PowerPoint Sunusu

advertisement
HIZLI
VİRAL TANI TESTLERİ
Doç. Dr. Dilek Çolak
Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi
Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
Viroloji Bilim Dalı
FEN. 2004. Ankara
Virolojik Tanı Yöntemleri
Direkt tanı
yöntemleri
İndirekt tanı
yöntemleri
Virolojik Tanı Yöntemleri
1. Direkt Tanı yöntemleri
• Direkt inceleme
Histoloji
Sitoloji
• Elektron mikroskobisi yöntemi
• Hücre kültürleri
• Antijenlerin saptanması
İmmün boyama (-floresan, -peroksidaz, vb)
ELISA
Lateks agl.
• Nükleik asitlerin tayini
Moleküler testler
Virolojik Tanı Yöntemleri
2. İndirekt Tanı Yöntemleri
• Özgül antikorların araştırılması
IgM
IgG
IgG avidite
serum, BOS, vb
Sitoloji:
Virus grubu !
Tzanck smear
HSV - VZV
Sitoloji:
İntranükleer inklüzyonlar
CMV
Elektron Mikroskobisi Yöntemi
Dışkı
Rotavirus, Adenovirus
Vezikül sıvısı
HSV, VZV
Elektron Mikroskobisi Yöntemi
Adenovirus
Rotavirus
(courtesy of Linda Stannard, University of Cape Town, S.A.)
Elektron Mikroskobisi Yöntemi
Direkt görüntü
Virus karekterizasyonu
Hızlı
Ayrdedici
Pahalı
Duyarlılık 106part./ml
Araştırma lab.
İmmün Elektron Mikroskobisi
Hücre kültürleri
• Konvansiyonel
CPE
Hücre kültürleri
• Geç sonuç (1-30 gün)
• Örnek kalitesi ve transportu çok önemli
• Kontaminasyon riski
• Örneklerin toksik etkisi
• Üremeyen viruslar
Hücre kültürleri
• Hızlı hücre kültürleri
CMV
48 saat
Viral Antijenlerin Saptanması
• Hızlı
• Canlı virusa gerek yok
• İmmünfloresan
boyama (FAT)
• EIA
• Lateks agl.
Viral Antijenlerin Saptanması
•
•
•
•
•
RSV
Influenza
Parainfluenza
Adenovirus
HSV
•
•
•
•
Varicella-zoster
CMV
Rotavirus
HBV
Viral Antijenlerin Saptanması
Nazofaringeal aspirat
RSV
Influenza A and B
Parainfluenza
Adenovirus
Dışkı
Rotaviruses
Adenoviruses
Deri
HSV
VZV
Kan
CMV (pp65 antijenemi testi)
Viral Antijenlerin Saptanması
İmmünfloresan boyama
Viral Antijenlerin Saptanması
FAT
Deride HSV (DFA)
(Virology Laboratory, Yale-New Haven Hospital)
Viral Antijenlerin Saptanması
CMV antijenemi testi;
Periferik kan lökositleri
CMV pp65 antijeni
3-4 saat
Ciddi lökopenide yetersiz kalır!
pp65 antijenemi testi
Viral Antijenlerin Saptanması
FAT
RSV
Influenza A
HSV 1-2;
Duyarlılık
FAT
80
Shellvial-IP
87.6
Kon.kültür
100
Özgüllük PPD
93.3
92.3
100
100
100
100
Chan EL et al. Clin Diagn Lab Immunol 2001;8:909-912
NPD
95.1
96.9
100
1188 nazal yıkama örneği  sitospin preparatı
FAT x Hızlı hücre kült.
