AVRASYA ÜNİVERSİTESİ Ders Tanıtım Formu Dersin Adı Genomik ve Proteomik Öğretim Dili Türkçe Dersin Verildiği Düzey Eğitim Öğretim Sistemi Örgün Öğretim (X) Dersin Türü Zorunlu () Seçmeli (X) Kuramsal Saat 3 Lisans (X) Ön Lisans () Uygulama Saat 0 Yüksek Lisans( ) Doktora( ) Uzaktan Öğretim( ) Diğer ( ) Dersin Alan Kodu MBGS Ders Kodu 418 Toplam Saat 3 Yarıyılı Bahar Ulusal Kredi 3 AKTS Kredi 5 Dersin Amacı Genomik ve proteomik bilimlerin gelişmesi ve uygulamalarını aktarmak Dersin Özet İçeriği Genom tanımı, tüm genom dizileme, çeşitli türlerde korunan genler, insan genomuna genel bakış, DNA dizisinde değişim olmadan genomda gen anlatımının değişmesi mümkün müdür? Genomik tanı, DNA dizisinin kullanımı ile yeni aşı, antibiyotiklerin yapımı, yeni tedavilerin bulunması, genomik varyasyonlar, genetik modifiye oranizmalar, DNA mikroarrayleri, farklı koşullar için proteinler, protein yapı ve fonksiyonu, protein çipleri Ön Koşul Dersler Yok Önerilen Seçmeli Dersler Yok Dersin Öğrenme Çıktıları 1. 2. 3. 4. Farklı genomları ve yapılarını tanıma DNA mikrodizilerinin önem ve uygulamalarını öğrenme Proteomik ve genomik hakkında bilgi sahibi olma Proteomik ve genomiğin önemini kavrama Dersin Koordinatörü Yrd.Doç.Dr. Filiz AYGÜN ERTÜRK Dersin Öğretim Elemanı Yrd.Doç.Dr. Filiz AYGÜN ERTÜRK Dersin Yardımcı Öğretim Elemanı (X) Sözel Anlatım () Tartışma ( ) Problem Çözme ( ) Deney Ders Kitabı / Önerilen Kaynaklar Yardımcı Ders Kitabı ( ) Doğrudan Dönüşüm Sistemi - Öğretim Yöntemleri ( ) Örnek Olay ( ) Drama ( ) Buluş Yoluyla ( ) Proje Discovering Genomics, Proteomics and Bioinformatics (2nd Edition) A. Malcolm Campbell, Laurie J. Heyer, Cold Spring Harbor Laboratory Press and Benjamin Cummings: (2006) Twyman, R. M., Principles of proteomics, BIOS Scientific Publishers, New York, 2004 Başarı Notunu Değerlendirme Sistemi (X) Bağıl Değerlendirme Yarıyıl içi çalışmaları Ölçme ve Değerlendirme (X) Bilgisayar Destekli ( ) Laboratuvar (X ) Ödev (X) Sunum Sayısı Katkı Payı %** Devam (a) - - Laboratuar - - Uygulama - - 1/5 AVRASYA ÜNİVERSİTESİ Alan Çalışması - - Derse Özgü Staj (Varsa) - - Ödevler 1 20 Sunum - - Projeler - - Seminer - - Ara Sınavlar* - - Genel ara sınav 1 80 2 100 Toplam Yarıyıl İçi Çalışmalarının Başarı Notuna Katkısı 40 Yarıyıl Sonu Sınavının Başarı Notuna Katkısı 60 TOPLAM 2/5 100 AVRASYA ÜNİVERSİTESİ Haftalara Göre Ders Konuları Hafta Konular 1 Prokaryotik ve Ökaryotik Genomların Yapısı 2 Fonksiyonel ve yapısal genomik 3 DNA Teknolojisi ve Genom Biliminin Gelişimi 4 Genom Manipulasyon Yolları (genetik haritalama yöntemleri, gen klonlama, genetik kütüphaneler, klonlama vektörleri) 5 DNA-Çiplerinin Yapımı ve Kullanımı 6 DNA dizisinde değişim olmadan genomda gen anlatımının değişmesi mümkün müdür? 7 Ara sınav 8 Proteomik dünyasına giriş 9 Proteinlerin dizi ve fonksiyon analiz metotları 10 Güncel proteomik uygulamaları 11 Protein çipleri ve gelecekte proteomik 12 Proteomikte kullanılan diğer ileri teknikler 13 İnsan proteom organizasyonu (HUPO) 14 Proteomik ve endüstriyel uygulamaları Ön Hazırlık Kaynak kitapların ilgili bölümleri okunur. Kaynak kitapların ilgili bölümleri okunur. Kaynak kitapların ilgili bölümleri okunur. Kaynak kitapların ilgili bölümleri okunur. Kaynak kitapların