
44
65
13
36
28
42
32
56
26
89
3
89
3
56
Kolon
kromatogrofisi
ile
saflaştırma
işleminde
öncelikle
137a
ve
137b
diastereomerlerinin, 138a ve 138b diastereomerlerinden ayrımı başarıldı. Bu ön
ayrımda aminin fazlasının uzaklaştırılmasıyla birlikte diastereomerik oran belirlendi.
137a ve 137b diastereomerlerinin oranı 1:1 iken 138a ve 138b diastereomerlerinin oranı
1:4 olduğu 1H-NMR spektrumlarından kolaylıkla görülmektedir. 137a ve 137b karışımı
tekrar kolon kromatografisine tabi tutuldu. Fakat bu izomerlerin kolon kromatogrofisi
ile birbirinden ayrılmadığı görüldü.
1:4 oranında oluşan 138a ve 138b karışımı tekrar ayrıma tabi tutuldu. 138a saf
ayrılmazken 138b saf olarak elde edilmektedir. 138b DCM/hek. karışımından
kristallendirildi. 138b izomerinin kristal formda olması mutlak stereokimyanın
belirlenmesi açısından oldukça önem taşımaktadır. Bu bileşiğin X-Ray analizi sonucu
ile mutalak stereokimyası (C10 (S), C8(R), C3(R) (Araştırma Bulguları (Şekil 4.42))
belirlendi. Bu başarının ardından SN2ı mekanizması üzerinden oluşan ürünlerin 138a,
138b verimini artırmak için bir seri denemeler yapıldı.
Hidroksil grubunun koruyucu gruplarla korunması durumunda klorun bağlı olduğu
merkezin sterik olarak kalabalıklaşacağı böylelikle nüklofilin bu merkeze saldırısının
zorlaşacağı öngörüldü. Böylelikle nüklofil SN21 üzerinden saldırarak yüksek verimle
138a ve 138b’yi vereceği düşünüldü.
Bu maksatla 135 BnBr ile korundu. Daha önceki reaksiyon şartlarında aminasyona
maruz bırakıldı. TLC ile takip edilen reaksiyonda ürünler karışımının (140a, 140b,
141a, 141b) olduğu görüldü (Şekil 3.28). Ana ürün olarak oluşmasını beklediğimiz
141a ve 141’nin yan ürün olarak oluştuğu ham ürünün 1H-NMR spekturmunda görüldü.
57
Şekil 3.28. 140a, 140b ve 141a, 141b’nin sentezi
BnBr ile yeterli sterik engel oluşturulamadığı düşüncesiyle hidroksil grubu daha hacimli
bir koruyucu grupla korunması planlandı. TBDPSCl ile hidroksil grubu korundu ve 142
elde edildi. 142 aminasyona maruz bırakıldı. Ham üründen alınan
1
H-NMR
spekturmunda da 143a ve 143b’nin 144a ve 144b ye göre daha yüksek verimle oluştuğu
gözlendi. Fakat burada diastereomerler (143a, 143b, 144a, 144b) birbirlerinden
ayrılamamaktadır. Bu yüzden her ne kadar 144 izomerlerinin verimi artırılmış olsa bile
ayrım yapılamamasından dolayı 142 ile çalışılmaktan vazgeçildi (Şekil 3.29).
Şekil 3.29. 143a, 143b ve 144a, 144b’nin sentezi
58
Amin 111’ye göre daha hacimli olan 131 ile de sübstitüsyon denendi. Çünkü bu amin
131 daha hacimlidir. Klorun bağlı olduğu merkeze nükleofilik saldırısı 111’e göre daha
zordur. Bu yüzden SN2ı üzerinden saldırı ile 145a ve 145b izomerlerini oluşturması
daha kolay olacağı düşünüldü (Şekil 3.30).
Şekil 3.30. ile 145a ve 145b’nin sentez planı
135 DCM içerisinde 131 ile reaksiyona sokuldu. Yapılan denemelerin hiç birinde hedef
ürünlere ulaşılamadı. Yapılan denemeler Çizelge 3.15’da özetlendi. Her bir denemde
çıkış bileşiği olduğu gibi geri kazanıldı.
Çizelge 3.15. 145a ve 145b’nin sentezinde kullanılan reaksiyon şartları
Sıra
no
Çıkış
Çözücü
Süre
Sıcaklık°C
Sonuç
1
30 mg
DCM
12 saat
25
Reaksiyon olmadı
2
46 mg
DCM-NEt3
20 saat
25
Reaksiyon olmadı
3
50 mg
THF
20 saat
75
Reaksiyon olmadı
4
36 mg
THF-NEt3
24 saat
75
Reaksiyon olmadı
135’in amin 111 ile reaksiyonundan oluşan 137a ve 137b hedef ürünlerin öncüsü
olması bakımından oldukça önemlidir. Direkt katılma ürünleri 137a, 137b’nin,
SN2ıüzerinden katılma ürünlerine 138a, 138b göre daha yüksek oranda elde edilmeleri
için çalışmalar yapıldı. Yarışmalı olarak ilerleyen bu reaksiyonu istediğimiz doğrultuda
kontrol edebilirsek
137a ve 137b -amino asit öncüsü hedef ürünlerinin yüksek
verimde sentezlenebileceği düşünüldü. Bu maksatla amin, süre, sıcaklık ve çözücü
59
parametrelerinde değişiklikler yapılarak reaksiyonlar gerçekleştirildi. Gerek amin
miktarı gerekse süre değiştirilerek yapılan reaksiyonlarda istenilen seçimlilik
sağlanamadı. 137 ve 138 ürünlerinin neredeyse aynı oranda oluştuğu ancak süre
uzatıldığında toplam verim de artış olduğu görüldü (Çizelge 3.14).
Çözücü sistemi değiştirilerek THF içerisinde 80°C’ye ısıtılan reaksiyonda da istenilen
ürün dağılımı elde edilemeyince daha yüksek sıcaklıklara çıkabilmek için toluen
içerisinde reflüks denendi. 24 saat sonrasında 137a, 137b diastereomerlerinin
miktarında artış gözlenmesinin ardından yeniden sonuçlar gözden geçirildi ve daha
yüksek sıcaklıkta deneme yapılmasına karar verildi. 50 mg ve 220 mg 135 bileşiği
toluen içerisinde amin 111 ile muamele edildi ve kapalı tüpte 110°C’de 17 saat
karıştırıldı. Çözücü evaporatörde uzaklaştırıldı. Ham ürün kolon kromatogrofisi ile
saflaştırıldı. %89 verimle 137a, 137b diastereomerlerinin sentezi başarıldı. Bunun yanı
sıra 138a, 138b diastereomerleri yok denecek kadar az (yaklaşık %3 oranında)
oluşmaktadır. Çizelge 3.14, sıra 14’te görüldüğü gibi sıcaklık ve zaman parametreleriyle
oynayarak yarışmalı olarak ilerleyen bu reaksiyonda ürün dağılımı arzu edilen şekilde
kontrol edilebilmektedir.
