Sinyal Transdüksiyonun I Hücreler Arası İletişim 1 (Sinyal İletimi 1) Yrd. Doç. Dr. İzzet YELKOVAN Mart 2006 SİVAS External sinyal iletimi: Hedef hücrelere sinyal iletimi (1) Endokrine sinyal iletimi: sinyal molekülleri (hormonlar) endokrin organ hücrelerince sentezlenirler – sentezlendikleri yerin uzağında başka bir mikroçevredeki hedef hücrelere etki ederler. (2) Parakrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri aynı mikro-çevreyi paylaşan bir hücre veya hücre grubu tarafında salınır ve yakın çevredeki diğer hücreleri etkiler (Neurotransmitterler ve neurohormonlar). (3) Autokrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri bir hücre veya hücre grubundan salınır ve sadece kendileri yanıt oluştururlar (bir çok büyüme faktörü). (4) Hücre – hücre ve hücre- matriks arası etkileşimlerde işe karışan moleküller. External sinyal iletimi: Hedef hücrelere sinyal iletimi (1) Endokrine sinyal iletimi: sinyal molekülleri (hormonlar) endokrin organ hücrelerince sentezlenirler – sentezlendikleri yerin uzağında başka bir mikroçevredeki hedef hücrelere etki ederler. (2) Parakrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri aynı mikro-çevreyi paylaşan bir hücre veya hücre grubu tarafında salınır ve yakın çevredeki diğer hücreleri etkiler (Neurotransmitterler ve neurohormonlar). (3) Autokrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri bir hücre veya hücre grubundan salınır ve sadece kendileri yanıt oluştururlar (bir çok büyüme faktörü). (4) Hücre – hücre ve hücre- matriks arası etkileşimlerde işe karışan moleküller. External sinyal iletimi: Hedef hücrelere sinyal iletimi (1) Endokrine sinyal iletimi: sinyal molekülleri (hormonlar) endokrin organ hücrelerince sentezlenirler – sentezlendikleri yerin uzağında başka bir mikroçevredeki hedef hücrelere etki ederler. (2) Parakrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri aynı mikro-çevreyi paylaşan bir hücre veya hücre grubu tarafında salınır ve yakın çevredeki diğer hücreleri etkiler (Neurotransmitterler ve neurohormonlar). (3) Autokrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri bir hücre veya hücre grubundan salınır ve sadece kendileri yanıt oluştururlar (bir çok büyüme faktörü). (4) Hücre – hücre ve hücre- matriks arası etkileşimlerde işe karışan moleküller. External sinyal iletimi: Hedef hücrelere sinyal iletimi (1) Endokrine sinyal iletimi: sinyal molekülleri (hormonlar) endokrin organ hücrelerince sentezlenirler – sentezlendikleri yerin uzağında başka bir mikroçevredeki hedef hücrelere etki ederler. (2) Parakrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri aynı mikro-çevreyi paylaşan bir hücre veya hücre grubu tarafında salınır ve yakın çevredeki diğer hücreleri etkiler (Neurotransmitterler ve neurohormonlar). (3) Autokrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri bir hücre veya hücre grubundan salınır ve sadece kendileri yanıt oluştururlar (bir çok büyüme faktörü). (4) Hücre – hücre ve hücre- matriks arası etkileşimlerde işe karışan moleküller. External sinyal iletimi: Hedef hücrelere sinyal iletimi (1) Endokrine sinyal iletimi: sinyal molekülleri (hormonlar) endokrin organ hücrelerince sentezlenirler – sentezlendikleri yerin uzağında başka bir mikroçevredeki hedef hücrelere etki ederler. (2) Parakrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri aynı mikro-çevreyi paylaşan bir hücre veya hücre grubu tarafında salınır ve yakın çevredeki diğer hücreleri etkiler (Neurotransmitterler ve neurohormonlar). (3) Autokrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri bir hücre veya