Virus
ADV
Infl.A
Infl.B
PI.1,2,3
RSV
Toplam
Duyarlılık
62.5
80
67.4
88.5
93.8
86.7
%
Özgüllük
100
98.6
100
99.7
95.6
93.8
Rochol C, et al. Pediatrics 2004;113:e51-e56
PPD
NPD
100
93.8
85
99.6
100
98
96.4 98.9
87
98
87.9 93.1
FAT yönteminde:
• Örnek kalitesi çok önemli
• Örnekte yeteri kadar hücre olmalı
“yalancı negatif sonuç”
• Deneyimli personel gerekli
• Çok sayıda örneğin incelenmesi zor
Viral Antijenlerin Saptanması
EIA
Viral Antijenlerin Saptanması
EIA
• Çok çeşitli
örnek çalışılır
• Fazla sayıda
örnek çalışılır
• Otomasyon
Viral Antijenlerin Saptanması
Membran EIA
Viral Antijenlerin Saptanması
Lateks aglütinasyon
Nükleik Asit Tayini
Moleküler testler
• Polimeraz zincir reaksiyonu
Klasik PCR
Real-time PCR
• Hibridizasyon
Nükleik Asit Tayini
Klasik PCR
Nükleik Asit Tayini
Nükleik Asit Tayini
Real-time PCR
Plato fazı
Geçiş fazı
Sinyal
Logaritmik faz
Eşik çizgisi
Baz çizgisi
10
20
Döngü sayısı
30
Nükleik Asit Tayini
Real-time PCR
Amplifikasyonla ilişkili floresan sinyallerinin
alınması için gereken siklus sayısı (Ct değeri),
başlangıçtaki hedef nükleik asit miktarıyla ters
orantılı
Nükleik Asit Tayini
Real-time PCR
ürün saptama
 SYBR green I
 Fluorescense resonance energy transfer
(FRET)
Hibridizasyon probları
Taq-man probları
Molecular beacons
SYBR green
FRET
Taq-man probları
Molecular Beacons
• 1-DNA
ekstraks.
• Tam kan
Hybrid capture CMV DNA
testi
4- Konjugat
• 2-Hedef
DNA’nın
CMV RNA
probu ile
hibridizasy
on
• 3-DNA: RNA
hybridlerinin
antikorla
tutulması
by antibody
•5.Kemilüm.
saptama
ADV, 37 konjonktival sürüntü örneği
Test
H.kült.
FAT
PCR
%
Duyarlılık Özgüllük PPD NPD
76.9
100
100 64.7
73.1
100
100 61.1
88.4
100
100 78.6
FAT (-)  diğer testler
Percivalle E, et al. J Clin Virol 2003;28:257-264
132 KHT alıcısı
ADV, >5000 örnek  perif. kan lökositleri
Real-time PCR
dışkı
idrar
boğaz sürüntüsü
Periferik kan löokositlerinde PCR (+)
İnvaziv ADV inf. göstergesi
Lion T, et al. Blood 2003;102:1114-1120
Moleküler testler: Avantajları
• Hızlı
Tedavi
monitörizasyonu
• Duyarlılık yüksek
“latent viruslar için kantitatif testler”
• Pek çok patojen için uygulanabiliyor
• Seçilen yönteme göre kontaminasyon riski çok az
“MagnaPure+LightCycler”
Moleküler testler: Dezavantajları
• Çoğu standardize değil
“internal ve eksternal kalite kontrol uygulamaları”
• Lab.lar arası sonuç karşılaştırması zor
“tanı karmaşası”
• PCR temelli olanlarda IC kullanılmalı
• Rutin sonuç verirken dikkat!
• Pahalı
•Seçilen yönteme göre kontaminasyon riski fazla
“in house PCR”
Seroloji:
BOS’da antikor tayini:
Herpesviruslar
Respiratuvar viruslar
İntratekal antikor sentezi olduğu gösterilmeli
BOS spesifik Ab :serum spesifik Ab BOS IgG:serum IgG  1.5
İletişim
Laboratuvar
klinik
Toplantılar
Karşılıklı bilgilendirme
Hasta bilgileri paylaşılmalı
.....
.....
Yorum
Elde edilen sonuçlar
neyin göstergesi
ne diyor
şimdi n’olacak?
Mikrobiyolog
yaptığı testin
sonucunun
yorumunu
yapabilmeli
Klinisyen istediği
testin sonucunun
yorumunu istemeli,
öğrenmeli
“Rekabet ile işbirliğini harmanlayıp;
düşleri ortak bir gerçekliğe aktarmak...”
Bahar Ö. Düzgören
Download