Yukarıda da bahsedildiği gibi her ne kadar bu ürünler yüksek verimle elde edebiliyor
olsak da birbirlerinden ayrımları problem olarak karşımıza çıkmaktadır. Bu maksatla
137a ve 137b’nin hafif fonksiyonellendirme veya ana iskelet yapısına dokunmadan ve
bizi hedeften uzaklaştırmayan reaksiyonlarla bu moleküllerin polaritesi değiştirilmek
istendi. Böylelikle kristallendirme veya kromatografik olarak izomerlerin kolaylıkla
ayrılabileceği düşünüldü.
p-nitrobenzoilklorür ile hidroksil grubu korundu. Bu bileşik genellikle kolay ester verir.
Aynı zamanda da kolay hidroliz olur. Çok polar grubu olduğu içinde genellikle ürünler
katıdır. Biz de esterifikasyondan 146a ve 146b’yi elde ettik. Fakat ham ürün katı
olmasına rağmen diastereomerler seçimli kristallendirmeye uğramamaktadırlar. TLC de
de bu ürünlerin Rf değerlerinde kayda değer bir farklılık gözlenmemektedir. Sonuç
olarak diastereomerler birbirinden bu teknikle de ayrılamadı.
60
Şekil 3.31. 147a ve 147b’nin sentez planı
-konjuge doymamış sisteme amin 111’in konjuge katılması üzerine de denemeler
yapıldı. 104 bileşiğine micheal tipi katılma ile  pozisyonunda aminin katılacağı
öngörüldü. Amino grubunun enantiyoselektif olarak çıkış bileşiğine yerleştirilmesi ile
daha sonraki basamaklarda çift bağın enantiyo ve diastereoselektif oksidasyonu
başarılabilecektir.
Şekil 3.32. 149’un sentez planı
104 ile 111 ve 131’nin her birinin ayrı ayrı THF deki çözeltisi -78°C’ye soğutuldu ve nBuLi ile muamele edilerek ilgili amitler 117 ve 150 reaksiyon ortamında oluşturuldu.
Bu reaksiyon karışımlarına 104’in THF deki çözeltisi yine aynı sıcaklıkta ilave edilip
reaksiyon karışımların oda sıcaklığına gelmesine müsaade edildi. Oda sıcaklığında 14
saat karıştırıldıktan sonra reaksiyon durduruldu ve ham ürünün 1H-NMR spektrumunda
sadece çıkış bileşiği ile karşılaşıldı (Şekil 3.33, Çizelge 3.16).
61
Şekil 3.33. 148’in sentez planı
Çizelge 3.16. 148’in sentezinde kullanılan reaksiyon şartları
Reaktif
Çözücü
Sıcaklık°C
-78
Süre
saat
14
111 (1.2 ek)/n-BuLi (1.1 ek)
THF
Reaksiyon olmadı
111 (2.2 ek)/n-BuLi (2.1 ek)
THF
-78
14
Reaksiyon olmadı
131 (2.5 ek)/n-BuLi (2.4 ek)
THF
-78
14
Reaksiyon olmadı
131 (2.5 ek)/n-BuLi (2.4 ek)
THF
-78
24
Reaksiyon olmadı
% verim
Belki amit çok güçlü bir baz (pKa 35 civarında) olduğu için nükleofilik katılmaya
isteksiz olabileceği düşünülerek konjuge katılma alkoksit (pKa 16 civarında) ile de
denemek istendi. Bu maksatla azot atmosferinde 0°C’de NaH’ün THF içerisindeki
süspansiyonu üzerine 1-feniletanol 151 THF içerisinde çözülerek ilave edildi. Değişik
zaman aralıklarında denemeler yapıldı. Her deneme TLC ile takip edildi ve çıkış
bileşiğinin reaksiyon ortamında bitmediği ve yeni bir spot oluşmadığı görüldü.
Şekil 3.34. 153’ün sentezi
62
Çizelge 3.17. 153’ün sentezinde kullanılan reaksiyon şartları
Reaktif
Çözücü
Sıcaklık
°C
Süre
% verim
saat
151 (1.0ek) / NaH (1.0 ek)
THF
0
8
Reaksiyon olmadı
151 (1.1ek) / NaH (1.0 ek)
THF
0
14
Reaksiyon olmadı
151 (1.1 ek) / NaH (1.0 ek)
THF
-15
24
Reaksiyon olmadı
-doymamış nitril 104’ün hem amin hem de alkol ile konjuge katılmaya karşı isteksiz
olduğu görüldü. Nitril grubu diğer karbonil gruplarıyla kıyaslandığında daha az elektron
çekici bir grup olduğu bilinmektedir. Çift bağın konjuge katılmaya karşı reaktivitesinin
artırılması gerekmektedir. 1,4-katılma karbonil grupları arasında en iyi esterlerle
gerçekleştiği bilinmektedir. Nitril grubunun estere dönüştürülerek konjuge katılmanın
denememesi gerekmektedir.
63
4. ARAŞTIRMA BULGULARI
4.1. 101’in Sentezi
Siklooktanon 100 (20,0 g, 158,00 mmol) Et2O’de çözülerek, üzerine NBS (299,66 g,
166,4 mmol) ve NH4OAc (1,220 g, 15,84 mmol)
ilave edildi. Bu karışım oda
sıcaklığında azot atmosferinde 19 saat karıştırıldı. Reaksiyon karışımı süzüldü. Süzüntü
su ve Et2O ile ekstrakte edildi. Organik faz Na2SO4 ile kurutuldu, çözücü evaporatörde
uzaklaştırıldı. Ham ürün 101 saflaştırılmaksızın bir sonraki kademede kullanıldı. 101
bileşiği 31,4 g %97 verimle elde edildi. Açık yeşil renkli sıvı, Rf= 0,63 (%10 EA/Hek).
1
H NMR (400 MHz, CDCl3) δ4.28 (dd, J=11.2, 4.2 Hz, 1H), 2.88 (td, J=12.1, 3.8 Hz,
1H), 2.47–2.25 (m, 3H), 1.99–1.49 (m, 6H), 1.41 (m, 1H), 1.17 (m, 1H).
13
C NMR (100 MHz, CDCl3) δ 209.0, 54.6, 36.4, 32.9, 29.0, 26.8, 25.6, 24.2.
64
Şekil 4.1. 101’in 1H-NMR spektrumu
Şekil 4.2. 101’in 13C-NMR spektrumu
65
4.2. 102’nin Sentezi
101 (12,75 g, 62,34 mmol) 50 mL DMSO’da çözüldü ve NaCN (9,18 g ,187,04 mmol)
ilave edildi. 20 saat 65°C’de azot atmosferinde karıştırıldı. Su (50 mL) ile reaksiyon
durdurularak, EA (3×75 mL) ile ekstrakte edildi. Organik faz 3 kez NaCl doygun
çözeltisi ile yıkandıktan sonra Na2SO4 üzerinden kurutuldu. Çözücü evaparatörde
uzaklaştırıldı. Silica gel kolondan EA/hek ile saflaştırılan 102 (7,26 g) %77 verimle elde
edildi. Sarı renkli sıvı, Rf= 0,6 (%10 EA/Hek).
1
H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 3.30 (dd, J=10.5, 4.1 Hz, 1H), 2.41 (m, 1H), 2.35 (dt,
J=14.3, 3.8 Hz, 1H), 2.27 (dq, J=14.3, 4.0 Hz, 1H), 1.88 (m, 1H), 1.79–1.34 (m, 7H),
1.26 (m, 1H).