hücre grubundan salınır ve sadece kendileri yanıt oluştururlar (bir çok büyüme faktörü). (4) Hücre – hücre ve hücre- matriks arası etkileşimlerde işe karışan moleküller. Fig. 7.2c (TEArt) Endokrin Bez Tarafından Hormon (ligand) Kana Salgılanır Kan Damarı Uzaktaki Hedef Hücreler Endokrin Sinyal İletimi External sinyal iletimi: Hedef hücrelere sinyal iletimi (1) Endokrine sinyal iletimi: sinyal molekülleri (hormonlar) endokrin organ hücrelerince sentezlenirler – sentezlendikleri yerin uzağında başka bir mikroçevredeki hedef hücrelere etki ederler. (2) Parakrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri aynı mikro-çevreyi paylaşan bir hücre veya hücre grubu tarafında salınır ve yakın çevredeki diğer hücreleri etkiler (Neurotransmitterler ve neurohormonlar). (3) Autokrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri bir hücre veya hücre grubundan salınır ve sadece kendileri yanıt oluştururlar (bir çok büyüme faktörü). (4) Hücre – hücre ve hücre- matriks arası etkileşimlerde işe karışan moleküller. External sinyal iletimi: Hedef hücrelere sinyal iletimi (1) Endokrine sinyal iletimi: sinyal molekülleri (hormonlar) endokrin organ hücrelerince sentezlenirler – sentezlendikleri yerin uzağında başka bir mikroçevredeki hedef hücrelere etki ederler. (2) Parakrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri aynı mikro-çevreyi paylaşan bir hücre veya hücre grubu tarafında salınır ve yakın çevredeki diğer hücreleri etkiler (Neurotransmitterler ve neurohormonlar). (3) Autokrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri bir hücre veya hücre grubundan salınır ve sadece kendileri yanıt oluştururlar (bir çok büyüme faktörü). (4) Hücre – hücre ve hücre- matriks arası etkileşimlerde işe karışan moleküller. External sinyal iletimi: Hedef hücrelere sinyal iletimi (1) Endokrine sinyal iletimi: sinyal molekülleri (hormonlar) endokrin organ hücrelerince sentezlenirler – sentezlendikleri yerin uzağında başka bir mikroçevredeki hedef hücrelere etki ederler. (2) Parakrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri aynı mikro-çevreyi paylaşan bir hücre veya hücre grubu tarafında salınır ve yakın çevredeki diğer hücreleri etkiler (Neurotransmitterler ve neurohormonlar). (3) Autokrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri bir hücre veya hücre grubundan salınır ve sadece kendileri yanıt oluştururlar (bir çok büyüme faktörü). (4) Hücre – hücre ve hücre- matriks arası etkileşimlerde işe karışan moleküller. Salgı Hücresi Fig. 7.2b (TEArt) Komşu Hedef Hücreler Parakrin Sinyal İletimi Neurotransmitter Fig. 7.2d (TEArt) Hedef Hücre Sinir Hücresi Sinaptik Açıklık Sinaptik Sinyal İletimi External sinyal iletimi: Hedef hücrelere sinyal iletimi (1) Endokrine sinyal iletimi: sinyal molekülleri (hormonlar) endokrin organ hücrelerince sentezlenirler – sentezlendikleri yerin uzağında başka bir mikroçevredeki hedef hücrelere etki ederler. (2) Parakrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri aynı mikro-çevreyi paylaşan bir hücre veya hücre grubu tarafında salınır ve yakın çevredeki diğer hücreleri etkiler (Neurotransmitterler ve neurohormonlar). (3) Autokrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri bir hücre veya hücre grubundan salınır ve sadece kendileri yanıt oluştururlar (bir çok büyüme faktörü). (4) Hücre – hücre ve hücre- matriks arası etkileşimlerde işe karışan moleküller. External sinyal iletimi: Hedef hücrelere sinyal iletimi (1) Endokrine sinyal iletimi: sinyal molekülleri (hormonlar) endokrin organ hücrelerince sentezlenirler – sentezlendikleri yerin uzağında