`{],,TN\

GAzl ÜN|VERSıTESı
BlLlMsEL ARAşTıRMA pRoJELERl lHTlyAç FoRMU
ginil,tive
göı-ü]üü
Eczacılık Fakültesi
Temel Eczacılık Bilimleri
pRoJE vöııerlclslNlı,ı eoı soyADl
PRoF.DR.
sevci RxRyoırı
rınlrıl
No
17lo2l2017
1
TEL : 2023155
GAzı
üN
ıVERSıTESı RE}GöRLüĞü,ııE
(Bilimsel Aıaştırma Pojeleri Birimi)
'o2no1741'kodlu ve Tip60 ve eüdlediği DM onanm genlerinin metilaslon ve ekspreeyon seııiyeleıi lle meme kanserinİn
moleküler a]t gruplan aııasındaki il§kilerin incelenmesi.' konulu projem için zorunlu olan aşağıda cinsi, miktarı ve özellikleri yazılı
toplam 7 kalem hizmetin / malzemenin / teçhizatın tahsis edilen ödenekten temin edilmesi için bilgilerinizi ve gereğini
az
ederim.
r.l
,$,^.\(
'{],,TN\
Sıra
No
Malzemenin cinsi
Miktarı
ölç,
Özetlği
Birimi
1.Kit 200 ul tam kan, doku ömeğ, paralln dokudan;
hücre kühüru, gram negatif veya pozitif bakteri ve
mayadan DNA izole edebilecek nitelikte olmalldlr.
2.Elde edilen DNA PCR amplifikasyonu ve real-time
PCR, southem blot uygulamalarında kullanılabilir
nitelikte olmalıdır.
3.Kit aşağıdaki reaktifleri içermelidir;
1
2
Quick DNA Universal kit 50 preps
Ez DNA Methylation Gold
Kit 50 Reactions
J
3
.
a.Tissue Lysis Buffer
b.Binding Buffer
c.Proteinase K, recombinant,PCR grade
d.lnhibitor Removal Bufier
e.Wash Buffer
f,Elution Buffer
g.High Pure filter tüpleri
h.Toplama tüpleri
4.Kit minimum 50 reaksiyon yapabilmelidir.
5.Kit en az 1 yıl miatlı olmalıdır.
kutu
kutu
1.Kit "sodyum bisülfit" uygulaması esasına
dayanmalıdır.DNA denaturasyonu ve bisülfit
uyguiaması tek adlmda Ve 3 saatten kısa sürede
tamamlanabilmelidir.Kit in-column desulphonation
teknolo.iisiyle çalışmalıd ır.
2.converte edilen DNA bisüıfit artlklarından
temizlenmiş ve purifie olarak e|de edilmelidir.
3.Kit metile olmayan sitozinlerin tam conversiyonunu
sağlamalı, işlem süresince DNA kayıp ve
deorasvonunu minimizeetmelidir.
4.Kitin convörsiüon etkirıliiti %99 dan fazb olm4dg.:
S.Kit 500pg-2 u'g arası DİIA yı converte edebifmğit:
6.kit kullanımını takiben elde edilen ürun direkt olarak
PCR,Real-Time PCR,MSP, Sequencing ve Microarrys
v.b yöntemlerde kullan ılabilmelidir.
7.Kitin oda sıcaklığında saklanmalıdır.
8.Kitin miadı en az 1 yıl olmalıdır.
ADET
.Metilasyon işaretli oligonükleotidler, ithal ma|ı
olmalıdır.
2.Metilasyon işaretli oligonükleotidlerin sentez skalası
't00 nmol olmalıdır.
3.Metilasyon işaretli oligonükleotidler, PCR Grade
halde sentezlenmiş olmalıdır.
4.Metilasyon işaretli oligonükleotidler ile birlikte,
DNA'nın tüm kantitatif değerlerini veren sentez
raporları da verilmelidir.
