öğretim elemanları için ders yükü bildirim formu

BAÜ FEF 2. Öğretim 2008 Bahar Moleküler Biyoloji 2 Arasınavı (26.04.2008)
Süre 60dk’dır. ANAHTAR
1.
Translasyon yoluyla transkripsiyonun kontrolü ....Trp......
operonunda görülür ve bu olay .... attenuasyon adını alır. (4p)
2.
[D] [Y] Trp operonunda repressör, triptofan varlığında
operatöre bağlanamaz ve böylece RNA polimeraz tarafından gen
ekspresyonu başlatılır. (2p)
3.
[D] [Y] Trp operonunda ortamda trp varsa saç tokası oluşurken
trp olmadığında oluşmaz (2p)
4. cis ve trans elementler hakkında hangisi en doğrudur? (5p)
a) cis elementler transkripsiyonda, trans elementler translasyonda
görev alır
b) cis elementler translasyonda, trans elementler transkripsiyonda
görev alır
c) cis elementler aktif trans elementler pasif olarak görev yapar
d) cis elementler sentezlendiği yerde, trans elementler sentezlendiği
yerden başka yerde görev yapar
e) Trans elementler ürünleriyle, cis elementler ürünsüz görev yapar
5. LacA geni hakkında hangisi doğrudur? (5p)
a) Arabinoz operonuna ait bir gendir
b) Triptofan operonuna ait bir gendir
c) Laktozu glukoz ve galaktoza ayırır
d) Laktozu hücre içine alır
e) Görevi kesin olarak bilinmemektedir
11. Prokaryotik promotorlarda çoğunlukla sadece ...TTGACA
kutusu... ve ....TATA kutusu.... elementleri bulunurken, ökaryotik
promotorlarda .....TATA kutusu, CAAT kutusu, ve GC kutusu...
elementleri bulunur. 5p
12. Gerçek aktivatör transkripsiyon faktörlerinin DNA’ya
bağlanma domainlerinin çeşitli motifleri vardır. Bunlar ....sarmaldönüş-sarmal..., çinko parmaklar ve lösin fermuarları... olarak
bilinir. Antirepressörler ise histon proteinlerini kromatinden ayırıpbağlama görevi görürler. Bunlardan ....SWI-SNF ve HAT
kompleksi....histonları uzaklaştırırken ...HD kompleksi....histonları
tekrar kromatine bağlar. 6p
13. Bir DNA molekülünün metillenip metillenmediğini anlamak
için nasıl bir deney yaparsınız? metin olarak anlatınız veya şekille
gösteriniz. 10p
Bu molekülü 2 gruba ayırıp birinci grubu MspI enzimi ile
ikinci grubu ise HpaII enzimi ile keseriz. Eğer her iki enzimle aynı
sayıda ve büyüklükte band verirse metilasyon yoktur farklı bandlar
oluşursa metilasyon vardır.
6. Jacob ve Monad neden lacI geninin bir allosterik molekül
olduğunu ileri sürmüşlerdir? (5p)
a) çünkü bu molekülün bir enzim olduğunu bulmuşlardır
b) başka bir moleküle tersinir bağlanıp 3 boyutlu yapısı değiştiği için
c) sentezlendiği yerden başka bir yerde görev yaptığı için
d) F’ faktörleriyle alındığında bozukluğu giderebildiği için
e) bir cis element olduğu için
7. Aşağıdaki E.coli genotiplerinin belirtilen ortamlardaki operon
aktivitesini + ve – koyarak belirtiniz. (Lac: laktoz, Glc: Glukoz) 12p
14. [D] [Y] Kep ekleme işlemi gen regülasyonunda en az rastlanan
aşamalardandır. (2p)
Genotip
15. ......Enhansırlar.... genin 3’ tarafı veya 5’ tarafında bulunurken,
...TATA kutusu/CAAT kutusu/GC kutusu...... sadece 5’ tarafında
bulunurlar (4p)
crp+ I+ O+ Z+ / F’I+
crp— I+ OC Z+
crp+ I+ O+ Z—Y+ A+
crp+ I— O+ Z+ / F’I+
Lac var
Glc yok
+
-+
+
Lac yok
Glc yok
-----
Lac var
Glc var
-----
8. Aşağıdakilerden hangisi doğru akış sırasıdır? (5p)
a) CAP  operatöre bağlanma  RNA Pol  Transkripsiyon
b) CAP-cAMP kompleksi  promotora bağlanma  RNA Pol 
Transkripsiyon
c) laktoz  repressöre bağlanma  operatörden ayrılma  RNA
Pol  Transkripsiyon
d) repressör  promotora bağlanma  operon kapalı
e) Triptofan  repressöre bağlanma  operatörden ayrılma  RNA
Pol  Transkripsiyon
9.
Arabinoz operonunda, Lac ve Trp operonundaki repressörün
yerine ....düzenleyici.... protein bulunur. Bu protein arabinoz
varlığında sadece ....uyarıcı bölgeye... bağlanırken, arabinoz
yokluğunda .....hem uyarıcı bölgeye hem de O2 bölgesine
.....bağlanarak transkripsionu engeller. (4p)
10. “Şapka”, “kuyruk” ve “fazlalıklar” gen ekspresyonu konusunda
size tam olarak ne ifade eder? Bunlardan kontrol amaçlı kullanılan
var mıdır? varsa bu kontrol nasıl olur? (10p)
Şapka ökaryotlardaki öncül mRNA’nın 5’ ucuna eklenen
7 metil guanozini, kuyruk aynı mRNA’nın sonuna eklenen poli A
kuyruğunu, fazlıklarda aynı mRNA’dan kesilerek çıkarılan intronları
ifade etmektedir. Poli A kuyuğunun uzun veya kısa olması
mRNA’nın ömrününun uzatılıp kısaltılması için kullanılır.
İntronların çıkarılması esnasında da, seçenekli splays yoluyla bir
intron bazen ekzon (veya bir ekzon bazen intron) olacak şekilde
tercih yapılabilir.
16. [D] [Y] Antirepressör Tx faktörleri RNA polimeraz ile direk
temas etmeden Tx başlamaz. (2p)
17. [D] [Y] TATA kutusu hem prokaryot hem de ökaryotlarda
bulunur ancak bazı genlerde bulunmaz (2p)
18. [D] [Y] Drosophila’da TRA proteini alternatif splyasla
oluşurken DSX-F ve DSX-M proteinlerinde tek tip mRNA söz
konusudur (2p)
19. Mayadaki gal genleri ile E.coli’deki lac genlerini karşılaştırınız.
(6p)
Hem lac hem de gal sistemi katabolit represyondan
etkilenir, ancak lac sistemi negatif gal sistemi ise pozitif
kontrol altındadır. Her ikisi de indüklenebilen
sistemlerdir.
20. Bir mRNA sadece bir proteini şifrelemeye yaryan kodonlardan
ibaret değildir. Ayrıca yapısında yer alan translasyona uğramayan
5’ ve 3’ dizileri bazı regülayson bilgilerini taşımaktadır. Bu
bilgiler ..karalılık dizileri ve mRNA’nın hücrenin belirli
bileşenlerine gitmesini sağlayan yönlendirme .... dizileridir.
Ayrıca tüm hücrelere ya da belirli hücre tipine özgü olabilen ....
kararsızlık elementleri..... de bulunur. (6p)