başka bir mikroçevredeki hedef hücrelere etki ederler. (2) Parakrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri aynı mikro-çevreyi paylaşan bir hücre veya hücre grubu tarafında salınır ve yakın çevredeki diğer hücreleri etkiler (Neurotransmitterler ve neurohormonlar). (3) Autokrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri bir hücre veya hücre grubundan salınır ve sadece kendileri yanıt oluştururlar (bir çok büyüme faktörü). (4) Hücre – hücre ve hücre- matriks arası etkileşimlerde işe karışan moleküller. External sinyal iletimi: Hedef hücrelere sinyal iletimi (1) Endokrine sinyal iletimi: sinyal molekülleri (hormonlar) endokrin organ hücrelerince sentezlenirler – sentezlendikleri yerin uzağında başka bir mikroçevredeki hedef hücrelere etki ederler. (2) Parakrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri aynı mikro-çevreyi paylaşan bir hücre veya hücre grubu tarafında salınır ve yakın çevredeki diğer hücreleri etkiler (Neurotransmitterler ve neurohormonlar). (3) Autokrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri bir hücre veya hücre grubundan salınır ve sadece kendileri yanıt oluştururlar (bir çok büyüme faktörü). (4) Hücre – hücre ve hücre- matriks arası etkileşimlerde işe karışan moleküller. External sinyal iletimi: Hedef hücrelere sinyal iletimi (1) Endokrine sinyal iletimi: sinyal molekülleri (hormonlar) endokrin organ hücrelerince sentezlenirler – sentezlendikleri yerin uzağında başka bir mikroçevredeki hedef hücrelere etki ederler. (2) Parakrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri aynı mikro-çevreyi paylaşan bir hücre veya hücre grubu tarafında salınır ve yakın çevredeki diğer hücreleri etkiler (Neurotransmitterler ve neurohormonlar). (3) Autokrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri bir hücre veya hücre grubundan salınır ve sadece kendileri yanıt oluştururlar (bir çok büyüme faktörü). (4) Hücre – hücre ve hücre- matriks arası etkileşimlerde işe karışan moleküller. External sinyal iletimi: Hedef hücrelere sinyal iletimi (1) Endokrine sinyal iletimi: sinyal molekülleri (hormonlar) endokrin organ hücrelerince sentezlenirler – sentezlendikleri yerin uzağında başka bir mikroçevredeki hedef hücrelere etki ederler. (2) Parakrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri aynı mikro-çevreyi paylaşan bir hücre veya hücre grubu tarafında salınır ve yakın çevredeki diğer hücreleri etkiler (Neurotransmitterler ve neurohormonlar). (3) Autokrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri bir hücre veya hücre grubundan salınır ve sadece kendileri yanıt oluştururlar (bir çok büyüme faktörü). (4) Hücre – hücre ve hücre- matriks arası etkileşimlerde işe karışan moleküller. External sinyal iletimi: Hedef hücrelere sinyal iletimi (1) Endokrine sinyal iletimi: sinyal molekülleri (hormonlar) endokrin organ hücrelerince sentezlenirler – sentezlendikleri yerin uzağında başka bir mikroçevredeki hedef hücrelere etki ederler. (2) Parakrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri aynı mikro-çevreyi paylaşan bir hücre veya hücre grubu tarafında salınır ve yakın çevredeki diğer hücreleri etkiler (Neurotransmitterler ve neurohormonlar). (3) Autokrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri bir hücre veya hücre grubundan salınır ve sadece kendileri yanıt oluştururlar (bir çok büyüme faktörü). (4) Hücre – hücre ve hücre- matriks arası etkileşimlerde işe karışan moleküller. External sinyal iletimi: Hedef hücrelere sinyal iletimi (1) Endokrine sinyal iletimi: sinyal molekülleri (hormonlar) endokrin organ hücrelerince