Şekil 4.3. 102’nin 1H-NMR spektrumu
66
4.3. 103’ün Sentezi
102 (1,72 g, 11,3 mmol) 10 mL DCM de çözüldü üzerine CCl4 (10,43 g, 67,8 mmol) ve
PPh3 (5,93 g, 22,6 mmol) ilave edildi. Basınçlı tüpte 100ºC’de 75 saat karıştırıldı. Sonra
reaksiyon karışımının oda sıcaklığına gelmesi beklendi. Huni gooch yardımıyla silica
gel’den 500 mL %50 EA/hek ile süzüldü. Süzüntünün çözücüsü vakumda uzaklaştırıldı.
Silica gel kolondan EA/hek ile saflaştırılan 103 1,38 g, %72 verimle elde edildi. Sarı
renkli sıvı, Rf= 0,40 (%10 EA/Hek).
1
H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 6.72 (t, J=8.5 Hz, 1H), 4.85 (dd, J=12.2, 4.9 Hz, 1H),
2.43–2.22 (m, 2H), 2.16 (ddt, J=13.3, 10.1, 4.6 Hz, 1H), 2.02 (ddd, J=16.6, 8.8, 4.2 Hz,
1H), 1.92–1.68 (m, 3H), 1.47–1.31 (m, 3H).
13
C NMR (100 MHz, CDCl3) δ 148.4, 118.0, 116.5, 53.2, 39.2, 29.0, 27.9, 26.1, 25.2
Şekil 4.4. 103’ün 1H-NMR spektrumu
67
Şekil 4.5. 103’ün 13C-NMR spektrumu
4.4. 104’ün Sentezi
104’ün (2.28 g, 13.43 mmol) 10 mL kuru DCM içerisindeki çözeltisine DBU (2.45 mg,
2.40 mL, 16.13 mmol) damla damla ilave edilerek 24 saat, oda sıcaklığında, azot
atmosferinde karıştırıldı. Su (10 mL) ile reaksiyon durdurularak DCM (3x10 mL) ile
ekstrakte edildi. Organik faz Na2SO4 ile kurutuldu. Çözücü evaporatörde uzaklaştırıldı.
Ham ürün silika gel kolonda saflaştırıldı. 104 (1.6 g) %90 verim ile elde edildi. Sarı
renkli sıvı, Rf=0,33 (%10 EA/Hek).
68
1
H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 6.55 (t, J = 7.8 Hz, 1H), 5.91 (dt, J = 11.1, 7.2 Hz, 1H),
5.79 (d, J = 11.3 Hz, 1H), 2.31 (dt, J = 11.1, 5.8 Hz, 2H), 2.18 (q, J= 6.4 Hz, 2H), 1.60–
1.45 (m, 4H).
4.5. 107a ve 107b’nin Sentezi
103 (3,3 g, 19.45 mmol) 10 mL DCM’de çözüldü. Üzerine (S)--metil benzilamin (3,87
mL, 29,17 mmol), ardından NEt3 (1,35 mL, 9,72 mmol) eklendi. Reaksiyon 25°C’de
azot atmosferinde 5 gün karıştırıldı. Çözücüsü uzaklaştırıldı ve Et2O/hekzan çözücü
sisteminde kristallendirildi. 107b 2,95 g, %60 verimle elde edildi. Beyaz renkli katı için
Rf=0.33 (%10 EA/Hek), En: 99-101ºC, []D=+5 (c=1, CHCl3). 107a 1.92 g, %39
verimle elde edildi. Sarı renkli sıvı için Rf= 0.23 (%10 EA/Hek), []D=-36 (c=0.5,
CHCl3).
107a
1
H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 7.45–7.19 (m, 5H), 6.60 (t, J=8.5 Hz, 1H), 3.93 (q, J=6.5
Hz, 1H), 3.76 (dd, J=11.9, 4.7 Hz, 1H), 2.26–2.04 (m, 2H), 1.88 (m, 1H), 1.82–1.54 (m,
4H), 1.46 (m, 1H), 1.36 (d, J=6.5 Hz, 3H), 1.33–1.20 (m, 3H).
13
C NMR (100 MHz, CDCl3) δ 148.0, 145.4, 128.6, 127.5, 127.2, 121.0, 118.2, 56.0,
52.2, 35.8, 29.6, 28.3, 27.2, 24.7, 22.6.
IR (neat, cm-1): 3316, 2213
69
107b
1
H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 7.33–7.19 (m, 5H), 6.72 (t, J=8.4 Hz, 1H), 3.82 (q, J=6.6
Hz, 1H), 3.37 (dd, J=12.0, 4.7 Hz, 1H), 2.07 (m, 1H), 1.77–1.54 (m, 5H), 1.47 (tt,
J=12.8, 3.9 Hz, 1H), 1.38 (d, J=6.6 Hz, 3H), 1.28–1.11 (m, 3H).
13
C NMR (100 MHz, CDCl3) δ 149.4, 145.0, 128.7, 127.4, 126.9, 121.0, 118.1, 56.1,
51.9, 35.9, 29.5, 28.1, 27.1, 25.0, 24.6.
IR (neat, cm-1): 3322, 2219
Şekil 4.6. 107a’nın 1H-NMR spektrumu
70
Şekil 4.7. 107a’nın 13C-NMR spektrumu
Şekil 4.8. 107b’nin 1H-NMR spektrumu
71
Şekil 4.9. 107b’nin 13C-NMR spektrumu
Şekil 4.10. 107b kristalinin ORTEPIII çizimi
72
4.6. 109’un sentezi
107b (210 mg, 0.82 mmol) bileşiğinin 5 mL asetik asit içerisindeki çözeltisine 0°C’de
Pd/C (%10) ilave edildi. Oluşan süspansiyondan 3 defa H2 gazı geçirilerek oksijen
uzaklaştırıldı. Reaksiyon 24 saat oda sıcaklığında karıştırıldı. Reaksiyon süzüldü.
Süzüntü doygun NaHCO3 (10 mL) ile yıkandı. DCM (3x10 mL) ile ekstrakte edildi.
Organik faz Na2SO4 ile kurutuldu. Çözücü evaporatörde uzaklaştırıldı. Ham ürün silika
gel kolonda saflaştırıldı. 109 (36 mg) %18 verim ile elde edildi. Renksiz sıvı, Rf=0,56
(%10 MeOH/DCM).
1
H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 7.37 – 7.20 (m, 5H), 3.75 (q, J = 6.6 Hz, 1H), 2.35 (dd, J
= 11.4, 6.0 Hz, 1H), 2.24 (dd, J = 11.4, 7.3 Hz, 1H), 1.70 – 1.33 (m, 17H), 1.27 – 1.16
(m, 2H)
13
C NMR (100 MHz, CDCl3) δ 145.8, 128.6, 127.1, 126.9, 58.7, 55.5, 37.8, 31.4, 30.9,
27.3, 27.2, 26.6, 25.8, 25.8, 24.6
IR (neat, cm-1) 3318, 2920, 2853, 1687, 1465
CHN hesaplanan (C17H27N)5CH2Cl2: C, 78.730; H, 10.525; Cl, 5.405; N, 5.338.
