XV. Ulusal Kimya Kongresi, İstanbul, 2001 FK

advertisement
FK-S32
XV. Ulusal Kimya Kongresi, İstanbul, 2001
SU K SİN İM İD İN H İD R O L İZ M EKANİZM ASININ
T E O R İK O LA RA K İN CELEN M ESİ
F. A. Konuklar*, V. Aviyente*, M.F. Ruiz-LopezG. Monarcf
^Boğaziçi Üniversitesi» Kimya Bölümü, 80815, Bebek- İstanbul Türkiye
#Üniversite Henri Poincare-Nancy 1,54506 Vandoeuvre-les-Nancy, France
Giriş
Suksinimid maddesinin hidroliz reaksiyonunun deneysel olarak incelenmesi sonucunda 3:1 oranında
izoaspartat ve aspartat maddelerinin oluştuğu gözlemlenmiştirfl]. Bu çalışmada, suksinimid
maddesinin nötür ve bazik ortamlardaki hidroliz reaksiyonlari için hidroliz tepkimeleri önerilmiş ve
modellenmiştir.
Yöntem
Hidroliz tepkimesinde yer alan tepken, ürün ve geçiş konumları Önce yarı ampirik PM3 yöntemi ile,
sonra da B3LYP/6-3İ+G* seviyesinde çalışıldı. Enerjilerin minimum olduğu kararlı yapılar gerçek
frekansların mevcudiyeti ile, geçiş hali yapılan kritik bağlara ait tek bir sanal frekans ile karakterize
edildi.
Sonuçlar
Bazik ortamdaki tepkime OH- grubunun nükleofılik karbonil karbonlarından C2 veya C5 ‘e
saldırması sonucu gerçekleşir. C2’ ye yapılan saldın sonucundan izoaspartat maddesi oluşur. Nötür
ortamda su ile oluşan tepkime ise iki farklı şekilde yer alabilir. Birinci durumda (Yol 1) su, halkanın
altından, ikinci durumda (Yol 2) ise halkanın üstünden yaklaşabilir. Modelleme sonucunda,
enzimlerde yaşlanma sürecinde önemli bir reaksiyon olan hidroliz tepkimesinin hangi ortamı ve
mekanizmayı tercih ettiğine karar verilmiştir.
Şekil 1. Suksinimid’in hidroliz tepkimesi.
t
Yol 1:
HjC4\
ANl-CHîfHjO
-----►
H C 3 -r /
2H>r
H_C4
2
\
CH-CHrC.NH-CH3
îr
\,7
o
*
r
Yol 2:
p a
HV
^
X
H2C " \ _ rH
^
'
/
CH3
H2<î
— ►
h 2Ç
n n- c h3
H
1
2
N-CH j
h'c
O
Kaynaklar
(1) Capasso, S. Mazzarella, L., Sica, F., Zagon, A., Peptide Res., 1989, 2, 195.
(2) Konuklar, F. A., Aviyente, V., Sen T., Bahar, I. J. Mol. Model., 2001,7, 5, 147-160.
o
Download