PH–113 Evcil Kanaryada (Serinus canaria

advertisement
PH–113
Evcil Kanaryada (Serinus canaria domestica) DNA-Eşey Tayini
Didem Molla, Sıla Toksöz, Zeynep Yurtkuran, Banu Avcıoğlu Dündar
Biyans Biyolojik Ürünler Ar-Ge Danışmanlık Ltd.Şti., [email protected]
Amaç: Çalışmada, kuşlardaki W ve Z kromozomları üzerinde bulunan kromo-helikaz-DNA
bağlayıcı (chromo-helicase-DNA binding, CHD) geni kullanılarak evcil kanaryalarda erken evrede
ve zarar verilmeden eşey belirlenmesi amaçlanmaktadır.
Gereçler ve Yöntemler: Ankara’daki kanarya yetiştiricilerinden çeşitli yaş evresindeki evcil
kanaryalardan birkaç adet tüy alınmıştır. Tüylerin deriye bağlanan kısmından 2-5 mm boyunda
kesit alınmış ve birkaç parçaya bölünerek proteinaz K çözeltisinde eriyinceye kadar bekletilmiştir.
Ardından, fenol-kloroform-isoamilalkol yöntemiyle DNA izolasyonu yapılmıştır. P2 (Griffiths,
R ve Tiwari, B. 1995) ve P8 [Griffiths ve ark., 1998) primerleri kullanılarak PCR yapılmış ve
bant farklıklıkları agaroz jelde gözlemlenmiştir. Ayrıca, kanaryaların CHD gen sekansını bulmak
ve özgü primer çifti tasarlamak için, yakın türlerin CHD gen dizileri karşılaştırılmış ve dejenere
primerler tasarlanmıştır. PCR’la çoğaltımın ardından, T/A klonlama vektörüne klonlanarak, DNA
dizi analizi yapılmıştır.
Bulgular: Kökeni kesin olarak bilinen iyi durumdaki dökülmüş tüylerden de, PCR için yeterli
miktarda ve kalitede DNA elde edilebilmekte ve eşeyi doğru olarak gösterebilmektedir. P2 ve P8
primer çifti, agaroz jelde gözlemlemeyi zorlaştıracak yoğunlukta, ancak beklenilen boya yakın
olmak üzere erkek kuşlarda tek, dişi kuşlarda çift bant vermiştir. Bunun üzerine, İspinozgiller
(Fringillidae) ailesine ait CHD gen parçaları taranmış ve yakın akraba türlere ait diziler sıralanarak
dejenere primer tasarlanmıştır.
Sonuç ve Tartışma: Kanaryalara ait herhangi bir CHD gen dizisine rastlanmamıştır. Papağangillerin
CHD geniyle eşey belirlenmesinde oldukça iyi sonuç veren P2 ve P8 primer çiftinin kanaryada PCR
optimizasyonunda güçlükler yaşanabilmektedir. İspinozgillere yönelik olarak tasarlanan dejenere
primerlerle PCR’la çoğaltımın ardından, T/A klonlama vektörüne klonlanarak, DNA dizi analizi
yapılacaktır.
Anahtar Kelimeler: Evcil kanarya, Serinus canaria domestica, “chromo-helicase-DNA binding”
geni, CHD, W kromozomu
Teşekkür: Gökhan Canlı ve Özgün Sözüer’e katkılarından dolayı teşekkür ederiz.
1418
21. Ulusal Biyoloji Kongresi, 03–07 Eylül 2012, Ege Üniversitesi, İzmir, Türkiye
http://www.ubk2012.ege.edu.tr
Download