öğretim elemanları için ders yükü bildirim formu

BAÜ FEF 2. Öğretim 2011 Bahar Moleküler Biyoloji 2 Arasınavı (06.04.2012)
Süre 60dk’dır. ANAHTAR
BÖLÜM 17 (30p)
1. Normal Lac represörüne aşağıdaki DNA’lardan hangisi bağlanmaz? (5p)
a) I+O+Z+ b) ISOZ+ c) I-O+Z+ d) I+O+Z- e) hepsi bağlanır
2. Trp operonu hakkında hangisi doğrudur? (5p)
a) baskılanabilir ve negatif kontrol altındadır
b) uyarılabilir ve negatif kontrol altındadır
c) uyarılabilir ve pozitif kontrol altındadır
d) baskılanabilir ve pozitif kontrol altındadır
e) uyarılabilir ama kontrolü pozitif veya negatif değildir.
7.
[D] [Y] TATA kutusu hem prokaryot hem de ökaryotlarda bulunur
ancak bazı konstitütif genlerde bulunmaz (2p)
[D] [Y] Drosophila’da TRA proteini alternatif splyasla oluşurken
DSX-F ve DSX-M proteinlerinde tek tip mRNA söz konusudur (2p)
9. Şekildeki in vitro transkripsiyon (tx) sistemi, ortama RNA Pol II,
FTIID, TFIIB ve TFIIE verildiği zaman çalışmaktadır. Bu sistemdeki
tx etkinliği ile kaba özütteki tx etkinliğini karşılaştıran deney sonuçları
şekilde görülmektedir (20p)
8.
3. lac operonuyla ilgili hangisi doğrudur? (10p)
a) lacI mutasyonu genin 5’ bölgesindedir
b) lacIS mutasyonu genin 5’ bölgesindedir
c) lacI repressörün laktoza bağlanan kısmının bozulmasıdır
d) lacIS repressörün operatöre bağlanan kısmının bozulmasıdır
e) hepsi doğru
4.
Triptofan biyosentezinin regülasyonunda attenuasyonun rolünü ve
çalışma mekanizmasını şekille ve / veya metinle anlatınız. (10p)
a)
-11 delesyonlu kalıptan neden hiç tx olmamış? (5p)
En önemli promoter elementleri burada olduğu için
b)
Delesyonsuz kalıptan elde edilen sonucu nasıl açıklarsınız? (5p)
Çekirdek özütünde bütün TF’ler olduğu için tam aktivite var.
Saflaştırılmış sistemde sadece 4 TF olduğu için tam aktivite yok.
Delesyonlu kalıplardan elde edilen sonuçları nasıl açıklarsınız
(10p)
-50’den önceki bölgelerde hiç TF yok. -50 ile -11 arasında sistemdeki
4TF dışındaki TF’lerin bağlandığı yerler olabilir. -11 ile +1 arasında
ise elzem promoter element(ler)i olduğu için burası iptal olduğunda tx
durmuştur.
c)
BÖLÜM 18 (30p)
BÖLÜM 17 (40p)
5. Ökaryotlardaki gerçek aktivatörlerle antirepressörleri birer örnekle
açıklayarak karşılaştırınız. (10p)
Gerçek aktivatörler transkripsiyon faktörleridir (TF) ve bunlar direk
olarak DNA’ya veya DNA’ya (promotöre) bağlı başka bir
transkripsiyon faktörüne bağlanırlar. Örnek TATA kutusu
bağlanma proteini (TBF), TFIID, TFIIA.
Antirepresörler ise promotöre bağlanmazlar, kromatinin açılarak
promotörün (DNA’nın) histon proteinlerden uzaklaştırılmasını yani
TF’lerin promotöre bağlanmasının engellerini kaldırmış olurlar.
SWI/SNF kompleksi, HAT kompleksi, HD kompleksi.
6.
Mayadaki gal genleri ile E. coli’deki lac genlerini karşılaştırınız (6p)
Hem lac hem de gal sistemleri katabolit aktivasyondan etkilenir, ancak lac
sistemi negatif gal sistemi pozitif kontrol altındadır. Her ikisi de
indüklenebilen sistemlerdir.
10. Her ikisi de normal görünüşlü bir çiftten erkeğin kız kardeşinde
retinoblastoma olduğu biliniyor. Bu durumda bu çiftin retinoblastomalı
çocuk sahibi olma ihtimali nedir? Bu çiftin hangi üyesinin nasıl bir test
yaptırmasını tavsiye edersiniz? (10p)
Retinoblastoma çekinik bir gen tarafından kontrol edildiğine göre bu
çiftin birinin veya her ikisinin heterozigot olma olasılığı vardır. Eğer
sadace biri ise Rb çocuk ihtimali sıfır, her, her ikisi de taşıyıcı
(heterozigot) ise o zaman Rb ihtimali %25 olur. Her iki ebeveynin de
Rb geninin bozuk olup olmadığını test ettirmesi gerekir.
11. a) pRB, hücreleri G1 kontrol noktasında tutabilmek için nasıl bir
görev yapar? b) Hücreler S fazına girmek için G1 kontrol noktasını
nasıl geçerler? (10p)
a) E2F hücrenin G1’den S fazına geçisinde görevlidir. G1 fazı boyunca
çekirdekteki pRB proteini, E2F ile etkileşir ve onu inaktive eder.
b) Hücre G1’den S fazına geçerken CDK4/siklin D1 kompleksi oluşur ve
pRB’ye fosfat gruplarını ekler. pRB fosforillenince, E2F serbest kalır,
transkripsiyonel olarak ative olur ve hücrelerin S fazına geçisine izin
verir. pRB’nin fosforilasyonu geçicidir. CDK/siklin kompleksleri
parçalanınca pRB tekrar E2F’ye bağlanıp inaktive eder ve hücre erken G1
fazına geçer.
12. Kanserle ilişkili olan iki sınıf genden tümör baskılayıcı genlerde ve
onkogenlerde hangi grup mutasyonlar işlev kazandıran mutasyonlar
olarak düşünülebilir ya da hangi grup mutasyonlar işlev kaybettiren
mutasyonlardır
açıklayınız.kontrolsüz
(10p)
Protoonkogenler hücre bölünmesini teşvik etme veya sürdürülmesinde görev alırlar. Mutant
durum (onkogenler),
hücre bölünmesini başlatır ya da
devam ettirir (fonksiyon kazanma). Genellikle bu fonksiyon kazanma anormal aktiviteli gen ürünlerinin artmasına ya da sürekli ortaya çıkmasına neden olur.
Diğer taraftan fonksiyon kaybetme hücre döngüsü boyunca döngüyü durdurma görevi yapan tümör baskılayıcı genler nedeniyle olur. Bu şekildeki genler mutant
ise hücre döngüsünü durdurma kapasitelerini kaybederler.