15. Ulusal Su Ürünleri Sempozyumu * 01-04

advertisement
15. Ulusal Su Ürünleri Sempozyumu * 01‐04 Temmuz 2009 * Rize Türkiye’nin Endemik Türü İnci Kefali’nin Filogenetik Analizi ve Sazansılar (Cypriniformes) Takımındaki Yeri 1,2*
Emre KESKİN
Hasan Hüseyin ATAR1 1 Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Su Ürünleri Bölümü, 06110 Dışkapı, Ankara 2 Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü Merkez Laboratuvarı, 06500 Beşevler, * E‐posta: [email protected] Özet Van Gölü, pH’sı 9.8 olan suyu ile dünya üzerindeki en büyük soda gölü ve aynı zamanda da ender rastlanan bir ekosistemdir. Sazangiller (Cyprinidae) familyasına ait inci kefali (Chalcalburnnus tarichi), dünya üzerinde sadece Van Gölü’nde yaşayan ve ticari değere de sahip endemik bir türdür. İlk kez bu çalışma ile Türkiye’nin endemik türü olan inci kefali (Chalcalburnus tarichi), mitokondriyal sitokrom b, 12S ribozomal RNA, 16S ribozomal RNA, sitokrom oksidaz I ve sitokrom oksidaz II genlerinin DNA dizi analizinden faydalanılarak incelenmiştir. Elde edilen DNA dizileri, daha önceden Sazansılar (Cypriniformes) takımına ait yayınlanmış veriler ile karşılaştırılmış, dört farklı yöntemden (Neighbor Joining, Minimum evolution, Maximum parsimony, Unweighted Pair Group Method of Arithmetic Average) faydalanılarak inci kefalinin (Chalcalburnus tarichi) filogenetik konumu ortaya koyulmuştur. Ayrıca elde edilen moleküler veriler A‐T içeriği, korunmuş bölgeler, parsimoni‐anlamlı bölgeler, transisyonel baz çiftleri, transversiyonel baz çiftleri, R değeri, pairwise genetik uzaklık gibi yöntemlerle de değerlendirilmiş ve elde edilen veriler Sazangiller (Cyprinidae) familyasına ait diğer türlerle karşılaştırılarak sonuçlar tartışılmıştır. Sitokrom oksidaz I bölgesinden elde edilen DNA dizisi ile bu türe ilişkin ilk DNA barkodu oluşturulmuştur. Anahtar Kelimeler: 12S rRNA, 16S rRNA, Chalcalburnus tarichi, COX1, COX2, DNA barkod, filogenetik, mitokondriyal DNA, sitokrom b. 117
Download