BÜYÜME HORMONLARI: OKSİN, GİBERRELLİN VE SİTOKİNİN HORMONLARA GENEL BAKIŞ Büyüme, gelişme ve farklılaşma Morfogenez Çevresel ve bitkisel faktörler-uyartıların taşınması Sachs’ın deneyleri Fitohormonlar (içsel ve dışsal hormonlar) Hormon tanımı Sentetik hormonlar Büyüme düzenleyicileri veya regülatörleri Oksinler, giberellinler, sitokininler, Etilen ve absisik asit Brassinosteroidler, poliaminler, jasmonik asit, salisilik asit Biyosentez yerleri Taşınım şekilleri Fizyolojik Etkileri Hormon Öncül maddeleri Oksin Triptofan Büyüyen tohumlar, genç yapraklar ve yaprak primordiyumları Hücreden hücreye polar taşınımla aktarılırlar Meyve gelişiminin uyarılması, çiçeklenme uyarılması (ananas) veya inhibisyonu, etilen sentezinin uyarılması, apikal dominansi devamı, tropizma cevapları, vasküler doku farklılaşmasının uyarılması, adventif kök uyarımı, yaprak ve meyve absisyonunun inhibisyonu Sitokinin Adenin ve fenil üre türevleri Kök uçları Kökten gövdeye ksilemle taşınırlar Hücre bölünmesinin ve doku kültürlerinde kök oluşumunun uyarılması, yaprak senesensinin geçiktirilmesi, apikal dominansinin çözülmesi Giberellin Mevalonik asit Büyüyen tohumların ve gövdenin genç dokularında, kökte sentezlenip sentezlenmediği bilinmemektedir Ksilem ve floemle taşınırlar Hücre bölünmesi ve uzamasını uyararak gövdede aşırı bir uzama sağlar. Cüce bitkilerin aşırı uzaması ve tohum çimlenmesinin uyarılması, iki yıllık ve uzun gün bitkilerinde çiçeklenmenin uyarılması, Hububatlarda tohum enzimlerinin üretiminin kontrolü Etilen Metiyonin Stres altındaki, senesens ve olgunlaşan dokular Difüzyon ile taşınırlar Meyvelerin olgunlaşması, yaprak ve çiçek senesensi, yaprak ve meyve absisyonunun uyarılması Absisik asit Mevalonik asit Olgun yapraklar ve özellikle su stresli dokular, tohumlar Yapraklard an diğer organlara floemle taşınırlar Stoma kapanması, yapraklardan büyüyen tohumlara fotosentetik ürün taşınımının ve embriyogenezin uyarılması, tohumlarda depo proteinlerin sentezinin uyarılması, belirli türlerde tohum ve tomurcuk dormansilerinin devam ettirilmesi veya BİTKİSEL VE HAYVANSAL HORMONLAR • • • • Hormon reseptörleri Protein, peptid, aminoasit türevi, steroid Molekük ağırlığı Somatotropin 191 aa (25000 Da), epinefrin 183 Da • Etilen 28 Da, Giberellik asit 346 Da • Düşük konsantrasyon • Taşınım HORMONLAR VE SİNYAL İLETİMİ • • • • Sinyalin alınması-reseptörler Plazma zarı, tonoplast, ER, nükleus Protein kinaz ve protein fosfatazlar Transkripsiyon faktörleri-fosforilasyon OKSİNLER Charles Darwin, Boysen-Jensen, Paal Went deneyleri AUXINE = BÜYÜME OKSİNLERİN BİTKİLERDE DAĞILIMI VE OKSİN TİPLERİ • Gelişmiş bitkiler, mantarlar ve bakteriler • Kök ve gövde uçları, kambiyal dokular, meyve, çiçek, yaprak meristemleri • Taşınım • Indol-3-asetik asit (IAA) • IAA = Indol halkası + asetik asit yan zinciri Tabii Oksinler Sentetik Oksinler