FURİL PİRİDİN MOLEKÜLLERİNİN YAPISAL, ELEKTRONİK VE ÇİZGİSEL OLMAYAN OPTİK ÖZELLİKLERİNİN TEORİK OLARAK İNCELENMESİ Emre YÖRÜK YÜKSEK LİSANS TEZİ İLERİ TEKNOLOJİLER GAZİ ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ŞUBAT 2007 ANKARA TEZ BİLDİRİMİ Tez içindeki bütün bilgilerin etik davranış ve akademik kurallar çerçevesinde elde edilerek sunulduğunu, ayrıca tez yazım kurallarına uygun olarak hazırlanan bu çalışmada orijinal olmayan her türlü kaynağa eksiksiz atıf yapıldığını bildiririm. Emre YÖRÜK iv FURİL PİRİDİN MOLEKÜLLERİNİN YAPISAL, ELEKTRONİK VE ÇİZGİSEL OLMAYAN OPTİK ÖZELLİKLERİNİN TEORİK OLARAK İNCELENMESİ (Yüksek Lisans Tezi) Emre YÖRÜK GAZİ ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ Şubat 2007 ÖZET Bu çalışmada furil piridin molekülünün tüm izomerleri için yapısal parametreleri ile elektronik ve çizgisel olmayan optik özellikleri yoğunluk fonksiyonu teorisi içerisinde Becke’nin üç parametreli enerji fonksiyoneli B3LYP hibrit yaklaşımı kullanılarak hesaplandı. Hesaplamalar GAUSSIAN 03W paket programı ile yapılmış, 6-311++G(2d,p) temel seti kullanılmıştır. Furil piridin molekülünün tüm izomerleri ve konformasyonlarının ayrı ayrı bağ uzunlukları, atomlar arası açıların değişimi, çizgisel olmayan optik özelliklerden statik polarizebilite (α), anizotropik polarizibilite ( ∇α ), HOMOLUMO enerji farklılıkları, açıya bağlı frekans değerleri ve IR şiddetleri ve statik hiperbolarizebilite (β) hesaplandı. Moleküllerin konformasyon durumlarının incelenerek, sterik etkinin varlığı ve etkileri hesaplanmıştır. Bilim Kodu : 912.1.080 Anahtar Kelimeler : Furil Piridin, Polarizebilite, Hiperpolarizebilite, B3LYP, Frekans ve IR şiddeti Sayfa Adedi : 67 Tez Yöneticisi : Yrd. Doç. Dr. Mehmet BAHAT v THEORETICAL INVESTIGATION OF STRUCTUREL, ELEKTRONIC AND NONLINEAR OPTICAL PROPERTIES OF FURIL PYRIDINE (M.Sc.Thesis) Emre YÖRÜK GAZI UNIVERSITY INSTUTE OF SCIENCE AND TECHNOLOGY February 2007 ABSTRACT In this study, the structural parameters, electronic and nonlinear optical properties (NLO) of Furil Pyridine molecules were calculated by using Becke three parameter functional (B3LYP) hybrid approaches within the density functional theory (DFT). All of calculations performed with 6-311G++(2d,p) basis sets by using GAUSSIAN 03W. All molecules calculated different conformations (cis and trans forms), then we calculated atomic distances, atomic angles, non linear optical properties such as polarizability, anisotropic polarizability and static hyperpolarizabilities. Science Code Key Words Page Number Adviser : 912.1.080 :Furil Pyridine, Polarizability, Hyperpolarizability, aB3LYP, Frequency ve IR intensity : 67 : Asst. Prof. Dr. Mehmet BAHAT vi TEŞEKKÜR Bu çalışmam süresince, yardımlarını esirgemeyen, bilgi ve birikimleri ile tezin şekillenerek gelişmesine yardımcı olan, saygıdeğer hocam Sayın Yrd. Doç. Dr. Mehmet BAHAT’a teşekkür ederim. Yüksek Lisans derslerimde bilgi ve tecrübelerini bizlerle paylaşan Fen Bilimleri Enstitüsü Fizik Bölümünün değerli hocalarına teşekkür ederim. vii İÇİNDEKİLER Sayfa ÖZET .......................................................................................................................... iv ABSTRACT................................................................................................................ v TEŞEKKÜR................................................................................................................vi İÇİNDEKİLER ......................................................................................................... vii ÇİZELGELERİN LİSTESİ........................................................................................x ŞEKİLLERİN LİSTESİ .............................................................................................xii SİMGELER VE KISALTMALAR.......................................................................... xiv 1. GİRİŞ ...................................................................................................................... 1 2. TEMEL BİLGİLER ................................................................................................ 2 2.1. Moleküler Modellemenin Oluşumu ................................................................. 2 2.2. Moleküler Modellemenin Kullanım Alanları................................................... 2 2.2.1. Moleküler mekanik metodlar (Force Field Method)............................ 4 2.2.2. Ab initio moleküler orbital yöntemleri ................................................. 5 2.2.3. Yarı deneysel (semiemprical) moleküler yöntemler ............................. 6 2.2.4. Çok elektronlu atomlar.......................................................................... 8 2.3. Kuantum Mekaniksel Enerji İfadeleri ve Yoğunluk Fonksiyoneli Teorisi(DFT) ..................................................................................................10 2.3.1. Nükleer çekim fonksiyonu ..................................................................11 2.3.2. Coulomb fonksiyonu ...........................................................................12 2.3.3. Hartree kinetik fonksiyonu ..................................................................12 2.3.4. Fock değiş – tokuş fonksiyonu............................................................13 2.3.5. Thomas – Fermi kinetik fonksiyonu ...................................................13 viii Sayfa 2.3.6. Dirac değiş tokuş fonksiyonu ..............................................................13 2.3.7. Vosko-Wilk-Nusair fonksiyonu ..........................................................15 2.3.8. Lee-Yong-Parr korelasyon fonksiyonu ...............................................16 2.3.9. B3LYP karma yoğunluk fonksiyonu teorisi .......................................17 2.4. Temel Setler ve 6-311-H-G(2d,p) Temel Seti................................................18 2.5. Geometri Optimizasyon .................................................................................22 2.6. Yoğunluk Fonksiyoneli Teorisinde Öz Uyumlu Alan Yönetimi (DFT SCF) ...................................................................................................25 2.7. Çizgisel Olmayan Optik Özellikler................................................................29 3. FURİL PİRİDİN MOLEKÜLLERİNİN YAPISAL, ELEKTRONİK VE ÇİZGİSEL OLMAYAN OPTİK ÖZELLİKLERİNİN TEORİK OLARAK İNCELENMESİ....................................................................................................32 3.1. Materyal.........................................................................................................32 3.2. Metod.............................................................................................................33 3.3. Hesaplanan Büyüklükler................................................................................33 3.4. Yapısal Parametreler ve Fiziksel Büyüklükler ..............................................34 3.5. Burulma Enerjisi Profili.................................................................................35 3.6. Moleküler Dipol Moment ..............................................................................39 3.7. Çizgisel Olmayan Özellikler..........................................................................42 3.8. Furil Piridin Molekülü Hesaplamaları ...........................................................44 3.8.1. 2-(2-furil) piridin molekülü hesaplamaları .........................................44 3.8.2. 3-(2-furil) piridin molekülü hesaplamaları .........................................46 3.8.3. 4-(2-furil) piridin molekülü hesaplamaları .........................................48 3.8.4. 2-(3-furil) piridin molekülü hesaplamaları .........................................50 ix Sayfa 3.8.5. 3-(3-furil) piridin molekülü hesaplamaları..........................................52 3.8.6. 4-(3-furil) piridin molekülü hesaplamaları ..........................................54 4. SONUÇ .................................................................................................................64 KAYNAKLAR .........................................................................................................65 ÖZGEÇMİŞ ..............................................................................................................68 x ÇİZELGELERİN LİSTESİ Çizelge Sayfa Çizelge 2.1. Enerjinin türevlerinden hesaplanabilen moleküler özellikleri ……… 8 Çizelge 3.1. Denge durumu enerjileri ............................................................................ 35 Çizelge 3.2. Moleküllerin hesaplanmış enerji, dipole, HOMO-LUMO enerjisi, ortalama statik polarizebilite, anizotropik polarizebilite ve statik hiperpolarizebilite değerleri ..................................................................44 Çizelge 3.3. 2-(2-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun B3LYP/6-311++ G (2d,p) modeliyle hesaplanmış bağ uzunlukları ... 45 Çizelge 3.4. 2-(2-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun B3LYP/6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmış açı değerleri ........45 Çizelge 3.5. 3-(2-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun B3LYP/6-311++ G (2d,p) modeliyle hesaplanmış bağ uzunlukları..... 47 Çizelge 3.6. 3-(2-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun B3LYP/6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmış açı değerleri ........47 Çizelge 3.7. 4-(2-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun B3LYP/6-311++ G (2d,p) modeliyle hesaplanmış bağ uzunlukları .... 49 Çizelge 3.8. 4-(2-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun B3LYP/6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmışaçı değerleri ......... 49 Çizelge 3.9. 2-(3-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun B3LYP/6-311++ G (2d,p) modeliyle hesaplanmış bağ uzunlukları .... 51 Çizelge 3.10. 2-(2-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun B3LYP/6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmış açı değerleri ........51 Çizelge 3.11. 3-(3-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun B3LYP/6-311++ G (2d,p) modeliyle hesaplanmış bağ uzunlukları... 53 Çizelge 3.12. 3-(3-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun B3LYP/6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmış açı değerleri .......53 Çizelge 3.13. 4-(3-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun B3LYP/6-311++ G (2d,p) modeliyle hesaplanmış bağ uzunlukları …55 xi Çizelge Sayfa Çizelge 3.14. 4-(3-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun B3LYP/6-311++ G (2d,p) modeliyle hesaplanmış açı değerleri........ 55 Çizelge 3.15. Bazı furil piridin moleküllerinin B3LYP/6-311++G(2d,p) modelinde hesaplanan dalga sayısı ve şiddeti ....................................... 56 Çizelge 3.16. Furil piridin molekülleri izomerleri B3LYP/6-311++G(2d,p) modelinde hesaplanan dalga sayısı ve şiddeti ....................................57 xii ŞEKİLLERİN LİSTESİ Şekil Sayfa Şekil 3.1. Furil piridin molekülü (cis konformasyonunda)......................................... 32 Şekil 3.2. 2-(2-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre enerjinin dihedral açıya göre değişimi ..........................36 Şekil 3.3. 3-(2-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre enerjinin dihedral açıya göre değişimi ..........................37 Şekil 3.4. 4-(2-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre enerjinin dihedral açıya göre değişimi ..........................37 Şekil 3.5. 2-(3-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre enerjinin dihedral açıya göre değişimi ..........................38 Şekil 3.6. 3-(2-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre enerjinin dihedral açıya göre değişimi ..........................38 Şekil 3.7. 4-(3-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre enerjinin dihedral açıya göre değişimi ..........................39 Şekil 3.8. 