BÖLÜM 1 BİTKİ HÜCRESİ VE KİMYASAL BİLEŞİMİ Mitokondri Kloroplast Sitoplazma Hücre zarı Granüllü ER Peroksizom Nukleus Vakuol Nukleolus Golgi aygıtı Nukleus zarı Hücre çeperi Ribozomlar Granülsüz ER Plazmodezma PROTOPLAST Bitki hücresi= Hücre çeperi + protoplast (protoplazma) Protoplazma % 75-85 su % 10-20 protein % 2-3 lipid % 1 karbohidrat % 1 inorganik madde NUKLEUS Nukleolus Nukleus zarı Porlar Kromozomlar Kromatin HÜCRE ZARI DIŞ ORTAM Oligosakkarit Glikoprotein Glikolipid Periferal protein İntegral protein Hidrofobik bölge İÇ ORTAM İntegral protein Hidrofilik polar uç Periferal proteinler Fosfolipid Hidrofilik protein İki tabakalı fosfolipid Tabakalar SİTOPLAZMA Kloroplast Hücre çeperi Tonoplast Merkezi vakuol MİTOKONDRİ İç zar Dış zar - Enzim-koenzim Krista Matriks - Oksidasyon ve solunum - Bitkilerde daha az GOLGİ AYGITI Gelen transport vesikülü Lümen Gelen transport vesikülü Sisternalar Yeni oluşmuş vesikül Giden transport vesikülü - Çeper sentezi - Hücre dışı salgı - Transport ENDOPLAZMİK RETİKULUM - Enzimler için yüzey Düz ER - Madde değişimi Nuklear porlar Nukleus zarı Granüler ER Sisternalar Ribozomlar PLASTİDLER Lökoplastlar (depo) Kloroplastlar (fotosentez) Kromoplastlar (renk maddesi) • Renk maddesi taşıyanlar: 1- Kloroplastlar 2- Kromoplastlar • Renk maddesi taşımayanlar: 1- Lökoplastlar KLOROPLASTLAR İç zar Stroma Dış zar Zarlar arası boşluk Granum (tilakoid yığınları) Lümen Tilakoid Lamel KROMOPLASTLAR LÖKOPLASTLAR RİBOZOMLAR ÖKARYOTLARDA: 40S 30 protein + 18S rRNA Küçük alt birim 80S Büyük alt birim 60S 40 protein + 5.8S rRNA + 28S rRNA + 5S rRNA PROKARYOTLARDA: 30S + 50S = 70S MİKROCİSİMLER 1- Peroksizomlar: Fotorespirasyon, katalaz, peroksidaz 2- Glioksizomlar: Glioksilat devri (yağların karbohidalara dönüşümü) MİKROTÜBÜL VE MİKROFİLAMENTLER alfa-tubulin • Hücre iskelet sistemi • İğ iplikleri • Preprofaz bandı heterodimer protofilament beta-tubulin HÜCRE ÇEPERİNİN YAPISI Sekonder çeper (S3) Sekonder çeper (S2) Sekonder çeper (S1) Primer çeper Orta lamel 1. HÜCRE Primer çeper Sekonder çeper Orta lamel Bitki hücre çeperi Plazmodezma Çeper tabakaları Orta lamel Primer çeper Sekonder çeper 2. HÜCRE BİTKİ HÜCRESİNİN KİMYASAL BİLEŞİMİ Su + İnorganik madde + Organik madde Kuru madde=Biyokütle=Biyomas (organik+inorganik madde) Kuru ağırlığın %90’ı organik, %10’inorganik BİTKİLERİN MİNERAL MADDE İÇERİĞİ - Oksijen ve hidrojen - 70ºC’ de 1-2 gün ----kuru ağırlık - Karbon, hidrojen, oksijen----- karbohidratlar - Yakma-----KÜL----mineral maddeler - Mineral madde miktarı-bitki tipi-çevre koşulları-iyon alınımında -seçicilik Tablo 1.1. Aynı Ortamda Büyütülen Farklı Bitki Türlerinde Bazı Elementlerin Kuru Ağırlığa Göre % Oranları Ca K Mg N P Ayçiçeği 1,68 3,47 0,73 1,47 0,08 Fasulye 1,46 1,19 0,57 1,48 0,05 Buğday 0,46 4,16 0,22 2,26 0,06 Arpa 0,68 5,04 0,29 1,94 0,12 Bitkiler ESANSİYEL BESİN ELEMENTLERİ Tablo 1.2. Bitki büyümesi için gerekli makroelementler Element % Kuru Ağırlık başına 1,5 N P 0,2 1,0 Gübre formu Absorbe edildiği form Eksiklik belirtisi NO3 veya NH4 (NH2)2CO (üre) (NH4)2SO4, NH3, NH4NO3, (NH4)3PO4 Yaprakların özellikle olgun kısımlarında açık yeşil bazen sarı veya kırmızı lekeler ile yavaş büyüme H2PO4 veya HPO2 Ca(H2PO4)2 (NH4)3PO4 Yapraklarda koyu yeşilden eflatuna kadar çeşitli renkler, zayıf meyve verme, olgunlaşmadan meyvelerin