Indol-3- asetik asit (IAA) 2-4-Diklorofenoksi asetik asit (2,4-D) Indol-3-bütirik asit (IBA) -Naftalenasetik asit (-NAA) 4-Kloroindol-3-asetik asit (4 Cl- 2-Metoksi-3,6-diklorobenzoik IAA) kamba) Fenil asetik asit (FAA) (Di 2,4,5-Triklorofenoksiasetik asit (2,4,5,-T) N,N-Dimetiletilthiokarbamat N,N-dimetiletiltiokarbamat • Herbisit • Antioksinler asit BAĞLI (KONJUGE) VE SERBEST OKSİNLER • • • • • • • IAA esterleri: Glukoz, miyoinositol Glukanlar, glukoproteinler Bağlanma = İnaktivasyon Oksin homeostatisi Taşınma Bozulmaya karşı korunma Depolanma OKSİN KONSANTRASYONUNUN BELİRLENMESİ 1- Avena koleoptil kıvrılma testi: 0,02-0,2 mg/L 2- Koleoptil büyüme testi: 3- Analitik teknikler: 10-12 g, TLC, HPLC, GC, MS 4- Immünolojik analizler: 10-9 g (=1 ng) 5- Radyolojik yöntemler: 2H veya 15N OKSİNLERİN TAŞINMASI • • • • • Aktif ve pasif taşınım Kök ve gövdede lateral ve longitüdinal Gövde ucu, kökler Işık ve yerçekimi Gelişim evresi, doku ve organ tipi 1- Tek yönlü polar taşınım: ENERJİ 2- Polar olmayan pasif taşınım: FLOEM - Koleoptil veya gövdede BAZİPETAL ↓ - Köklerde AKROPETAL ↓ - Yerçekimi etkisi yok Solunum inhibitörleri Bazipetal taşınım daha baskın Endosperm-koleoptil ucu POLAR OKSİN TAŞINIMININ DÜZENLENMESİ Apoplastik asidifikasyon Kök ve gövdede kambiyum ve genç floem Yerçekimi Flavonoidler AUX1 geni Oksin – proton simportu – hücreye giriş PIN1 ve PIN2 geni – hücreden çıkış ABCB genleri Naftilfitalamik asit (NPA), 2,3,5 triiyodobenzoik asit (TIBA), 2-karboksifenil-3-fenilpropan-1,3dion (CPD)→Çıkış inhibitörü Naftoksiasetik asit (NOA) → giriş inhibitörü OKSİN BİYOSENTEZİ 1 2 3 1: Triptofan aminotransferaz 2: Indolpürivat dekarboksilaz 3: NAD indolasetaldehit dehidrogenaz veya indolasetaldehit oksidaz OKSİNLERİN OKSİDASYONU • • • • • Peroksidaz (POD) grubu enzimler Serbest IAA 1/α Peroksidaz aktivitesi Fotooksidasyon Riboflavin Oksindol-3-asetik asit ve 3-metilenoksindol OH POD 3-metilen oksindol CO2 O oksindol-3-asetik asit FARKLI DOKULARIN OKSİNE VERDİKLERİ CEVAPLAR • • • • • • Hücre uzaması ve genişlemesi Fizyolojik aralık 10-11-10-4 M Köklerde 10-9-10-7 M Köklerde 10-6-10-4 M Gövdede 2x10-5 M ETİLEN OKSİNLERİN FİZYOLOJİK ETKİLERİ 1- Hücre seviyesinde - Genişleme - Hücre bölünmesi - Su alınımı - Sitoplazmik hareketler 2- Doku seviyesinde - Vasküler farklılaşma 3- Organ seviyesinde - Meyve büyümesi ve absisyonu - Ovaryum gelişimi - Köklenme, kök uzaması - Apikal dominansi - Yaprak genişlemesi - Yaprak absisyonu - Gövde uzaması - Organ ve doku yaşı - Oksin konsantrasyonu - Oksin tipi - Diğer hormonlarla ilişkisi - Dokunun durumu OKSİNLER-ÇEPER GENİŞLEMESİ Oksin uyarısı HÜCRE ÇEPERİ Plazma membranı Hücre çeperi Aktiv asyon Ekspansin SİTOPLAZMA Selüloz molekülü OKSİNLER-KÖK VE YAPRAK BÜYÜMESİ • • • • Çeper asidifikasyonu Oksin etilen etkileşimi Etilen inhibitörleri Yaprak damarlarının büyümesi OKSİN-LATERAL