sentezlenirler – sentezlendikleri yerin uzağında başka bir mikroçevredeki hedef hücrelere etki ederler. (2) Parakrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri aynı mikro-çevreyi paylaşan bir hücre veya hücre grubu tarafında salınır ve yakın çevredeki diğer hücreleri etkiler (Neurotransmitterler ve neurohormonlar). (3) Autokrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri bir hücre veya hücre grubundan salınır ve sadece kendileri yanıt oluştururlar (bir çok büyüme faktörü). (4) Hücre- hücre ve hücre- matriks arası etkileşimlerde işe karışan moleküller. External sinyal iletimi: Hedef hücrelere sinyal iletimi (1) Endokrine sinyal iletimi: sinyal molekülleri (hormonlar) endokrin organ hücrelerince sentezlenirler – sentezlendikleri yerin uzağında başka bir mikroçevredeki hedef hücrelere etki ederler. (2) Parakrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri aynı mikro-çevreyi paylaşan bir hücre veya hücre grubu tarafında salınır ve yakın çevredeki diğer hücreleri etkiler (Neurotransmitterler ve neurohormonlar). (3) Autokrin sinyal iletimi: sinyal molekülleri bir hücre veya hücre grubundan salınır ve sadece kendileri yanıt oluştururlar (bir çok büyüme faktörü). (4) Hücre- hücre ve hücre- matriks arası etkileşimlerde işe karışan moleküller.. Geçit Bölgesi Gap Junction Koneksinler Hücre- hücre Özet (1) Sinyal üreten hücre tarafından sinyal molekülünün sentezlenmesi (2) Sinyal üreten hücre tarafından sinyal molekülünün salınması. (3) Sinyal molekülünün hedef hücreye taşınması (4) Sinyalin hedef hücrede özgül reseptör protein tarafından tutulması (5) Hücre içi sinyal transdüksiyon yolunu tetiklemesi (6) Hücre metabolizmasında veya gen ekspresyonunda değişiklikler (hücresel yanıt). (7) Sinyalin sönümlenmesi, çoğunlukla hücresel yanıtın sonlandırılması. Özet (1) Sinyal üreten hücre tarafından sinyal molekülünün sentezlenmesi (2) Sinyal üreten hücre tarafından sinyal molekülünün salınması. (3) Sinyal molekülünün hedef hücreye taşınması (4) Sinyalin hedef hücrede özgül reseptör protein tarafından tutulması (5) Hücre içi sinyal transdüksiyon yolunu tetiklemesi (6) Hücre metabolizmasında veya gen ekspresyonunda değişiklikler (hücresel yanıt). (7) Sinyalin sönümlenmesi, çoğunlukla hücresel yanıtın sonlandırılması. Özet (1) Sinyal üreten hücre tarafından sinyal molekülünün sentezlenmesi (2) Sinyal üreten hücre tarafından sinyal molekülünün salınması. (3) Sinyal molekülünün hedef hücreye taşınması (4) Sinyalin hedef hücrede özgül reseptör protein tarafından tutulması (5) Hücre içi sinyal transdüksiyon yolunu tetiklemesi (6) Hücre metabolizmasında veya gen ekspresyonunda değişiklikler (hücresel yanıt). (7) Sinyalin sönümlenmesi, çoğunlukla hücresel yanıtın sonlandırılması. Özet (1) Sinyal üreten hücre tarafından sinyal molekülünün sentezlenmesi (2) Sinyal üreten hücre tarafından sinyal molekülünün salınması. (3) Sinyal molekülünün hedef hücreye taşınması (4) Sinyalin hedef hücrede özgül reseptör protein tarafından tutulması (5) Hücre içi sinyal transdüksiyon yolunu tetiklemesi (6) Hücre metabolizmasında veya gen ekspresyonunda değişiklikler (hücresel yanıt). (7) Sinyalin sönümlenmesi, çoğunlukla hücresel yanıtın sonlandırılması. Özet (1) Sinyal üreten hücre tarafından sinyal molekülünün sentezlenmesi (2) Sinyal üreten hücre tarafından sinyal molekülünün salınması. (3) Sinyal molekülünün hedef hücreye taşınması (4) Sinyalin hedef hücrede özgül reseptör protein tarafından tutulması (5) Hücre içi sinyal transdüksiyon yolunu tetiklemesi (6) Hücre metabolizmasında veya gen ekspresyonunda