2-(2-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre dipol momentinin dihedral açıya göre değişimi...........40 Şekil 3.9. 3-(2-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre dipol momentinin dihedral açıya göre değişimi...........40 Şekil 3.10. 4-(2-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre dipol momentinin dihedral açıya göre değişimi..........41 Şekil 3.11. 2-(3-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre dipol momentinin dihedral açıya göre değişimi...........41 Şekil 3.12. 3-(3-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre dipol momentinin dihedral açıya göre değişimi...........42 Şekil 3.13. 2-(2-furil) piridin molekülünün a)cis, b) trans konformasyonu..............44 Şekil 3.14. 3-(2-furil) piridin molekülünün a)cis, b) trans konformasyonu..............46 Şekil 3.15. 4-(2-furil) piridin molekülünün a)cis, b) trans konformasyonu..............48 Şekil 3.16. 2-(3-furil) piridin molekülünün a)cis, b) trans konformasyonu.............50 xiii Şekil Sayfa Şekil 3.17. 3-(3-furil) piridin molekülünün a)cis, b) trans konformasyonu.............52 Şekil 3.18. 4-(3-furil) piridin molekülünün a)cis, b) trans konformasyonu.............54 Şekil 3.19. 2-(2-furil) piridin a) cis ve b) trans konformasyonlarının IR spektrumu..............................................................................................58 Şekil 3.20. 3-(2-furil) piridin a) cis ve b) trans konformasyonlarının IR spektrumu ............................................................................................59 Şekil 3.21. 4-(2-furil) piridin a) cis ve b) trans konformasyonlarının IR spektrumu..............................................................................................60 Şekil 3.22. 2-(3-furil) piridin a) cis ve b) trans konformasyonlarının IR spektrumu..............................................................................................61 Şekil 3.23. 3-(3-furil) piridin a) cis ve b) trans konformasyonlarının IR spektrumu..............................................................................................62 Şekil 3.24. 4-(3-furil) piridin a) cis ve b) trans konformasyonlarının IR spektrumu..............................................................................................63 xiv SİMGELER VE KISALTMALAR Bu çalışmada kullanılan simgeler ve kısaltmalar açıklamaları ile birlikte aşağıda verilmiştir. Simgeler Açıklama E Molekülün toplam enerjisi cµi Moleküler orbital açılım katsayısı EC Kolerasyon enerjisi Ee Molekülün elektronik enerjisi E0 Sıfır nokta enerjisi ET Kinetik enerji EXC Değiş tokuş kolerasyon enerjisi EV Nükleer çekim enerjisi Fij Kuvvet sabiti g Gaussian fonksiyonlar G Kuvvet sabiti matrisi μ Dipol moment αort Ortalama polarizebilite ∇α Anizotropik polarizebilite β Hiperpolarizebilite ζ Elektrik alan Φµ Atomik orbital vXC Değiş tokuş ve kolerasyon operatörü Η Hamiltonyen ρ Elektron yoğunluğu ρα α spinli elektronların yoğunluğu ρβ β spinli elektronların yoğunluğu xv Kısaltmalar Açıklama DFT Yoğunluk fonksiyoneli teorisi EB3LYP B3LYP değiş tokuş ve kolerasyon enerjisi GAUSSIAN 03W Gaussian 03W paket programı HF Hartree-Fock metodu B3LYP Kolerasyon enerjili 3 parametreli Becke karma metodu 1 1.GİRİŞ Bu çalışma furil piridin molekülünün izomerleri olan 2-(2-furil)-piridin, 3-(2furil)-piridin, 4-(2-furil)-piridin, 2-(3-furil)-piridin, 3-(3-furil)-piridin ve 4-(3furil)-piridin moleküllerinin yapısal, elektronik ve çizgisel olmayan optik (NLO) özelliklerinin kuantum mekaniksel metodlar kullanılarak, bilgisayar ortamında hesaplanmasını içermektedir. Hesaplamalar iki ana kısımdan oluşmaktadır. Birinci kısımda; molekülün geometri optimizasyonu yapılarak yapısal parametreleri yani bağ uzunlukları, bağ açılarını ve dihedral açıları, moleküler orbital enerjinin (HOMO-LUMO), çizgisel olmayan polarizebilite ve optik özelliklerinden statik statik hiperpolarizebilite ve polarizebilite, titreşim anizotropik frekansları tüm konformasyonlar için hesaplanmıştır. İkinci kısımda ise, her bir molekülün trans konformasyonu alınarak yukarıda zikredilen hesaplamalar tekrarlanarak iki durum arasındaki farklar hesaplanarak, molekülün genel karakteristiği belirlenmiştir. Hesaplamaların tamamı GAUSSIAN 03W paket programında kodlanmış bulunan, Yoğunluk Fonksiyonu Teorisi (DFT) nin B3LYP metodu kullanılmıştır. Temel set olarak 6-31 l++G(2d,p) kullanılmıştır. 2 2.TEMEL BİLGİLER 2.1. Moleküler Modellemenin Oluşumu Gelişen teknoloji ve modern bilim, her alanda yeni gereksinimler, yeni çözümler aramakta, araştırma ve geliştirme hizmetlerine önemli miktarda mesai ve bütçeler ayırmaktadır. Artan ihtiyaçlar, zorunlu gereksinimlerin en kısa, kalıcı ve etkin şekilde sağlanması ve bazı teknik imkânsızlıkların başarı ile atlatılması planlı bir çalışma ile mümkün olmaktadır. Bu tip önemli ve maliyetli bilimsel gelişim süreçlerinde ne istediğini bilen, ve ne elde etmek hedefini belirleyebilen bilim adamları için en önemli gereksinim uygun malzeme ve ekipmanların gerekli yerlerde kullanılmasının sağlanmasıdır. Bu sayede deneme – yanılma yöntemleri ile boşa zaman harcanmayacak, amaca uygun materyaller elde edilebilinecektir. İşte bilim adamlarının uzun sürelerce ve herhangi bir sonuç garantisi olmadan laboratuarlarda çalışarak ulaşabilecekleri fiziksel deneylerin sonuçlarını, teknolojik gelişmenin en büyük gücü olan bilgisayarlarca çok ucuz ve hızlı bir şekilde hesaplanması ihtiyaçları oluşmuştur. Bilgisayarlar kullanılarak yapılacak hesaplamalarda, fiziksel kuralların bilgisayarca bilinmesi, uygulanması ve hatta değerlendirilmesi gibi ihtiyaçlar doğmuştur. Moleküler modelleme; bir molekülün özelliklerinin fizik yasalarından hareketle bilgisayarla hesaplanması olarak tanımlanan fiziksel bir modellemedir. 2.2. Moleküler Modellemenin Kullanım Alanları Bu alanda çalışanlar, ilk olarak mevcut modellerin bilgisayar ortamında tam ve eksiksiz olarak çalışmasını sağlamaktır. Çünkü bu sayede fizik, kimya ve ilgili bilimlerin temel hesap yöntemleri kolaylıkla uygulanabilir ve karşılaştırmalar yapılarak sonuçların doğruluk oranları tespit edilebilmektedir. Günümüzde moleküler modellemenin sanıldığından çok daha geniş bir uygulama alanı vardır; bunların en başında fizik, kimya, biyoloji, ilaç sanayisi, malzeme bilimi bulunmaktadır. Deneysel çalışmaları desteklemek ya da deneysel çalışma yapmadan elde edilecek 3 sonuçlan önceden tahmin edebilmek amacıyla hesaplamalı yöntemleri kullanacak olan araştırmacılar için genel olarak 2 farklı seçenek vardır. Bunlar Moleküler mekanik yöntemler Moleküler mekanik metotlar, molekülü oluşturan atomlar arasındaki kimyasal bağı kütle – yay modeli gibi kabul ederek uygun hesaplama yöntemleri geliştirir. Bu nedenle elektronik yapıyı detaylı olarak göz önüne almaz. Elektronik yapı metotları Elektronik yapı metotlarında ise molekülü oluşturan atomların elektronik yapısını detaylı olarak göz önüne alarak hesaplama yapar. Moleküllerin özelliklerinin hesaplanmasında kullanılan metotlar ise iki ana gruba ayrılır. Ab inito metotlar: Ab initio metotlar, çalışılan molekül için molekül ile ilgili veya molekülü oluşturan gruplar veya molekülü oluşturan atomlar ile ilgili olarak deneysel değer kullanmadan, fiziğin temel yasalarından hareket ile hesaplamalar yapmaktadır. Semiemprical metotlar: Semiemprical metotlarda ise deneysel parametreler kullanılarak hesaplamalar yapılır. Bu nedenle deneysel olarak elde edilen sonuçların doğruluğuna göre, elde edilebilecek sonuçlarda değişiklik göstermektedir. Bu yöntemlerin her birinin olumlu yönleri ve eksikleri vardır. Bu nedenle bilimsel çalışmalara başlanmadan önce, kullanılacak molekül yada moleküllerin geometrisi, atom (elektron) sayıları oldukça önemlidir. Moleküler modellemede kullanılan metodların en temel amacı, molekülün enerjisini analitik olarak yazabilmektir. Bir molekülün enerjisini bildiğimizde ise, molekülle 4 ilgili birçok önemli özellikleri kolayca bulabiliriz. 2.2.1. Moleküler mekanik metodlar (Force Field Method) Moleküler mekanik metodu (Kuvvet alanı metodu veya Force Field Method); bir molekülün enerjisini ve yapısını belirlemek için kullanılan hesaplama metodudur. Bu metodda, molekülün toplam potansiyel enerjisini minimum yapan molekül yapısı bulunur. Moleküler mekanik hesaplamalarında elektronlar dikkate alınmaz. Moleküler mekanik modellerde atomlar birer küre, bağlar ise yay olarak düşünülür, yani kütle-yay sistemi olarak kabul edilir [1]. Atomların dikkate alınması ile atomlar arasındaki etkileşmeler önem kazanacaktır. Atomlar arası etkileşmeler iki kısma ayrılır [2]: 1- Kimyasal bağlarla bağlanmış atomlar arası etkileşmeler a) Gerilme titreşimi, b) Açı bükülme titreşimleri, c) Burulma titreşimi, d) Düzlem dışı açı bükülmesi. 2- Kimyasal bağlarla birbirine bağlanmamış atomlar arası etkileşmeler a) Van der Waals etkileşmeleri b) Elektrostatik etkileşmeler. Bunların dışında moleküldeki bağlar ve açılar birbirinden bağımsız olmadıklarından verilen bir gerilme, bükülme veya burkulma hareketi komşu bağlara ve bağ açılarına da bağlıdır. Bu tür çiftleşme ile oluşan etkileşmelerin enerjisi genelde saf etkileşmelerden daha küçüktür. Bu etkileşmeler burkulma-bükülme, gerilme-bükülme bükülme-bükülme gibi etkileşmelerdir. 5 Atomlar arası etkileşmelerin her biri potansiyel enerji ile tanımlanır. Molekülün toplam potansiyel enerjisi bu etkileşmelere karşılık gelen potansiyel enerjilerin toplamıdır. Moleküler mekanik veya Kuvvet alam yaklaşımında (Force Field Method) moleküler enerji; E FF = E str + Ebend + Etors + E wdw + E el + E cross (2.1) ile verilir. Burada Estr gerilme enerjisi, Ebend bükülme enerjisi , Etors torsiyon enerjisi, Ev d w : Van der Waals enerjisi, E el : elektrostatik enerjisi, enerjisidir. Moleküler mekanik yöntemlerin kodlandığı AMBER ve CHARM gibi paket programlar vardır. Bu programlar bir kimyasal sistemdeki atomlar arasındaki etkileşmeleri klasik fizik kuralları ile tanımlar. Bu programlar oldukça hızlıdır ve temel haldeki bir sistemin enerjisini tam olarak hesaplayabilirler. Bununla birlikte bu yöntemlerle elektronik yapıya bağlı olan özellikler ya da elektronik yapı hakkında bilgi edinilemez. Bir tepkime sistemi modellenerek bağ oluşumu ya da parçalanması içeren işlemler yapılamaz. 2.2.2. Ab initio moleküler orbital yöntemleri Ab initio moleküler orbital yöntemleri kuantum mekaniksel temellere dayanır ve bu yöntemler ile yapı ve buna bağlı özellikler hesaplanabilir. Ab initio metodlar moleküler mekanik ve yarı deneysel metodların tersine, ilgilenilen molekül için ışık hızı Planck sabiti, elektronların kütlesi gibi temel fiziksel sabitler hariç deneysel değerler kullanmaz [3]. Hesaplama süresi moleküler mekanik yöntemlere göre çok daha fazladır. Bu süreyi azaltmak için geometrilerde ve kullanılan parametrelerde bazı basitleştirmeler yapılabilir. Ancak bu kesin olmayan sonuçların elde edilmesine neden olur. Hesaplama süresi, molekülü veya moleküler sistemi içeren elektron sayısına bağlıdır. 