GAzl üNlVERslTEsl BlLlMsEL ARAşT|RMA PRoJELER| lHTlYAç

GAzl üNlVERslTEsl
BlLlMsEL ARAşT|RMA PRoJELER| lHTlYAç FoRMu
elRlı,ü|lve
PRoJE YöNErlclslNlN ADl soYADl
BöLüMü
TAR|Hl
No
1610312017
1
PRoF.DR. GöNEN özcAN
Diş Hekimliği Fakültesi
Temel Dişhekimliği Bilim.
TEL | 203423244 45
GAzl oNlVERslTEsl REı(TöRLOĞO,NE
(Bilim8ol Araştrma Projeleri Bİdml)
'03/201743' kodlu ve 'ozon
Gaz ıryguhmala$nln Poıi.lmplant tsln Tedavislndold
Etldnllğlnln D€ğo[l€rıdldlm*r
konulu projem
için zorunlu olan aşağlda cinsi, miktarl ve özellikleri yazlll toplam 2 kalem hazmetin / malzemenin / teçhizatn tahsis edilen
ödenekten temin edi|mesi için bilgi|erinizi Ve gereğini arz ederim.
oo
imza
slra
No
Malz€m€nin
cinsi
Miktarl
öls,
Özelliği
Birimi
1)
Rna izolasyon kiti;
50 örnekten RNA izolasyonuna imkan sağlayacak
miktarda olmalldür, Kit içe.ik bilgileri;
a) Kit, Fenol ve guanidin tiyosiyonatln monofazik
solüsyonu olmalIdlr.
b) DNA, RNA ve protein izolasyonlan için uygun
olmalüdlr.
c) Kit, birim ambalajl 50ml olmak üzere '1 adet olacak
şekildo toslim odilm6lidir.
d) Kültüre edilmiş hücrodon, dokudan veya kandan
..
izolasyon yapılabilmelidir.
2)ornok saylslna yelerli mlktarda cDNA ssnlez kili;
a.Kit RNA'dan tek zincirli cDNA sentezinde kullanüan
tüm reaktifleri içermelidir. sentezlenen coNA PcR
amplafikasyonu Ve .eal-time PcR da kullanllabilecek
nitelikte olmalldlr,
b.Kit; GDNA sentezi için primer Ve template DNA
haricinde başka malzeme goreksinimine ihtiyaç
duymamalldür.
1
Gen eksp.esyon seti 5 gen ( RNA izolasyon kiti cDNA
sentez kiti primer probe seta 1500 rxn Mastermix
,|
1 adet
set
c.cDNA sentezinde kullanllan reverse t.anscriptase
enziminjn RNA'ya bağlı DNA Polimeraz activitesi,
DNA' ya bağlI DNA polimeraz activitesi, çift zancir
çözümleme ve RNase H activilesi olmalldlr.
d.Kit aşağldaki reaktifl eri içermelidir;
i.Transcİiptor Reverse
ii.Transcriptase
iil.Transcriptor RT Reaction Buffer (5x)
iv.Protector RNase lnhibitor
v.DeoxyniJcleotide Mix
Vi.Anchored-oligo(dT) 1 8Primer
vii.Random Hexamor Primer
Viii.KontrolRNA
ix.Kontrol Primor Mix PBGD
x,su, PcR{rade
e.Kal minimum 50 reaksiyon yapabilmeıidir.
f.Kil, Hlgh Fldehty özellikll olmall ve 1ng-4pg alasındaki
konsankasyona sahip tüm RNA'larl cDNA ya
çevirebilmeljdjr.
g.Kitin çallşma süresi45 dk yl geçmemelidir.
h.Lightcylcer real-tjme PcR cahazüna vo primer setine
uygun masler miks ve platelel is(enmektedir.
3)Primel dzileri vo özellikleri son kullanlcl taraflndan
Çahşma öncesi firmaya bildi.ilecektir. Dizayn edilecek
primer-probe setleri sclerostin, oPG, VEGF, lL-1 B, lL8 ve AOTB gen bölgelerine özgü olmall ve içerik
olarak aşağldaki glbi olmalldlr,
a,Probe-plimer mix. 300 reaksiyon çallşabilmelidir
b.Problal. Lightcycler R6al Tim6 PcR cihaZlarlnda
slra
No
Malzomonİn
cinsi
Miktarl
ölçu
Özelliği
Birimi
çallşma için optimizde edilmiş olmalldlr,
c.Problar. inlernel üzerinden dizayn edilebilmeli ve
primer-probe kanşlm halınde gelmeli.
d,çallŞma slraslnda p.imeFprobe iÇin t6krar bil
konsantrasyon ayan yapmaya gerek duyulmamalldlr.
e.Probe un kallp DNA ya bağlanma slcakllğl 60
santiglad dereceye optimizo odilmiş olmalldlr.
f,Probe. FAM ile işarotlonmiş yaklaşlk 8-9 baz llk
oligonikleotid dizisi olmall Ve Taql\.4an p.obe gibi
çallşmalldür.
4)Çallşma süresince yelerli miktarda Probe İVlaster
|\,,liks;
a,Klt Llghtcycler cihaztna uyumlıJ olmaıldlr.
b.Absolute Ve R6lative Quantificalion anallzi yapmayl
sağlayacak hot-start özellikli PcR master mixi
olmalldlr,
c.Gen eksprosyonu Ve kantitasyon çallşmalannda
kullanlma uygı]n olmalıdır
d.Hidroliz (Taq[.1an) probu ve Universal Probe Library
problanyla kullanlma uygun olmalldlr.
e.Kit'e dışandan sadece prob6, primer V6 kalıp DNA
veya cDNA eklemek gerekmektedir
lKit 2x Konsantrasyon da olmalldlr
g,optimizasyonıJ için ekstra [49Cl2 eklenmesi
gerekmemelidir.
h,Kit 500 reaksiyon için yetecek miktarda olmalıdır.
5)
ÇallŞmadakıJllanllacakkapiller;
a.20pl hacimli, 1.5 mm dlş çapll polapropilen başlIkll ve
kontaminasyon riskini azaltacak bir kapağı olmaıdür.
b.Kapaklar kapiller kutusu içinde steril şekiıde dizili
olma|l ve Lc cihaz| ile birlikte verilen otomatik bir alet
yardlmlyıa rahatllkla yerleştirilmelidir.
c.PcR performanslnln ve optimal floresan
hansmisyonun(,in sağlanabilmesİ için yüksek kalitelı bir
borisiljkat cam kullanllmlş olmasl gerekmektedar.
d.Bir kolide 96 kapiler Ve kapak içeren 5'li kutular
halinde olmalldlr,
e.Lightcyc|er ReaLTimo PcR cihazl kapjller modeli ile
kullanlma uygun olmalldlr.
Çallşmanln başlnda, ilgilifirma taraflndan
uvouIama desteöi mutlaka verilmelidir.
6)
2
penopaper
2
adet