TOMURCUK BÜYÜMESİ • Apikal dominansinin devamı • Thimann ve Skoog (1934)-oksin konsantrasyonu • Gövde büyümesi – Tomurcuklarda inhibisyon • Gövde ucunun koparılması-Lateral tomurcuklarda oksin artışı • Gövde ucunun koparılması-Lateral tomurcuklarda ABA azalması OKSİNLER-LATERAL KÖK OLUŞUMU • • • • 10-6 M, primer ve lateral kökler Perisikl Oksin-hücre bölünmesi • Kesme, yaralanma • Arabidopsis’in alf mutantları OKSİNLER-MEYVE GELİŞİMİ • Meyve büyümesi-polenlerdeki oksinler • Tohumlar • Partenokarpik meyve oluşumu • Oksin-etilen etkileşimi 1) Oksinler akenlerde üretilir. 2) Oksinler taşınabilir. 3) Oksin, reseptakulum dokusunda hücre genişlemesi ve büyümesini başlatır. OKSİNLER-YAPRAK ABSİSYONU • Yaprak, çiçek ve meyve absisyonu • IAA’nun uygulanma zamanı • Yaprak-yaşlanma-oksin azalır-senesensabsisyon • Tozlaşma-döllenme-oksin üretimi-absisyon yok • Döllenme yok-etilen artışı-absisyon OKSİNLERİN TİCARİ KULLANIMI • • • • • • • Köklendirme Ananasta çiçeklenmeyi uyarma Meyve ve yaprak absisyonunu önleme Partenokarpi Meyve seyrekleştirme Herbisit Sentetik ve doğal oksinlerin etki derecesi OKSİNLERİN ETKİ MEKANİZMASI • • • • • Epidermis Bekleme periyodu Kararlı periyot Siyanit ve azid inhibisyonu Protein sentez inhibitörleri OKSİNLER- GEN EKSPRESYONU • AUX/IAA ve SCFTIR-reseptörler • ARF (auxine response factor)-transkripsiyon faktörleri • Oksin yoksa; • AUX/IAA + ARF → OKsin genlerinin inhibisyonu AUX/IAA OKSİN ARF SCFTIR PARÇALANMA Gen ekspresyonu AUX/IAA ARF AuxRe (oksin cevap elementi) ARF GELİŞİMSEL CEVAPLAR DNA • • • • ABP1 (auxine binding protein) – oksin reseptörü Fosfolipaz A2 AUX/IAA, SAUR ve GH3-erken cevap genleri Glutatyon-S-transferaz – geç cevap genleri GİBERELLİNLER 1950 Kimyasal yapı belli Biyolojik aktivite???? Boyuna büyüme (uzama) Cücelik genleri GİBERELLİNLERİN AKTİVİTESİ Hidroksil (OH) gruplarının yerleşimi GA1, GA3, GA19, GA4, GA7 GA1, dönüşüm ve cücelik Cüce bitkilerde GA20 Aktivite olarak GA1 > GA20 GA3 mantarlarda Giberellinler-glukoz (COOH grubu; giberellin glukozitleri) Giberellinler-glukoz (OH grubu; giberellinglikosil esteri) Giberellin glukozidleri inaktif – DEPO?? ent-giberellan iskeleti GA1 (19-C) GA37 (20-C) GA3 GA20 (19-C) GA27 (20-C) GİBERELLİNLERİN KEŞFİ Ascomycetes, Giberella fujikuroi Bakanea (aptal fide) hastalığı 1930’da kristal formda izolasyon→giberellin A1 Karboksilik asit Giberellin A3 (GA3) Cüce, rozet formunda ve uzun bitkiler Tohumlar GAx GİBERELLİNLERİN HAREKETİ Ksilem ve floem Taşınım genç dokulara doğru Çimlenen tahıl tohumlarındaki hareket Skutellum → Alevron tabakası GİBERELLİNLERİN BİYOSENTEZİ İzopren birimleri 4 izoprenoid birimi, 20 C’li terpenoidler GA12-aldehit → ÖNCÜ MADDE Hidroksilasyon ve oksidasyon 19 C’li giberellinler Sentez-enzimatik reaksiyonlar Tohumlar (10-100 mg/g) Genç yapraklar, tomurcuklar Sentez ve aktivasyon yerleri Plastid Endoplazmik