5.Metilasyon işaretli oligonükleotidler, liyofilize halde
sentezlenmelidir.
6.Meti|asyon işaretli oligonükleotidler, soğuk zincir ile
teslim edilmelidir.
,1
3
Prımer 7 gen MSP-PCR 100 Baz
7
i,,
Sıra
No
Malzemenin cinsi
Miktarı
ölç,
Birimi
Özelliği
7.Malzemeyi veren firma orjinal firmaya ait yetki
belqesini ibraz edebilmelidir.
't.Kit dokudan RNA izole edebilecek
niteliKe
;
4
Direct-zolru RNA MiniPrep Plus w/ TRl Reagent 50
prep
kutu
DNase l
DNase lncubation Buffer
Wash Buffer I
wash Buffer ll
5
6
7
SensiFAST cDNA synthesis kit 50 reactions
SensiFAST SYBR no-ROX kit 50 reactions 2000 rxns
4x5
m|
Primer gen 7
1OO
baz
J
ADET
Elution Buffer
High Pure filter tüpleri
Toplama tüpleri
4.Kit minimum 50 reaksiyon yapabilmelidir.
5.Kit en az '1 vı| miat|ı olmalıdır.
'1
.Kit RNA'dan tek zincirli cDNA sentezinde kullanılan
tüm reaktifleri içermelidir. Sentezlenen cDNA PCR
ampllifikasyonu ve real-time PCR da kullanılabilecek
nitelikte olmalıdır.
2.Kit; cDNA sentezi için primer ve template DNA
haricinde başka malzeme gereksinimine ihtiyaç
duvmamalldlr.
3.cDNA sentezinde k:ullan lan reverse transciptase
enziminin RNA'ya bağlı DNA polimereraz aktivitesi,
DNA'ya bağlı DNA polimeraz aktivitesi, çift zincir
çözümleme ve RNase H aktivilesi olmalıdır.
4.Kit minimum 50 reaksiyon yapabilmelidir.
5.cDNA sentezi 9 kb'ye kadar yapılabilmelidir.
6.Reaksiyon sıcaklığı 37'C olmalıdır.
7.Kitin çalışma süresi 45 dk yı geçrneme|idir.
8^Kft en az 1 vıl mlellı olmnlırlır
ı
1.Kit laboratuarda bulunan LightÖycler480 cihazına
uyumlu olmalıdır.
2. Qua ntifi cation analizi y apmayı sağ layaca k hot-sta rt
pcR
özellikli
master mixi olmalıdır.
3.Kit 2X konsantrasyonunda olmalı ve kullanıma hazır
2
ADET
7
ADET
i'
olmalıdır.
2.Elde edilen RNA; PCR amplifikasyonu ve real{ime
PCR, nouthern blot, RNase protection
uygulamalarında kul|arilSilir nibliKo olmalıdr.,.ı.ı
3.Kit aşağıditO ft*dilğtWı,ırdldt' ı ffS§J
Lysis/Binding
Buffer
halde olmahdır.
4.Kit'e dışandan sadecc primer ve kalıp DNA veya
cDNA eklemek gerekmektedir.
5.Kit, MgC12 optimizasyonu gerektirmez.
6.Kit, 2000 reaksiyon olmalıdır.
7.Malzemeyi veren firma orjinal firmaya ait yetki
belqesini ibraz edebilmelidir.
1.Oligonükleotidler, ithal malı olmalıdır.
2.0ligonükleotidlerin sentez skalası 0.1 umol olmalıdır.
3.0ligonükleotidler, PCR Grade halde sentezlenmiş
olmalıdır.
4.Oligonükleotidler ile bidihe, DNA'nın tüm kantitatif
değerlerini veren sentez raporları verilmelidir.
5.0ligonükleotidler, liyofi lize halde sentez|enmelidir.
6.oligonükleotidler, soğuk zincir ile teslim edilmelidir.
7.Malzemeyi veren firma orjanal firmaya ait yetki