6 2.2.3. Yarı deneysel (semiemprical) moleküler yöntemler Yan deneysel (semiemprical) moleküler yöntemler ise bu iki durum arasında yer alır. Ab inito moleküler orbital yöntemleri gibi yarı deneysel yöntemlerde kuantum mekaniksel esaslara dayanır. Bu yöntemlerde, moleküler özelliklerin deneysel değerlere yakın sonuçlar vereceği parametreler mevcuttur. Etkileşim integralleri için yaklaşık fonksiyonların kullanılmasıyla hesaplama süresi ab initio yöntemlerin hesaplama süresi ile karşılaştırılamayacak kadar azdır. Çok küçük sistemler için kullanılabileceği gibi büyük kimyasal sistemler için de kullanılabilir [3]. Ab initio ve semiemprical moteküler orbital yöntemlerin her ikisi de orbitalleri hidrojen benzeri orbitaller olarak tanımlar. Dalga fonksiyonlarında Slater ve Gaussian tipi orbitaller kullanılır. Bir sistemin değişim yöntemi ile hesaplanması aşağıdaki basamakları içerir. a) Sistem için bir hamiltoniyen (H) yazılır, b) Değişken parametreler içeren bir dalga fonksiyonu ( Ψ ) seçilir, c) Enerji minimumlaştırılır. Değişik yaklaşımları anlayabilmek için öz uyumlu alan (SCF, Self Consistent Field) yönteminin açıklanması gerekir. Moleküler orbitaller ( Ψ ), atomik orbitallerin (φ)doğrusal bileşimi olarak yazılır (LCAO yaklaşımı) ψ = ∑ v Η Ψ=EΨ c vφ v (2.2) (2.3) Schrödinger denklemi çözülür. Burada H tek elektron işlemcisidir. SCF LCAO moleküler orbital yaklaşımına dayanan ilk, yarı deneysel moleküler orbital yöntemi Pople ve arkadaşları (1965) tarafından geliştirilen CNDO' dur. Austin Model l adı verilen AM1 yöntemi de Dewar ve arkadaşları (1985) tarafından, MNDO 7 yönteminden geliştirilmiştir. Bu yöntem esas olarak moleküldeki büyük itmeleri ortadan kaldırmak için MNDO yönteminin çekirdek-çekirdek itme fonksiyonlarında küçük bir değişiklik yapılmasıyla oluşturulmuştur. MNDO-PM olarak adlandırılan ve MNDO'nun üçüncü parametrizasyonu olduğunu göstermek için PM3 şeklinde gösterilen program ise en son geliştirilen yöntemlerden birisidir. Çok sayıda element için parametreleri aynı anda optimize edebilen bir yaklaşımdır. Son yıllarda MOPAC ve AMPAC gibi çeşitli moleküler orbital yöntemlerini yapısında bulunduran paket programlar geliştirilmiştir. Bunlardan MOPAC, J.P. Stewart tarafından geliştirilen n paket programdır ve diğer iki paket programın önemli özelliklerini de içermektedir. Moleküllerin kuvvet alanlarının ve titreşim spektrumlarının kuantum mekaniksel yöntemlerle hesaplanması P. Pulay'm 1969'daki klasik çalışmasına dayanır. Bu çalışmada Pulay "kuvvet" veya "gradyent" metodu denilen metodu önermiştir. Metod çok atomlu moleküllerin kuvvet alanlarının hesaplanmasında gerçekçi bir yaklaşımdır. Pulay'ın temel katkısı enerjinin nükleer koordinatlara göre birinci türevinin (atomlara etki eden kuvvetler, gradyent) ab initio metodlarda analitik olarak elde edilebileceğini göstermesi ve Hartree-Fock metodu için elde edilmiş olmasıdır. İkinci ve daha üst mertebeden analitik türevlerin elde edilmesi kuantum mekaniksel hesaplama yöntemleri için gerçek bir devrim olmuştur. Kuantum mekaniksel metodlardan Hartree-Fock (HF), yoğunluk fonksiyonu teorisi (DFT), Möller-Plesset teorisi (MP2) için 1970-1980'li yıllarda enerji ifadesinin 1. ve 2. analitik türevleri alınarak spektroskopik büyüklüklerin hesabı için kullanmışlardır [5,6]. Birinci türevlerin hesaplanması sonucunda geometrik optimizasyon yapılır, ikinci türevler bize kuvvet sabitini dolayısı ile titreşim frekanslarını verir. ÎR şiddetleri ise dipol momentlerin türevinden bulunur. Günümüzde kuantum mekaniksel yöntemler ile hesaplama yapan GAUSSIAN 98W, GAMESS, HONDO, Q-CHEM, HYPERCHEM, TURBOMOL gibi paket programların tamamı değişik mertebelerden analitik türevler kullanır. Çizelge 2.1'de enerjinin türevlerinden hangi büyüklüklerin hesaplanabileceği verilmektedir. 8 Çizelge 2.1. Enerjinin türevlerinden hesaplanabilen moleküler özellikleri Türev İfadesi Hesaplanabilen büyüklükler ∂E e / ∂R Atomlara etki eden kuvvetler, moelküllerin geometrisi, kararlı noktalar ∂ 2 E e / ∂Ri ∂R j Kuvvet sabitlerini, temel frekanslarını, Infrared ve spektrumları, titreşim genlikleri ∂ 2 Ee / ∂R j ∂ε α Birincil hiperpolarizebilite, dipol moment türevleri, harmonik yaklaşımda infrared şiddeti ∂ 3 Ee / ∂R j ∂ε α ∂ε β Polarizibilite (kutuplanabilirlik) türevleri, harmonik yaklaşımda Raman şiddeti titreşim Raman Çizelge 2.1'de Ee toplam elektronik enerjiye, R atomik koordinatlara, ε elektrik alan bileşenine karşılık gelir [6] . Kuantum mekaniksel metodlar ve yarı deneysel metodlar bir molekülün enerjisi ve fiziksel büyüklükleri Schrödinger denklemini çözerek elde eder. H ψ = Eψ (2.4) Schrödinger denkleminin yalnızca hidrojene benzer iyonlar için tam olarak çözümü yapılabilir. Fakat ikiden fazla elektrona sahip kuantum mekaniksel sistemler için Schrödinger denkleminin tam olarak çözümü mümkün değildir. Birden fazla elektrona sahip kuantum mekaniksel sistemler için Schrödinger denklemini çözmek için Ab inito metodlan matematiksel yaklaşımlar kullanırlar. 2.2.4. Çok elektronlu atomlar Schrödinger denklemi iki elektronlu atomlar için tam çözüm veremediği için yaklaşık metotlar kullanılır. Çok elektronlu atomlar üzerindeki tüm hesaplamaların 9 başlangıç noktası iki elektronlu atomlar için ele alınan merkezcil alan yaklaşımıdır. Bu yaklaşıklıktaki temel düşünce, atomik elektronların, çekirdek ve diğer tüm elektronların oluşturdukları etkin, küresel olarak simetrik V(r) potansiyelinde hareket etmeleridir. Bu yaklaşıklık, her elektronun, çekirdeğin çekimi ve bir elektron ile diğer (N-l) elektron arasındaki itme etkileşmelerinin ortalama etkisini gösteren, bir etkin potansiyelde hareket ettiği düşünülen bağımsız parçacık modelini temel alır. Bundan başka, (N-l) elektronun toplam etkisi elektron ve çekirdek arasındaki merkezcil Coulomb çekimini perdelemek ∑1/ r i< j ij olduğundan elektronlar arasındaki itme terimim S(ri) olarak yazacağımız, büyük küresel simetrik bileşeni ihtiva ettiği görülmektedir. Bir elektronun etkin potansiyel enerjisine iyi bir yaklaşıklık V( r ) = − Z + S(r ) rij (2.5) küresel simetrik potansiyelle sağlanır. Büyük ve küçük uzaklıklarda V(r) nin biçimini kolayca elde edebiliriz. Gerçekten, önce diğer (N-l) elektrona ait rj uzaklığına kıyasla çekirdekten ri uzaklığı büyük olan bir i elektronunu göz önüne alalım. Bu durumda r ij ≈ r i ve 1/rij ≈ 1/ri ‘dir. Buna göre i elektronu, yaklaşık olarak, − Z N −1 1 Z − N +1 +∑ =− ri J =1 ri ri (2.6) ile verilen bir potansiyelinde hareket eder ve bu potansiyel diğer (N-l) elektron tarafından perdelenen çekirdeğin Coulomb alanına karşılık gelir. 10 2.3. Kuantum Mekaniksel Enerji İfadeleri ve Yoğunluk Fonksiyoneli Teorisi (DFT) DFT'nin temeli 1964 yılında Hohenberg ve Kohn'un elektron sisteminin taban durum elektronik enerjiyi elektron yoğunluğunun (ρ) bir fonksiyoneli olarak yazmasına dayanır. Taban durum yoğunluk ve enerji fonksiyoneli bilgisiyle sistemin taban durum özelliklerini tanımlamak mümkündür. Bir molekülün enerjisi veya diğer fiziksel büyüklükleri (kuantum mekaniğinin dalga fonksiyonu gösteriminde) Schrödinger denkleminin çözülmesi ile elde edilir. Schrödinger denklemi, Hˆ ψ = E ψ (2.7) ile verilir. Burada H moleküldeki etkileşmeleri tanımlayan bir operatör, ψ moleküler dalga fonksiyonu, E ise moleküler sistemin farklı kararlı durumlarına karşılık gelen enerjileridir. Bir molekülün elektronik enerjisi kuantum mekaniksel olarak kapalı formda, E e = E T + E V + E J + E XC (2.8) yazılabilir. Burada ET elektronların hareketinden kaynaklanan kinetik enerji, Ev çekirdekelektron çekim ve çekirdek çiftleri arasındaki itme potansiyel enerjisidir, EJ elektronelektron itme terimi (elektron yoğunluğunun Coulomb öz-etkileşimi olarak da tanımlanır), EXC = EX + EC ise değiş tokuş (EX) ve korelasyon (Ec) terimidir ve elektron-elektron etkileşmelerinin geri kalan kısmını kapsar. Daha doğrusu ; değiş tokuş enerjisi aynı spinli elektronlar arasındaki etkileşim enerjisidir. Kuantum mekaniksel dalga fonksiyonunun antisimetrikliğinden dolayı ortaya çıkar. Korelasyon enerjisi ise farklı spinli elektronlar arasındaki etkileşme enerjisidir. Bu enerjinin büyüklükleri hakkında bir fikir edinmek için Ne atomunun enerjilerini verebiliriz. Atomik birimler cinsinden Ne atomunun hesaplanmış enerjileri: 11 Ee=129.4, ET =129 EV=312 EJ=66, EX=-12 EC =-0.4 atomik birim (Hartree) dir (1hartree(H) = 27.192 eV dur). Eğer enerjinin açık ifadesi moleküler dalga fonksiyonu ψ' ye bağımlı ise bu HartreeFock metodu olarak bilinir. HF modeli korelasyon yani etkileşim enerjisini dikkate almaz. Eğer enerji ifadesi elektron yoğunluğu ρ ‘ya bağlı ise bu yoğunluk fonksiyonu modeli DFT olarak bilinir. Yani yoğunluk fonksiyonu teorisi (DFT)'nin temel dayanak noktası; Elektronik sistemin enerjisini elektron yoğunluğuna bağlı olarak ifade etmesidir. Yoğunluk fonksiyonu teorisinde sıkça kullanılan üç temel kavramın tanımı aşağıdaki verilmektedir. 1. Elektron yoğunluğu, ρ= ρ(r), herhangi bir noktadaki elektron yoğunluğu. 2. Tek düze elektron gazı modeli: Bir bölgedeki yük dağılımının, sisteme düzgün dağılmış n tane elektron ve sistemi nötralize edecek kadar pozitif yükten oluştuğu varsayımına dayalı idealize edilmiş bir modeldir. Klasik DFT modelinde enerji ifadeleri elde edilirken elektron dağılımının, V hacimli bir küp içinde olduğu ve elektron yoğunluğunun olduğu p=n/V varsayımı ile verildiği yapılmıştır, yani sistemde p sabit n, kabul V →∞ edilmiştir. 3. Fonksiyonel: bağımsız x değişkenine bağımlı değişkene fonksiyon denilir ve F[/] ile gösterilir . Fonksiyonel kavramı yerine fonksiyon kavramı tercih edilecek fakat sembol gösterimi olduğu gibi kullanılacaktır. Örneğin Coulomb fonksiyoneli yerine Coulomb fonksiyonu veya Coulomb enerjisi ifadeleri kullanılacaktır E e = E T + E V + E J + E XC ile verilen enerji fonksiyonlarını (fonksiyonelleri) daha detaylı inceleyecek olursak, aşağıdaki fonksiyonları kullanmamız gerekir. 2.3.1. Nükleer çekim fonksiyonu Za nükleer yüküne sahip Ra'da sabitlenmiş bir atomun çekirdek ve elektronlar arasındaki elektrostatik Coulomb potansiyeli, 12 N E = −∑ Z a ∫ a r r r v dr r − Ra ρ (r ) (2.9) ile verilmektedir. Burada N toplam çekirdek sayısıdır. 2.3.2. Coulomb fonksiyonu Atomdaki elektronlarının birbirinden bağımsız hareket ettiğini varsayarak bir elektronun diğer elektronlar ile etkileşim enerjisi, EJ = r 1 1 v r r ρ (r ) r r ρ (r ′)dr dr ′ ∫ ∫ 2 r − r′ (2.10) ifadesi ile verilir. 2.3.3. Hartree kinetik fonksiyonu Hartree, 1928 yılında bir atomdaki i. elektronun diğerlerinden tamamen bağımsız olarak yi orbitalinde hareket ettiği varsayımı altında toplam kinetik enerjinin her bir elektronun kinetik enerjilerinin toplamı olarak aşağıdaki gibi yazılabileceğini gösterdi, E HT 28 = − r r r 1 n ψ i (r )∇ 2ψ i (r )dr ∑ ∫ 2 i (2.11) Tek elektronlu sistemler hariç bu yaklaşım bize tam doğru kinetik enerjiyi vermez. Çünkü gerçekte elektronlar birbirinden bağımsız olarak hareket etmezler. Bu nedenle EHT 28 < E T . Buna rağmen H28 iyi bir yaklaşıklıktır. 13 2.3.4. Fock değiş tokuş fonksiyonu 1930'da Fock dalga fonksiyonunun antisimetrik olmaması nedeni ile Pauli dışarlama ilkesini ihlal ettiğini ve dalga fonksiyonunun antisimetrikleştirilmesi ile ortadan kaldırılabileceğini gösterdi. Buna Fermi düzeltmesi veya değiş tokuşu denilmektedir. Fock bu düzeltme enerjisinin aşağıdaki değiş tokuş fonksiyonu ile verilebileceğini gösterdi, E X F 30 r r r r ψ i (r )ψ j (r ′)ψ i (r ′)ψ j (r ) r r 1 n n = − ∑∑ ∫ ∫ dr dr ′ r r r − r′ 2 i j (2.12) Burada ψ i antisimetrik dalga fonksiyonudur. 2.3.5. Thomas-Fermi kinetik fonksiyonu 1927 yılında Thomas ve Fermi tek düze elektron gazı modelinde kinetik enerji için bir formül türetti. Bu modelde kinetik enerji ifadesi, T ETF 27 = 2/3 3 r r 6π 2 ) ∫ ρ 5 / 3 ( r ) dr ( 10 (2.13) ile verilmektedir. Bu ifade atom ve moleküllerin enerjilerim H28 modelinde yaklaşık % 10 daha küçük hesaplamaktadır. TF27 ifadesi klasik yoğunluk fonksiyonu teorisinin doğuşu olarak kabul edilir. 