Bulunan C:78.45,H:10.10,N:5.48
73
Şekil 4.11. 109’un 1H-NMR spektrumu
Şekil 4.12. 109’un 13C-NMR spektrumu
74
Şekil 4.13. 109’un APT-NMR spektrumu
4.7. 110’un Sentezi
104 (885 mg, 6.64 mmol) bileşiği 5 mL DCM içindeki çözeltisine mCPBA (1.93 g, 8.63
mmol, %77) ilave edildi. 18 saat oda sıcaklığında karıştırıldı. Reaksiyon NaHSO3 (10
mL , %35 sulu çözelti) ile yıkandı. Organik faza doygun NaHCO3 (10 mL) çözeltisi
ilave edildi. Sulu faz DCM (3x10 mL) ile ekstrakte edildi. Birleştirilen organik fazlar
Na2SO4 ile kurutuldu. Çözücü evaporatörde uzaklaştırıldı. Ham ürün silika gel kolonda
saflaştırıldı. 110 (723 mg) %73 verim ile elde edildi. Renksiz sıvı, Rf=0,50 (%30
EA/Hek).
75
1
H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 6.69 (t, J = 7.2 Hz, 1H), 3.52 (d, J = 3.9 Hz, 1H), 3.21
(dt, J = 9.6, 3.9 Hz, 1H), 2.43 (m, 1H), 2.33–2.16 (m, 2H), 1.90–1.55 (m, 3H), 1.49 (m,
1H), 1.25 (m, 1H).
13
C NMR (100 MHz, CDCl3) δ 151.45, 118.08, 110.63, 58.57, 52.19, 29.76, 27.37,
25.47, 25.02.
IR (neat, cm-1) 2937, 2862, 2220, 1636, 1454, 1408
Şekil 4.14. 110’un 1H-NMR spektrumu
76
Şekil 4.15. 110’un 13C-NMR spektrumu
4.8. 113’ün sentezi
110 (100 mg, 0.67 mmol) 0.2 mL izopropanolde çözülerek, oda sıcaklığında (S)-metylbenzylamine (0.25 mL, 2.01 mmol) ilave edildi. Basınçlı tüpte 3 gün, 80°C’de
karıştırıldı. Oda sıcaklığına gelmesi beklendi. Çözücüsü evaporatörde uzaklaştırıldı.
Et2O/Hekzan ile kristallendirme sonucu 113 (53 mg) %31 verim ile elde edildi. Rf=0,46
(%30 EA/Hek). Beyaz katı. Erime noktası: 98-100°C
77
1
H NMR (400 MHz,CDCl3) δ 7.35 – 7.20 (m, 5H), 6.16 (t, J = 7.5 Hz, 1H), 4.37 (m,
1H), 4.30 (s, 1H), 3.70 (m, 1H), 2.21 – 1.91 (m, 5H),1.66 – 1.36 (m, 6H).
13
C NMR (100 MHz, CDCl3) δ 147.9, 144.4, 141.8, 128.8, 127.3, 125.8, 121.2, 113.9,
89.5, 53.2, 32.5, 29.6, 24.6, 23.8, 23.4.
IR (neat, cm-1) 3380, 2928, 2213, 1625
CHN hesaplanan C17H20N2: C, 80.91; H, 7.99; N, 11.10. Bulunan C, 8.65; H, 8.232; N,
11.02
Şekil 4.16. 113’ün 1H-NMR spektrumu
78
Şekil 4.17. 113’ün APT-NMR spektrumu
4.9. 114’in sentezi
110 (70 mg, 0.46 mmol) 2 mL izopropanolde çözülerek, oda sıcaklığında (S)-metylbenzylamine (0.05 mL, 0.46 mmol) ilave edildi. Basınçlı tüpte 3 gün, 80°C’de
karıştırıldı. Oda sıcaklığına gelmesi beklendi. Çözücüsü evaporatörde uzaklaştırıldı.
Ham ürün silika gel kolonda saflaştırıldı. 114 (51 mg) %74 verim ile elde edildi. Açık
sarı renkli sıvı Rf=0,56 (%30 EA/Hek).
79
1
H NMR (400 MHz,CDCl3) δ 6.69 (t, J = 8.8 Hz, 1H), 3.29 (s, 2H), 2.55 – 2.47 (m,
2H), 2.21 (td, J = 8.8, 2.4 Hz, 2H), 1.86 (p, J = 6.0 Hz, 2H), 1.69 (ddt, J = 12.2, 9.0, 2.4
Hz, 2H).
13
C NMR (100 MHz, CDCl3) δ 208.8, 149.1, 119.2, 110.0, 44.7, 41.1, 26.8, 25.7, 24.9.
IR (neat, cm-1) 2940, 2219, 1705, 1462
CHN hesaplanan C9H11NO: 72.46; H, 7.43; N, 9.39; O, 10.72 Bulunan C, 72.88; H,
7.436; N, 9.264
Şekil 4.18. 114’ün 1H-NMR spektrumu
80
Şekil 4.19. 114’ün 13C-NMR spektrumu
4.10. 118’in Sentezi
K2CO3 (2.28 g, 16.55 mmol)’ın DMF (15 mL) içerisinde, oda sıcaklığında, azot
atmosferinde süspansiyonu oluşturuldu. 110 (1.90 g, 12.73 mmol) 15 mL DMF’de
çözülerek süspansiyonun üzerine ilave edildi. Reaksiyon 17 saat karıştırıldı. Su (20 mL)
ile durduruldu. EA (3x10 mL) ile ekstrakte edildi. Organik faz Na2SO4 ile kurutularak,
çözücü evaporatörde uzaklaştırıldı. Ham ürün silika gel kolonda saflaştırıldı. 118 (1.56
g) %80 verim ile elde edildi. Renksiz sıvı, Rf=0,43 (%30 EA/Hek).
81
1
H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 6.42 (d, J = 6.8 Hz, 1H), 5.96 (dt, J = 11.2, 6.9 Hz, 1H),
5.84 (d, J = 11.2 Hz, 1H), 4.35 (m, 1H), 2.59 – 2.29 (m, 2H), 2.05 – 1.75 (m, 3H), 1.64
– 1.33 (m, 2H).
13
C NMR (100 MHz, CDCl3) δ 150.9, 138.0, 121.1, 118.1, 110.6, 70.3, 32.7, 28.8, 20.8.
IR (neat, cm-1) 3412, 2953, 2221, 1449
CHN hesaplanan C9H11NO: C, 72.46; H, 7.43; N, 9.39; O, 10.72. Bulunan C, 72.876; H,
7.653;
N, 9.050
Şekil 4.20. 118’in 1H-NMR spektrumu
82
Şekil 4.21. 118’in 13C-NMR spektrumu
4.11. 123’ün sentezi
118 (140 mg, 0.94 mmol) 5 mL DCM çözülerek, mCPBA (252 mg, 1.13 mmol) ilave
edildi. 60 saat, oda sıcaklığında karıştırıldı. Reaksiyon ortamı NaHSO3 (%35 sulu
çözelti) ile yıkandı. Organik faz doygun NaHCO3 (5 mL) çözeltisiyle yıkandı, DCM
(3x5 mL) ile ekstrakte edildi. Organik faz Na2SO4 ile kurutularak, çözücü evaporatörde
uzaklaştırıldı. Ham ürün silika gel kolonda saflaştırıldı. 123 (76 mg) %48 verim ile elde
edildi. Açık sarı renkli sıvı, Rf=0,43 (%30 EA/Hek).
