MOLEKÜLER BİYOLOJİ VE GENETİK BÖLÜMÜ DERS BİLGİ PAKETİ

MOLEKÜLER BİYOLOJİ VE GENETİK BÖLÜMÜ DERS BİLGİ PAKETİ
Dersin Kodu / Adı
MBG304 /MOLEKÜLER BİYOLOJİDE KULLANILAN YÖNTEMLER LAB II
Sınıfı / Dönemi
Dili
Düzeyi
Türü
Kategorisi
Kredisi
Eğitim Şekli
Ön Koşul Dersler
Öğretim Üyesi
Diğer Öğr. Üyeleri
Yardımcılar
Ders Saatleri
3/Bahar
Türkçe
Lisans
Zorunlu
Temel bilimler
Teori
0
Yüz yüze
Yok
1
Uygulama
0
Laboratuar
2
Yok
Gündüz: Gece:
Dersin Alt Limit Değeri
35
Dönem Sonu Sınavı Barajı
40
ETKİNLİK
Değerlendirme
Ölçütleri
AKTS Kredisi
3
Adet
Yüzde (%)
Ara Sınav
1
20
Kısa Süreli Sınavlar
-
-
Ödevler
4
20
Dönem Ödevi/Projesi
-
-
Laboratuar
-
-
Diğer
-
-
Dönem Sonu Sınavı
1
60
Dersin Amacı
Moleküler Biyoloji, Moleküler Genetik, Gen Mühendisliği, Mikrobiyoloji ve Biyoteknoloj
konularla ilgili olarak laboratuar tekniklerinin öğretilmesi deney yapabilme becerisinin
kazandırılmasıdır
Öğrenim Çıktıları
Bu ders moleküler biyolojide kullanılan tekniklerin uygulamalarını içerir
Ders İçeriği ve Programı
Haftalar
Konular
1
Real Time PCR -Cihazların uygulamalı tanıtılması -Cihazları kullanmaları - Real Time
PCR ile ilgili deney yapma
2
Mikrosatellit uygulamaları -Mikrosatellit markırların seçilmesi -PCR ile mikrosatallit
bölge amplifikasyonu -Agaroz jelde gözlemleme
3
SSCP uygulamaları-DNA izolasyonu -Solüsyon hazırlama -DNA’nı denaturasyonu Agaroz jel elektroforezi
4
Gen klonlama ve bakteri üretimi -Gen bulma -Gen aplifikasyonu -Spesifik genlere
adaptör takılması -PCR işlemi -Genin taşıyıcı vektöre aktarılması -Genin bakteride
çoğaltılması
5
Rekombinant DNA teknolojisi -DNA izolasyonu -PCR ve vektörlerin restriksiyon
enzimleri ile kesimi
6
Rekombinant DNA teknolojisi yöntemleri ile protein üretimi -Genin bakteriye
transformasyonu ve protein üretimi -Elde edilen proteinlerin saflaştırılması
7
Southern blot tekniği -DNA izolasyonu -Prob hazırlama -Restriksiyon enzimleri ile
DNA’nın kesimi -Blotlama
8
Western blot tekniği -Proteinlerin jel elektroforezi -Spesifik antikorlarla muamele -Jelin
görüntülenmesi
9
Dot-blot / Slot-blot -Nükleik asit izolasyonu -Prob hazırlama -Blotlama
10
ELISA tekniği -Enzim saflaştırma -Eliza tekniğinin uygulanması
11
Gen silme -İnvert PCR ile gen silme -PCR ile kontrolü
12
Gen susturma -miRNA ile ilgili veri tabanları -miRNA izolasyonu -miRN’ ların çeşitli
organizmalarda kullanılabilme olanakları
13
Gen transferi ve Transgen üretimi -Gen izolasyonu ve prokaryotik ve ökaryotik
organizmalara aktarabilme stratejileri
14
Protein izolasyonu -Protein izolasyonu
Ders Kitapları
ve/veya
Kaynakları
Su Ürünlerinde Uygulamalı Moleküler Biyoloji Teknikleri Lisansüstü Yaz Okulu
Ders Kitabı. Atatürk Üniversitesi Ziraat Fakültesi Ders Yayınları No:237, 99-105.
sayfalar, 129 sayfa, Erzurum, (2008).