dökülmesi KCl Benekli ya da kıvrılmış yapraklar, yavaş büyüme, kök sisteminin zayıf gelişmesi K+ K Ca 0,25 Ca2+ CaO (yanmış kireç), Ca(OH)2 (sönmüş kireç), CaCO3, CaSO4 (alçıtaşı) Uçtaki tomurcukların bozulması veya ölmesi, kök büyümesinde azalma Mg 0,2 Mg 2+ MgSO4(İngiliz tuzu), Mg(NO3)2, MgCl2 Özellikle yaşlı yaprakların damarları arasında klorozis, sonra yaprak kenarlarına ve uçlarına yayılma S 0,2 SO42- (NH4)2SO4 CaSO4 Azot eksikliğine benzer açık yeşil yapraklar ve yavaş büyüme Element % Kuru Ağırlık başına Absorbe edildiği form Gübre formu Eksiklik belirtisi 0,1 Fe2+ veya Fe+3 Demir şelatları Genç yapraklarda genel klorozis, damar bölgelerinin sarıya dönüşmesi 0,0006 Bo-3 veya B4O72- Na2B4O7 (Sodyum tetraborat) Uçlarda ölüm ya da hasar, biçimi bozulmuş ve kolay kırılan yap-raklar, kök büyümesinde gecikme 0,03 Mn2+ MnSO4 Demir eksikliğine benzer belirtiler, ilk damarlar arasında gelişen klorozis Zn2+ ZnSO4 Yaprak büyümesinin gecikmesi, kısa internodlar, anormal düzende kök saçakları MoO4 2- Na2MoO4 (sodyum molibdat) Damarlar arasında klorozis, yap-rakların kıvrılması, manganez veya demir eksikliğine benzer özellikler 0,0006 Cu 2+ CuSO4 CuO Sık sık kenarlarının kıvrılmasıyla oluşan klorozitik yapraklar, sürgün uçlarında tepeden köke doğru kuruma, lateral tomurcukların çalı gibi görünen sürgün vermesi 0,1 Cl- KCl Genç yapraklar mavimsi yeşil ve parlak, daha sonra kırmızımsı kahverengi (güneşte yanmış gibi) görünüm de olması ve ölmesi. Ni 0,0001 Ni2+ Na 0,01 Na+ Fe B Mn Zn 0.0008 0.0001 Mo Cu Cl Yapraklarda klorozis ve nekrozis. Zayıf gelişimli fideler. NaCl Klorosis, nekrosis ve çiçeklenmede azalma Klorozis orta dereceli klorosis orta dereceli klorosissararma Nekrozis ESANSİYEL OLMAYAN ELEMENTLER • Al, Co, I, F, Se, Ba • Co → azot metabolizması BİTKİLERİN ORGANİK MADDE İÇERİĞİ Karbohidratlar, lipidler, proteinler KARBOHİDRATLAR 1:2:1 C:H:O (CH2O)n Çeper yapısında Enerji kaynağı MONOSAKKARİTLER 3-7 C atomu Trioz, tetroz, pentoz, heksoz DİSAKKARİTLER POLİSAKKARİTLER Polimer 1,4-glikozidik bağ -glukoz → -glikozidik bağ 1-4 bağı → AMİLOZ 1-6 bağı → molekülde dallanma (amilopektin) Glikojen (Fungus, cyanobakterler) İnulin (Taraxacum sp.) Selüloz mikrofibrilleri Selüloz demetleri Selüloz molekülleri Selülozdan farklı polisakkaritler (hemiselüloz, pektik asit) LİPİDLER Yağ veya yağımsı maddeler Suda çözünmezler YAĞLAR Hidrofilik-hidrofobik Ester bağı FOSFOLİPİDLER MUMLAR Yağ asitleri + uzun zincirli alkoller Bal mumu, kutikula Süberin PROTEİNLER Amino asitler Hidrojen atomu Amino grubu Karboksil grubu Değişken grup YİRMİ DOĞAL AMİNOASİT Glisin (Gly) Alanin(Ala) Valin (Val) Fenilalanin (Phe) Lösin (Leu) Metionin (Met) Prolin (Pro) Treonin (Thr) Asparagin (Aspn) Triptofan (Trp) Izolösin (Ileu) Lizin (Lys) Serin (Ser) Tirozin (Tyr) Sistein (Cys) Glutamin (Gln) Arjinin (Arg) Aspartat (Asp) Histidin (His) Glutamat (Glu) Peptid bağı, Polipeptid Amino grubu Karboksil grubu Peptid bağı Amino ucu Karboksil ucu • • • • Yapısal fonksiyon Enzimatik fonksiyon Enerji kaynağı LEKTİNLER HÜCRENİN pH DEĞERİ VE ORGANİK ASİTLER Enzim aktivitesi H+ gradienti Çeper büyümesi Toprağın pH değeri Tampon çözeltiler Asit-baz HCl → H+ + Cl NaOH → Na+ + OHOH- + H+ → H2O Organik asitler Vakuol Meyvelerin ekşi tatları Metabolik fonksiyonlar Fitoremediasyon Ağır metal detoksifikasyonu