83
1
H NMR (400 MHz,CDCl3) δ 6.00 (dt, J = 12.0, 6.2 Hz, 1H), 5.62 (d, J = 12.0 Hz, 1H),
3.59 (ddd, J = 10.8, 7.5, 3.6 Hz, 1H), 3.48 (d, J = 10 Hz, 1H) 2.45 (m, 1H), 2.33 (s, 1H),
2.17 (m, 1H), 2.02 – 1.77 (m, 3H), 1.66 (m, 1H).
13
C NMR (100 MHz, CDCl3) δ 139.6, 117.8, 117.3, 71.0, 67.0, 48.1, 35.0, 29.7, 22.4.
IR (neat, cm-1)3412, 2917, 2239, 1658, 1561, 1457
CHN hesaplanan C9H11NO2: C, 65,44; H, 6.71; N, 8.48; O, 19.37. Bulunan C, 65.22; H,
6.257; N, 8.485
Şekil 4.22. 123’ün 1H-NMR spektrumu
84
Şekil 4.23. 123’ün bileşiğinin13C-NMR spektrumu
Şekil 4.24. 123’ün NOE-NMR spektrumu
85
4.12. 132’nin Sentezi
Azot atmosferindeki CBr4 (933,66 mg, 2,8 mmol) ve PPh3(734.4 mg, 2.8 mmol) üzerine
118 (210 mg, 1.40 mmol) 8 mL kuru DCM’de çözülerek 0 oC’de ilave edildi. Reaksiyon
16 saat, oda sıcaklığında azot atmosferinde karıştırıldı. Çözücü evaporatörde
uzaklaştırıldı. Ham ürün silika gel kolonda saflaştırıldı. 132 (265 mg) %89 verimle elde
edildi. Renksiz sıvı Rf=0,80 (%30 EA/Hek).
1
H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 6.58 (d, J = 7.4 Hz, 1H), 6.00 (dt, J =11.2, 7.1 Hz, 1H),
5.86 (d, J = 11.2 Hz, 1H), 4.74 (t, J = 9.3 Hz, 1H), 2.36 – 2.13 (m, 3H), 2.06 – 1.81 (m,
2H), 1.50 (m, 1H).
13
C NMR (100 MHz, CDCl3) δ 146.5, 138.1, 121.3, 117.7, 111.4, 47.5, 33.5, 27.6, 22.4
IR (neat, cm-1) 2938, 2220, 1728, 1148
CHN hesaplanan C9H10BrN: C, 50.97; H, 4.75; Br, 37.68; N, 6.60. Bulunan C, 50.89;
H, 5.059; N, 6.889
86
Şekil 4.25. 132’nin 1H-NMR spektrumu
Şekil 4.26. 132’nin bileşiğinin13C-NMR spektrumu
87
4.13. 133a ve 133b’nin Sentezi
118 (100 mg, 0.67 mmol) bileşiği ve Cl3CCN (0.67 mL, 6.7 mmol) 4 mL DCM de azot
atmosferinde oda sıcaklığında çözüldü. Reaksiyon ortamı 0°C’ye soğutulduktan sonra
DBU (0.06 mL, 0.4 mmol) 48 saatte 2 periyot halinde ilave edildi. 48 saat sonra
reaksiyon doygun NH4Cl çözeltisiyle (5 mL) ile durdurularak DCM (3x5 mL) ile
ekstrakte edildi. Organik faz Na2SO4 ile kurutuldu. Çözücü evaporatörde uzaklaştırıldı.
Ham ürün silika gel kolonda saflaştırıldı. 133a (40 mg) 133b (28 mg) toplamda %35
verimle elde edildi. Beyaz katı 133a Rf=0,83 (%30 EA/Hek). 133b Rf=0,73 (%30
EA/Hek).
133a
1
H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 6.01 (dt, J = 11.9, 9.4 Hz, 1H), 5.82 (dd, , J = 11.9, 1.3
Hz 1H), 5.10 (d, J = 8.1 Hz, 1H), 4.92 (ddd, J = 11.7, 8.1, 2.4 Hz, 1H), 2.45 – 2.33 (m,
2H), 2.25 (m, 1H), 2.12 – 1.89 (m, 2H), 1.68 – 1.52 (dddd, J = 15.3, 13.3, 8.4, 3.3 Hz,
1H),
13
C NMR (100 MHz, CDCl3) δ 164.9, 136.1, 125.4, 115.7, 86.1, 79.7, 59.5, 34.4, 26.0,
23.3.
IR (neat, cm-1) 2957, 1657, 1475
88
CHN hesaplanan C11H13Cl3N2O: C, 45.00; H, 3.78; Cl, 36.28; N,9.54; O, 5.45. Bulunan
C, 41.52; H, 3.571; N, 8.347
Şekil 4.27. 133a’nın 1H-NMR spektrumu
89
Şekil 4.28. 133a’nın bileşiğinin13C-NMR spektrumu
Şekil 4.29. 133a’nın bileşiğinin APT-NMR spektrumu
90
133b
1
H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 5.90 (dd, J = 11.8, 1.2 Hz, 1H), 5.81 (dt, J = 11.8, 8.7
Hz, 1H), 4.97 (d, J = 8.8 Hz, 1H), 4.84 (ddd, J = 11.8, 8.8, 2.6 Hz, 1H), 2.44 – 2.24 (m,
3H), 2.05 (m, 1H), 1.77 (m, 1H), 1.66 (m, 1H)
13
C NMR (101 MHz, CDCl3) δ 165.7, 129.0, 127.7, 115.6, 86.8, 74.6, 59.3, 24.4, 24.2,
22.6.
IR (neat, cm-1) 2954, 2221, 1726, 1652, 1549
Chn CHN hesaplanan C11H13Cl3N2O: C, 45.00; H, 3.78; Cl, 36.28; N,9.54; O, 5.45.
Bulunan C, 44.87; H, 4.172; N, 9.625
Şekil 4.30. 133b’nin 1H-NMR spektrumu
91
Şekil 4.31. 133b’nin 13C-NMR spektrumu
4.14. 134’ün Sentezi
118 (100 mg, 0.67 mmol) ve Cl3CCN (0.67 mL, 6.7 mmol) 3 mL CH3CN’de azot
atmosferinde oda sıcaklığında çözüldü. Reaksiyon ortamı -25°C’ye soğutulduktan sonra
DBU (0.10 mL, 0.69 mmol) damla damla ilave edildi. 3 saat sonra reaksiyon doygun
NH4Cl çözeltisiyle (5 mL) ile durdurularak DCM (3x5 mL) ile ekstrakte edildi. Organik
faz Na2SO4 ile kurutuldu. Çözücü evaporatörde uzaklaştırıldı. Ham ürün silika gel
92
kolonda saflaştırıldı. 134 (160 mg) %82 verimle elde edildi. Açık sarı renkli sıvı,
Rf=0,83 (%30 EA/Hek).
1
H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.33 (s, 1H), 6.39 (dd, J = 6.8, 2.3 Hz, 1H), 6.0 (m, 1H),
5.89 (d, J = 11.2 Hz, 1H), 5.39 (m 1H), 2.39 (ddd, J = 15.9, 9.3, 6.7 Hz, 1H), 2.12 –
1.79 (m, 3H), 1.63 (m, 1H), 1.44 (m, 1H).
13
C NMR (100 MHz, CDCl3) δ 161.4, 145.7, 138.4, 121.6, 117.8, 112.5, 91.4, 77.4,
29.22 28.6, 20.7.