2.3.6. Dirac değiş tokuş fonksiyonu Çok elektronlu sistemlerde, elektronlann p yoğunluğu ile tek düze dağılımı varsayımı altında 1930'da Dirac değiş tokuş enerjisinin, E X D 30 =E X LDA 3⎛ 3 ⎞ =− ⎜ ⎟ 2 ⎝ 4π ⎠ 1 3 ∫ρ 4 3 r r (r )d 3 r (2.14) 14 T ifadesi ile verilebileceğini gösterdi. ETF 27 ve EDX30 ifadelerine klasik yoğunluk fonksiyonları denilir. Yoğunluk fonksiyoneli teorisi DFT'nin bugünkü anlamda temelleri 1964 yılında Hohenberg ve Kohn yoğunluk ve enerjiyi tanımlayan tek bir fonksiyonun varlığını gösterdiler, fakat bu teorem bu fonksiyonun açık ifadesini vermemiştir. DFT de toplam enerji, yoğunluğun bir fonksiyonu olarak verilmektedir. E [ρ ] = E T [ρ ] + E V [ρ ] + E J [ρ ] + E XC [ρ ] (2.15) Hohenberg ve Kohn Exc ifadesinin tamamen elektron yoğunluğuna bağlı olarak belirlenebileceğini gösterdi. Pratikte, Exc spin yoğunluğunu ve gradiyentleri içeren bir integral ile hesaplanır. r r r r r E XC [ρ ] = ∫ f [ρ α (r ), ρ β (r ), ρ α (r ), ρ β (r )]d 3 r (2.16) Eş. 2.17’ de ρ α , α spin yoğunluğunu, αβ, β spin yoğunluğunu, ρ ise toplam elektron yoğunluğunu (ρα+ρβ) göstermektedir.Exc gelen değiş tokuş ve ise aynı-spin etkileşmelerine karşılık kanşık-spin etkileşmelerine karşılık gelen korelasyon enerjileri olmak üzere iki kısma ayrılır. E XC [ρ ] = E X [ρ ] + E C [ρ ] E X [ρ ] = EαX [ρ α ] + E βX [ρ β ] (2.17) C E C [ρ ] = Eαα [ρ α ] + E ββC [ρ β ] + EαβC [ρα , ρ β ] Her üç terimde yine elektron yoğunluğunun fonksiyonudur. Eş. 2.17’ deki Ex [ρ] terimi değiş tokuş fonksiyonu, Ec [ρ] ise korelasyon fonksiyonu adım alır. Her iki fonksiyon da iki kısma ayrılır: yerel (lokal) fonksiyonlar sadece elektron yoğunluğu ρ 15 ' ya bağımlı, gradyent-düzeltmeli fonksiyonlar hem ρ 'ya hem de gradyenti V ρ 'ya bağımlıdır. Şimdi değiş tokuş enerjisi ile ilgili ifadelere daha detaylı bakalım. Yerel değiş tokuş fonksiyonu Eş. 2.14’ de şöyle verilmektedir; E X LDA 3⎛ 3 ⎞ =− ⎜ ⎟ 2 ⎝ 4π ⎠ 1 3 ∫ρ 4 3 r r (r )d 3 r (2.18) Bu ifade tekdüze elektron gazı için değiş tokuş enerjisidir. Ancak bu ifade moleküler sistemleri tanımlamakta yetersizdir. Becke 1988 yılında LDA değiş tokuş fonksiyonunu aşağıdaki şekilde formüle etti, 4 E X Becke88 =E X LDA Burada x = ρ r ρ 3 x2 −γ ∫ d 3r −1 1 + 6γ sinh x −4 3 v ∇ρ (2.19) , γ ise asal gaz atomlarının bilinen değiş tokuş enerjilerine fit edilerek seçilmiş bir parametredir ve Becke tarafından 0.0042 Hartree olarak bulunmuştur. Becke fonksiyonu yerel (lokal) LDA değiş tokuş fonksiyonuna bir düzeltmedir ve LDA fonksiyonunun eksikliklerinin çoğunu düzeltmektedir. 2.3.7. Vosko-Wilk-Nusair fonksiyonu Korelasyon enerjisi ile ilgili çalışmalar değiş tokuş enerjisi ile karşılaştırdığımızda daha yavaş ilerlemiştir. 1980 yılında Vosko, Wilk ve Nusair (VWN) tekdüze elektron gazının korelasyon enerjisi için bir ifade türetmiştir. Tek düze elektron gazı için parçacık başına düşen VWN korelasyon enerjisi, ε VCW N ⎧ ⎫ x2 2b Q −1 ⎪ ln X x + Q tan 2 x + b ⎪ ( ) ⎪ ⎪ ( rs ) = A ⎨ ⎬ ⎪ b x 0 ⎡ ln ( x − x 0 ) + 2 ( b + 2 x 0 ) tan − 1 Q ⎤ ⎪ ⎢ ⎥ ⎪ X (x) Q x + b ⎦ ⎭⎪ ⎩ X (x) ⎣ (2.20) 16 ifadesi ile verilmektedir. Bu ifadede kullanılan kısaltmalar ise, 4 3 1 π rs = 3 ρr x = rs1/ 2 Q = ( 4c − b2 ) X ( x) = x2 + bx + c ifadeleri ile verilmektedir. Bu ifadedeki sabitlerin değerleri ise, A=0,0621814, χ 0 = -0,409286, b=13,0720, c=42,7198 olarak verilmektedir. Tüm sistemin VWN korelasyon enerjisi, r C r C EVWN = ∫ ρ (r )ε VWN dr (2.21) ifadesi ile verilmektedir. VWN korelasyon enerjisi ifadesi atom ve moleküllerde korelasyon enerjisini yaklaşık iki kat fazla vermektedir . 2.3.8. Lee -Yang-Parr korelasyon fonsiyonu Lee-Yang-Parr 1988 yılında korelasyon enerjisi için yeni bir ifade türetti. Bu ifade 1989 yılında Miehlich ve arkadaşlarınca daha sade ve hesaplama zamanını azaltacak şekilde sadeleştirildi. LYP korelasyon enerjisinin Miehlich formu, ECLYP = − a ∫ ρα ρ β 4 1 + g ρ −1/ 3 ρ ⎧ ⎪ ⎪ ⎪⎪ − ab ∫ w ⎨ ρα ρ β ⎪ ⎪ ⎪ ⎩⎪ w = ( ⎡ 11/ 3 2 2 ⎛ 47 7 ⎞ ⎛5 1 ⎞ 8/3 8/3 ⎢ 2 C F ( ρα + ρ β ) + ⎜ 18 − 18 δ ⎟ ∇ρ − ⎜ 2 − 18 δ ⎟ ∇ρα + ∇ρ β ⎝ ⎠ ⎝ ⎠ ⎢ ⎢ δ − 11 ⎛ ρα ρβ 2⎞ 2 ∇ ρα + ∇ρ β ⎟ ⎢− ⎜ ρ 9 ⎝ ρ ⎠ ⎢ ⎢ 2 2 2 2 ⎛ ⎞ ⎢ − ρ 2 ∇ρ + ⎜ ρ 2 − ρ β2 ⎟ ∇ρα ⎝3 ⎠ ⎣⎢ 3 e x p ( − c ρ r− 1 / 3 ) 1+ gρ −1/ 3 r ρ r− 1 1 / 3 , δ = c ρ r− 1 / 3 + g ρ r− 1 / 3 3 ,CF = ( 3π −1/ 3 1+ gρr 10 2 ) 2 )⎤⎥⎥ ⎫⎪⎪ ⎥ ⎪⎪ ⎥⎬ ⎥⎪ ⎥⎪ ⎥⎪ ⎦⎥ ⎭⎪ 2/3 (2.22) 17 a=0,04918, b=0,132, c=0,2533, g=0,349 ile verilmektedir. LYP korelasyon enerjisi He atomunun verilerinden türetilen 4 tane parametre içermektedir. Atom ve moleküllere uygulandığında korelasyon enerjisini LYP modeli VWN modelinden çok daha iyî vermektedir ancak hala tam değildir . 2.3.9. B3LYP karma yoğunluk fonksiyoneli teorisi Dalga mekaniğine dayanan HF teorisinin değiş tokuş enerjisi için iyi sonuç vermemesi ve korelasyon enerjilerini hesaplayamaması ancak kinetik enerji için uygun bir İfade vermesi, saf DFT modellerinin ise değiş tokuş ve korelasyon enerjilerini daha iyi vermesi nedeni ile tam enerji ifadesi için saf HF veya saf DFT modelleri yerine bu modellerin her ikisinin de enerji ifadelerinin toplam elektronik enerji ifadesinde kullanılmaları sonucu karma (melez, hibrit) modeller üretilmiştir. Bu modeller toplam enerji, bağ uzunlukları, iyonizasyon enerjileri v.b. çoğu büyüklükleri saf modellerden daha iyi hesaplamaktır. Literatürde sıkça kullanılan enerji fonksiyonlarının birçoğu aşağıda verilmiştir. Kinetik enerji fonksiyonları: H28, TF27,... Değiş tokuş enerjisi fonksiyonları: F30, D30, B88, şeklinde verilebilir. Korelasyon enerjisi fonksiyonları: LYP, VWN, şeklinde verilebilir. Bir karma model bu enerji ifadelerini birleştirerek yeni bir enerji ifadesi elde edebilir. Becke değiş tokuş ve korelasyon enerjisi XC için aşağıdaki karma modeli önermiştir, XC X XC E karma = c HF E HF + c DFT E DFT (2.23) Burada c'ler sabitlerdir. Becke'nin önerdiği karma modeller BLYP ve B3LYP’dir. Bu karma modellerden en iyi sonuç verenlerden biri; LYP korelasyon enerjili üç parametreli Becke karma modeli( B3LYP)'dir. B3LYP modelinde değiş tokuş ve korelesyon enerjisi, 18 X X X C C C EBXC3 LYP = ELDA + c0 ( EHF − ELDA + c2 ( ELYP − EVWN ) + c1ΔEBX88 + EVWN ) (2.24) ifadesi ile verilmektedir. Burada c0 , c1 ve c2 katsayıları deneysel değerlerden türetilmiş sabitlerdir ve değerleri sırası ile 0.2, 0.7, 0.8 dir. Dolayısı ile B3LYP modelinde bir molekülün toplam elektronik E B 3 LYP = E T + E V + E J + E BXC3 LYP (2.25) olarak elde edilir. Burada en önemli nokta, değiş tokuş ve korelasyon enerjileri ile ilgili ifadelerin tam olmaması nedeniyle bu enerjiler ile ilgili olarak DFT modelinde atomik ve moleküler sistemlerde daha iyi sonuç verecek fonksiyonlar ile ilgili çalışmalar literatürde yoğun olarak devam etmektedir. 2.4. Temel Setler ve 6-311-G(2d,p) Temel Seti Orbitallerin matematiksel tanımına temel set olarak tanımlanır. Bir moleküler orbital; moleküllerin atomlardan oluşması ve aynı cins atomların farklı cins moleküllerde benzer özellikler göstermeleri nedeni ile atomik orbitallerin çizgisel toplamları olarak yazılabilir. ψι orbitali ile φμ atomik orbitalleri arasındaki bağıntı, N ψ i = ∑ cμiφμ (2.26) μ =1 ifadesi ile verilir. Burada cμι moleküler orbital katsayıları olarak tanımlanmıştır. φμatomik orbitallerini ise temel fonksiyonlar olarak adlandırabiliriz. Temel fonksiyonlar (basis functions), 2 r g (α , r ) = cx n y m z l e −αr (2.27) Gaussian-tipi atomik fonksiyonlar şeklinde seçilebilir. Burada a fonksiyonun genişliğini belirleyen bir sabit, c ise α,l,m ve n ye bağlı bir sabittir, 19 s, py ve dxy tipi gaussian fonksiyonlar sırasıyla aşağıda verilmiştir. 3 r ⎛ 2α ⎞ 4 −α 2 g s (α , r ) = ⎜ ⎟ e ⎝ π ⎠ r ⎛ 128α 5 ⎞ ⎟⎟ g y (α , r ) = ⎜⎜ 3 ⎝ π ⎠ 1 r ⎛ 2048α 7 g xy (α , r ) = ⎜⎜ 3 ⎝ π Bu ifadeler 4 ye −αr (2.28) 2 1 2 ⎞ 4 ⎟⎟ xye −αr ⎠ ilkel (pirimitive) gaussianlar olarak adlandırılmaktadırlar. Sınırlandırılmış gaussianlar ise; (2.29) φ μ = ∑ d μp g p p ifadesi ile verilmektedir. Burada δμi ‘ler herhangi bir temel set için sınırlı sayıda sabitlerdir. Sonuçta bir moleküler orbital, ⎛ ⎞ ψ i = ∑ C μiφ μi = ∑ c μi ⎜⎜ ∑ d μp g p ⎟⎟ μ μ ⎝ p (2.30) ⎠ ifadesi ile verilmektedir. Bir moleküler orbital veya dalga fonksiyonu ile ilgili hesaplamalarda en büyük sorun cμi, çizgisel açılım katsayısının her bir orbital için hesaplanmasıdır. Bu nedenle atomik orbitaller için bir çok temel set önerilmiştir. Minimal temel setler herhangi bir atom için gerektiği sayıda temel fonksiyon içerir. Buna göre aşağıdaki örnekte bazı atomların orbital yapısı gösterilmiştir. Bu atomların elektron sayılarına göre orbitalleri dolu, yarı dolu ve boş orbitaller olarak adlandırılır. En yüksek elektronlarla dolu orbitale HOMO, en düşük boş orbitallere de LUMO denir. 20 Örnek olarak, H: 1s C: ls 2s 2px 2py 2pz Split valans temel setleri ise her bir valans orbitali için farklı büyüklükte ( α) iki veya daha çok temel fonksiyon içerirler. Örnek ; C:ls 2s 2s 2px 2py 2pz 2px 2p 2pz Burada ' işaretli ve işaretsiz orbitallerin büyüklükleri farklıdır. 3-21G, 4-21G, 6-31G temel setleri minimal setleridir. Split valans temel setleri orbitallerin büyüklüğünü değiştirir fakat şeklini değiştirmez. Polarize temel setler ise bir atomun taban durumunu tanımlamak için gerekenden daha fazla açısal momentumu orbitallere ekleyerek orbitallerin şeklini değiştirir. Örneğin polarize temel setler karbon atomları için d fonksiyonlarını (orbitalini) da göz önüne alır: 4-21 G*(4-21 G(d)), 6-31G*(6-31G(d)) gibi. Hidrojen atomunda (H) p orbitalinde göz önüne alınmış ise bu durumda temel setler 6-31G**(6-31G(d,p)) olarak gösterilir . Kullandığımız temel setlerde 6-311++G(2d,p) ifadesinin anlamı; 6 ’ nın anlamı, dolu (core) orbitaller için altı tane Gaussian tipi orbital kullanıldığını gösterir. 311 ise valans orbitallerinin üçe varıldığını belirtir, ++ ise H ve II.sıra elementleri için kullanılır. (2d,p) ise, 2d ve p orbitallerinin dikkate alındığını belirtir. 21 3 r r r 3 r φ1's (r ) = ∑ d k/ g s (a k′ , r ) ve φ1ns (r ) = ∑ d kn g s (a kn , r ) k =1 (2.31) k =1 Hesaplamalarımızda kullanılan 6-31G** temel seti için ifadelerimiz ve sabitler aşağıda verilmiştir. Hidrojen atomu için s orbitalleri olarak yazılabilir. Karbon ve oksijen atomları için s ve p atomik orbitalleri, 6 r r φ1s (r ) = ∑ d1s ,k g s (a1k , r ) k =1 r 3 r φ 2/ s (r ) = ∑ d 2 s ,k g s (a k/ , r ) k =1 3 r r φ 2/ px (r ) = ∑ d 2/ p ,k g px (a 2/ k , r ) (2.32) k =1 r 3 r φ 2//s (r ) = ∑ d 2ns ,k g s (a 2nk , r ) k =1 φ // 2 px 3 r r (r ) = ∑ d 2//p ,k g px (a 2 k , r ) k =1 (3z 2 − r 2 , xz, yz, x 2 − y 2 ) exp(− a d r 2 ) olarak yazılabilir. 5 tane d tipi gaussian fonksiyonu vardır;Karbon ve oksijen atomları için d orbitali sözde (virtuel) bir orbital olup, ve kısıtlanmamıştır. Yani terimsel olarak; φ d = g d (α d ) (2.33) 22 φ’ ve φ’’ fonksiyonları valans kabuğunun iç ve dış kısımlarına karşılık gelir. 2.5. Geometri Optimizasyonu Bu bölümde moleküllerde denge durum geometrisinin nasıl hesaplandığı üzerinde duracağız. İnceleyeceğimiz yöntem gradyent optimizasyonu veya kuvvet metodu olarak bilinir. Hesaplamalar moleküler sistem belirli bir geometride iken yapılır. Moleküllerdeki yapısal değişiklikler molekülün enerjisinde ve diğer birçok özelliklerinde değişiklikler oluşturur. Molekülün yapısındaki küçük değişiklikler sonucu oluşan enerjinin koordinata bağımlılığı "potansiyel enerji yüzeyi (PES)" olarak tanımlanır. Potansiyel enerji yüzeyi moleküler yapı ile sonuç enerji arasındaki ilişkidir. Bir molekül için potansiyel enerji eğrilerini veya yüzeyim bilirsek denge durumundaki geometriye karşılık gelen minimum enerjili nokta bulunabilir. İki atomlu bir molekülde bağ gerilmesine karşılık gelen elektronik minimum enerjili nokta Em ve Xm ile gösterilmektedir. Potansiyelin harmonik kısmı Hooke yasası ile verilir.Burada G enerjinin konuma (x) göre ikinci türevidir ve kuvvet sabiti olarak d 2E =G≡k dx 2 (2.34) ile verilir. Çok boyutlu problemlerde ise, genişletilmiş Hooke yasası aşağıdadır; 1 m m E = E m + ( x − x ) + G ( x − x ) veya 2 ⎡G11 1 m m E = E m + ( x1 − x1 , x 2 − x 2 ,...) ⎢⎢G21 2 ⎢⎣ ... [ ][ ] G12 G22 ... ...⎤ ⎡ x1 − x1m ⎤ ⎢ ⎥ ...⎥⎥ ⎢ x 2 − x 2m ⎥ ...⎥⎦ ⎢⎣ ... ⎥⎦ (2.35) 23 Burada ( x − x m ) yer değiştirme vektörü ve G ise elemanlarını köşegen ve köşegen dışı etkileşen kuvvet sabitlerinin oluşturduğu Hessian matrisi adını alır. ⎡ ∂2E ∂2 E ⎤ ⎢ ∂ 2 x 2 ∂x ∂x KK ⎥ ⎢ 1 1 2 ⎥ ⎡G11 G12 KK ⎤ ⎢ ⎥ ⎢ G22 KK⎥ ∂2E ⎥ KKK ⎥ = ⎢ ⎢ 2 ⎢ ⎥ x ∂ . KKK 2 ⎢ ⎥ ⎢ ⎥ ⎢ KKKKK⎥ ⎣ KKK. ⎦ ⎢ ⎥ ⎢⎣ ⎥⎦ (2.36) Moleküler geometri optimizasyonu ( x1m − x2m ,...) konumlarına karşılık gelen minimum enerjili noktalan bulmak demektir. Bu ilk aşamada gradyent vektörü g'yi bulalım. g =( ∂E ∂E , ,.....) ∂x1 ∂x 2 (2.37) İkinci aşamada ise gradyent vektörünün sıfır olduğu noktalan bulmaktır. g = (0,0,0,.......) (2.38) Daha önce belirtildiği gibi gradyent vektörünün sıfır olduğu noktalar minimum enerjili duruma karşılık gelir ve molekülün bu durumdaki geometrisi denge durumu geometrisidir.Bir molekül için potansiyel enerji yüzeyinde birçok maksimum ve minimumlar görülür Maksimumların ve minimumların özelliklerini ve anlamlanın oldukça önemlidir. Buna göre potansiyel enerji yüzeyindeki minimumlar sistemin dengede olduğu yerdir. Tek bir molekül için farklı minimumlar farklı konformasyonlara veya yapısal izomerlere karşılık gelir. Bu konformasyonlar veya yapısal izomerler farklı fiziksel özellikler gösterirler. Yapısal izomerler arasındaki farklılıklar ise bu molekülün genel karakteristiği hakkında oldukça net sonuçlar sunar. 