retikulum Sitosol Giberellinlerin Tayini • UV ışınlarını absorbe etmezler • Floresans özellikleri yok • • • • • Kağıt kromatografisi İnce tabaka kromatografisi HPLC, GC, MS Reseptörler İmmünolojik analizler BİYOLOJİK ANALİZLER 1- Marul hipokotil uzama testi 2- Cüce pirinç mikrodamla testi 3- Hububat tohumlarında -amilaz testi GİBERELLİNLERİN FİZYOLOJİK ETKİLERİ 1- Gövde uzaması - Le ve le genleri - Normal bitkilerde GA1 fazla - Le geni: GA20 → GA1 2- Cüce bitkilerde boy uzaması B A C D Şekil 1. (A) Cüce mutant (-GA1); (B) Cüce mutant (+GA1); (C) Normal genotip (-GA1) ve (D) Normal genotip (+GA1). • • • • • GA-uzama-açık yeşil-ince gövde-küçük yaprak GA-20-oksidaz, GA-3-oksidaz GA-2-oksidaz Işık-sıcaklık GA-absisik asit (ABA) 3- Uzun gün bitkilerinde boy uzaması - Aydınlıkta gövde uzaması yavaş, GA1 fazla Aydınlık-GA duyarlılığı Çiçeklenme için uzun gün Kısa gün, GA20 GA19 Uzun gün GA20 GA19 Uzun gün koşullarında GA19 → GA20 4- Gençleşmeyi uyarır - Odunlu çok yıllık bitki - Hedera helix → GA3 gençleşme - Koniferlerde → GA4 + GA7 → generatif evreye geçiş ve üreme 5-Çiçeklenmeyi uyarır • Marul, ıspanak 6- Vernalizasyon • Çiçeklenme uyarısı • Kışlık bitkiler • İki yıllık bitkiler 7- Erkek çiçek oluşumu • • • • Erkek çiçek oluşumu Polen gelişimi GA-GAMYB transkripsiyon faktörleri gamyb mutantları-küçük ve polensiz çiçek 8- Meyve oluşumu ve büyümesi OKSİN-GİBERELLİN ETKİLEŞİMİ • Sentez uyarımı • Oksin-GA3oks transkripsiyonu • Oksin-GA2oks inhibisyonu 9- Sel stresi ve gövde uzaması • Çeltik • DELLA proteinleri-GA duyarlılığını azaltır 10- Hücre bölünmesi ve uzaması • • • • • • • • • • • • GA-Hücre sayısı ve boyutları artar Subapikal meristemler Sikline bağımlı protein kinazlar (CDP) G1-S ve G2-M Çeper yumuşaması ve su alınımı GA-oksinler-çeper asidifikasyonu?????? Ksiloglukan endotransglikosilaz/hidrolaz Çeper yumuşatıcı enzim GA-XETH genlerinin uyarılması GA- Ca+2 miktarı GA-çeper sentezinin uyarılması Peroksidaz inhibisyonu 11- Çimlenmeyi uyarır • Stratifikasyon • Işık-GA20 → GA1 dönüşümü-çimlenme • Işık- GA-GA3ox geninin uyarılması -amilaz GA3 GA7 GA-reseptör-DELLA proteinlerinin bozulmasıGAMYB ekspresyonu-α-amilazın transkripsiyonuCa+2 birikimi-α-amilazın endosperme taşınması Giberellinlerin moleküler etki mekanizması • GID1 proteinleri-GA reseptörü • GA yoksa DELLA proteinleri GAMYB ekspresyonunu önler • GA varsa; GA+GID1+DELLA-GAMYB geni aktifleşir-GA cevabı oluşur Giberellinlerin Ticari Kullanımları 1- Meyve üretimi 2- Arpanın maltlaşması 3- Şeker kamışı verimi 4- Bitki ıslahı: Koniferler 5- Giberellin sentez inhibitörleri SİTOKİNİNLER Bitki hücrelerinde bölünmenin uyarılması Kesik organlarda senesensin geciktirilmesi Kotiledon genişlemesi Kloroplast olgunlaşması Besin maddelerinin taşınması Morfogenez SİTOKİNİNLERİN KEŞFİ Domates suyu, maya ekstraktları Hindistan cevizi sütü Olgun ve farklılaşmış