IR (neat, cm-1) 3338, 2940, 2864, 2222, 1665
Şekil 4.32. 134’ün 1H-NMR spektrumu
93
Şekil 4.33. 134’ün APT-NMR spektrumu
4.15. 135’in sentezi
118 (400 mg)’ye HCl gazı ile doyurulmuş metanol çözeltisinden (10 mL) ilave edildi.
Oda sıcaklığında 5 saat karıştırıldı. Çözücü evaporatörde uzaklaştırıldı. Ham ürün silika
gel kolonda saflaştırıldı. 135 (290 mg) %58 verimle elde edildi. Beyaz renkli katı,
Rf=0,36 (%30 EA/Hek).
94
1
H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 6.79 (td, J = 8.8, 1.2 Hz, 1H), 4.78 (d, J = 9.9, Hz, 1H),
3.98 (dq, J = 9.9, 3.5 Hz 1H), 2.53 (s, 1H), 2.04 – 1.82 (m, 2H), 1.77 – 1.64 (m, 3H),
1.47 – 1.31 (m, 1H)
13
C NMR (100 MHz, CDCl3) δ 150.6, 116.8, 116.5, 75.4, 60.5, 32.1, 28.9, 28.9, 21.6.
IR (neat, cm-1); 3455, 2935, 2223,1626, 1448
CHN hesaplanan C9H12ClNO: C, 58.23; H, 6.52; Cl, 19.10; N, 7.54; O, 8.62. Bulunan
C, 58.13; H, 6.196; N, 7.218
Şekil 4.34. 135’in 1H-NMR spektrumu
95
Şekil 4.35.135’in 13C-NMR spektrumu
Şekil 4.36. 135’in -NMR spektrumu
96
Şekil 4.37. 135’in NOE-NMR spektrumu
Şekil 4.38. 135’in kristalinin ORTEPIII çizimi
97
4.16. 137a ve 137b’nin Sentezi
135 (220 mg, 1.19 mmol) 5 ml Toluen’de çözüldü. Üzerine (S)--metil benzilamin
(111) (0.23 mL, 1.77 mmol) eklendi. Reaksiyon 110°C’de basınçlı tüpte 17 saat
karıştırıldı. Oda sıcaklığına gelmesine müsaade edildi. Çözücüsü uzaklaştırıldı ve silica
gel kolondan EA/Hek ile saflaştırıldı. 137a, 137b 285 mg, %89 verimle elde edildi.
Diastereomerler birbirinden ayrılamadı. Açık sarı renkli sıvı Rf=0.56 (%30 EA/Hek).
Şekil 4.39. 137a, 137b’nin 1H-NMR spektrumu
98
4.17. 138a ve 138b’nin Sentezi
135 (220 mg, 1.19 mmol) 5 mL DCM’de çözüldü. Üzerine (S)--metil benzilamin
(111) (0.31 mL, 2.38 mmol) 0°C’de azot atmosferinde damla damla ilave edildi. Oda
sıcaklığında 24 saat karıştırıldı. Çözücüsü uzaklaştırıldı ve silica gel kolondan EA/Hek
ile saflaştırıldı. 138a 12 mg %4 verimle, 138b 140 mg %40 verimle elde edildi.
DCM/Hek kristallendirildi. Kristal yapıdaki madde 138b Rf= 0.33 (%30 EA/Hek).
1
H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 7.56 – 7.14 (m, 5H), 6.40 (d, J = 6.9 Hz, 1H), 4.77 (td, J
= 6.9, 3.3 Hz, 1H), 4.27 (dd, J = 10.3, 4.5 Hz, 1H), 3.89 (q, J = 6.5 Hz, 1H), 1.93 – 1.20
(m, 13H).
13
C NMR (100 MHz, CDCl3) δ 148.97, 145.52, 128.38, 127.34, 127.17, 121.38, 118.54,
67.44, 57.05, 54.24, 36.36, 35.46, 23.59, 23.26, 21.33.
HRMS (C17H23N2O) hesaplanan: 271.1810, bulunan 271.1805
99
Şekil 4.40. 138b’nin 1H-NMR spektrumu
Şekil 4.41. 138’in bileşiğinin13C-NMR spektrumu
100
Şekil 4.42. 138b kristalinin ORTEPIII çizimi
101
5. SONUÇ ve TARTIŞMA
Siklooktandan çıkılarak 103 ve 104 nolu bileşikler başarıyla sentezlendi. 103 ve 104’ün
verimleri
reaksiyon
şatlarında
yapılan
değişikliklerle
seçimli
olarak
elde
edilebilmektedir. Ancak bu reaksiyondan yapısı belirlenemeyen bir ürün de 105
oluşmaktadır.
Şekil 5.1. Çıkış bileşiklerinin sentezi
103’ün kiral amin 111 ile reaksiyonundan 107a ve 107b’nin sentezi başarıldı. Bu
sentezin ardından -amino asite ulaşmamız için gerekli olan hidroliz ve hidrojenasyon
basamaklarına
geçildi.
107a
ve
107b
hidrojenasyona
maruz
bırakıldığında
diastereomerik karışım elde edildi. Eğer amin grubuna ilave bir koruyucu grup takılırsa
hidrojenasyonun seçimli olmayacağı düşünüldü. Fakat amin grubunun korunması
başarısızlıkla sonuçlandı (Şekil 5.2).
102
Şekil 5.2. Çift bağın seçimli indirgenmesi çalışmaları
104, epoksidasyonla 110’a dönüştürüldü. Epoksit amin 111 ile epoksit açılmasına
maruz bırakıldı. Literatürde yedili halkada değişik nükleofillerle epoksit açılması
regioselektif olarak allilik merkezden gerçekleştiği bilinmektedir (Şekil 5.3).
103
Şekil 5.3. 110’un 111 ile allilik merkezden açılmasıyla -hidroksi--aminoasit sentezi
Bu bilgiler ışığında gerçekleştirilen reaksiyonlarda istenilen ürünler elde edilemedi.
Fakat bizim çalışmalarımızda amin ile epoksit açılma ürününe rastlanmadı. Fakat 111’in
veya NEt3’in CH2’den proton koparması ile ilerleyen epoksit açılma ürünü 118 elde
edildi. Değişik baz ve çözücüler kullanılarak yüksek verimlerde prokiral ve kiral
merkezlere sahip 118’in sentezi gerçekleştirildi. Çift bağların elektron yoğunlukları
birbirinden farklı olduğu için epoksidasyonun seçimli olarak ilerleyeceği öngörüldü.
-doymamış sistem elektronca fakir olduğu için epoksidasyonun diğer çift bağ
üzerinden gerçekleşeceği düşünüldü. Her ne kadar allilik sistemlerde hidroksil
gruplarının epoksidasyonu yönlendirdiği biliniyorsa da, bu daha çok oluşan ürünün
hidroksil grubuna göre stereokimyası ile ilgilidir. Bizim sistemimizde ise 118’in
mCPBA ile oksidasyonundan ana ürün olarak 123 bileşiği elde edildi (Şekil 5.4).
104
Şekil 5.4. 108 ve 123 bileşiklerinin sentezi
Hidroksi--aminoasitin sentezi, 118’den başlanarak bir kaç basamakta hedef ürüne
ulaşılabileceği
düşünüldü.