değişiklikler (hücresel yanıt). (7) Sinyalin sönümlenmesi, çoğunlukla hücresel yanıtın sonlandırılması. Özet (1) Sinyal üreten hücre tarafından sinyal molekülünün sentezlenmesi (2) Sinyal üreten hücre tarafından sinyal molekülünün salınması. (3) Sinyal molekülünün hedef hücreye taşınması (4) Sinyalin hedef hücrede özgül reseptör protein tarafından tutulması (5) Hücre içi sinyal transdüksiyon yolunu tetiklemesi (6) Hücre metabolizmasında veya gen ekspresyonunda değişiklikler (hücresel yanıt). (7) Sinyalin sönümlenmesi, çoğunlukla hücresel yanıtın sonlandırılması. Özet (1) Sinyal üreten hücre tarafından sinyal molekülünün sentezlenmesi (2) Sinyal üreten hücre tarafından sinyal molekülünün salınması. (3) Sinyal molekülünün hedef hücreye taşınması (4) Sinyalin hedef hücrede özgül reseptör protein tarafından tutulması (5) Hücre içi sinyal transdüksiyon yolunu tetiklemesi (6) Hücre metabolizmasında veya gen ekspresyonunda değişiklikler (hücresel yanıt). (7) Sinyalin sönümlenmesi, çoğunlukla hücresel yanıtın sonlandırılması. • Sinyal transdüksiyonu bilginin, hücre dışından sitoplazmaya veya çekirdeğe taşınması için gerçekleşen moleküler olayların tamamıdır. • Amplifikasyon (zaman ve nitelik) ikinci haberciler aracılığı ile sinyallerin amplifikasyonu (genellikle küçük moleküllerin turnover’leri oldukça hızlıdır) Çoklu kontrol sinyal Algılama - Kabul etme Amplifikasyon Transduksiyon Hücresel yanıtlar Sinyal molekülü 1 Reseptör proteini Aktif adenilat siklaz 2 Amplifikasyon 3 GTP G protein İnaktif 4 Amplifikasyon Adenilat siklaz cAMP 5 6 Amplifikasyon Protein kinaz Enzim 7 Amplifikasyon Enzimatik ürünler • Hücresel yanıtlar özellikle sinyal iletim yollarının (pathway) açılması ile aşağıdaki hücresel değişikliklere neden olabilir: • hücre döngüsü ilerleyişi • gen ekspresyonu • protein trafik • hücre göçü • hücre iskeleti mimarisi • hücresel konumlanma • metabolizma • hücresel kalımlılık Farklı hücreler aynı sinyal molekülüne farklı yanıtlar üretebilirler Asetilkolin (neurotransmitter’den biri) (a)Kalp kas hücresi: kontraksiyon (kasılma) gücünde ve oranında azalma (b) iskelet kas hücresinde: kontraksiyon (c) düz kas hücresinde: relaksiyon (d) tükrük bezi hücresinde: salgı salgılama Reseptörler Hücre Yüzey Reseptörleri Hücre İçi Reseptörler Sitozolik Reseptörler Çekirdek İçi Reseptörler ? Matriks? Kromatin- DNA? Sinyal Molekül Inhibitör Protein Sinyal Molekül Bağlanma Yeri Sinyal Molekül Bağlama Domaini Transkripsiyon-Aktive Edici Domain DNA Bağlama Domaini Reseptörler Reseptörler Hücre Yüzey Reseptorleri (almaçları) dört farklı grupta toplanmışlardır. 1- Enzim Reseptörler 2- Enzimli Bağlı Reseptörler 3- Iyon-kanalı bağlı reseptörler 4- G-protein bağlı reseptörler Reseptör tipleri 1- Enzim Reseptörler Protein kinase reseptörleri (PKR) Ligand Hücre zarı Inaktif enzim Reseptör tipleri 1- Enzim Reseptörler Protein kinase reseptörleri (PKR) Ligand Aktif enzim Reseptör tipleri 1- Enzim Fig. 7.5bReseptörler (TEArt) İnaktif Katalitik Domain Enzimik reseptörler Sinyal- Ligand Aktif Katalitik Domain Reseptör tipleri 2- Enzim Bağlı Reseptörler sitokin reseptörler, büyüme hormonu reseptörleri ve interferonlar gibi İnaktif enzim Reseptör tipleri 2- Enzim Bağlı Reseptörler sitokin reseptörler, büyüme hormonu reseptörleri ve interferonlar gibi Aktif enzim Reseptör tipleri 2- Enzim Bağlı Reseptörler 6 grubu vardır (subfamilya) Reseptör Tirosin Kinazlar Tirosin Kinaz Associated Reseptörler Reseptör-benzeri Tirosin Fosfatazlar Reseptör Serin/Treonin Kinazlar Reseptör Guanilil Siklazlar Histidin-Kinaz Associated Reseptörler Reseptör