24 Sırtlardaki düşük nokta bir yönde yerel minimum, diğer yönde bir maksimumdur. Bu tür noktalara "eyer noktaları, saddle point" adı verilir. Eyer noktalan iki denge yapısı arasındaki geçiş yapısına karşılık gelir. Geometri optimizasyonları genellikle potansiyel enerji yüzeyindeki minimumları araştırır, bu münasebetle moleküler sistemlerin denge yapılarını tahmin eder. Optimizasyon aynı zamanda geçiş yapılarını da inceler. Biz minimumlara optimizasyonu göz önüne alacağız. Minimumlara optimizasyonlara minimizasyon denir. Bundan böyle optimizasyon dediğimizde minimizasyondan bahsediyor olacağız. Minimumlarda ve eyer noktalarında enerjinin birinci türevi yani gradyent sıfırdır. Kuvvet gradyentin negatifidir. Bu nedenle bu noktalarda kuvvet de sıfırdır. Potansiyel enerji yüzeyinde gradyent vektörü g'nin sıfır olduğu noktaya "kararlı noktalar" denir. Başarılı geometri optimizasyonlannın tümü kararlı noktalan bulmayı hedefler. Geometri optimizasyonu giriş geometrisindeki moleküler yapıda başlar ve potansiyel enerji yüzeyini dolaşır. Bu noktada enerji ve gradyenti hesaplar ve hangi yöne doğru ne kadar gidileceğine karar verir. Gradyent eğimin dikliğini verdiği kadar, yüzey boyunca mevcut noktadan enerjinin çok hızlı düştüğü noktayı da verir. Enerjinin atomik koordinatlara göre ikinci türevi kuvvet sabitini verir. Optimizasyon algoritmalarının çoğu kuvvet sabitleri matrisi olarak bilinen Hessian’ı da hesaplar veya tahmin eder. Kuvvet sabitleri bu noktadaki yüzeyin eğriliğini tanımlar ki bir sonraki aşamanın belirlenmesinde ek bilgi verir. Optimizasyon yakınsadığında tamamlanmış olur. Yani hesaplanan geometride g vektörü sıfır ve bir sonraki aşamada hesaplanan değerler arasındaki fark ihmal edilebilir bîr değerde ise optimizasyon tamamlanmış olur . optimizasyonu yapılan hesaplamalar matris yapısı ile ifade edilirler. Bu sayede hem hesaplamalar kolaylaşır hem de birçok fiziksel özellikler kolaylıkla elde edilebilir. 25 2.6. Yoğunluk Fonksiyoneli Teorisinde Öz Uyumlu Alan Yöntemi (DFT SCF) Bu bölümde Gaussian 03W paket programında bir molekülün spektroskopik büyüklüklerinin yoğunluk fonksiyoneli teorisi DFT çerçevesinde nasıl hesaplandığına bakacağız. Daha Önceki bölümlerde kullandığımız ifadeleri tamamen tekrar veya modifıye ederek kullanacağız. Daha önce de belirtildiği gibi kuantum mekaniksel elektronik enerji ifadeleri şu temel kısımlara ayrılarak yazılabilir; (2.39) E e = E T + E V + E J + E XC Burada ET ve EV kinetik ve elektron-çekirdek etkileşim enerjileri, EJ ise ρ elektron yoğunluğunun Coulomb öz-etkileşimi ve EXC de ρ yoğunluğunun bir fonksiyonu olarak türetilebilen elektron-elektron itme enerjisinin geri kalan (değiş-tokuş ve korelasyon) kısmıdır. Bir moleküler orbital ψi , atomik orbitallerin çizgisel kombinasyonları olarak yazılabileceği daha önceden belirtilmişti; ψ i = ∑ c μiφ μ (2.40) μ Toplam elektron yoğunluğu ise şu şekildedir; n ρ = ∑ψ i (2.41) 2 i Yukarıdaki eşitliklerin Eş. 2.40 ve Eş.2.41 ‘nin kombinasyonundan elektron yoğunluğunun temel setlere bağlı ifadesi elde edilir. Bu ifade; N N N μ v i ρ = ∑∑∑ c μi c viφ μ φ v = ∑ Pμvφ μ φ v μv (2.42) 26 şeklindedir. Burada Pμv = ∑ c μi cvi (2.43) i ile verilerek, yoğunluk matrisi olarak bilinir. Değiş tokuş ve korelasyon enerjisi ise Eş. 2.44’in elektron yoğunluğuna ve elektron yoğunluğunun gradyentine bağlı olarak, r r r r E xc = ∫ f ( p (r ), ∇p (r ))dr (2.44) kapalı formunda verilmektedir. Bu enerjiye karşılık gelen değiş tokuş ve kolerasyon potansiyeli ise; r r δE xc (r ) v (r ) = r δp(r ) xc (2.45) ifadesi ile verilmektedir. Standart varyasyonel hesap bize şu sonucu verir; v xc = ∂f d ∂f d ∂f d ∂f − − − x y ∂p dx ∂p ∂y ∂p dz ∂p 2 (2.46) Burada p x = ∂p / ∂x kısaltması uygulanmıştır. EXC [ρ] değeri biliniyor ise, bu ifade kolaylıkla hesaplanabilir. FˆKSψ i = ε i , KSψ i (2.47) Kohn-Sham orbitalleri ψi aşağıdaki tek-elektron denklemlerinin çözümünden elde edilebilir Burada Kohn-Sham operatörü FˆKS olarak bilinir. Eş. 2.38’ daki her bir enerji, erine 27 yazılıp cμi bilinmeyen katsayılarına göre minimize edilip düzenlendiğinde aşağıdaki denklem seti elde edilir. N ( Fμν − ε S μν )cν ∑ ν i i (2.48) =0 Burada ε i dolu orbitaller için tek-elektron enerji özdeğerleridir. Burada S μi çakışma matrisi olup aşağıdaki ifade ile verilmektedir. N ∑ ( Fμ v v − ε i S μ v )c v i = 0 (2.49) Kohn-Sham operatörü, Fock tipi bir matris olarak, core Fμν = H μν + J μν + FμνXC (2.50) ifadesi ile verilmektedir. Burada, H μν ⎛ ⎜ 1 Za = ∫ φ μ (r )⎜ − ∇ 2 − ∑ a r − Ra ⎜ 2 ⎝ ⎞ ⎟ ⎟φν (r )d r ⎟ ⎠ (2.51) J μ v Coulomb matrisi olup, N J μν = ∑ Pλσ ( μv / λσ ) = ∫∫ φ μ (r )φν (r ) λσ 1 r−r ′ φ λ (r )φσ (r )d rd r ′ (2.52) ifadesi ile verilmektedir. Kohn-Sham operatörünün değiş tokuş ve korelasyon kısmı ise aşağıda şekilde ifade edilir, 28 ⎡ df ⎛ ∂f FμνXC = ∫ ⎢ φ μ φν + ⎜⎜ 2 .∇ρ β ⎢⎣ dρ α ⎝ ∂γ αβ ⎤ ⎞ ⎟.∇(φ μ φν )⎥d r ⎟ ⎥⎦ ⎠ ifadesi ile verilir. Benzer şekilde FμXC v (2.53) yazılabilir. Bu matris elemanları ile Eş. 2.45 ‘deki vXC potansiyel ifadesi özdeştir. Bu ifadeler aşağıda verilen iteratif (ardıl) öz uyumlu alan yöntemi ile çözülür. Sonuçta Eş. 2.39 ‘dan Khon-Sham elektronik enerji ifadesi, N core E = ∑ Pμν H μν + μν 1 Pμν Pλσ ( μν ) + E XC λσ 2 (2.54) elde edilir. Bu ifadenin açık formu bizim kullandığımız modelde şüphesiz ki EB3LYP dir. İlgili molekülün enerjisi ve geometrik parametreleri DFT modelinde SCF yöntemi ile hesaplanır. Bu yöntemin işleyişi ise şu şekilde olmaktadır. • Yaklaşık bir moleküler orbital ifadesi giriş değeri olarak tahmin edilir. Bu tahmin atomik orbitallerin çizgisel kombinasyonuna dayanır (Eş. 2.40). Atomik orbital olarak 6-31++G** • Elektron yoğunluğu bu tahmini moleküler orbitalden hesaplanır ve giriş değeri olarak kabul edilir (Eş. 2.41). • Tahmini enerji ifadesi hesaplanır (Eş. 2.54) • xc S μv , H μcore hesaplandıktan sonra v , J μv , Fμv Fμv değeri hesaplanır (Eş. 2.53). Eş. 2.48’ deki karakteristik denklemden ε i ve cvi hesaplanır. Bu hesaplamaların en önemli aşamalarından birisi burasıdır. • Hesaplanan cvi ‘lerden ψ i ’ler tekrar hesaplanır. Bu başlangıç değer hesaplamalarından sonra SCF çevrimi tekrar başlar. Yani elektron yoğunluğu sırasıyla tüm değişkenler için ayrı ayrı 29 ρ , S μv , H co re μv , J μ v , F μXv C , ε i , c v i , E e , ∂ E e / ∂ R , değerleri hesaplanır. Bu işlem, hesaplanan bu büyüklüklerin bir önceki değeri ile hesaplanan değeri arasındaki fark kabul edilir bir seviyeye inene kadar devam ettirilir. 2.7. Çizgisel Olmayan Optik Özellikler Organik materyaller hızlı bilgi erişimi ve optiksel depolama uygulamaları için önemli materyallerdir. Çizgisel olmayan organik materyaller, içerisinde ışık dalgalarının etkileşebildiği materyallerdir. Organik materyallerde optik özellikler polarizebilite ile belirlenir. Bir atom veya molekülün polarizebilitesi, çekirdek ve elektronların karalı durumlarından ne kadar kolayca yer değiştirebildiklerinin bir ölçüsüdür. Bir atom veya molekülde kolaylıkla yer değiştiren elektronlar çekirdekten en uzakta olan valans elektronlarıdır. Bu nedenle valans elektronlarının polarizebiliteye çok büyük katkısı vardır. Bir molekül dış bir ℑ elektrik alanına konulduğunda molekülde yeni bir yük düzenlenmesi gündeme gelir ki, bu molekülün dipol momenti μe ’nin ⎛1⎞ ⎝2⎠ ⎛1⎞ ⎝6⎠ μ e = μ e (ℑ = 0) + ⎜ ⎟αℑ + ⎜ ⎟ βℑ 2 (2.55) denklemine göre değişmesine neden olur (Eş. 2.55). Burada, μe ( ℑ = 0) elektrik alan bulunmadığı durumdaki molekülün dipol momentini, α dipol polarizebilitesini, β ikinci derece polarizebilite veya birinci derece hiperpolarizebiliteyi (first hyperpolarizability) gösterir. α (polarizebilite) özelliği ℑ elektrik alanı etkisi altında moleküler elektronik dağılımla birleştiren çizgisel optik özellik olarak düşünülürken β ise çizgisel olmayan 30 optik özellik olarak düşünülür. Eş. 2.55 ‘e benzer olarak sistemin toplam enerjisinin Taylor seri açılımı [ l9,20]. ⎛1⎞ ⎛1⎞ E (ℑ) = E (0) − μ i ℑi − ⎜ ⎟ μ ij ℑi ℑ j − ⎜ ⎟ β ijk ℑi ℑ j ℑ k + ..... ⎝6⎠ ⎝2⎠ (2.56) seklindedir. Burada E(0) sistemin elektrik alan olmadığı durumlardaki toplam enerjisidir. Alt indisler kartezyen koordinattan belirtir ve çarpımlar bu kartezyen koordinatlar (x, y, z) üzerinden yapılır. Zayıf elektrik alanlar için çizgisel α polarizebilite özelliği moleküler materyalleri karakterize eder. Büyük elektrik alanlar için çizgisel olmayan etkiler önemlidir ve materyaller β çizgisel olmayan optik özellikleriyle karakterize edilirler. Yön değiştiren (ossilasyon yapan) alanlar için (elektromagnetik radyasyon gibi) bu özellikler frekansa bağlıdır ve dinamik özellikler olarak bilinir. Frekansın sıfıra gitmesi limiti limϖ →0 durumunda bu özellikler statik özellikler olarak bilinir. Çizgisel olmayan optik özelliklerin hesaplanmasında ortalama statik polarizebilite için 1 3 α ort = (α ii + α jj α kk ) (2.57) anizotropik polarizebilite için Δα = [ 1 (α ii − α jj ) 2 + (α ii − α kk ) 2 + (α jj − α kk ) 2 2 ve toplam statik hiperpolarizebilite için ise ] 1 2 (2.58) 31 [ β top = (β iii + β ijj + β ikk )2 + (β jjj + β jkk + β jii )2 + (β kkk + β kki + β kjj )2 şeklindeki ifade elde edilir. ] 1 2 (2.59) 32 3. FURİL PİRİDİN MOLEKÜLLERİNİN YAPISAL, ELEKTRONİK VE ÇİZGİSEL OLMAYAN OPTİK ÖZELLİKLERİNİN TEORİK OLARAK İNCELENMESİ 3.1. Materyal Bu çalışmada furil piridin moleküllerinin yapısal, titreşimsel, elektronik ve çizgisel olmayan optik özelliklerinin B3LYP/6-311++g(2d,p) modeli ile hesaplanmıştır. Furil piridin molekülünün 6 tane yapısal izomeri vardır. Birçok izomerin cis ve trans konformasyonunda olması nedeniyle toplam 12 tane konformasyon vardır. Buna göre, 2-(2-furil) piridin cis, 2-(2-furil) piridin trans, 3-(2-furil) piridin cis, 3-(2-furil) piridin trans, 4-(2-furil) piridin cis, 4-(2-furil) piridin trans, 2-(3-furil) piridin cis, 2-(3-Furil) piridin trans, 2-(3-furil) piridin cis, 2-(3-furil) piridin trans, 2-(4-Furil) piridin cis ve 2-( 2-furil ) piridin trans olmak üzere toplam on iki farklı durum incelenmiştir. Şekil 3.1 Furil piridin molekülü (cis konformasyonunda) 33 Furil piridin molekülleri birçok molekülün sentezinde, antikanser ilaç araştırmalarında kullanılmıştır [7-9]. Aynı zamanda potansiyel antikanser ilaç sentezlerinde uygulamaları kullanılmaktadır [10]. C.Öğretir ve P.Civcir tarafından furil piridin ve türevlerinin bazı fiziksel özellikleri AM1, PM3,MND metodları ile hesaplanmıştır [11] . 3.2. Metod Furil piridin moleküllerinin denge geometrisi Yoğunluk Fonksiyonu Teorisi (DFT) metodu ile, LYP (Lee, Yang, Parr ) korelasyon enerjili üç parametreli Becke karma modeli kullanılarak elde edilmiştir. Yoğunluk Fonksiyonel Teoris (DFT) için basis set olarak 6-311++G(2d,p) kullanılmıştır. Tüm hesaplamalar GAUSSIAN 03W programında B3LYP/6-311++G(2d,p) modeli ile, 4 adet bilgisayar kullanılarak yapısal parametreler ve çizgisel olmayan optik özellikler hesaplanmıştır. 3.3. Hesaplanan Büyüklükler Furil Piridin moleküllerinin her bir konformasyonu için GAUSSIAN 03W programında ilk olarak geometri optimizasyonu yapılarak moleküllerin ; • Yapısal büyüklükleri ( bağ uzunlukları, bağ açıları) • Elektronik büyüklükleri (elektronik enerji, dipol moment, moleküler orbital enerjileri farkları (HOMO-LUMO ) • Çizgisel olmayan optik özellikleri (polarizebilite, anizotropik polarizebilite ve hiperpolarizebilite değerleri elde edilmiştir. 