Cl3CCN
ile
allil
alkoller
aminasyona
maruz
bırakılabilmektedir. Bu maksatla alkol 118, Cl3CCN ile reaksiyona sokuldu. Daha sonra
reaksiyon ortamına DBU ilave edilerek ara ürünün 133a ve 133b düzenlenmesine
müsaade edildi. Fakat tek kademe de 133a ve 133b ye ulaşma denememizde reaksiyon
veriminin oldukça düşük olduğu görüldü. İki basamakta gerçekleştirilen reaksiyonda ise
istenilen hedef ürünler elde edilemedi. 133a ve 133b’nin yüksek verimle sentezi için
daha sonraki çalışmalarımızda alternatif yöntemler uygulanarak hedefe gidilmeye
çalışılacaktır.
105
Şekil 5.5. 133a ve 133b bileşiklerinin sentezi
-hidroksi--aminoasit sentezi için direkt bazik ortam veya Lewis asidi katalize açılma
yerine metanolik HCl ile açılmanın da denenmesi gerektiği düşünüldü. Epoksit 110’un,
metanolik HCl ile ile reaksiyonundan -amino asit öncü 135 nolu bileşik %58 verimle
elde edildi. 135’in aminasyon çalışmalarında 1:1 oranında 137a ve 137b oldukça
yüksek verimle sentezlendi. Kromatografik yöntemlerle izomerlerin birbirinden
ayrılmadığı görüldü. Bunun üzerine hafif fonksiyonellendirme ile izomerlerin
birbirinden ayrılacağı öngörüldü. Fakat gerçekleştirilen bir seri reaksiyonda istenilen
sonuca ulaşılamadı. 135’in aminasyonu ile elde edilen bir diğer izomer karışımı olarak
elde edilen 1:4 oranında 138a ve 138b izomerlerinden 138b’nin kristal formda elde
edilmesiyle X-Ray ile mutlak streoekimyası belirlendi.
106
Şekil 5.6. 137a, 137b ve 138a, 138b’nin sentezi
X-Ray ile mutlak stereokimyası belirlenen 138b daha sonraki çalışmalarımızda
hidrojenasyona maruz bırakılacaktır. Amin grubunun hidrojenasyonu yönlendirmesi ile
nitril grubunun amine göre anti, hidroksile göre syn olacağı düşünülmektedir. Nitril
grubunun hidrolizi ile hidroksi--amino asit elde edilecektir. Her ne kadar 138a’nın XRay analizi yoksa da bu bileşik 138b’nin izomeri olmak zorundadır. Yapının Şekil
5.6’de verildiği gibi olduğu düşünülmektedir. 138a’da benzer şekilde hidrojenasyon ve
hidrolizle ilgili amino asite 155a’ya dönüştürülecektir (Şekil 5.7)
Şekil 5.7.-hidroksi--aminoasit sentezi için izlenecek yol
107
Daha sonraki çalışmalarımızda 137a ve 137b’nin hidrolizi ve elde edilen karboskilik
asitler üzerinden laktamlar elde edilmeye çalışılacaktır. Laktam basamağında izomerler
ayrılarak mutlak stereokimyaları belirli -amino asit öncüsü
edilecektir (Şekil 5.8).
Şekil 5.8.-hidroksi--laktam sentezi için izlenecek yol
159a ve 159b elde
108
KAYNAKLAR
Buchwaldt, L., Green, H., 1992. Phytotoxicity of destruxin B and its possible role in the
pathogenesis of Alternaria brassicae. Plant Pathol. 41, 55–63.
Bunnage, M. E., Ganesh, T., Masesane, I. B., Orton, D, Steel, P. G., 2003. Asymmetric
synthesis of the putative structure of (-)-oryzoxymycin. Org. Lett., 5(3), 239242.
Chippindale, A. M., Davies, S. G., Iwamoto, K., Parkin, R. M., Smethurst, C. A. P.,
Smith, A. D., Rodriguez-Solla, H., 2003. Asymmetric synthesis of cyclic amino acids and cyclic amines via sequential diastereoselective conjugate
addition and ring closing metathesis. Tetrahedron, 59, 3253.
Choi, S. and Silverman, R. B., 2002. Inactivation and Inhibition of γ-Aminobutyric
Acid Aminotransferase by Conformationally Restricted Vigabatrin Analogues. J.
Med. Chem., 45, 4531.
Coursindel, T., Martinez, J., Parrrot, I., 2011. Concise Pathway to New
Multifunctionalized Constrained Pentacin Derivatives by Means ofTwo
Stereospecific Tandem Reactions. Eur. J. Org. Chem., 4519-4522.
Crews, P.; Manes, L. V.; Boehler, M., 1986. Jasplakinolide, a cyclodepsipeptide from
the marine sponge, JaspiSP. Tetrahedron Lett., 27, 2797.Davies, S. G., Garrido,
N. M., Kruchinin, D., Ichihara, O., Kotchie, L. J.; Price, P. D., Mortimer, A. J.
P., Russell, A. J., Smith, A. D., 2006. Homochiral lithium amides for the
asymetric synthesis of -amino acids. Tetrahedron: Asymmetry, 17, 1793.
Dragovich, P. S., Murphy, D. E., Dao, K., Kim, S. H., Li, L. S., Ruebsam, F., Sun, Z.,
Tran, C. V., Xiang, A. X., Zhou, Y., 2008. Efficient synthesis of (1R,2S) and
(1S,2R)-2-aminocyclopentanecarboxylic acid ethyl ester derivatives in
enantiyomerically pure form. Tetrahedron: Asymmetry., 19, 2796.
Forró, E., rva, J., Fülöp, F., 2001. Preparation of (1R,8S)- and (1S,8R)-9azabicyclo[6.2.0]dec-4-en-10-one: potential starting compounds for the
synthesis of anatoxin-Tetrahedron: Asymmetry., 12, 643.
Forró, E., Fülöp, F., 2003. Lipase-Catalyzed Enantioselective Ring Opening of
Unactivated Alicyclic-Fused-Lactams in an Organic Solvent. Org. Lett., 5,
1209.
Fülöp, F., 2000. The Chemistry of 2-Aminocyclopentanecarboxylic Acid.In Studies in
Natural Products Chemistry, Atta-ur-Rahman, Ed., Elsevier, Amsterdam,22,
273–306.
Fülöp, F., 2001. The chemistry of 2-aminocycloalkanecarboxylic acids. Chem. Rev.,
101(7), 2181-2204.
Gardiner, J., Anderson, K. H., Downard, A., Abell, A. D., 2004. Synthesis of Cyclic Amino Acid Esters from Methionine, Allylglycine, and Serin. J. Org. Chem., 69,
3375.
Garrido, N. M., Blanco, M., Cascon, I. F., Diez, D., Vicente; Sanz, F., Urones, J. G.,
2008. Asymetric synthesis of (1S,2R)-2-aminocyclooctanecarboxylic acid.
Tetrahedron: Asymmetry., 19, 2895.
109
Gedey, S., Eycken, J. V., Fü1öp, F., 2002. Liquid-Phase Combinatorial Synthesis of
Alicyclic â-Lactams via Ugi Four-Component Reaction. Org. Lett., 4(11), 19671969.
Gomes, P. B., Markus, N., Hans-Martin, D., Christian, H., 2010. Pitucamycin:
Structural Merger of a Phenoxazinone with an Epoxyquinone Antibiotic. J. Nat.
Prod., 73, 1461–1464.