tipleri 3- Iyon-kanalına bağlı reseptörler neurotransmitter-geçitli iyon kanalları İyonlar Reseptör tipleri 3- Iyon-kanalına bağlı reseptörler neurotransmitter-geçitli iyon kanalları Reseptör tipleri 3- Iyon-kanalına bağlı reseptörler neurotransmitter-geçitli iyon kanalları 3- Iyon-kanalı bağlı reseptörler Fig. 7.5aSinyal (TEArt) İyonlar Reseptör tipleri 4- G-protein- bağlı reseptörler epinefrine, serotonin ve glukagon reseptörleri Enzim G protein NH2 Ligand bağlanma yeri COOH G-protein- bağlanma yeri Reseptör tipleri 4- G-protein- bağlı reseptörler epinefrine, serotonin ve glukagon reseptörleri Enzim Reseptör tipleri 4- G-protein- bağlı reseptörler epinefrine, serotonin ve glukagon reseptörleri Enzim Aktif G protein Reseptör tipleri 4- G-protein- bağlı reseptörler epinefrine, serotonin ve glukagon reseptörleri enzim Reseptör tipleri 4- G-protein- bağlı reseptörler epinefrine, serotonin ve glukagon reseptörleri Aktif enzim 4- G-protein bağlı reseptörler Fig. 7.5c (TEArt) G protein G-protein bağlı receptor Aktif G protein İnaktif Enzim ya da iyon kanalı Aktif Enzim ya da İyon Kanalı İlke (Prensip) Sinyal Transdüksiyonunda Geri Dönüşümlü Fosforilasyon Önemli Bir Rol Oynar • Hücre içi sinyal iletim pathway’leri protein kinaz’lar ve protein fosfataz’ların oluşturduğu ve yönlendirdiği fosforilasyon cascade’lerdir. Bunlar hücredeki düğme-anahtarlardır Kinazlar & Fosfatazlar Protein kinazlar proteinleri fosforile ederler. Kinaz Protein ATP P Protein ADP Kinazlar & Fosfatazlar Protein kinazlar proteinleri fosforile ederler. Protein fosfatazlar proteinleri defosforile ederler. Kinaz Protein Protein Protein ATP P P Fosfataz P Protein ADP • İnsanlarda 500’den fazla protein kinaz ve 100’den fazla protein tirosin fosfataz bulunur. • Evrimsel açıdan iyi korunmuşlardır ve amino asit dizilimleri ve protein işlevleri tanımlanmıştır. protein kinazlar 1-Ser/Thr spesifik protein kinazlar 2-Tyr spesifik protein kinazlar 3-Histidin spesifik protein kinazlar (Lys ve Arg den de yapan enzimler vardır) 4-Aspartat veya glutamat spesifik protein kinazlar Deneysel Protein Kinaz (İn vitro) • Protein kinaz • Substrat • ATP (radyoaktif ATP kullanılabilir, [32P]-g-ATP) • Mg2+ • Tampon Metod Aktiviteleri protein kinazlar tarafından düzenlenen moleküller Enzimler : sinyal transdüksiyon enzimleri veya ara metabolizma enzimleri Adaptör Proteinler Sinyal Proteinleri Transkripsiyon Faktörleri İyon Kanalları Transmembran Reseptörler Ribozomal Proteinler (S6) Yapısal Proteinler Transport Proteinleri Reseptörler (A) Ekstrasellüler bölge N - Ligand bağlanır. -Yüzlerce amino asit uzunluğunda ve çeşitli yapısal dizi motifleri taşır.Ör. Ig benzeri domainler,lösince zengin domainler. -Çoğu reseptör PTK’lar Nve O- bağlı olarak modifiye haldedir. C Reseptörler (B) Transmembrane bölge N -Reseptör PTK’ların tümü tek bir transmembran bölge taşır. -Transmembran bölgeyi birkaç bazik amino asit izler. C Reseptörler (C) Sitoplazmik bölge N • juxtamembrane bölgeyi oluşturur. C Reseptörler (C) Sitoplazmik bölge N -juxtamembrane bölgeyi oluşturur. -Bunu protein kinaz catalitik domain izler (PTK), C Reseptörler (C) Sitoplazmik bölge -- juxtamembrane bölgeyi oluşturur. N -Bunu protein kinaz catalitik domain izler (PTK), -Sonra C- terminal bölgesi gelir. C Reseptörler (C) Sitoplazmik bölge N - Protein kinaz katalitik domaini iyi korunmuş ~250 aa uzunluğundadır. C Reseptörler (C) Sitoplazmik bölge N - Protein kinaz katalitik domaini iyi korunmuş ~250 aa uzunluğundadır. -C- terminal bölgesi tirozin fosforilasyonunun en çok meydana geldiği yerdir. -Ancak