Yardımcı Kitaplar
1.Temizkan,G., Arda, N.,2004. Moleküler Biyolojide Kullanılan Yöntemler. Nobel
Tıp Kitapevi. 2.Balbás,P., Lorence, A.,2004.Recombinant Gene Expression.
Humana Press Inc. 999 Riverview Drive, Suite 208,Totowa, New Jersey 07512
3.Atatürk Üniversitesi Biyoteknoloji Uygulama Ve Araştirma Merkezi Uygulamali
Moleküler Biyoloji Teknikleri Kursu, Erzurum, 15-20 Mayıs 2000. 4.Atatürk
Üniversitesi Biyoteknoloji Uygulama Ve Araştirma Merkezi Uygulamali
Molekuler Biyoloji Teknikleri Kursu, Erzurum,13-24 Eylül 1999.
Dokümanlar
-
Dersin Öğrenim Çıktıları ve Program Yeterliliklerine Katkı Düzeyi
ÖÇ
No
Ders Öğrenim Çıktısı
Katkı
Yaptığı
Prog.Y
a
1
2
Moleküler biyoloji ve genetikle ilgili çeşitli veri tabanları
kullanımları öğrenilir
Primer ve prob dizayn edebilecek
Laboratuarda moleküler biyoloji ve genetikle ilgili alet ve
cihazları kullanabilecek
Nükleik asit izole edebilme ve özel bir maksat için
4
kullanabilme.
Real Time PCR,Mikrosatellit, SSCP uygulamaları, Gen
klonlama ve bakteri üretimi, Rekombinant DNA teknolojisi,
5
Rekombinant DNA teknolojisi yöntemleri ile protein
üretimi, Southern blot tekniği, Western blot tekniği, Dot-blot
/ Slot-blot ELISA tekniği, Gen silme, Gen susturma,
Gen transferi ve Transgen üretimi, Protein izolasyonu ile
6
ilgili deney yapabilme
Katkı Düzeyi (1: Düşük 2:Düşük ~ Orta
3: Orta
4: Yüksek
Katkı
Düzeyi b
1
2
3
4
1, 4
Ö.Y. c
5
x
1,3
3
b
5: Mükemmel)
Ölçme Yöntemi ( 1: Yazılı Sınav, 2: Sözlü Sınav, 3: Ödev/Proje, 4: Laboratuar Çalışması / Sınavı, 5:
Seminer / Sunum )
c
PY. No
a
1-
Alanında yer alan temel kavramları anlayıp yorumlayabilme
2-
Kazanmış olduğu teorik bilgiyi pratikte kullanabilme ve sorunlara çözüm önerisi getirebilme
Program Yeterlilikleri
3-
Sahip olduğu bilgiyi uygun şekilde aktarabilme
4-
Bulunduğu anabilim dalındaki veya farklı disiplinlerdeki kişilerle bir araya gelip takım çalışması
yapabilme
5-
Etkileşim içerisinde olduğu diğer bilim dalları ile ilgili temel düzeyde bilgi sahibi olabilme
6-
Elde ettiği sonuçları bilim dünyasına arz edebilme
7-
Bilimsel, sosyal, kültürel, dini ve ahlaki değerlere duyarlı olabilme ve kişisel sorumluluk farkındalığı
kazanabilme
8-
Alana ait bilgileri bilim etiği çerçevesinde sosyal ve bilimsel değişiklikleri göz önüne alarak
sorgulayabilme
9-
Varsa alanı ile ilgili eğitim sorunlarına duyarlı olup çözüm getirebilme
10-
Mesleki alandaki gelişmelerin yanı sıra sosyal alandaki gelişmeleri takip edebilme, bunlarda aktif olarak
rol alabilme
11-
Kazandığı bilgileri farklı disiplinlerden edindiği bilgilerle birleştirerek yorumlayabilme bilme
12
Alanının gerektirdiği düzeyde bilgisayar yazılımı ile birlikte bilişim ve iletişim teknolojilerini
kullanabilme
13
Yazılı ve sözlü olarak kendini ifade edebilme
14
Bir yabancı dili kullanarak alanındaki bilgileri takip edebilme ve meslektaşları ile iletişim kurabilme