Griffith, O.W., 1986. Beta-Amino Acids - Mammalian Metabolism and Utility as
Alpha-Amino-Acid Analogs. Annual Review of Biochemistry,. 55., 855-878.
Hamersak, Z., Roje, M., Avdagic, A., Sunjic, V., 2007. Quinine-mediated parallel
kinetic resolution of racemic cyclic anhydride: stereoselective synthesis, relative
and absolute configuration of novel alicyclic -amino acids. Tetrahedron:
Asymmetry., 18, 635.
Hashimot.T, 1972.Structures of Oryzoxymycin and Its Dimerization Product. Journal of
Antibiotics, 25(6): p. 350
Hornykiewicz, O., 2002. L-DOPA: From a biologically inactive amino acid to a
successful therapeutic agent. Amino Acids, 23, 65–70.
Iwamoto, T., Tsujii, E., Ezaki, M., Fujie, A., Hashimoto, S., Okuhara, M., Kohsaka, M.,
Imanaka, H., Kawabata, K., Ina- moto, Y., Sakane, K. 1990. J. Antibiot., 43, 1.
Kawabata, K., Inamoto, Y., Sakane, K., Iwamoto, T., Hashimoto, S. 1990. J. Antibiot.,
43, 513.
Kiss, L., Forró, E., Bern th, G., Fülöp, F., 2005. Synthesis of alicyclic trans--amino
acids from cis--hydroxycycloalkanecarboxylates. Synthesis., 8, 1265.
Kiss, L., Forro, E., Sillanpaa R., Fülöp F., 2008. Novel Functionalized Cispentacin
Derivatives:
Synthesis
of
1,2,3-triazole-substitued
2aminocyclopentanecarboxylate steroisomer. Tetrahedron: Asymmetry, 19, 2856–
2860.
Kiss, L., Fülöp, F., 2012. Synthesis of Carbocyclic and Hetereocyclic Aminocarboxylic Acids. Chemical Reviews., B.
Konishi, M., Nishio, M., Saitoh, K., Miyaki, T., Oki, T., Kawagu- chi, H. J., 1989
Antibiotics. 42, 1749.
Matsushima, Y., Kino, J., 2009. New Concise Route to 2-Amino-3
hydroxycycloalkanecarboxylic Acids by Imidate-Mediated Intramolecular
Conjugate Addition. Eur. J. Org. Chem., 10, 1619–1624.
Nicolaou, K. C., Dai, W., Guy, R. K., 1994. Chemistry and Biology of Taxol. Angew.
Chem. Int. Ed. Engl., 33(1), 15-44.
Oki, T., Hirano, M., Tomatsu, K., Numata, K., Kamei, H., 1989, J. Antibiotics., 42,
1756.
Palko, M., Benedek G., Forró, E., eber, E., Hanninen., Sillanpaa, R., M., Fülöp, F.,
2010.
Synthesis
of
monoand
dihydroxy-substituted
2aminocyclooctanecarboxylic acid enantiomers. Tetrahedron: Asymmetry, 21(8),
957-961.
Pegova, A., Abe, H., Boldyrew., 2000. Hydrolysis of Carnosine and Related Compunds
by Mammalian Carnosinases. Comp. Biochem. Phys. B-Biochem. Mol. Biology.,
127(4), 443-446.
Roers, R., Verdine, G.L., 2001. Concise Enantio- and Diastereoselective Synthesis of
Alpha-Hydroxy-Alpha-Methyl-Beta-Amino Acids. Tetrahedron Lett., 42(21),
3563-3565.
110
Schofield, C. J.,Walter, M.W., 1999. Amino Acids, Peptidase and Proteins., 30, 335397
Spiteller, P., Ruth, M., Von Nussbaum, F., Steglich, W., 2000. Detection of a 2,3Aminomutase in the Mushroom Cortinarius violaceus. Angew. Chem. Int. Ed.,
39, 2754–2756.
Steel, G. P. and Masesane I. B., 2004. Stereoselective routes to 3-hydroxy and 3,4dihydroxy derivatives of 2-aminocyclohexanecarboxylic acid. Tetrahedron Lett.,
45, 5007–5009
Sterr, D.L., Lew, R.A., Perlmutter, P., Smith, A.I., Aguiler, M.I., 2002. Beta-Amino
Acids: Versatile Peptidomimetics. Curr. Med. Chem., 9(8), 811-822.
Stierle, A, Strobel, G.,Stierle, D., 1993. Taxol and Taxane Production by TaxomycesAndreanae, An Endophytic Fungus of Pacific Yew. Science, 260(5105), 214216.
Szakonyi, Z., Bal zs, A., Martinek, T. A., Fülöp, F., 2006. Enantioselective addition of
diethylzinc to aldehydes catalyzed by amino alcohols derived from (+)-and
(-)- -pinene. Tetrahedron: Asymmetry, 17, 199.
Szakonyi, Z., Bal zs, A., Martinek, T. A., Fülöp, F., 2010. Stereoselective synthesis of
pinane-based - and amino acids via conjugate addition of lithium amides
and nitromethane. Tetrahedron: Asymmetry, 21, 2498.
Szakonyi, Z., 2005. Synthesis of 3-and 4-hydroxy-2-aminocyclohexanecarboxylic acids
by iodocyclization. European Journal of Organic Chemistry, (18) 4017-4023.
Tang, W., Wu, S., Zhang, X., 2003. Enantioselective Hydrogenation of Tetrasubstituted
Olefins of Cyclic -(Acylamino)acrylates. J. Am. Chem. Soc., 125, 9570.
Umezawa, H., Ishizuka, M., Agoyagi, T., Takeuchi, T., 1976. Enhancement of DelayedType Hypersensitivity by Bestatin, An Inhibitör of Aminopeptidase- and
Leucine Aminopeptidase. J. Antibiot. 29(8), 857-859.
Von Nussbaum, F., Spiteller, P., 2004. In mino Acids in Nature in Highlights in
Bioorganic Chemistry: Methods and Applications. Wiley – VCH, Weinheim, p.
63-89.
Windholz, M., Budavari, S., Stroumtsos, L.Y., Fertig, M.N., 1976. Eds. The Merck
Index, An Encyclopedia of Chemicals and Drugs. 9th ed., Merck, Ranway, NJ,
p. 909.
Zabriskie, T. M., Klocke, J. A., Ireland, C.M., Marcus, A.H., Molinski, T.F., Faulkner,
D.J., Xu, C., Clardy, J., 1986. Jaspamide, a modified peptide from a Jaspis
sponge, with insecticidal and antifungal activity. J. Am. Chem. Soc., 108, 3123.
Ziegelbauer, K., Babczinski, P., Schönfeld, ., 1988. Moleculer Mode of Action of the
Antifungal -Amino Acid BAY 10-8888. Antimicrob. Agents and Chemother.
42(9), 2197-2205.
111
ÖZGEÇMİŞ
12 Ocak 1988 tarihinde Ankara’da dünyaya geldi. İlkokul ve lise eğitimini Ankara’da
aldı. 2006 yılında girdiği Atatürk Üniversitesi Eğitim Fakültesi Kimya Bölümünden
2011 yılında mezun oldu. 2012 yılında Atatürk Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü
Kimya Anabilim Dalında yüksek lisans eğitimine başladı. Halen Atatürk Üniversitesi,
Fen Bilimleri Enstitüsü’nde öğretimine devam etmektedir.
Download