İLERİ DÜZEY MOLEKÜLER TEKNİKLER KURSU: 17-18
advertisement
İLERİ DÜZEY MOLEKÜLER TEKNİKLER KURSU: 17-18 Ekim 2015 DNA Dizi Analizi ve Uygulama Alanları 17 Ekim 2015 Cumartesi 09:00-9:15 09:15-9:30 Kursun Tanıtımı Meltem YALINAY Açılış Konuşması 09:30-10:15 DNA Dizi Analizi Yöntemlerinin Mikrobiyolojide Kullanım Alanları Meltem YALINAY 10:15-10:30 Ara 10:30-11:15 DNA Dizi Analizi Yöntemlerinin Gelişimi ve Sanger Reaksiyonu Doruk ENGİN 11:15-12:00 Pirosekans Reaksiyonu ile DNA Dizileme Canan KÜLAH 12:00-13:00 13:00-14:00 14:00-15:00 15:00-15:15 Ara-Öğle yemeği Uygulama-1: DNA Dizi Analizi Yöntemiyle Bakteri İdentifikasyonu: Nükleik Asit İzolasyonu Canan KÜLAH Spin-kolon yöntemi DNA izolasyonu Elde edilen nükleik asitin saflığının kontrolü Uygulama-1: DNA Dizi Analizi Yöntemiyle Bakteri İdentifikasyonu: 16S rDNA bölgesinin in-house PCR ile çoğaltılması Burçe Yalçın 16S rDNA bölgesinin özellikleri PCR reaksiyonun ana basamakları komponentleri ve optimizasyonu Ara 15:15-16:00 Yeni Nesil DNA Dizileme Sistemleri Barış OTLU 16:00-17:00 Uygulama-1: DNA Dizi Analizi Yöntemiyle Bakteri İdentifikasyonu: 16S rDNA Amplifikasyon Ürününün görüntülenmesi Barış OTLU Agaroz jel elektroforezi ile görüntüleme Jelden DNA saflaştırılması 17:00-18:00 18:00-20:00 Moleküler Mikrobiyolojik Tanıda DNA Dizi Analizi Uygulamaları Literatür Derlemesi Burçe YALÇIN Akşam Yemeği TANISAL MOLEKÜLER MİKROBİYOLOJİ KURSU-2: 17-18 Ekim 2015 DNA Dizi Analizi ve Uygulama Alanları 18 Ekim 2015 Pazar 09:00-09:30 Uygulama-1: DNA Dizi Analizi Yöntemiyle Bakteri İdentifikasyonu: Sanger Dizileme için “Cycle Sequencing” Doruk ENGİN “Cycle Sequencing” rekasiyonunun değişkenleri ve optimizasyonu Rekasiyonun Hazırlanması 9:30-10:15 Dizi Analizi Sonuçlarının Biyoinformatik Analizi Doruk ENGİN 10:15-10:30 10:30-12:00 12:00-13:00 Ara Uygulama-2: DNA Dizi Analizi Yöntemiyle Bakteri İdentifikasyonu: “Cycle Sequencing” sonrasında NaAc ile saflaştırma Doruk ENGİN, Barış OTLU “Cycle Sequencing” sonrasında ürünlerin NaAc ile saflaştırılması DNA’ların liyofize hale getirilmesi ABİ Prism 310 Genetic Analyser cihazının tanıtımı Örneklerin cihaza yüklenmesi Ara-Öğle yemeği Uygulama-2: Pirosekans ile Mikobakteri Tiplendirilmesi Canan KÜLAH, Özkan YENER 13:00-15:00 15:00-15:30 15:30-16:15 16:15-17:00 17:00-17:30 Pirosekans reaksiyonun prensipleri Pirosekans reaksiyonu için hazırlık ve sistemin tanıtılması Pirosekanslama ile deney tasarımı Ara DNA Dizi Analizi Uygulamalarında Karşılaşılabilecek Sorunlar Z. Ceren KARAHAN Uygulama: DNA Dizi Analizi Sonuçların Değerlendirilmesi Meltem YALINAY Değerlendirme Toplantısı ve Sertifika Dağıtımı Meltem YALINAY UYGULAMA EKİBİ Meltem YALINAY, Barış OTLU, Z. Ceren KARAHAN Doruk ENGİN, Canan KÜLAH, Burçe YALÇIN, Berrin ÖZTÜRK, Özkan YENER