ilgili bölümleri okunur. Kaynak kitapların ilgili bölümleri okunur. Kaynak kitapların ilgili bölümleri okunur. Kaynak kitapların ilgili bölümleri okunur. Kaynak kitapların ilgili bölümleri okunur. Kaynak kitapların ilgili bölümleri okunur. Kaynak kitapların ilgili bölümleri okunur. Kaynak kitapların ilgili bölümleri okunur. Kaynak kitapların ilgili bölümleri okunur. DERSİN ÖĞRENME ÇIKTILARININ PROGRAM YETERLİLİKLERİ İLE İLİŞKİLENDİRİLMESİ Program Yeterlilikleri 01 02 03 04 3 5 4 4 PY 02 Canlıların yapı ve işlevlerini inceleyebilir, yapı-işlev ilişkisini tanımlayabilir. 5 5 5 5 PY 03 Organizma ve populasyonlardaki genetik aktarımları açıklayabilir; santral dogmada yer alan mekanizmaları moleküler düzeyde tanımlayabilir. 4 4 4 4 3 5 4 4 PY 01 Temel ve uygulamalı alanlardaki farklı disiplinlerin yaklaşım ve bilgilerini kendi alanında kullanabilir. PY 04 Moleküler Biyoloji ve Genetik alanında kullanılan yöntemleri ve teknikleri uygulayabilir. 3/5 AVRASYA ÜNİVERSİTESİ PY 05 Biyoloji konuları ile ilgili problemleri saptama, sentez yaparak problemlerin çözümüne yönelik hipotez kurabilir, çeşitli 3 5 4 gözlemsel ve deneysel yöntemler kullanarak hipotezi çözme becerisi kazanabilir. PY 06 Gerek bireysel gerekse çok disiplinli gruplarda mesleki gelişimine yönelik faaliyet ve projelerde aktif çalışma becerisi kazanma ve bu 5 5 5 süreçte ortaya çıkabilecek durumlarda sorumluluk alabilir. PY 07 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliğinin bilincine sahip olur ve mesleki bilgi ve 5 5 5 becerilerini sürekli olarak geliştirir. PY 08 Moleküler Biyoloji ve Genetik alanı ile ilgili konularda düşüncelerini ve sorunlara ilişkin çözüm önerilerini nicel ve nitel verilerle 5 5 5 destekleyerek uzman olan ve olmayan kişilerle paylaşır. PY 09 Analitik düşünme yeteneği ile sonuç 5 5 5 çıkarma sürecinde zamanı etkin kullanır. PY 10 Alanı ile ilgili yayınları takip edebilecek ve kullanabilecek düzeyde yabancı dil bilgisini etkin 5 5 5 bir biçimde kullanabilir. PY 11 Mevcut teknolojik imkanları da kullanarak kaynak taraması yapabilir, bilgiyi bulur, 5 5 5 yorumlayabilir, eğitime, endüstriye, tarıma, sağlık ve çevre problemlerine uygulayabilir. PY 12 Evrensel ve toplumsal değerlere duyarlı, ülke çıkarlarını gözeten, araştıran, üreten, etik değerlere sahip bireyler olup meslek hayatında 5 5 5 profesyonel davranış sorumluluğu sergileyebilme yeteneğine sahiptir. PY 13 Biyolojik teknolojileri Ülkemiz biyoçeşitliliğinin korunması ve 3 4 4 sürdürülebilmesinin önemini anlamlandırabilir ve değerlendirebilir. * 1: Çok düşük 2: Düşük 3: Orta 4: Yüksek 5: Çok yüksek 4/5 4 5 5 5 5 5 5 5 4 AVRASYA ÜNİVERSİTESİ AKTS ( Öğrenci İş Yükü) Hesabı (Ortalama Saat) Etkinlikler Sayısı Kuramsal Ders 14 Uygulamalı Ders 0 Ödevler 1 Sunum / Seminer hazırlama 0 Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi (Ön 14 Çalışma, pekiştirme, vb) Dönem Ödevi / Proje 0 Uygulama (Lab., Atölye, Arazi, PDÖ) 0 Diğer bilgi edinme çalışmaları 0 Kısa Sınav(lar) 0 Ara Sınav(lar) 1 Yarıyıl Sınavı 1 Ön Hazırlık 1 0 10 0 Etkinlik Süresi 3 0 0 0 Toplam İş Yükü 56 0 10 0 0 4 56 0 0 0 0 7 10 0 0 0 0 1 2 Toplam İş Yükü (Saat) Yuvarla [Toplam İş Yükü (saat) / Haftalık İş Yükü (30)] = Dersin AKTS Kredisi 5/5 0 0 0 0 8 12 142 5