34 3.4. Yapısal Parametreler ve Fiziksel Büyüklükler Bu çalışmada furil piridin molekülünün izomerleri incelenmiştir. Furil piridin molekülleri bir tane furan ve bir tane piridin halkasının birbirine C-C bağı yapması ile oluşmuştur. Furil ve piridin moleküllerinin birbirlerine bağlanma konumlarına göre 6 farklı yapısal izomeri olup, dönü izomerleri de göz önüne alınırsa toplam 10 adet izomeri bulunmaktadır. Furil ve piridin molekülleri C-C bağı etrafında serbestçe dönebilmektedir. Bu dönü hareketi molekülün fiziksel büyüklüklerini etkiler. Yani molekülün enerjisi, dipol momenti, polarizebilitesi gibi değerler bu dönü hareketlerinden dolayı değişim gösterirler. Bu şekilde açıya bağlı olan değişimler birçok araştırmacı tarafından incelenmiştir [12]. Furil piridin birbirine tek bağ ile bağlanmış moleküller, bu bağ etrafında serbestçe dönebilmektedir. Denge durumu ise üç temel etki ile belirlenmektedir: a. Halkalar arasındaki π -konjugasyonu, molekülleri düzlemsel tutar. b. Piridin halkasındaki N-C ile furil halkasındaki O atomu arasındaki çekici elektrostatik etkileşme, molekülü düzlemsel tutma eğilimindedir. Halkalar arasındaki hidrojenlerin sterik etkisi tek bağ etrafında moleküllerin dönü hareketi dihedral açı ile belirlenir ve molekülün bir çok fiziksel özeliğini etkiler . Hesaplanan fiziksel büyüklükler dihedral açıya bağlı olarak değişim gösterir. Buna göre molekülün denge durum geometrisi, konjugatif etkilerin maksimum olduğu O0 ve bu etkilerin sıfırlandığı 90° deki konformasyonları önemlidir. Bu değerlerin tespiti ve sterik etkinin dihedral açıya bağlı olarak değişimini incelemek için 00’den 1800’ye kadar 150’lik açı artışları ile tüm enerjiler hesaplanmıştır. Sterik etki nedenliyle oluşan etkileşmeler nedeniyle denge durum enerjileri ve açıları Çizelge 3.36 ‘de verilmiştir. Optimizasyonu yapılan Furil Piridin moleküllerinden bazılarının denge durum açılarının düzlemsel, bazılarının ise düzlemsel olmadığı gözlenmiştir. Bu farklılığın nedeni, sterik etki ile atomlar arasında kurulan itme – çekme kuvvetlerinin denge durumudur. Buna göre; 3-(2-furil) piridin trans ve 3-(3-furil) piridin trans moleküllerinin optimize edilmiş denge durum açıları düzlemsel değildir. Bu nedenle bu iki molekül için dihedral açı değeri 00 alınarak ΔE0 ve 900 35 için ΔE90 değerleri hesaplanmıştır. Çizelge 3.1 Denge durum enerjileri hesapları Denge Enerjisi ε (a.u) 2-(2-Furil) Piridin ΔE90 (a.u) -477,2497273 2-(2-Furil) Piridin Trans -477,2498021 -477,2623953 3-(2-Furil) Piridin -477,2513828 -477,2584973 -477,2513828 -477,2589471 4-(2-Furil) Piridin -477,2599783 -477,2600911 4-(2-Furil) Piridin Trans -477,2506092 -477,2600957 2-(3-Furil) Piridin -477,2494429 -477.2577472 2-(3-Furil) Piridin Trans -477,2494136 -477,2573425 -477,2502 -477,2532295 -477,2502251 -477,2538114 4-(3-Furil) Piridin -477,2502403 -477,2544928 4-(3-Furil) Piridin Trans - 477,2502403 -477.2544932 Molekül 3-(2-Furil) Piridin Trans ΔE0 (a.u) -477,258857 3-(3-Furil) Piridin 3-(3-Furil) Piridin Trans -477,2528642 -477,258055 3.5. Burulma Enerjisi Profili Tek bağ etrafında moleküllerin dönü hareketi dihedral açı ile belirlenir ve molekülün bir çok fiziksel özeliğini etkiler. Açıya bağlı değişimlerin incelenmesinde temel yaklaşım olarak Katı dönücü yaklaşımı ele alarak,optimize geometride dihedral açı istenilen değerde sabitlenir ve bu açı değerinde fiziksel büyüklükler hesaplanır. Furil piridin molekülü için B3LYP/6-311++G(2d,p) temel seti ile burulma bariyerleri hesaplanmıştır. Burulma bariyerinin belirlenmesinde önemli iki etken sterik ve konjugatif etkileşmelerdir. Bu etkileşmelerden ilki halkalar arasındaki hidrojenlerin sterik etkisi diğeri ise iki n- sistemi arasındaki konjugatif etkidir. Bu etkilerin furil piridin molekülleri için mevcut olduğu gözlenmiştir. Bu sonuçların ise ilgili moleküllerin π-konjugasyonlarının ortaya çıkardığı sonuçlar ile ilgili beklentilere (sterik etkiler) uygun olduğu görülmüştür. Bu çalışmada furil piridin molekülünün tüm izomerleri için denge durum açısı ve 36 denge durumu enerjisi B3LYP/6-311G(2d,p) metodunda ayı ayrı ölçülmüştür. 3-(2furil) piridin trans molekülü ile 3-(3-furil) piridin trans molekül konformasyonlarında denge açısı 00’den faklı olduğundan E0 taban durum enerjisi hesaplanmıştır. Diğer konformasyonların düzlemsel bir geometride olduğu görülmüştür. Denge durum dihedral açı değeri sıfır dereceden farklı olan moleküller için 0° ve 90° de bariyer yükseklikleri hesaplanır. Bizim molekülümüz için sıfır derece aynı zamanda denge geometrisi olduğu için 90° deki enerji bariyeri hesaplanmıştır. Bu ise Furil Piridin molekülü üzerinde sterik etkilerin olduğunun bir göstergesidir. -477,248000 0 20 40 60 80 100 120 140 160 180 200 -477,250000 Enerji (a.u) -477,252000 -477,254000 -477,256000 -477,258000 -477,260000 -477,262000 -477,264000 Dihedral Açı (Derece) Şekil 3.2. 2-(2-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre enerjinin dihedral açıya göre değişimi 37 -477,251000 0 50 100 150 200 -477,252000 -477,253000 Enerji (a.u.) -477,254000 -477,255000 -477,256000 -477,257000 -477,258000 -477,259000 -477,260000 Dihedral Açı (Derece) Şekil 3.3. 3-(2-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre enerjinin dihedral açıya göre değişimi -477,250000 0 50 100 150 200 Enerji (a.u) -477,252000 -477,254000 -477,256000 -477,258000 -477,260000 -477,262000 Dihedral Açı (Derece) Şekil 3.4. 4-(2-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre enerjinin dihedral açıya göre değişimi 38 -477,249000 -477,250000 0 50 100 150 200 -477,251000 Enerji (a.u) -477,252000 -477,253000 -477,254000 -477,255000 -477,256000 -477,257000 -477,258000 -477,259000 Dihedral Açı (Derece) Şekil 3.5. 2-(3-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre enerjinin dihedral açıya göre değişimi -477,250000 0 50 100 150 200 -477,250500 Enerji (a.u.) -477,251000 -477,251500 -477,252000 -477,252500 -477,253000 -477,253500 -477,254000 Dihedral Açı (Derece) Şekil 3.6. 3-(3-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre enerjinin dihedral açıya göre değişimi 39 -477,250000 -477,250500 0 50 100 150 200 Enerji( a.u.) -477,251000 -477,251500 -477,252000 -477,252500 -477,253000 -477,253500 -477,254000 -477,254500 -477,255000 Dihedral Açı (derece) Şekil 3.7. 4-(3-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre enerjinin dihedral açıya göre değişimi 3.6. Moleküler dipol moment Polar bir bağ, bir elektriksel alanla temas ettirilirse, bağ belli bir ölçüde bir 'döndürme kuvveti' etkisinde kalır. Daha polar bağa, polarlığı az olana göre daha fazla kuvvet etki eder. Bağın polarlığının bir ölçüsü olan, dipol moment, bağa etkiyen kuvvetin değerinden hesaplanabilir. Dipol moment, e x d olarak ifade edilir; burada e, elektrostatik birim olarak yük, d ise yükler arası uzaklıktır. Bağ momenti Debye birimi (D) cinsinden verilir. Bağ momentleri, H-H gibi polar olmayan bağ için sıfırdır. Belirli bir bağın bağ momenti, bileşikten bileşiğe bağıl olarak sabittir. Molekülün dipol momenti, μ; bir moleküldeki bağ dipol momentlerinin vektörel olarak toplamıdır. Vektörel toplam bağ momentlerinin doğrultu ve büyüklükleri göz önüne alınarak yapıldığından, dipol moment bir bütün olarak molekül polarlığının bir ölçüsüdür. 40 Dipol Moment (Debye) 2,5000 2,0000 1,5000 1,0000 0,5000 0,0000 0 20 40 60 80 100 120 140 160 180 200 Dihedral Açı (Derece) Şekil 3.8. 2-(2-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre dipol momentinin dihedral açıya göre değişimi Dipol Moment (Debye) 3,5000 3,0000 2,5000 2,0000 1,5000 1,0000 0,5000 0,0000 0 50 100 150 200 Dihedral Açı (Derece) Şekil 3.9. 3-(2-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre dipol momentinin dihedral açıya göre değişimi 41 4,0000 Dipol Moment (Debye) 3,5000 3,0000 2,5000 2,0000 1,5000 1,0000 0,5000 0,0000 0 50 100 150 200 Dihedral Açı (Derece) Şekil 3.10. 4-(2-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre dipol momentinin dihedral açıya göre değişimi 3,0000 Dipol Moment (Debye) 2,5000 2,0000 1,5000 1,0000 0,5000 0,0000 0 50 100 150 200 Dihedral Açı (Derece) Şekil 3.11. 2-(3-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre dipol momentinin dihedral açıya göre değişimi 42 Dipol Moment (Debye) 3,0000 2,5000 2,0000 1,5000 1,0000 0,5000 0,0000 0 50 100 150 200 Dihedral Açı (Derece) Şekil 3.12. 3-(3-furil) piridin molekülünün B3LYP/6-311++G(2d,p) modeline göre dipol momentinin dihedral açıya göre değişimi 3.7. Çizgisel Olmayan Optik Özellikler Organik çizgisel olmayan optik materyaller son yıllarda çeşitli fotonik teknolojideki potansiyel uygulamalarından dolayı önemli bir yere sahip olmuştur. Özellikle hiperpolarizebiliteye sahip organik moleküller oldukça ilgi çekmektedir. Karbon atomu ile diğer elementler arasındaki bağlar sigma σ ve π -bağı olmak üzere iki çeşittir. Moleküler sistemlerin çizgisel olmayan optik özellikleri π -bağındaki elektronların polarizebilitesine bağlıdır. Bu tezde, polarizebilite, ortalama polarizebilite ve hiperpolarizebilite ifadelerini kullanılmıştır. Tanımsal olarak ortalama polarizebilite; üç ayrı doğrultuda ortaya çıkan polarizebilite bileşenlerinin büyüklüklerinin ortalamasıdır. O halde ortalama polarizebilite, moleküler yapının sıvı içinde üç boyutta tamamen dönebilme gücüne bağımlı olarak belirlenebilmektedir. Tüm moleküller elektronlarla doldurulmuş en yüksek dolu moleküler orbital (HOMO) ve en düşük boş moleküler orbitale (LUMO) sahiptirler. Furil Piridin moleküllerinin cis ve trans durumları için HOMO- LUMO enerjileri Çizelge 3.2 ‘de verilmiştir. HOMO-LUMO enerjisi farkının minimum olması demek statik 43 polarizebilitenin yüksek olması anlamındadır.Furil Piridin moleküllerinin çizgisel olmayan optik özelliklerinin tamamı DFT B3LYP / 6-311++ G(2d,p) metodu kullanılarak hesaplanmıştır [13-15]. Tüm moleküllerin ortalama statik polarizebilite, anizotropik polarizebilite ve statik hiperpolarizebilite değerli Çizelge 3.2’ de verilmiştir. Hesaplamaların tamamında dihedral açı, geometri optimizasyonu sonucunda ulaşılmış denge durum açılarıdır. Çizelge 3.2 Moleküllerin hesaplanmış enerji, dipole, HOMO-LUMO ( H-L ) enerjisi, ortalama statik polarizebilite, anizotropik polarizebilite ve statik hiperpolarizebilite değerleri Enerji (eV) Dipole (D) HOMO-LUMO (eV) α (a.u) Δα (a.u) β (a.u) 2-(2-furil) piridin -12986,96 2.2661 4,57 121.89 74.88 989.77 2-(2-furil) piridin trans -12987,07 1.1725 4,55 121.83 75.09 947.08 3-(2-furil) piridin -12986,97 3.0293 4,58 120.56 60.64 820.19 3-(2-furil) piridin trans -12986,98 2.2902 4,59 120.63 60.41 790.01 4-(2-furil) piridin -12987,01 3.3712 4,62 120.30 60.19 874.01 4-(2-furil) piridin trans -12987,01 3.3709 4,62 120.30 60.19 874.01 2-(3-Furil) Piridin -12986,95 2.3238 4,89 115.80 57.28 651.77 2-(3-furil) piridin trans -12986,94 1.7901 4,97 115.72 57.26 717.76 3-(3-furil) piridin -12986,82 1.8139 4,94 114.65 55.59 529.79 3-(3-furil) piridin trans -12986,84 2.5129 5,18 114.17 46.39 480.06 4-(3-furil) piridin -12986,86 2.4926 5,03 114.46 61.17 578.01 4-(3-furil) piridin trans -12986,86 2.4932 5,03 114.47 61.19 579.85 44 3.8.1. 2-(2-furil) piridin molekülü (a) (b) Şekil 3.13. 2-(2-furil) piridin molekülü a) cis ve b) trans konformasyonu Şekilde; 5 numaralı atom oksijen atomu • 14 numaralı atom azot atomu • 1,2,3,4,9,10,11,12,13 numaralı atomlar karbon atomudur • 6,7,8 ,15,16,17,18 numaralı atomlar hidrojen atomudur 2-(2-furil)-piridin molekülünün GAUSSIAN 03W programı ile geometri optimizasyonu yapılarak, sırasıyla bağ uzunlukları, üçlü açı değerleri, çizgisel olmayan optik özellikleri 45 hesaplanmıştır. Çizelge 3.3. 2-(2-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun B3LYP/ 6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmış bağ uzunlukları Geometrik Parametreler Bağlar R1 R2 R3 R4 R5 R6 R7 R8 R9 R10 R11 R12 R13 R14 R15 R16 R17 R18 R19 R(1,2) R(1,5) R(1,6) R(2,3) R(2,7) R(3,4) R(3,8) R(4,5) R(4,9) R(9,10) R(9,14) R(10,11) R(10,16) R(11,12) R(11,15) R(12,13) R(12,17) R(13,14) R(13,18) Cis Bağ Uzunlukları ( Ao) Trans Bağ Uzunlukları (Ao) 1.3583 1.3549 1.0765 1.4244 1.0778 1.3687 1.0774 1.3648 1.4591 1.4032 1.3410 1.3834 1.0822 1.3914 1.0837 1.3898 1.0826 1.3317 1.0862 1.3577 1.3595 1.0764 1.4257 1.0779 1.3644 1.0766 1.3708 1.4549 1.4009 1.3439 1.3859 1.0815 1.3897 1.0837 1.3920 1.0826 1.3296 1.0862 Çizelge 3.4 2-(2-furil)-piridin moleküllerinin cis ve trans konformasyonunun B3LYP/ 6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmış açı değerleri Geometrik Parametreler Üçlü Açılar A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8 A9 A10 A11 A12 A13 A14 A15 A16 A17 A18 A19 A20 A(2,1,5) A(2,1,6) A(1,2,3) A(1,2,7) A(2,3,4) A(2,3,8) A(3,4,5) A(3,4,9) A(1,5,4) A(4,9,10) A(4,9,14) A(9,10,11) A(9,10,16) A(10,11,12) A(10,11,15) A(11,12,13) A(11,12,17) A(12,13,14) A(12,13,18) A(9,14,13) Cis Açı Değerleri ( Derece o) Trans Açı Değerleri ( Derece o) 110.65 133.39 105.92 126.56 106.75 126.65 109.28 132.73 107.38 120.37 117.60 119.00 120.50 119.04 120.24 117.90 121.52 123.864 120.32 118.16 110.48 133.51 106.27 126.26 106.58 128.14 109.59 132.52 107.05 121.68 115.99 118.71 120.05 119.13 120.19 118.00 121.55 123.78 120.28 118.04 46 3.8.2. 