hücrelerde bölünme Kallus oluşumu KİNETİNİN KEŞFİ F. Skoog (1945-1955) İletim dokusu + öz dokusu + oksin→BÖLÜNME Vasküler doku yoksa bölünme yok Adenin, nükleik asitler Otoklav edilmiş ringa balığı sperm DNA’sı 6-furfurilaminopürin (kinetin) Kinetin=yapay sitokinin ZEATİNİN KEŞFİ Olgun olmayan mısır tohumu ekstraktları Zeatin=doğal sitokinin 6-AMİNOPÜRİN TÜREVİ Pürin + riboz → zeatin ribosit Pürin + fosforik asit → zeatin ribotid Pürin + glukoz → zeatin glukosid Benzil aminopürin (BAP) → sentetik sitokinin SİTOKİNİNLERİN BELİRLENMESİ HPLC Kütle spektroskopisi İmmünolojik metodlar Gaz kromatografisi Biyolojik analizler - Genişleme testleri - Senesensin geciktirilmesi SİTOKİNİNLERİN HÜCREDE BULUNMA ŞEKİLLERİ Serbest sitokininler Bağlı sitokininler Yüksek bitkilerde zeatin, dihidrozeatin ve izopentil adenin t-RNA SİTOKİNİNLERİN DAĞILIMI Kök uçları, büyüyen meyveler, çimlenen tohumlar, embriyo Kök nodülleri (bakteri+bitki) Ksilem ve floem sıvısında Genç yapraklarda Dormansi-sitokinin miktarı Yaprak yaşı Bakteri, mantar, algler, kara yosunları, eğreltiler, açık ve kapalı tohumlular Kök nematodları SİTOKİNİNLERİN TAŞINIMI Kök apikal meristemleri Köklerden yapraklara pasif taşınım Transpirasyon akımı Ksilem sıvısı Su stresi Nükleotid??? Zeatin ribosit Sitokinin üretimi • Kültüre alınmış hücreler • Kallus oluşumu • Alt kültür-oksin ve sitokinin üretimi tümör dokusu Kültür ortamı ÇOĞALMA • Ti plazmidi+bitki genomu • Oksin ve zeatin genleri • Trp→oksin dönüşümü SİTOKİNİNLERİN BİYOSENTEZİ Serbest sentez t-RNA’ya bağlı sentez Sitokinin sentaz-kloroplastlar SİTOKİNİNLERİN FİZYOLOJİK ETKİLERİ 1- Hücre genişlemesi - Kotiledonlar - Çeper asidifikasyonu yok 2- Hücre siklusunun kontrolü G1-S-G2-M G1-sitoplazmik kütle artışı S-DNA replikasyonu Oksin+sitokinin-hücre bölünmesi Oksin ve sitokinin yoksa, G1 veya G2’de durur 3- Morfogenez 4- Senesensin geciktirilmesi ve besinlerin hareketi 5- Lateral tomurcuk üzerindeki etkisi • Sitokinin/Oksin yüksekse tomurcuk gelişimi • Eksojen sitokinin-tomurcuk gelişimi • Apikal dominansi 6- Nodül oluşumu • Sitokinin-nodülin genlerinin aktivasyonu 7- Kök ve sürgünlerde hücre bölünmesi • KNOX genleri-IPT genleri-sitokinin sentezi • KNOX genleri-GA20oks genleri-sitokinin/GA oranı yüksek- yaprak primordiyumlarına dönüşüm engellenir Sitokininler-kök ve gövde apikal meristemleri • Köklerde vasküler doku farklılaşması • Sitokinin yüksek-farklılaşma hızlı-büyüme yavaş • Sitokinin az-farklılaşma yavaş-büyüme hızlı Sitokininlerin moleküler etki mekanizması • • • • • • • • • AHK2 ve AHK3 genleri-reseptör proteinleri ARR genleri (Arabidopsis response regulator) LHCB ve SSU genleri-ışıkla regüle edilir Nitrat redüktaz geni Sitokrom P450 geni Peroksidaz genleri Savunma genleri AHP geni (Arabidopsis histidin fosfotrenfer) Sitokinin+CRE1→B tipi ARR proteinlerin aktivasyonu →A tipi genlerin aktivasyonu