Klinik Örneklerden İzole Edilen Küf Mantarlarının

advertisement
S-07
Klinik Örneklerden İzole Edilen Küf Mantarlarının Klasik ve Moleküler Yöntemlerle
Tanımlanması
Şahin DİREKEL, Feza OTAĞ, Gönül ASLAN, Gürol EMEKDAŞ
Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Mersin
e-posta: [email protected]
İmmün sistem yetmezliği bulunan hastalarda invaziv fungal infeksiyonlar morbidite ve
mortalitenin önemli nedenlerinden biridir. Sıklıkla izole edilen Aspergillus türleri başta olmak
üzere Fusarium ve Zygomycetes türleri yüksek mortaliteye yol açan etkenlerdir.
Tanımlanmalarında çoğunlukla konvansiyonel yöntemler kullanılmakla birlikte kimi ender
rastlanan türlerin adlandırılmalarında moleküler yöntemlere gereksinim duyulmaktadır. Bu
çalışmada, Fakülte Hastanemizin yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların çeşitli klinik
örneklerinden izole edilen filamentöz mantarların tür dağılımını, klasik yöntemler ve PZR bazlı
DNA dizi analizi teknikler ile tanımlayarak sonuçlarının karşılaştırılması ile ortaya konulması
amaçlanmıştır. 22 aylık bir dönemde etken olarak izole edilen 32 filamentöz mantar çalışma
kapsamına alınmıştır. Klasik yöntemle, 6 Aspergillus niger, 6 A.flavus, 5 A.fumigatus, 4
A.terreus, 5 Fusarium spp., 2 Bipolaris spp. ve 1’er Acremonium spp., Aurebasidium spp.,
Mucor spp. ve Scedosporium spp. olmak üzere toplam 32 filamentöz mantar kimi tür düzeyinde
kimi cins düzeyinde tanımlanmıştır. DNA dizi analiz sonuçlarıyla karşılaştırıldığında sadece üç
filamentöz mantarın tanısında uyumsuzluk saptanmıştır: Aspergillus türleri her iki yöntemle
doğru tanımlanmıştır. Bipolaris, Scedosporium, Aureobasidium ve Fusarium suşları (biri hariç)
cins düzeyinde doğru olarak tanımladığımız anlaşılmıştır. Klasik yöntemle Acremonium,
Mucor ve Fusarium olarak cins düzeyinde tanımladığımız 3 suş, dizi analizi ile sırasıyla
Lecythophora, Rhizopus ve Cylindrocarpon olarak adlandırılmıştır. Sonuç olarak, klinik
örneklerden yaygın olarak izole edilen filamentöz mantarların gerek cins gerek tür düzeyinde
tanımlanmalarında
klasik
yöntemler
yeterli
olmaktadır.
Ender
rastlanan
türlerin
tanımlanmasında ise referans laboratuvarlarda genotiplendirme yöntemlerine gereksinim
duyulmaktadır.
Anahtar
Kelimeler:
Filamentöz
mantarlar,
Aspergillus,
Fusarium,
Lecythophora,
Cylindrocarpon
23
1.ULUSAL MİKOLOJİ GÜNLERİ, 01-04 Eylül 2014
Erzurum Teknik Üniversitesi, Erzurum, TÜRKİYE
www.mikoloji2014.com
Download