3-(2-furil) piridin molekülü (b) (a) (b) Şekil 3.14. 3-(2-furil) piridin molekülü a) cis ve b) trans konformasyonu Şekilde; • 5 numaralı atom oksijen atomu • 14 numaralı atom azot atomu • 1,2,3,4,9,10,11,12,13 karbon atomu • 6,7,8,15,16,17,18 numaralı atomlar hidrojen atomudur. 3-(2-furil)-piridin molekülü GAUSSIAN 03W programıyla geometri optimizasyonu ile bağ uzunlukları, üçlü açı değerleri, çizgisel olmayan optik özellikleri hesaplanmıştır. 47 Çizelge 3.5. 3-(2-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun B3LYP/ 6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmış bağ uzunlukları Geometrik Parametreler Bağlar R1 R2 R3 R4 R5 R6 R7 R8 R9 R10 R11 R12 R13 R14 R15 R16 R17 R18 R19 R20 R21 R(1,2) R(1,5) R(1,12) R(1,18) R(2,3) R(2,6) R(2,12) R(3,4) R(3,7) R(4,5) R(4,8) R(9,10) R(9,14) R(9,16) R(10,11) R(10,17) R(11,12) R(11,15) R(12,13) R(13,14) R(13,18) Cis Bağ Uzunlukları ( Ao) Trans Bağ Uzunlukları (Ao) 1.3665 1.3699 1.4533 2.7163 1.4268 1.0775 2.5909 1.3560 1.0777 1.3600 1.0762 1.3919 1.3341 1.0854 1.3842 1.0830 1.3991 1.0833 1.4034 1.3315 1.0838 1.3665 1.3703 1.4531 1.4267 1.0773 1.3559 1.0777 1.3607 1.0762 1.3903 1.3360 1.0853 1.3861 1.0831 1.3990 1.0821 1.3982 1.0825 1.4029 1.3289 1.0857 Çizelge 3.6 3-(2-furil)-piridin moleküllerinin cis ve trans konformasyonunun B3LYP/ 6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmış açı değerleri Geometrik Parametreler Üçlü Açılar A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8 A9 A10 A11 A12 A13 A14 A15 A16 A17 A18 A19 A20 A(2,1,5) A(1,2,3) A(1,2,6) A(2,3,4) A(2,3,7) A(3,4,5) A(3,4,8) A(1,5,4) A(10,9,14) A(10,9,16) A(9,10,11) A(9,10,17) A(10,11,12) A(10,11,15) A(1,12,13) A(1,12,11) A(11,12,13) A(12,13,14) A(12,13,18) A(9,14,13) Cis Açı Değerleri ( Derece o) Trans Açı Değerleri ( Derece o) 109.14 106.84 126.47 106.18 127.38 110.39 133.61 107.43 122.94 120.66 118.82 120.30 119.31 120.22 121.47 98.99 117.03 123.94 119.74 117.93 109.15 133.70 117.14 126.72 106.22 126.41 110.36 116.01 107.41 122.90 116.34 118.95 120.79 119.12 120.01 121.99 117.04 124.13 120.05 117.83 48 3.8.3. 4-(2-furil) piridin molekülü (a) (a) (b) Şekil 3.15. 4-(2-furil) piridin molekülü a) cis ve b) trans konformasyonu Şekilde; • 5 numaralı atom oksijen atomu • 14 numaralı atom azot atomu • 1,2,3,4,9,10,11,12,13 karbon atomu • 6,7,8,15,16,17,18 numaralı atomlar hidrojen atomudur. 4-(2-furil)-piridin molekülünün GAUSSIAN 03W programı ile geometri optimizasyonu yapılarak, sırasıyla bağ uzunlukları, üçlü açı değerleri, çizgisel olmayan optik özellikleri hesaplanmıştır. 49 Çizelge 3.7. 4-(2-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun ııB3LYP/ 6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmış bağ uzunlukları Geometrik Parametreler Bağlar R1 R2 R3 R4 R5 R6 R7 R8 R9 R10 R11 R12 R13 R14 R15 R16 R17 R18 R19 R(1,2) R(1,5) R(1,11) R(2,3) R(2,6) R(3,4) R(3,7) R(4,5) R(4,8) R(9,10) R(9,14) R(9,15) R(10,11) R(10,16) R(11,12) R(12,13) R(12,17) R(13,14) R(13,18) Cis Bağ Uzunlukları (A0 ) Trans Bağ Uzunlukları (A0 ) 1.3669 1.3705 1.4519 1.4253 1.0774 1.3570 1.0777 1.3581 1.0763 1.3860 1.3367 1.0858 1.4002 1.0826 1.3992 1.3883 1.0815 1.3349 1.0859 1.3668 1.3704 1.452 1.4253 1.0774 1.3570 1.0777 1.3581 1.0763 1.3880 1.3354 1.0859 1.3995 1.0815 1.3999 1.3863 1.0827 1.3362 1.0859 Çizelge 3.8 4-(2-furil)-piridin moleküllerinin cis ve trans konformasyonunun ıB3LYP/ 6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmış açı değerleri Geometrik Parametreler Üçlü Açılar A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8 A9 A10 A11 A12 A13 A14 A15 A16 A17 A18 A19 A20 A(2,1,5) A(2,1,11) A(1,2,3) A(1,2,6) A(2,3,4) A(2,3,7) A(3,4,5) A(3,4,8) A(1,5,4) A(10,9,14) A(10,9,15) A(9,10,11) A(9,10,16) A(1,11,10) A(1,11,12) A(11,12,13) A(11,12,17) A(12,13,14) A(12,13,18) A(9,14,13) Cis Açı Değerleri ( Derece o) Trans Açı Değerleri ( Derece o) 109.12 133.46 106.86 126.36 106.13 127.42 110.48 133.49 107.38 123.97 119.89 119.25 119.64 121.27 121.77 119.11 120.64 124.08 119.79 116.61 109.13 133.45 106.86 126.36 106.13 127.42 110.47 133.49 107.38 124.07 119.83 119.11 120.25 121.75 121.29 119.25 121.11 123.98 119.85 116.61 50 3.8.4. 2-(3-furil) piridin molekülü (a) (b) Şekil 3.16. 2-(3-furil) piridin molekülü a) cis ve b) trans konformasyonu Şekilde; • 15 numaralı atom oksijen atomu • 6 numaralı atom azot atomu • 1,2,3,4,5, 11,12,13,14 numaralı atomlar karbon atomu • 6,7,8,9,10, ,16,17,18 numaralı atomlar hidrojen atomudur. 2-(3-furil)-piridin molekülünün GAUSSIAN 03W programı ile geometri optimizasyonu yapılarak, sırasıyla bağ uzunlukları, üçlü açı değerleri, çizgisel olmayan optik özellikleri hesaplanmıştır. 51 Çizelge 3.9. 2-(3-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun B3LYP/ ıı6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmış bağ uzunlukları Geometrik Parametreler Bağlar R1 R2 R3 R4 R5 R6 R7 R8 R9 R10 R11 R12 R13 R14 R15 R16 R17 R18 R19 R(1,2) R(1,6) R(1,13) R(2,3) R(2,8) R(3,4) R(3,7) R(4,5) R(4,9) R(5,6) R(5,10) R(11,12) R(11,15) R(11,16) R(12,13) R(12,17) R(13,14) R(14,15) R(14,18) Cis Bağ Uzunlukları (A0 ) Trans Bağ Uzunlukları (A0 ) 1.3999 1.3450 1.4652 1.3868 1.0822 1.3886 1.0838 1.3918 1.0826 1.3297 1.3297 1.3523 1.3641 1.0761 1.4404 1.0776 1.3636 1.3570 1.0749 1.4020 1.3425 1.4665 1.3841 1.0827 1.3910 1.0837 1.3891 1.0826 1.3326 1.0861 1.3509 1.3669 1.0761 1.4387 1.0764 1.3645 1.3570 1.0763 Çizelge 3.10. 2-(3-furil)-piridin moleküllerinin cis ve trans konformasyonunun ıB3LYP/ 6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmış açı değerleri Geometrik Parametreler Üçlü Açılar A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8 A9 A10 A11 A12 A13 A14 A15 A16 A17 A18 A19 A20 A(2,1,6) A(2,1,13) A(1,2,3) A(1,2,8) A(2,3,4) A(2,3,7) A(3,4,5) A(3,4,9) A(4,5,6) A(4,5,10) A(1,6,5) A(12,11,15) A(12,11,16) A(11,12,13) A(11,12,17) A(1,13,12) A(1,13,14) A(13,14,15) A(13,14,18) A(11,15,14) Cis Açı Değerleri ( Derece o) Trans Açı Değerleri ( Derece o) 121.57 121.77 119.27 120.41 119.02 120.26 117.85 121.61 123.79 120.25 118.46 110.42 133.49 106.47 125.63 128.83 125.76 110.78 132.32 106.91 121.55 122.07 119.31 120.43 119.00 120.28 117.87 121.55 123.76 120.33 118.48 110.50 133.68 106.48 127.56 125.99 128.55 110.81 133.61 106.73 52 3.8.5. 3-(3-furil) piridin molekülü (a) (b) (b) Şekil 3.17. 3-(3-furil) piridin molekülü a) cis ve b) trans konformasyonu Şekilde; • 5 numaralı atom oksijen atomu • 14 numaralı atom azot atomu • 1,2,3,4,9,10,11,12,13 atomlar karbon atomu • 6,7,8,15,16,17,18 numaralı moleküller hidrojen atomudur. 3-(3-furil)-piridin molekülünün GAUSSIAN 03W programı ile geometri optimizasyonu yapılarak, sırasıyla bağ uzunlukları, üçlü açı değerleri, çizgisel olmayan optik özellikleri hesaplanmıştır. 53 Çizelge 3.11.3-(3-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun B3LYP/ 6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmış bağ uzunlukları Geometrik Parametreler Bağlar R1 R2 R3 R4 R5 R6 R7 R8 R9 R10 R11 R12 R13 R14 R15 R16 R17 R18 R19 R(1,2) R(1,5) R(1,6) R(2,3) R(2,12) R(3,4) R(3,7) R(4,5) R(4,8) R(9,10) R(9,14) R(9,16) R(10,11) R(10,17) R(11,12) R(11,15) R(12,13) R(13,14) R(13,18) Cis Bağ Uzunlukları (A0 ) Trans Bağ Uzunlukları (A0 ) 1.3648 1.3584 1.0758 1.4426 1.4664 1.3516 1.0771 1.3619 1.0762 1.3916 1.3332 1.0855 1.3845 1.0831 1.3995 1.0834 1.4011 1.3323 1.0850 1.3635 1.3593 1.0763 1.4408 1.4662 1.3526 1.0779 1.3620 1.0762 1.3899 1.3353 1.0854 1.3871 1.0831 1.3970 1.0837 1.4024 1.3303 1.0862 Çizelge 3.12. 3-(3-furil)-piridin moleküllerinin cis ve trans konformasyonunun B3LYP/ 6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmış açı değerleri Geometrik Parametreler Üçlü Açılar A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8 A9 A10 A11 A12 A13 A14 A15 A16 A17 A18 A19 A20 A(2,1,5) A(2,1,6) A(1,2,3) A(1,2,12) A(2,3,4) A(2,3,7) A(3,4,5) A(3,4,8) A(1,5,4) A(10,9,14) A(10,9,16) A(9,10,11) A(9,10,17) A(10,11,12) A(10,11,15) A(2,12,11) A(2,12,13) A(12,13,14) A(12,13,18) A(9,14,13) Cis Açı Değerleri ( Derece o) 111.08 133.40 104.95 127.47 127.56 106.70 125.61 110.48 116.09 106.76 122.79 116.43 118.81 120.88 119.70 120.51 122.42 116.35 124.55 115.44 Trans Açı Değerleri ( Derece o) 110.90 133.11 105.20 127.34 127.44 106.60 126.15 110.45 116.05 106.82 122.92 116.35 118.77 120.92 119.48 120.20 121.92 116.68 124.37 115.95 54 3.8.6. 4-(3-furil) piridin molekülü (a) (b) Şekil 3.18. 4-(3-furil) piridin molekülü Şekilde; • 15 numaralı atom oksijen atomu • 6 numaralı atom azot atomu • 1,2,3,4,5, 11,12,13,14 atom karbon atomu • 7,8,9,10, 16,17,18 numaralı moleküller hidrojen atomudur. 4-(3-furil)-piridin molekülünün GAUSSIAN 03W programı ile geometri optimizasyonu yapılarak, sırasıyla bağ uzunlukları, üçlü açı değerleri, çizgisel olmayan optik özellikleri hesaplanmıştır. 55 Çizelge 3.13. 4-(3-furil)-piridin molekülünün cis ve trans konformasyonunun ıB3LYP/ 6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmış bağ uzunlukları Geometrik Parametreler Bağlar R1 R2 R3 R4 R5 R6 R7 R8 R9 R10 R11 R12 R13 R14 R15 R16 R17 R18 R19 R(1,2) R(1,5) R(1,6) R(2,3) R(2,12) R(3,4) R(3,7) R(4,5) R(4,8) R(9,10) R(9,14) R(9,16) R(10,11) R(10,17) R(11,12) R(11,15) R(12,13) R(13,14) R(13,18) Cis Bağ Uzunlukları (A0 ) Trans Bağ Uzunlukları (A0 ) 1.3865 1.3363 1.0859 1.4001 1.0828 1.3982 1.4655 1.3890 1.0823 1.334 1.0860 1.3512 1.3632 1.0761 1.4418 1.0772 1.3651 1.3564 1.0759 1.3893 1.3337 1.0860 1.3980 1.0823 1.4004 1.4656 1.3862 1.0828 1.3367 1.0859 1.3513 1.3634 1.0761 1.4418 1.0772 1.3651 1.3563 1.0759 Çizelge 3.14. 