katalitik bölgede de tirozin fosforilasyon yeri vardır, burası kinaz aktivitesi için gereklidir. C Reseptörler Reseptör Protein Tirozin Kinaz Sinyal Transdüksiyonunu Başlatır (1) Ligand extrasellular domaine bağlanır (2) Reseptor oligomerizasyonu olur (3) Tirosine otofosforilasyona uğrar Reseptörler Reseptör Protein Tirozin Kinaz Sinyal Transdüksiyonunu Başlatır (1) Ligand extrasellular domaine bağlanır (2) Reseptor oligomerizasyonu olur (3) Tirosine otofosforilasyona uğrar Reseptörler Reseptör Protein Tirozin Kinaz Sinyal Transdüksiyonunu Başlatır (1) Ligand extrasellular domaine bağlanır (2) Reseptor oligomerizasyonu olur (3) Tirosine otofosforilasyona uğrar P P P P Reseptörler Otofosforilasyonun iki sonucu vardır: P P Kinaz Aktif P P Diğer Proteinleri bağlar Sinyal iletimi (1) PTK’nın katalitik aktivitesini aktive eder. (2) Konformasyonel değişiklik geçirerek sitoplazmik sinyal ileticilere bağlanılmasını sağlar. Reseptörler (I) Ligandın bağlanması reseptor oligomerizasyonuna neden olur Reseptörler (I) Ligandın bağlanması reseptor oligomerizasyonuna neden olur • Ligand bağlanması geri-dönüşümlü, özgül ( spesifik) ve yüksek afinite’lidir. Reseptörler (I) Ligandın bağlanması reseptor oligomerizasyonuna neden olur • Ligand bağlanması geri-dönüşümlü, özgül ( spesifik) ve yüksek afinite’lidir. Reseptörler Örnek: PDGF (platelet-derived growth faktör) (trombosit kökenli büyüme faktörü) • PDGF A ve B zincirlerinin homo ya da heterodimeri olabilir. B B A A A B Reseptörler Örnek: PDGF (platelet-derived growth faktör) (trombosit kökenli büyüme faktörü) • PDGF A ve B zincirlerinin homo ya da heterodimeri olabilir. . B B A A A B • PDGF A zinciri sadece a PDGF reseptörüne, B zinciri hem hem de reseptörlerine bağlanabilir. PDGF-AA ancak reseptör homodimerini, ve PDGF-AB ancak - ve - reseptör oluşumunu indükleyebilirler. A A A B A B B B B B B B Reseptörler Örnek: PDGF (platelet-derived growth faktör) (trombosit kökenli büyüme faktörü) • Farklı komposisyonları farklı hücresel yanıtların oluşmasını sağlar. A A A B A B B B B B B B Reseptörler Örnek: EGF (epidermal growth faktör) • Ligand’lar monomerik • Reseptörler homo ve heterodimerik Konformasyon değişimi Protein kinaz inaktif P Reseptör oligomerizasyonu Protein kinaz aktif P Otofosforiasyon (Transfosforilasyon) P P P P Sönümlenme - Defosforilasyon - Reseptörün alınması -(endositoz vb) - Fosforilasyon loop’larınca negatif feed-back P P P P Fosfataz Defosforilasyon P P P P P P P P P Endositoz (-) feedback Reseptörlerin Sitoplazmik Proteinlerle Etkileşimleri Protein Tirozin Kinaz (PTK) aracılığı ile sinyal iletiminde bir sonraki adım sitoplazmik proteinlerle etkileşimdir. Protein-Protein Etkileşim Modülleri burada önem kazanır. 1- Src Homoloji Proteini 2 (SH 2) domaini 2- Src Homoloji Proteini 3 (SH 3) domaini • Bu protein modülleri sinyal transdüksiyon yollarındaki (pathway) özgül etkileşimleri yönlendirirler. P P P P Grb2 1- Src Homoloji 2 (SH 2) domaini • SH 2 domaini fosfotirozinli motifleri tanır. • ~100 aa uzunluğundad. • İlk Src ailesi proteinler ile homolojileri bulunmuştur. • SH 2, PTK reseptöründeki otofosforile fosfotirozine dizi özgül olarak bağlanır. 