PH–051 Pseudomonas syringae`nin (GTG) primerleri kullanılarak

Enterobacter aerogenes Doktora tezi, 1995.M.Gül, et al., The beneficial effects of pentoxifylline on
caerulein-induced acute pancreatitis in rats,. Dig Dis Sci. , 2009. 54(3): p. 555-63.J.J. Bozda and
L.D.Russel, Electron Microscopy,. 18-19, 1999.
Anahtar Kelimeler: Vitreoscilla hemoglobini, Erwinia hebicola, ATP, NAD, Oksijen alımı, TEM.
Teşekkür: Bu çalışma, “İnönü Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri (APYB 2011/10)”
desteğiyle gerçekleştirilmiştir.
PH–051
Pseudomonas syringae’nin (GTG)5
primerleri kullanılarak moleküler karakterizasyonu
Arzu Görmeza, Medine Güllüceb, Ahmet Adıgüzelc, Fikrettin Şahind
Erzurum Teknik Üniversitesi Fen Fakültesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü, Erzurum
b
Atatürk Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Erzurum
c
Atatürk Üniversitesi, Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü, Erzurum
d
YeditepeÜniversitesi, Mimarlık ve Mühendislik Fakültesi, Genetik ve Biyomühendislik Bölümü,
Kayışdağı, İstanbul
[email protected]
a
Amaç: Türkiye ekonomisi için oldukça büyük öneme sahip olan kayısı bitkisinde en önemli
bakteriyel hastalık etmenlerinden biri olan Pseudomonas syringae, kayısı yetiştiriciliği yapılan
alanlarda zaman zaman epidemik boyutta ciddi kayıplara yol açmaktadır. Bu çalışma da Erzurum
ve ilçelerinde (İspir, Pazaryolu, Narman, Oltu, Uzundere, Olur, Şenkaya ve Tortum) yetiştirilen
kayısı örneklerinden izole edilen Pseudomonas syringae türlerinin moleküler tiplendirilmesi
amaçlanmıştır.
Gereçler ve Yöntemler: Erzurum il ve ilçelerindeki hastalıklı kayısı ağaçlarından alınan bitki
örneklerinden genel ve seçici besi yerleri kullanılarak Pseudomonas syringae strainleri izole
edilmiş ve saf bakteri kültürlerinden genomik DNA izolasyonu yapılmıştır. Çalışmada kullanılan
izolatların genomik fingerprint analizleri (GTG)5 primeri kullanılarak yapılmıştır.
Bulgular: Yapılan analizler sonucunda, izole edilen 97 Pseudomonas syringae türünün (GTG)5
primeri kullanılarak rep-PCR analizleri gerçekleştirilmiş ve 450-3500 bp aralığında değişen 6-14
bant tespit edilmiştir. Genellikle gıda patojenlerinde kullanılan (GTG)5 primerlerinin bitki patojeni
olan Pseudomonas türlerinin de ayırımında başarılı bir şekilde kullanılabileceği gözlemlenmiştir.
Sonuç ve Tartışma: Pseudomonas syringae strainlerinin tür, hatta patovar seviyesinde moleküler
identifikasyonunda rep-PCR yöntemlerinden biri olan (GTG)5 primerlerinin de etkin bir şekilde
kullanılabileceği sonucuna varılmıştır.
Anahtar Kelimeler: Pseudomonas syringae, (GTG)5, genomik fingerprint, Erzurum
1362
21. Ulusal Biyoloji Kongresi, 03–07 Eylül 2012, Ege Üniversitesi, İzmir, Türkiye
http://www.ubk2012.ege.edu.tr