4-(3-furil)-piridin moleküllerinin cis ve trans konformasyonunun ıB3LYP/ 6-311 ++ G (2d,p) modeli ile hesaplanmış açı değerleri Geometrik Parametreler Üçlü Açılar A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8 A9 A10 A11 A12 A13 A14 A15 A16 A17 A18 A19 A20 A(2,1,5) A(2,1,6) A(1,2,3) A(1,2,12) A(2,3,4) A(2,3,7) A(3,4,5) A(3,4,8) A(1,5,4) A(10,9,14) A(10,9,16) A(9,10,11) A(9,10,17) A(10,11,12) A(10,11,15) A(2,12,11) A(2,12,13) A(12,13,14) A(12,13,18) A(9,14,13) Cis Açı Değerleri ( Derece o) 111.08 133.40 104.95 127.47 127.56 106.70 125.61 110.48 116.09 106.76 122.79 116.43 118.81 120.88 119.70 120.51 122.42 116.35 124.55 115.44 Trans Açı Değerleri ( Derece o) 110.90 133.11 105.20 127.34 127.44 106.60 126.15 110.45 116.05 106.82 122.92 116.35 118.77 120.92 119.48 120.20 121.92 116.68 124.37 115.95 56 Çizelge 3.15. Bazı furil piridin moleküllerinin B3LYP/6-311++G(2d,p) modelinde hesaplanan dalga sayısı ve şiddeti 1 2(2F)P Cis 42,8 2(2F)P-C 2(2F)P Şiddet Trans D.S 0,1 67,0 2(2F)P-T Şiddet 2,2 3(2F)P Cis D.S 34,2 3(2F)P-C Şiddet 0,2 3(2F)P 3(2F)P-T Trans D.S Şiddet 34,7 2,0 4(2F)P 3(3F)P-C Trans D.S Şiddet 46,9 0,26 2 104,4 3,7 105,4 2,8 109,0 0,8 109,0 0,5 107,4 0,0 3 161,1 2,2 151,6 3,2 157,3 0,2 157,3 1,0 157,5 0,1 4 254,7 0,4 256,4 0,2 263,4 1,2 261,7 1,1 266,6 6,1 5 357,8 0,1 357,0 0,0 355,5 0,1 353,6 0,0 348,5 0,1 6 409,1 2,6 411,0 3,5 403,9 2,8 405,4 1,7 386,2 0,0 7 450,9 0,0 452,0 0,2 441,1 2,6 443,0 2,7 445,3 2,3 8 506,8 1,4 506,5 1,7 497,8 0,5 498,0 0,2 523,4 10,1 9 610,1 7,3 611,1 7,4 608,6 7,4 608,2 7,9 608,2 7,6 10 635,1 4,0 636,5 3,9 636,0 2,9 635,4 3,3 678,5 12,6 11 682,8 10,3 672,3 10,7 684,7 7,6 686,0 7,1 684,0 1,0 12 724,2 8,5 722,8 8,4 720,5 12,8 721,2 12,6 698,3 28,1 52,8 13 744,3 0,9 741,4 37,9 67,2 3,7 727,4 3,8 744,4 14 752,2 73,2 753,1 26,6 740,4 67,2 739,5 69,7 755,1 1,1 15 789,9 52,7 791,0 59,3 802,5 31,2 802,4 39,7 811,3 32,1 16 820 0,6 831,5 3,8 821,8 9,6 829,1 4,8 842,2 25,5 17 865,8 0,1 876,1 0,9 861,7 0,3 865,1 0,0 866,1 0,3 18 887,7 0,9 899,0 0,6 906,1 6,0 905,9 6,8 876,0 0,4 19 907,1 8,3 905,8 9,1 923,6 17,7 923,9 11,9 906,2 8,1 20 928,6 13,4 927,0 15,7 940,5 0,1 938,1 0,6 927,2 9,9 21 977,2 0,3 978,7 0,5 967,2 2,0 967,2 1,3 980,4 0,2 22 993,9 0,1 997,6 0,0 992,7 0,1 997,3 0,1 1002,5 0,0 23 1004,9 3,5 1005,9 7,0 1029,2 5,0 1027,5 33,2 1008,6 15,2 24 1039,7 29,8 1023,9 30,4 1040,2 29,4 1040,1 5,2 1035,1 37,3 25 1059,9 7,6 1061,1 8,5 1047,8 6,9 1048,6 9,4 1068,3 0,4 26 1085,9 2,7 1083,0 1,4 1081,9 1,1 1080,9 1,0 1092,6 0,3 27 1110,9 18,3 1101,8 10,7 1107,7 8,1 1104,1 10,3 1103,3 4,6 28 1127,5 4,3 1125,8 9,4 1142,6 9,2 1146,1 4,1 1122,1 3,8 29 1176 7,6 1175,8 3,6 1179,7 6,9 1179,6 7,0 1181,6 2,4 30 1189,8 7,5 1181,8 8,9 1216,7 3,2 1215,9 5,5 1236,8 1,8 31 32 1248,2 1287,6 4,2 1,1 1237,4 1285,1 3,6 2,6 1246,8 1277,6 2,1 4,1 1247,4 1279,3 0,3 4,5 1247,2 1271,9 13,1 2,2 33 1319,8 2,6 1303,6 17,5 1307,5 8,0 1304,3 5,2 1307,7 5,6 34 1323,2 17,0 1333,2 2,3 1370,7 3,0 1372,7 5,8 1360,5 0,9 35 1422,8 0,5 1417,3 0,0 1410,0 1,6 1408,5 1,7 1416,4 0,9 36 1469,8 39,3 1458,7 24,3 1445,4 14,7 1463,3 16,4 1449,9 13,0 37 1482,4 23,4 1503,5 18,7 1509,2 12,0 1492,0 17,5 1501,9 21,8 38 1519,7 61,6 1518,5 78,8 1526,9 30,2 1529,9 20,6 1533,4 20,3 39 1600,8 24,6 1592,7 15,7 1597,9 9,6 1595,2 8,3 1583,0 14,5 40 1604,5 2,7 1621,4 46,7 1612,3 4,2 1616,9 6,9 1613,8 13,3 41 1625,4 105,9 1633,0 78,5 1633,0 4,4 1631,9 3,8 1637,5 142,1 42 3142,9 24,5 3144,1 23,6 3152,3 10,9 3149,8 20,7 3146,1 29,8 43 3171,1 6,2 3170,7 8,5 3172,5 18,7 3154,2 3,5 3148,8 13,2 44 3190,6 15,9 3191,9 14,1 3175,0 1,9 3181,2 14,9 3187,4 9,2 45 3196,9 6,5 3203,7 2,2 3189,9 13,3 3198,9 4,7 3202,7 2,6 46 3240,9 4,6 3244,5 3,5 3243,5 6,6 3244,7 4,2 3245,3 3,6 47 3251,7 0,4 3266,5 0,4 3254,6 0,2 3256,0 0,0 3256,5 0,0 48 3275,6 0,0 3275,7 0,0 3277,6 0,5 3277,7 0,0 3276,9 0,0 57 Çizelge 3.16. Furil piridin molekülleri izomerleri B3LYP/6-311++G(2d,p) modelinde hesaplanan dalga sayısı ve şiddeti 1 2(3F)P Cis D.S 44,8 2(3F)P -C 2(3F)P Şiddet Trans D.S 0,2 31,7 2(3F)P-T Şiddet 0,2 3(3F)P Cis D.S -46,7 3(3F)P-C Şiddet 1,0 3(3F)P Trans D.S 51,3 3(3F)P-T Şiddet 1,4 4(3F)P Trans D.S 4(3F)P-T Şiddet -37,9 0,1 2 106,4 0,0 106,9 1,9 11,6 2,0 107,9 0,1 108,9 0,3 3 154,1 0,1 155,1 0,7 161,3 2,5 136,7 1,4 162,0 0,9 4 271,9 6,2 270,9 0,0 276,2 0,0 288,5 0,1 281,3 3,2 5 353,4 0,1 352,5 0,3 351,5 0,1 345,0 0,3 345,7 0,0 6 409,4 0,0 409,8 3,3 401,0 3,0 411,9 2,8 384,2 0,0 7 446,6 2,3 447,4 3,2 429,6 2,0 422,5 0,3 433,6 1,6 8 514,4 10,1 513,2 5,3 508,6 4,6 520,2 0,1 530,5 16,4 9 620,0 7,6 613,2 16,1 613,7 16,4 617,3 16,6 614,6 16,7 10 637,8 12,5 637,2 4,2 636,0 3,8 635,2 2,8 650,1 0,0 11 649,0 1,0 654,5 0,1 655,6 0,0 664,9 1,1 685,3 0,8 12 718,3 28,1 718,3 11,8 720,7 12,0 721,8 6,1 691,6 32,7 13 727,5 52,7 736,4 17,2 721,8 9,6 727,9 21,6 730,0 14,3 14 751,0 1,0 751,1 21,2 728,4 8,5 733,8 17,9 753,0 2,8 15 787,0 32,2 783,0 81,0 793,9 109,2 797,2 84,3 803,5 83,8 16 831,9 25,6 819,2 11,3 826,5 1,8 829,8 1,4 842,9 11,8 17 844,8 0,3 878,0 0,1 854,2 2,2 857,3 0,0 850,8 0,1 18 889,0 0,4 890,5 0,3 893,1 0,0 894,0 29,6 867,0 0,0 19 892,6 8,1 893,9 25,9 935,3 26,9 942,4 0,6 893,2 24,4 20 950,1 9,9 950,5 19,1 941,5 17,1 944,6 19,1 948,4 7,0 21 975,4 0,2 976,3 0,3 962,8 0,2 969,2 0,9 977,1 0,0 22 992,2 0,0 992,3 0,0 992,4 0,0 999,3 0,0 1000,5 0,0 23 1008,5 15,2 1009,0 3,0 1038,2 3,1 1034,0 2,8 1011,5 12,2 24 1034,9 35,3 1024,4 17,1 1042,0 19,2 1042,7 12,7 1037,9 17,9 25 1066,3 0,3 1065,0 8,5 1059,3 7,4 1059,5 14,2 1081,8 24,0 26 1084,1 0,3 1084,9 28,4 1086,8 29,1 1081,7 30,0 1096,7 1,5 27 1115,6 4,6 1117,3 10,4 1126,0 1,4 1123,4 0,1 1118,8 0,3 28 1140,7 3,8 1130,9 0,6 1145,7 0,5 1143,4 12,1 1128,4 7,3 29 1179,4 2,4 1179,9 5,0 1187,2 8,8 1185,5 55,0 1188,0 54,5 30 1184,4 1,7 1180,6 71,6 1222,9 75,9 1219,2 3,0 1249,7 0,2 31 1243,6 13,2 1256,4 1,2 1261,8 5,5 1257,0 2,6 1251,0 14,6 32 1282,7 2,1 1284,6 0,1 1280,6 0,0 1277,3 0,7 1278,2 0,7 33 1312,1 5,7 1315,6 2,5 1333,2 9,7 1328,7 0,4 1332,0 2,4 34 1343,0 0,9 1340,9 0,2 1359,6 0,1 1360,3 2,8 1351,3 1,8 35 1402,1 0,9 1396,3 9,5 1399,0 3,6 1392,4 3,1 1399,4 5,1 36 1465,9 13,0 1471,9 28,3 1452,6 16,0 1456,8 25,3 1454,2 16,1 37 1504,8 21,8 1499,9 13,3 1512,2 17,9 1504,8 1,5 1518,9 2,2 38 1538,1 20,1 1538,4 43,1 1541,2 49,6 1536,6 27,8 1546,0 17,8 39 1589,9 14,5 1604,7 26,0 1597,9 24,6 1593,9 12,6 1581,7 16,4 40 1624,1 12,9 1614,1 19,9 1617,3 27,7 1618,8 5,0 1617,5 5,8 41 1631,7 142,3 1629,8 119,2 1633,1 87,0 1633,0 5,5 1636,9 143,7 42 3142,6 27,9 3144,2 22,9 3151,0 23,1 3144,5 16,3 3144,7 27,8 43 3168,6 15,4 3167,8 6,9 3157,3 5,1 3152,3 12,7 3147,4 12,5 44 3189,3 9,1 3185,4 17,5 3171,4 15,2 3170,8 11,6 3184,2 12,0 45 3195,2 2,7 3193,6 6,6 3188,0 10,1 3188,2 13,5 3190,2 8,6 46 3247,1 3,7 3262,2 0,9 3250,6 1,3 3245,1 0,6 3250,7 0,7 47 3277,9 0,0 3270,3 0,0 3274,4 0,6 3271,4 0,4 3274,7 0,4 48 3292,0 0,0 3282,5 3,1 3280,3 0,6 3277,9 0,1 3281,0 0,2 Şekil 3.19. 2-(2-furil) piridin a) cis ve b) trans konformasyonlarının B3LYP/6-311++G(2d,p) modeli ile IR Spektrumu (b) (a) 58 Şekil 3.20. 3-(2-furil) piridin a) cis ve b) trans konformasyonlarının B3LYP/6-311++G(2d,p) modeli ile IR Spektrumu (b) (a) 59 Şekil 3.21. 4-(2-furil) piridin a) cis ve b) trans konformasyonlarının B3LYP/6-311++G(2d,p) modeli ile IR Spektrumu (b) (a) 60 Şekil 3.22. 2-(3-furil) piridin a) cis ve b) trans konformasyonlarının B3LYP/6-311++G(2d,p) modeli ile IR Spektrumu (b) (a) 61 Şekil 3.23. 3-(3-furil) piridin a) cis ve b) trans konformasyonlarının B3LYP/6-311++G(2d,p) modeli ile IR Spektrumu (b) (a) 62 Şekil 3.24. 4-(3-furil) piridin a) cis ve b) trans konformasyonlarının B3LYP/6-311++G(2d,p) modeli ile IR Spektrumu (b) (a) 63 64 4. SONUÇ Bu tez çalışmasında konformasyonları olan furil piridin molekülünün izomerleri ve uygun 2-(2-furil) piridin, 2-(2-furil) piridin trans, 3-(2-furil) piridin, 3-(2-furil) piridin trans, 4-(2-furil) piridin, 4-(2-furil) piridin trans, 2-(3furil) piridin, 2-(3-furil) piridin trans, 3-(3-furil) piridin, 3-(3-furil) piridin trans ve 4-(3-furil) piridin, 4-(3-furil) piridin trans moleküllerinin yapısal, elektronik ve çizgisel olmayan optik özellikleri ab inito metotlarından B3LYP/ 6-311++G(2d,p) metodu ile incelenmesi yapılmıştır. Hesaplamalarda DFT metodları kullanılmasının nedeni, deneysel hesaplamalara en uygun sonuçları elde etmeyi hedeflemektir. Sterik etki nedeniyle, moleküller arasındaki yapısal ve çizgisel olmayan optik özelliklerin değişimleri, açıya bağlı enerji değişimleri, polarizebilite, hiper polarizebilite ve anizotropik polarizebilite değerlerinin değişimleri her bir izomer içini izomerin farklı konformasyonları için hesaplanması ile Furil Pirindin molekülünün genel karakteristiği elde edilmiştir. Bu sayede bu molekülün farklı izomerleri için hesaplanan enerji değerleri 00 civarlarında minimum, 900’de ise maksimum değere ulaştığı gözlemiştir. Molekülün polarizebilitesi hesaplanarak, bir elektrik alan altında molekül üzerinde oluşabilecek değişimler incelenmiştir. Buna ek olarak molekülün hiperpolarizebilite değerleri farklı konformasyonlar için hesaplanarak molekülün fotonik teknolojiye uygun olduğu sonucu ortaya çıkmıştır. Bu sonucu HOMO-LUMO enerjileri de sterik etkinin molekül polarizebiliteye olan etkisini gösterir. 65 KAYNAKLAR 1. Iliescu, T., Irimie F.D, Bolboaca M., Paisz Cs., Keifer W., “Surface enhanced Raman spectroscopy of 5-(4-fluor-phenyl)-furan carbaldehide absorbed on silver colloid” Vibrational Spectroscopy, 29:251-255 (2002). 2. Höltje H.D., Sippl W., Rognan D., Folkers G., “Moleculer Modelling” , 2nd ed. John Wiley& Sons Ltd.,New York 18-78 (2003). 3. Çelik, İ, Akkurt, M., İde, S., Tutar, A. And Çakmak, O., "C7H8Br4 Molekülünün Konformasyon Analizi ve Kuantum Mekanik Yöntemle Optimizasyonu, Elde Edilen Elektronik ve Yapısal Parametrelerin X- ışınlan Yapı Analiz Sonuçlan ile Karşılaştırılması", Gazi University Journal Science. , 16 (l):2735,a(2003). 4. Jensen, F., " Introduction to Computational Chemistry ", John Wiley & Sons Ltd. , New York, 26-38 (1999). 5. Pople,J.A., Krishnan, R.,Schlegel,H.B., Binkly, J.S., John Wiley& Sons Ltd., New York, 26-38 (1999). 6. Pulay, P., " Analytical derivative methods in quantum chemistry, Ab initio Methods in Quantum Chemistry- 11", Ed. By K.P. Lawley, John Wiley & Sons Ltd., New York, 43-78 (l 987). 7. Grein,F., “New theoertical studies on the dihedral angle and energy barriers of biphenyl”, Journal of Moleculer Structure (Theocem) 624:23-28 (2003). 8. Göller, A., Grummt, U.W., “Torsional barries in biphenyl, 2,2’-bipyridine and 2phenylpyridine”,Chemical Physics Letter 312:399-405 (2000). 9. Sancho-Garcia, J.C., Karpfen,A., “ Conformational analysis of 2,2’ - bifuran: correlated high - level ab initio and DFT results”, Theor Chem Acc, 115:427 433 (2006). 10. Duarte ,H.,A., Duani,H.,Almeida,W., “Ab initio correlated comparative study of the torsional potentials for 2,2’-bipyrrole and 2,2’-bifuran five membered heterocyclic dimers”, Chemical Physics Letters 369:114-124 (2003). 11. Lukes,V., Breza, M., Biskupic, S., “Structure and electronic properties of bithiophenes. I.Torsional dependence”, Journal of Molecular Structure (Theochem)a618:93-100a(2002). 12. Becke, A.D., “Density functional thermochemistry. III. The role of exact Exchange”.aJ.Chem,aPhys.,a98:5648-5660,a(1993). 66 13. Bahat, M., " Kinazolin molekülünün kuvvet alanının DFT B3LYP/6-31G* tabanlı SQM metodu ile hesabı ve bazı Hoffinan - tipi komplexlerin titreşimsel spektroskopi ile incelenmesi " , Doktora Tezi . Gazi Üniversitesi Fen BilimleriAEnstitüsü,aAnkara,a20-50a(2000). 14. Cebe, M. , "Atom ve Molekül Kimyası ( Kuantum Kimyası )", Yayınları,aUludağaÜniversitesiaBasımevi,aBursa,a577a(1998). Vipaş 15. Aygün, E., Zengin, M. D., "Atom ve Molekül Fiziği", Ankara Üniversitesi Fen Fakültesi Fizik Bölümü, Bilim yayınları, Ankara, 233-252 (1998). 16. Koksal, F., " Fenciler İçin Kuantum Kimyası " , Ondokuz Mayıs ÜniversitesiaYayınları,aSamsun,a237-290a(1992). 17. Dıtchfıeld, R., W.J.Hehre, J.A. Pople, " Self consistent molecular orbital methods .IX. An expected Gaussian type basis for moleculer orbital studies of organic molecules”, J.Chem.Phyes.,54(2):724-732 (1971). 18. Grein,F., “New theoretical studies on the dihedral angle and energy barriers of biphenyl” Journal of Molecular Structure (Theochem) 624: 23-28 (2003). 19. Born, M., R. Oppenheimer, " Quantum theory of molecules ", Ann. Phys., 84: 457-464(1927). 20. Duarte H.A., H. Duani, Wagner B. De Almeida, "Ab inito correlated comparative study of the torsional potentials for 2.2'-bipyrrole and 2.2'-bifuran five membered heterocyclic dimers ", Chemical Physics Letters 369: 114-124 (2003). 21. Miehlich, B., Savin, A., Stoll, H., Presuss, H., "Results obtained with the correlation energy density functional of Becke and Lee, Yang and Parr", Chem. Phys. Lett., 157(3): 200-2007 (1989). 22. Hehre, W J.,Radom, L., Schleyer,P., "J.A. Pople, Abinito Molecular Orbital Theory”, John Wiley & Sons Ltd, New York, 52 (1986). 23. Parr, R.G., Yang, W. , " Density Functional Theory “, Oxford University Press, England, 18(1989). 67 ÖZGEÇMİŞ Kişisel Bilgiler Soyadı, adı : YÖRÜK, Emre Uyruğu : T.C. Doğum tarihi ve yeri : 30.01.1978 Ankara Medeni hali : Bekar Telefon : 0 (312) 496 18 62 Faks : 0 (312) 496 18 65 e-mail : [email protected]. Eğitim Derece Eğitim Birimi Yüksek lisans Gazi Üniversitesi /İleri Teknolojiler Mezuniyet tarihi Bölümü Lisans Gazi Üniversitesi/ Fizik Bölümü 2000 Lise M.E.Resulzade Anadolu Lisesi 1996 İş Deneyimi Yıl Yer Görev 1997-1999 Eşe Tekstil Ltd.Şti Kurucu-Şirket Ortağı 1999-2002 Madcom Bilgisayar Ltd.Şti Kurucu-Şirket Ortağı 2002-2006 Bey Bilgisayar Ltd.Şti Kurucu-Şirket Ortağı Yabancı Dil İngilizce Hobiler Bilgisayar teknolojileri, Futbol, Boks, Müzik 68