2- Src Homoloji 3 (SH 3) domaini SH 3 modülleri prolince-zengin dizileri tanır ve bağlanır. ~60 aa uzunluğundadır. SRC Ailesi ile Sinyal Transdüksiyonu İlk Tavuk Fibrosarcom serbest hücrelerinde tanımlandı. Sonra transformasyona neden olan bir viral onkogen olduğu bulundu. v-src Proto- onkogenlerin ve sinyal transdüksiyon pathway’lerin keşfedilmelerine yol açmıştır. Hala normal hücrelerdeki işlevleri tam olarak açıklanamamıştır. Hücre zarına bağlı olarak lokalize olurlar SRC SRC Ailesinin bilinen 8 üyesi vardır: SRC LCK BLK HCK FGR YES LYN FYN SRC Dizileri: (a) miristilasyon dizisi (b) unique bölge (c) SH 3 domain (d) SH 2 domain (e) katalitik domain (f) regülatör bölge Y Unique Membran SH 3 SH 2 Protein kinaz Y SRC (a)- Miristilasyon Dizisi • N-ucu ikinci pozisyondaki glisini ile hücre zarı bileşeni, 14 karbonlu yağ asit zinciri miristik asite eklenir. • Ko-translasyonel sentezle yapılır. • SRC’nin 1-7 aa’leri ile yine miristilli olan Piruvat Kinaz’ın Nucuna eklenebilir. • Gli2 → Ala2 mutasyonu miristilasyonu önler. • Hücre zarında stabilizasyonu için gereklidir, fakat zorunlu değildir. Piruvat Kinaza eklenebilir. Unique Membran SH 3 SH 2 Y Protein kinaz Y SRC (b) Unique Bölge • Bu bölge, SRC protein kinazların substratları olan özgül hücresel proteinler ile etkileşimlerini sağlar. • Dizisi, ailenin her üyesinde farklıdır. Y Unique Membran SH 3 SH 2 Protein kinaz Y SRC (c) Katalitik Domain • ATP’deki g- fosfatın tirosine aktarılmasını katalizler. •Otofosforilasyon yeri (Tyr416) kinaz aktivitesini artırır. Otofosforilasyon yeri Y Unique Membran SH 3 SH 2 Protein kinaz Y SRC (d) Regülatör domain • Aktivitesini düzenler. • C-terminal 16-19 dizisi tirosin fosforilasyon yeridir(Tyr527). • Tyr527’nin fosforilasyonu kinaz aktivitesini inhibe eder. Y Unique Membrane SH3 SH2 Protein kinase Y SRC • v-src, v-yes, and v-fgr viral onkogen ürünlerinde Cterminal ucu kısalmıştır ve Tyr527 yoktur. • Bu viral onkogen ürünler normal proteinden daha fazla katalitik aktiviteye sahiptirler. Ayrıca; • Try527mutasyonları kinaz aktivitesini artırır. P Unique SH 3 SH 2 Y Protein kinaz Y + P Unique SH 3 SH 2 Y P Unique SH 3 SH 2 +++ Protein kinaz Y Protein kinaz F Mutasyon +++ Kinaz Aktivitesi SRC • Fosfataz ile Tyr527’in defosforilasyonu kinaz aktivitesini artırır. Kinaz Aktivitesi P Unique SH 3 SH 2 Y Protein kinaz Fosfataz P Unique SH 3 SH 2 Y Protein kinaz Y + Y +++ SRC Tyr527, SRC’nin kendisi tarafından fosforile edilemez. - ATP bağlama yerindeki bir mutasyon enzimi inaktive eder. ATP bağlanma yeri P Unique SH 3 SH 2 Unique SH 3 SH 2 K Y Protein kinaz R Y Protein kinaz Y P Y SRC Moleküliçi Etkileşim Y P Unique SH 3 SH 2 İNAKTİF P Y Unique SH 3 SH 2 Protein kinaz AKTİF Y SRC SRC Ailesinin İşlevleri • Her farklı üyenin ekspresyon modeli de farklıdır. • Ekspresyon modeli bazı işlevleri için kanıtlar verir. T hücreler B hücreler NK hücreler Monositler Granulositler Trombositler Fibroblastlar Src - - + + + +++++ ++ Yes + - -/+ -/+ -/+ ++ + Fyn ++ + + + + + + Lck ++++ -/+ +++ - - - - Fgr - - + ++ ++ + - Hck - ++ - +++ ++ + - Lyn - +++ + + ? + -/+ Blk - +++ - - - - - SRC SRC Ailesinin İşlevleri SRC’nin olası substratları • SRC’nin aktive olmuş formlarınca transformasyon; çok sayıda hücresel proteinin, SRC’nin substratlarıdan bazılarının ve onkogenik kapasitesi için kritik önemi olanların tirozin fosforilasyonu ile aynı zamanda olur. SRC SRC Ailesinin İşlevleri SRC’nin olası substratları • Sinyal Transdüksiyonuna Katılan Proteinler • Hücre İskelet Proteinleri SRC SRC Ailesinin İşlevleri PDGF sinyal iletiminde Src SRC, YES ve FYN B B B B B B Src Y579 Y581 Gene ekspresyonu Hücre döngüsünde ilerleyiş SRC SRC Ailesinin İşlevleri Heamopoietik Sinyal Transdüksiyonunda SRC Ailesi • Hücre yüzey proteinleri üzerinden (CD 4, CD 8 gibi) bir çok sinyal transdüksiyon yolununda görev alır. • Anti-CD 4 antibadileri ile birlikte CD 4’leri çapraz bağlar. • Sinyallerin değerlendirmeye alınmasını sağlar. • FYN, T hücre sinyal iletiminde önemlidir.